Усть-Ишимский человек

[Dessa]

Спасибо! Конечно, интересно.)

Если пройти по ссылке, то можно увидеть данные нашей современницы.
http://paleoforum.ru/index.php/topic,8152.msg164086.html#msg164086
Это достаточно смуглая (а если загорит, так вообще коричневая) светлоглазая женщина с каштановыми волосами.

А ссылка Гильгамеша http://elementy.ru/news/432322
дает информацию для размышлений о возможном происхождении фенотипических особенностей
Думаю, что 65% WHG-UHG  (охотников -собирателей)оставили свой след.   


" Так, на территории Германии возделывали поля светлокожие (по присутствию гомозиготного аллеля светлой кожи гена SLC24A5) кареглазые шатены или брюнеты.

В центральной Европе бродили охотничьи племена светлоглазых шатенов, устраивая временные жилища в скальных укрытиях; цвет их кожи был темнее, чем у их соседей-земледельцев.

На северных территориях у охотников были светлые глаза и более светлая кожа. По-видимому, ген светлой кожи появился у жителей Европы до прихода ближневосточных носителей земледельческой культуры, но закреплялся с разной скоростью у разных народов."


Связи различных популяций древней и современной Европы, Азии (онге) и Америки (каритиана, Karitiana). Группы современных людей закрашены синим цветом, розовым обозначены два новых генома из Люксембурга и Германии (Штутгарт) и сибирский из Мальты (МА1), зеленым — реконструированные популяции. Сплошной линией обозначены прямые потомки без примесей пришлых народов, а пунктиром — население, сложившееся из нескольких разнородных источников. Цифры показывают процент примеси (и одно стандартное отклонение) в той или иной популяции. ANE (Ancient North Eurasian) — древние североевразийцы, WHG (West European Hunter-Gatherer) — западно-европейские охотники-собиратели, EEF (Early European Farmer) — раннеевропейские земледельцы. Схема из обсуждаемой статьи

[Dessa]

Есть  два  варианта  -     отвезти  материал к    Паабо  или    делать  самим.   Нам  хочется     что-то  сделать  самим  -  прекрасно  при  этом  понимая,  что  до     возрастов   материала, с  которым  работает Паабо,  нам  быстро   не  дойти.   
Насчет  подсчетов  - все  будет  меняться,   и  процент   неандеров  тоже.  После    каждого  следующего  генома.  И  древнего,  и  современного  -  база     сиквенсов     быстро  растет.  Плюс  -    есть   очень  много  вариантов  того,  как  считать. Да  и  в  целом   насколько  значимы   на  круг    отличия  между  2.5%  и 3% ?   Или  все  эти различия  укладываются  в  ошибку ? 

Ну что ж, могу сказать, что жаль, что ваша лаборатория не в моем городе.)
Я вот даже подумывала, а не подать ли заявку на вакансию постдока в Лейпциге? Но понимаю, что это лишь мечты, не соотносящиеся с жизненными реалиями.))

[afrosergey]

http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=551219

Не умеют наши люди завидовать молча. Более злобный и менее занятой человек начет отдельных моментов этого обсуждения вообще мог бы задуматься насчет иска о защите чести и достоинства. А я посмеюсь. Профессиональный уровень тоже прям кхм... выпирает. "В любой судебке", мда...

Gilgamesh, по-моему, у них на форуме вполне  "нормальная" реакция для "нормальных" завистников людей.  Просто ссылку разместил Vladimirkox не в той теме... Надо бы в "Новое Средневековье" 

[вечерний Андрей]

Есть  два  варианта  -     отвезти  материал к    Паабо  или    делать  самим.   Нам  хочется     что-то  сделать  самим  -  прекрасно  при  этом  понимая,  что  до     возрастов   материала, с  которым  работает Паабо,  нам  быстро   не  дойти.   
Насчет  подсчетов  - все  будет  меняться,   и  процент   неандеров  тоже.  После    каждого  следующего  генома.  И  древнего,  и  современного  -  база     сиквенсов     быстро  растет.  Плюс  -    есть   очень  много  вариантов  того,  как  считать. Да  и  в  целом   насколько  значимы   на  круг    отличия  между  2.5%  и 3% ?   Или  все  эти различия  укладываются  в  ошибку ? 

Ну что ж, могу сказать, что жаль, что ваша лаборатория не в моем городе.)
Я вот даже подумывала, а не подать ли заявку на вакансию постдока в Лейпциге? Но понимаю, что это лишь мечты, не соотносящиеся с жизненными реалиями.))

Лейципг к вашему городу ближе, чем лаборатория Питера?
Я абсолютно не в теме палеогенетических исследований, просто интересно, к Рогаеву не проще было бы устроиться?

[Gilgamesh]

Д. Райх расшарил статью, ну все шишки от издательства к нему если что http://genetics.med.harvard.edu/reich/Reich_Lab/Welcome_files/2014_Fu_Nature_UstIshim.pdf

[Dessa]

У меня популяционные корни немного поменялись по сравнению с первоначальным вариантом. Может, и неандертальщину поменяют и уточнят со временем.

Вы тоже в 23andme тестировались?)

Да.

Обнаружила интересный ресурс:


http://www.y-str.org/p/ancient-dna.html

"За последние годы был опубликован ряд работ, посвященных попыткам генотипирования останков древних людей — от живших несколько тысячелетий назад до «усть-ишимца» с предположительным возрастом около 45 тысяч лет, неандертальцев и «денисовки». Количество таких расшифровок растет все быстрее, что не может не вызывать оптимизма.  Трудами известного геномного блоггера Феликса Чандракумара большинство из них было переведено в простой и доступный формат, аналогичный файлам raw data от FTDNA и 23andMe".

В GEDMatch можно поиграть с этнокалькуляторами и даже попытаться сравнить свой геном с геномами древних.Для этого следует взять из таблицы (кот. видна, если пройти по ссылке) номера, которыми обозначены древние геномы.

[вечерний Андрей]

Меня вот интересуют палеонтологические аспекты этой находки.
Описание местонахождения, сопутствующая фауна и т.д. Проводились ли такие исследования? Есть ли публикации об этом, или может планируются?
По этому поводу информации практически никакой - профиль статьи в Натуре не тот.
Кстати, отчего у кости такой угольно-черный цвет? Особенность вмещающей породы?

[Gilgamesh]

Вообще см. Сапплементы. Если кратко, то публикаций о геологии и палеобиоте в контексте находки человека нет, но в планах. Вне контекста исследовано довольно поверхностно, в т.ч. немного мной. Пойма и каргинско-сартанские террасы, которые по правобережью примыкают к массиву более древних плейстоценовых отложений Тобольского материка, все подстилается континентальным (озерным, дельтовым) олигоценом. Относительно обильная мамонтовая фауна с лесными элементами, как правило вымытая, есть переотложенные кости более древних комплексов плейстоцена. Флора с существенной таежной составляющей.

Цвет - минералы и гуминовые кислоты, вживую с коричневыми тонами, на срезе бледнее, но окрашена.

[Арон.]

 А отчего он умер? Молодой, здоровый парень, и ..того..

[Gilgamesh]

От черепно-мозговой травмы. По покоцаному бедру это прям отлично видно.

[Dessa]

А отчего он умер? Молодой, здоровый парень, и ..того..

А возраст, в котором скончался Усть-Ишимец разве известен?

[Арон.]

А отчего он умер? Молодой, здоровый парень, и ..того..

А возраст, в котором скончался Усть-Ишимец разве известен?

Это гипотеза . Тогда до старости мало кто доживал.

[Gilgamesh]

Да, молодой. Антропологи говорят.

[catty]

Да, молодой. Антропологи говорят.

Жалко-то как...

[Арон.]

Да, молодой. Антропологи говорят.

Жалко-то как...

Всё не так грустно. Геном Усть-Ишимца известен, значит когда-нибудь его воспроизведут заново. К тому времени мамонтов научатся клонировать - он будет на них охотиться. Это будет рай для палеолитических охотников.