Филогенетика беспозвоночных

Автор Set O. Lopata, марта 16, 2005, 18:46:14

« назад - далее »

Alexy

Цитата: "plantago"у меня есть большая коллекция PDF статей последних лет (начиная с 2003) про филогению всего... Вот, выкладываю список архивов PDF (статьи по мегафилогении протистов и животных с 2003), как просили. Сами архивы живут на http://herba.msu.ru/shipunov/else/temp, но не очень долго. Размер архивов --- 47 и 83 мегабайт.
Уважаемый Плантаго! У вас есть филогении семейств или отрядов млекопитающих аж до видового уровня (наприсмер семейства псовых, полорогих) или хотя бы до уровня родов?

Вы бы могли выложить где-нибудь ваш архив по животным снова?
Буду очень благодарен за такую ценную и интересную информацию!

plantago

Архив лежит на прежнем месте, никуда не делся, стал больше и лучше. Сейчас даже обновления идут не раз в месяц, а постоянно.
По млекам там статей мало. Одной статьей Вы не обойдетесь, придется смотреть много. Рекомендую Вам самому поискать нужные статьи по соответствующим журналам и базам данных, а если полные версии статей окажутся недоступны, то спросить здесь или на molbiol.ru в форуме "Fulltext".
С уважением,
plantago

mastax

В библиотеке plantago есть вот такая любопытная статья (как я понял, еще не опубликованная?):
Deuterostome phylogeny reveals monophyletic chordates and the new phylum Xenoturbellida
doi:10.1038/nature05241
S. J. Bourlat et al.

Deuterostomes comprise vertebrates, the related invertebrate
chordates (tunicates and cephalochordates) and three other invertebrate
taxa: hemichordates, echinoderms and Xenoturbella1. The
relationships between invertebrate and vertebrate deuterostomes
are clearly important for understanding our own distant origins.
Recent phylogenetic studies of chordate classes and a sea urchin
have indicated that urochordates might be the closest invertebrate
sister group of vertebrates, rather than cephalochordates,
as traditionally believed2–5. More remarkable is the suggestion that
cephalochordates are closer to echinoderms than to vertebrates
and urochordates, meaning that chordates are paraphyletic2. To
study the relationships among all deuterostome groups, we have
assembled an alignment of more than 35,000 homologous amino
acids, including new data from a hemichordate, starfish and
Xenoturbella. We have also sequenced the mitochondrial genome
of Xenoturbella. We support the clades Olfactores (urochordates
and vertebrates) and Ambulacraria (hemichordates and echinoderms
6). Analyses using our new data, however, do not support a
cephalochordate and echinoderm grouping and we conclude that
chordates are monophyletic. Finally, nuclear and mitochondrial
data place Xenoturbella as the sister group of the two ambulacrarian
phyla1. As such, Xenoturbella is shown to be an independent
phylum, Xenoturbellida, bringing the number of living deuterostome
phyla to four.

От себя. Авторов у этого типа  будет аж 14. Впрочем, более корректно писать автора, выделившего класс Xenoturbellida, в скобках. Подтвердилась гипотеза Акса и Рейзингера о близости ксенотурбеллы к иглокожим. Строение эпидермиса и статоциста тому подтверждение.

Set O. Lopata

Ну наконец-то! А я уж думал не дождусь :) Теперь-то почти наверняка можно считать, что ксенотурбелла нашла-таки своё место среди вторичноротых.

Set O. Lopata

На Элементах заметку прочитал про нового ископаемого представителя Lophotrochozoa. http://elementy.ru/news/430468 По-моему всё же никакого принципиально нового света на проблему происхождения моллюсков и аннелид эта находка не пролила.

ЦитироватьHalkieriids and wiwaxiids are cosmopolitan sclerite-bearing metazoans from the Lower and Middle Cambrian. Although they have similar scleritomes, their phylogenetic position is contested. A new scleritomous fossil from the Burgess Shale has the prominent anterior shell of the halkieriids but also bears wiwaxiid-like sclerites. This new fossil defines the monophyletic halwaxiids and indicates that they have a key place in early lophotrochozoan history.
Оригинал статьи Конвей Морриса и Каро http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/315/5816/1255 не доступен, к сожалению, и в архиве plantago ешё не появился полный вариант :(

mastax

Set O. Lopata
Действительно - что может дать это животное в понимании филогении?

Set O. Lopata

Да, mastax, я помню Вашу точку зрения на способность палеонтологических находок прояснять спорные филогенетические вопросы. И в целом с ней склонен согласиться, конечно. Просто, с детства, видимо, засела в голове идея о "переходном звене", обретение которого расставит все точки над i  :)

plantago

В архиве статья уже есть: to/os_/ani_/conway-morris2007.pdf
Enjoy!
Сколько же лет, интересно, Conway-Morris?
С уважением,
plantago

Set O. Lopata

Спасибо, plantago! Вы просто незаменимый человек :)
А почему Вас заинтересовал возраст Конвей-Морриса? 56 лет ему, вроде. Хотя, с другой стороны, действительно: сколько себя помню - всегда чего-нибудь из его трудов читал.

plantago

Цитата: "Set O. Lopata"Хотя, с другой стороны, действительно: сколько себя помню - всегда чего-нибудь из его трудов читал.
Вот и я тоже...
С уважением,
plantago

Set O. Lopata

Прочитал статью Темеревой и Малахова: "Ответ Томасу Бартоломеусу..."
http://www.nature.ok.ru/invertebrates/pdf_files/invert3_1%20001_021_Temereva.pdf                        
В чём всё-таки причина таких разночтений? Кто-то не видит очевидного или это вопрос интерпретаций? В самом деле так сложно установить наличие/отсутствие тримерного целома у форонид?

mastax

ЦитироватьВ самом деле так сложно установить наличие/отсутствие тримерного целома у форонид?
Set O. Lopata
Сложности бывают в том, чтобы доказать, что вот эта полость – целом, а эта – нет. Скажем, до сих пор нет единства, есть ли у приапулид целом, являются ли половые мешки немертин целомическими полостями. У целома есть свои критерии: определенный тип организации клеточной выстилки, ее закладка, связь с внешней средой и другими полостями. Я не являюсь сторонником архицеломатной концепции, как В.В. Малахов, но все же доверяю данным Темеревой и Малахова, что у форонид трехмерный целом. (Хотя доводы Бартоломеуса весьма интересны и не беспочвенны.) Жаль только, что русскоязычная статья не будет прочитана подавляющим большинством зарубежных зоологов.

plantago

Хорошая статья, спасибо!
И действительно, забавно и печально одновременно, что "Ответ..." на аглоязычную статью написан по-русски, тем более что Bartolomaeus -- немец ;)
С уважением,
plantago

mastax

plantago
Любопытно, что иногда иностранцы (!) публиковали в русских журналах ответы на критику со стороны русских  коллег. Так, Nielsen в Зоол. журнале опубликовал ответ на критику его теории со стороны Ивановой-Казас.  Редакции любят конструктивную полемику, т.к. она привлекает внимание к журналу. Американцы или англичане наверняка ухватились бы за критическую статью в адрес  немца....

Set O. Lopata

Наткнулся на страницу с публикациями Matthew D. Hooge по бескишечным турбелляриям. Много очень интересных статей, в том числе и про новые семейства Acoela.
http://hooge.developmentalbiology.com/cv/