paleoforum.ru

Цитата: "Комбинатор"

Цитата: "Сергей"

Цитата: "Комбинатор"
код выглядит так: АААААААА......
то что им можно закодировать?

                                 TTTTTTTT

Вот именно, что ничего, кроме одной-единственной вырожденной последовательности...

Цитата: "Комбинатор"
Вот именно, что ничего, кроме одной-единственной вырожденной последовательности...

Вырожденной для кого?

Цитата: "Сергей"

Цитата: "Комбинатор"
Вот именно, что ничего, кроме одной-единственной вырожденной последовательности...

Вырожденной для кого?

Для кого угодно (для любого читателя, будь то хоть Эйнштейен, хоть иРНК).

Цитата: "Комбинатор"
Для кого угодно (для любого читателя, будь то хоть Эйнштейен, хоть иРНК).

С Энштейном понятно, а вот с иРНК - нет.

Цитата: "Сергей"

Цитата: "Комбинатор"
Для кого угодно (для любого читателя, будь то хоть Эйнштейен, хоть иРНК).

С Энштейном понятно, а вот с иРНК - нет.

А что конкретно не понятно?
Теоретически по такому генкоду можно сгенерировать максимум один белок. Практически - ни одного.

Цитата: "Комбинатор"
Теоретически по такому генкоду можно сгенерировать максимум один белок. Практически - ни одного.

Увы, Вы тоже путаете понятие данных с понятием информации.

Информация - это процесс обработки данных декодировщиком.

Уже один значёк ''Т'' предполагает наличие массы всяких клеточных процессов, которые являются частью этого самого декодировщика. Не буду расшифровывать, надеюсь понятно.

Последовательность ТТТТТТТТ может нести  массу информации, в зависимости от того, откуда она взята:

может кодировать 2+2/3 фенилаланина, а может и 2+2/3 лизина, если кодируется другая цепь.

может, если недалеко находится последовательность ААААААААА - сигналом для образования шпильки РНК

может, поскольку в этом месте происходит сужение малого жёлоба ДНК, сигналом для фазирования нуклеосомы

и т.д.

Цитата: "Сергей"

Цитата: "Комбинатор"
Теоретически по такому генкоду можно сгенерировать максимум один белок. Практически - ни одного.

Увы, Вы тоже путаете понятие данных с понятием информации.

Информация - это процесс обработки данных декодировщиком.

Уже один значёк ''Т'' предполагает наличие массы всяких клеточных процессов, которые являются частью этого самого декодировщика. Не буду расшифровывать, надеюсь понятно.

Последовательность ТТТТТТТТ может нести  массу информации, в зависимости от того, откуда она взята:

может кодировать 2+2/3 фенилаланина, а может и 2+2/3 лизина, если кодируется другая цепь.

может, если недалеко находится последовательность ААААААААА - игналом для образования шпилько РНК

может, поскольку в этом месте происходит сужение малого жёлоба ДНК сигналом для нуклеосомы

и т.д.

Сергей, я понимаю, что последовательность из одного миллиона T может кодировать очень много лизина, (либо фенилаланина при другом декодировщике, либо много чего ещё, в зависимости от "личности" декодировщика). Но больше, при том же декодировщике, она не может кодировать ничего. У неё нет альтернативы. В этом смысле она вырождена, вне зависимости от природы декадировщика.

Вы можете интерпретировать её как угодно, но если у неё нет альтернативы, то она несёт ноль бит информации. А для того, что бы появилась альтернатива, нужна по крайней мере вторая буква.

Комбинатор

Если «интеллект» природы занимается кровавым изобретательством, то такая Природа  очень смахивает на  Природу ультадарвиниста Р. Докинза «природа с окровавленными клыками и когтями».

Р.Докинз
«Эгоистичный ген»
«Парадоксально, что Эшли Монтегю (Ashley Montagu) критикует Лоренца как «прямого потомка мыслителей XIX в. с их представлениями о природе как о чудовище «с окровавленными клыками и когтями». Насколько я понимаю взгляды Лоренца на эволюцию, он должен быть совершенно заодно с Монтепо, отбрасывая возможные заключения, вытекающие из знаменитого высказывания Теннисона. В отличие от них обоих я считаю, что «природа с окровавленными клыками и когтями» как нельзя, лучше выражает наши современные представления о естественном отборе.
»


Может ли быть интеллект быть не гуманным ?
Многие считают, что интеллект,знания, в отличия от варварства и невежества приводит к гуманизации

Цитата: "Комбинатор"
Сергей, я понимаю, что последовательность из одного миллиона T может кодировать очень много лизина, (либо фенилаланина при другом декодировщике, либо много чего ещё, в зависимости от "личности" декодировщика). Но больше, при том же декодировщике, она не может кодировать ничего. У неё нет альтернативы. В этом смысле она вырождена, вне зависимости от природы декадировщика.

Вы можете интерпретировать её как угодно, но если у неё нет альтернативы, то она несёт ноль бит информации. А для того, что бы появилась альтернатива, нужна по крайней мере вторая буква.

Речь, вроде, шла о 8Т, а не о миллионе. 8Т может быть и невырожденной, если кодировщик реагирует на сигнал из 8 букв.

Цитата: "Сергей"

Цитата: "Комбинатор"
Сергей, я понимаю, что последовательность из одного миллиона T может кодировать очень много лизина, (либо фенилаланина при другом декодировщике, либо много чего ещё, в зависимости от "личности" декодировщика). Но больше, при том же декодировщике, она не может кодировать ничего. У неё нет альтернативы. В этом смысле она вырождена, вне зависимости от природы декадировщика.

Вы можете интерпретировать её как угодно, но если у неё нет альтернативы, то она несёт ноль бит информации. А для того, что бы появилась альтернатива, нужна по крайней мере вторая буква.

Речь, вроде, шла о 8Т, а не о миллионе. 8Т может быть и невырожденной, если кодировщик реагирует на сигнал из 8 букв.

8T фактически означает, что вы неявно подразумевается и наличие второй буквы - пробела (конец сообщения). В коде ДНК для этого зарезервировно, если я правильно помню, аж целых 3 специальных сочетания букв (стоп-кодоны).

Сергей, Комбинатор. Ваш диалог очевидно основан на мельчайшем недоразумении. Комбинатор просто имел в виду вырожденную последовательности в обобщенном абстрактном виде. В общем-то, не слишком хочется влазить в теорию информации, там много всяких дебрей, но может лучше вернуться к попытке общими усилиями промоделировать что-нибудь? В общем-то, моделирование сообществ - это одна из моих прямых ипостасей, могу подключиться...

Basileus
Не расскажите, что моделировали? Интересно. Если здесь оффтопично - в личку или отдельную тему.

Большей частью - пространственные модели абстрактных нейтральных сообществ с явным прицелом на поиск мультифрактальности.. А подробности реально лучше не здесь наверное.. Если интересно - можно и в личку..

Цитата: "Basileus"Сергей, Комбинатор. Ваш диалог очевидно основан на мельчайшем недоразумении. Комбинатор просто имел в виду вырожденную последовательности в обобщенном абстрактном виде. В общем-то, не слишком хочется влазить в теорию информации, там много всяких дебрей, но может лучше вернуться к попытке общими усилиями промоделировать что-нибудь? В общем-то, моделирование сообществ - это одна из моих прямых ипостасей, могу подключиться...

sss уже предложил свою упрощённую модель эволюции генофонда простейших сообществ типа вирусов (послал мне в личку). Если он не возражает, я могу выложить её здесь вместе со своими комментариями для дальнейшего обсуждения.

Цитата: "Basileus"Сергей, Комбинатор. Ваш диалог очевидно основан на мельчайшем недоразумении. Комбинатор просто имел в виду вырожденную последовательности в обобщенном абстрактном виде. В общем-то, не слишком хочется влазить в теорию информации, там много всяких дебрей, но может лучше вернуться к попытке общими усилиями промоделировать что-нибудь? В общем-то, моделирование сообществ - это одна из моих прямых ипостасей, могу подключиться...

Увы, Basileus, это отнюдь не недоразумение, а самый ключевой  вопрос.

Собственно всё обсуждение на этом форуме сводится к вопросу: как в эволюции появляется новая информация. Но без определения самого термина ''информация'' любое обсуждение и любое моделирование эволюционных процессов - это не более чем игра в бирюльки.

Из диалога с Комбинатором  мне теперь понятно, откуда у него растут ноги ''разумности эволюции''.  Юрич, вроде, недавно сказал, что деление на эволюционистов и антиэволюционистов находится на генетическом уровне. Похоже что так.

Меня, кстати, моделирование тоже интересует, но на самом исходном уровне: как разные последовательности ДНК влияют на её физические свойства, и как это потом сказывается на эволюции разных классов организмов. На самом деле это тоже информационная задачка, а подходы к их решению должны быть однотипны.