paleoforum.ru

Если вывешивать, то более дробными порциями, чтобы пользователи могли выбирать из списка архивов, а не были вынуждены качать махину размером с компакт диск.
Для закачки таких массивов нужен софт, поддерживающий возобновление процесса.

Итак, свершилось. Архивы в виде отдельных файлов с названиями "автор+год" живут на
http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref/to
За логином-паролем --- в личку.

P.S. RAR- архивы, которые выложены раньше, будут лежать до воскресенья включительно.
Весь архив выложу в папку else/ref (пароль-логин тот же), когда будет время (сообщу обязательно). Обновлять планирую раз в месяц, если будет получаться; возможно, реже.

По поводу обмена архивами.. Есть разные сервисы, позволяющие работать с большими объемами данных и хорошей скоростью. Вот небольшая заметка про некоторые из них, если интересно: http://exler.ru/reviews/07-03-06.htm

Как я понял, plantago,  Вы не собираете материал по вымершим таксонам. Можно ли будет к Вам обращаться с просьбой выложить какую-либо конкретную статью по палеонтологии?

The Hox gene complement of acoel flatworms, a basal bilaterian clade
Charles E. Cook, Eva Jime´nez, Michael Akam and Emili Salo
EVOLUTION & DEVELOPMENT 6:3, 154–163 (2004)
http://www.tmd.ac.jp/artsci/biol/textbiodiv/EvolHocflatworm.pdf

Gene Regulatory Networks and the Evolution of Animal Body Plans
Eric H. Davidson1 and Douglas H. Erwin
Science 10 February 2006: Vol. 311. no. 5762, pp. 796 - 800
Development of the animal body plan is controlled by large gene regulatory networks (GRNs), and hence evolution of body plans must depend upon change in the architecture of developmental GRNs. However, these networks are composed of diverse components that evolve at different rates and in different ways. Because of the hierarchical organization of developmental GRNs, some kinds of change affect terminal properties of the body plan such as occur in speciation, whereas others affect major aspects of body plan morphology. A notable feature of the paleontological record of animal evolution is the establishment by the Early "Cambrian of virtually all phylum-level body plans. We identify a class of GRN component, the kernels" of the network, which, because of their developmental role and their particular internal structure, are most impervious to change. Conservation of phyletic body plans may have been due to the retention since pre-Cambrian time of GRN kernels, which underlie development of major body parts.

Neurophylogeny: Architecture of the nervous system and a fresh view on arthropod phyologeny
Steffen Harzsch
Integrative and Comparative Biology 2006 46(2):162-194
http://icb.oxfordjournals.org/cgi/reprint/46/2/162

Цитата: "Set O. Lopata"Как я понял, plantago,  Вы не собираете материал по вымершим таксонам. Можно ли будет к Вам обращаться с просьбой выложить какую-либо конкретную статью по палеонтологии?

Материал специально не собираю, но обрашаться, конечно, можно. Что за статья (статьи)?

Почитал статью Петрова Phylogeny of Molting Protostomes (Ecdysozoa)
as Inferred from 18S and 28S rRNA Gene Sequences
N. B. Petrov and N. S. Vladychenskaya
Molecular Biology, Vol. 39, No. 4, 2005, pp. 503–513.

Paradoxopoda-то похоже подтверждаются    Вот уж не подумал бы...

ЦитироватьParadoxopoda-то похоже подтверждаются Surprised Вот уж не подумал бы...

поживем - узнаем. Хотя лично я в статьи Петрова не очень верю.

Статья, которая вышла 3 года назад, но осталась также малоизвестной, как и недавняя монография этого довольно известного автора:
Проблема колониальности, модулярности и индивидуальности губок и особенности их морфогенезов при росте и бесполом размножении
А. В. Ересковский
БИОЛОГИЯ МОРЯ, 2003, том 29, № 1, с. 3-12
Проведен сравнительный анализ организации губок с целью выяснения проблемы их колониальности, индивидуальности или модулярности. Поставленная проблема проанализирована с морфологической, физиологической, морфогенетической и иммунологической позиций. Сторонники гипотезы колониальной организации губок процесс формирования нового зооида интерпретируют как не доведенное до конца бесполое размножение. Впервые проведен сравнительный анализ морфогенезов губок при ростовых процессах и при бесполом размножении, который убедительно показал их различие. В основе роста находится реаранжировка (ремоделлинг) структур, сопровождаемая дезорганизацией и реорганизацией тканей и соседних элементов водоносной системы. Основным механизмом почкования является миграция полипотентных и секреторных клеток в очаг развития почки. Формирование новых водоносных единиц не является не доведенным до конца бесполым размножением, и поэтому термины "колония" и "зооид" к губкам неприменимы. Морфологически обособленную губку, независимо от ее конструктивного уровня (аскон, сикон или лейкон) и количества имеющихся у нее оскулюмов (водоносных модулей), следует рассматривать в качестве индивида.

Еще одна статья, касающаяся губок. Авторы приходят к заключению, что семейство эндемичных байкальских губок следует объединить с бодягами. С этим следует согласиться, т.к. чисто морфологические различия между этими семействами незначительны, и даже специалист не всегда может отличить безгеммульных бодяг от любомирскиид. Хотя сама проблема числа семейств пресноводных губок и их происхождения остается открытой.

Addis, J. S. & Peterson, K. J. (2005). Phylogenetic relationships of freshwater sponges (Porifera, Spongillina) inferred from analyses of 18S rDNA,
COI mtDNA, and ITS2 rDNA sequences. — Zoologica Scripta, 34, 549–557.
The phylogenetic relationships of nine species of freshwater sponges, representing the fami-lies Spongillidae, Lubomirskiidae, and Metaniidae, were inferred from analyses of 18S rDNA, cytochrome oxidase subunit I (COI) mtDNA, and internal transcribed spacer 2 (ITS2) rDNA sequences. These species form a strongly supported monophyletic group within the Demo-spongiae, with the lithistid Vetulina stalactites as the sister taxon. Within the freshwater sponge clade, the basal taxon is not resolved. Depending upon the method of analysis and sequence, the metaniid species, Corvomeyenia sp., or the spongillid species, Trochospongilla pennsylvanica, emerges as the basal species. Among the remaining freshwater sponge species, the spongillids, Spongilla lacustris and Eunapius fragilis, form a sister group to a clade comprised of the spongillid species, Clypeatula cooperensis, Ephydatia fluviatilis, and Ephydatia muelleri, and the lubomirskiid species, Baikalospongia bacillifera and Lubomisrkia baicalensis. C. cooperensis is the sister taxon of E. fluvialitis, and E. muelleri is the sister taxon of (B. bacillifera + L. baicalensis). The family Spongillidae and the genus Ephydatia are thus paraphyletic with respect to the lubomirskiid species; Ephydatia is also paraphyletic to C. cooperensis. We suggest that C. cooperensis be trans-ferred to the genus Ephydatia and that the family Lubomirskiidae be subsumed into the Spongillidae.

Я недавно у Borchiellini et al встретил упоминание про семейство хищных глубоководных губок Cladorhizidae, которые утратили характерный для губок план строения. Вы, mastax, про них что-нибудь рассказать можете?

Вот ещё статья про интересную червеобразную медузу:
Solution to the phylogenetic enigma of Tetraplatia, a worm-shaped cnidarian.
A.G. Collins et al
Biol. Lett. (2006) 2, 120-124
http://www.lifesci.ucsb.edu/~haddock/abstracts/Collins_Tetraplatia_2006.pdf

Vacelet, J. and N. Boury-Esnault. 1996. A new species of carnivorous sponge (Demospongiae; Cladorhizidae) from a Mediterranean cave. Bulletin de l'Institut Royal des Sciences Naturelles de Belgique Biologie, 66(suppl.): 109-115.
губка не имеет ирригационной системы. Пасивный хищник.

Set O. Lopata
Статья A.G. Collins et al  меня приятно удивила: оказывается, сейчас выделяют еще и класс Staurozoa!

Итальянцы бунтуют против линяющих. Знаю, что эту статью опубликовали в 2005 в Zoologischer Anz., но номера не помню:
The clade Ecdysozoa, perplexities and questions
Giovanni Pilato ,  , Maria Grazia Binda, Olga Biondi, Vera D'Urso, Oscar Lisi, Alessandro Marletta, Santa Maugeri, Vittorio Nobile, Giancarlo Rappazzo, Giorgio Sabella, Francesca Sammartano, Giuseppe Turrisi and Fabio Viglianisi

Abstract
A relatively new clade, the Ecdysozoa [Aguinaldo et al., 1997. Nature 387, 489–493] was raised based on the 18S ribosomal DNA sequences that indicate a close relationship between the moulting phyla (Arthropoda, Tardigrada, Onychophora, Nematoda, Nematomorpha, Kinorhyncha, Lorificera and Pri-apula), from which the Annelida, with other phyla, are excluded.
However, the authors here expressed puzzlement about this conclusion. In particular they stressed that: (a) ecdysis might not be an autapomorphy for the Ecdysozoa; (b) some Ecdysozoa phyla are unrelated from one another with regard to morphology and embryogeny; (c) the annelids have a body architec-ture that is more similar to arthropods than some of the Ecdysozoa; (d) the annelids are moulting ani-mals; (e) some phyla excluded from the new clade (e.g. the gastrotrichs), probably carry out a gradual ecdysis by flaking similar to that of the polychaetes.
The authors concluded that the clade Ecdysozoa appears to be phylogenetically unconvincing.

Статья итальянцев есть в архиве, а Schmidt-Rhaesa только что опубликовал на нее ответ (в приложении).

Schmidt-Rhaesa – это тот самый ученый, который, как считают, нанес по Cephalorhyncha Малахова сокрушительный удар, отделив от них волосатиков. Вопрос отделения спорный. Молекулярное древо здесь довольно проблематичное. Вопрос об интроверте у нектонемы не закрыт. Поэтому Малахов слишком рано пошел на попятную, согласившись с этим.