Автор Тема: Гемостаз  (Прочитано 4415 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Гемостаз
« : Октябрь 24, 2018, 12:26:12 »
Доброе время суток. Нужно компетентное мнение.

Поскольку обнаружил значительные объемы информации о немочи современных лабораторий в выявлении редких заболеваний, то возник вопрос: имеет ли смысл делать исследование на мутации гемостаза? А именно:

"Расширенное исследование генов системы гемостаза: F2, F5, MTHFR, MTR, MTRR, F13, FGB, ITGA2, ITGВ3, F7, PAI-1"

В качестве обоснования была приведена следующая литература (которую в силу отсутствия биологического образования я совершенно не понял):

Никитина Л.А. и др. Роль некоторых генетических полиморфизмов в невынашивании беременности // Проблемы репродукции, 2007, С.83-89.
Güngör et al. The presence of PAI-1 4G/5G and ACE DD genotypes increases the risk of early-stage AVF thrombosis in hemodialysis patients. // Ren Fail. 2011;33(2):169-7
Wei YS, et al. Association of the integrin gene polymorphisms with ischemic stroke and plasma lipid levels // Zhonghua Yi Xue Yi Chuan Xue Za Zhi. 2009;26(2):211-5
Gohil et al., The genetics of venous thromboembolism. A meta-analysis involving approximately 120,000 cases and 180,000 controls // Thromb Haemost, 2009. 102(2): 360-70
Goodman et al., Which thrombophilic gene mutations are risk factors for recurrent pregnancy loss? // Am J Reprod Immunol, 2006. 56(4):230-6
Gerhardt, A., et al. The polymorphism of platelet membrane integrin alpha2beta1 (alpha2807TT) is associated with premature onset of fetal loss // Thromb Haemost, 2005. 93(1):124-9.
Ruzzi, L., et al., Association of PLA2 polymorphism of the ITGB3 gene with early fetal loss // Fertil Steril, 2005. 83(2): 511-2
База OMIM: http://omim.org/entry/176930 
База OMIM: http://omim.org/entry/227400 
База OMIM +227400 http://omim.org/entry/607093 
База OMIM: http://omim.org/entry/602568 
База OMIM: http://omim.org/entry/156570
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/RCV000012861/

Делать или не делать? Жду Вашей помощи.

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #1 : Октябрь 24, 2018, 16:31:20 »
Ну    до  кучи  еще  одна  ссылочка   -  база  данных ClinVar,   один  из  генов   панели.   Более   100   полиморфизмов  или  мутаций,  большая  часть  из  которых benign   или  uncertaine  significance.  Поэтому   вообще  нельзя  говорить  о  гене  -  надо  говорить  о    конкретном  полиморфизме.  Посему  нужен  список rs.
И  очень  настораживает "древность"  ссылок.
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #2 : Октябрь 24, 2018, 16:45:01 »
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar/?term=F5%5Bgene%5D

Собственно  ссылка.
И    еще  последняя   ваша  ссылка   тоже  на  клинвар.  Конкретный     полиморфизм   -   всего  одна  работа,  риск  развития  инфаркта  миокарда  (что   не  совсем  гемостаз). 
А  вот   работа  последняя   по  времени. 2018  год.

Medicine (Baltimore). 2018 Sep;97(39):e12566. doi: 10.1097/MD.0000000000012566.
Polymorphism of R353Q (rs6046) in factor VII and the risk of myocardial infarction: A systematic review and meta-analysis.
Huang H1, Long W1, Zhao W1, Zou L1, Song Y1, Zuo J2, Yang Z3.
Author information
Abstract
OBJECTIVE:
Genetic components substantially contribute to the development of myocardial infarction (MI), and R353Q polymorphism (rs6046) in FVII gene has been suspected to be associated with the risk of MI.

METHODS:
A meta-analysis was conducted on the links between R353Q polymorphism and the susceptibility of MI. A comprehensive literature search was performed on 8 electronic databases. The main effects of the genotypes were estimated using a logistic regression approach. The odds ratios with 95% confidence intervals were calculated using the conventional summary method meta-analysis. The possible sources of heterogeneity among the included studies were explored using meta-regression analysis and subgroup analysis.

RESULTS:
A total of 18 eligible case-control studies, comprising of 4701 cases and 5329 controls, were included. No overall statistical relationship was identified between R353Q and MI by any of the genetic models. The meta-regression demonstrated that the Asian population, body mass index (BMI) category, and diabetes affected the heterogeneity. In addition, subgroup analyses showed that heterogeneities were identified in Asian population and BMI category, which highly agree with the results of meta-regression.

CONCLUSIONS:
The current meta-analysis suggested that R353Q polymorphism was not associated with the M Irisk. Asian population, BMI category, and diabetes might be related to the incidence of MI. However, large-scale, case-control studies with rigorous designs are essential to provide accurate evidence.

Главная      фраза   -   что  упомянутый    полимофризм  в   последней ссылке   не  ассоциирован с  риском  инфаркта  миокар да
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #3 : Октябрь 24, 2018, 16:46:26 »
Сухой    остаток   -  в  этом  месте  точно  не  стал   бы.
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #4 : Октябрь 25, 2018, 10:06:40 »
Ну    до  кучи  еще  одна  ссылочка   -  база  данных ClinVar,   один  из  генов   панели.   Более   100   полиморфизмов  или  мутаций,  большая  часть  из  которых benign   или  uncertaine  significance.  Поэтому   вообще  нельзя  говорить  о  гене  -  надо  говорить  о    конкретном  полиморфизме.  Посему  нужен  список rs.
И  очень  настораживает "древность"  ссылок.

а что поменялось за последние 10 лет?

https://www.invitro.ru/analizes/for-doctors/novosibirsk/841/21927/

Профиль включает в себя исследование основных полиморфизмов в генах системы гемостаза и фолатного цикла:
F2 c.*97G>A (20210 G>A; rs1799963),
F5 c.1601G>A (Arg534Gln; 1691 G>A; rs6025), 
MTHFR c.665C>T (Ala222Val; 677 C>T; rs1801133),
MTHFR c.1286A>C (Glu429Ala; 1298 A>C; rs1801131),
MTR c.2756A>G (Asp919Gly; rs1805087),
MTRR c.66A>G (Ile22Met; rs1801394),
F13 с.103G>T (I63Т; rs5985),
FGB c.-467G>A (-455 G>А; rs1800790),
ITGA2 c.759C>T (Phe253Phe, 807 C>T; rs1126643),
ITGB3 c.176T>C (Leu59Pro; 1565 T>C; rs5918),
F7 c.1238G>A (Arg353Gln; 10976 G>A; rs6046),
PAI-1 (SERPINE1) –675 5G>4G (rs1799889).




Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #5 : Октябрь 25, 2018, 10:31:55 »
И    еще  последняя   ваша  ссылка   тоже  на  клинвар.  Конкретный     полиморфизм   -   всего  одна  работа,  риск  развития  инфаркта  миокарда  (что   не  совсем  гемостаз). 

но ведь F5 патоген в большом проценте случаев (тромбофилия и Factor V deficiency)

Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #6 : Октябрь 25, 2018, 10:51:24 »
и далее (правда значительно реже)

Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #7 : Октябрь 25, 2018, 11:13:14 »
но ведь F5 патоген в большом проценте случаев


всмысле, что многие мутации в F5 приводят к патологии гемостаза

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #8 : Октябрь 25, 2018, 13:14:08 »
Любимый     фактор V   и  Лейденская  мутация.
Вопрос    номер  1  -   для  чего  конкретного    этот   фактор  является   доказанным  генетическим фактором  риска  ?
Ответ  -   расскажу       позднее. Но   это  одно  конкретное        нарушение.  Которое  встречается  с  частотой  1:1000  человек.
У  гомозигот   по  Лейдену     -  80\1000.  Но    гомозигот  по  Лейдену   -   примерно  1  на  5000.  У    гетерозигот    (коих   в  РФ  около 3%)  риск развития    данной   патологии  повышен  примерно в  2  раза.
И   есть  очевидный   фактор,  который   влияет  на  развитие     данного   заболевания  намного  сильнее,  чем  генетика.   
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Cirill

  • Участник форума
  • Сообщений: 734
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #9 : Октябрь 25, 2018, 15:12:47 »
полностью запутался в приведенной статистике

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #10 : Октябрь 25, 2018, 17:58:35 »
Да   все  просто.  Есть   такое   заболевание   -   тромбоз  вен  нижних  конечностей  и     малого  таза.  Встречается  с  частотой  1  на  1000  человек.   Обычно на     фоне  замедления   венозного  оттока  из-за   расширения   вен.   Так  вот  у  гомозигот по  Лейдену  он  повышен -   80   на  1000.   Но   вот   частота  таких  гомозигот    -  1  на  5000  человек.   Гетерозигот  больше -  примерно 3%    населения.   Но  у  них  риск  повышен  в  2  раза. 
В    общем    если  есть  проблемы  с  венами  нижних  конечностей      - физкультура    или  специальное   утягивающее   белье.   Эффективнее,  чем    типировать  Лейден. 
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Dessa

  • Участник форума
  • Сообщений: 1288
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #11 : Октябрь 25, 2018, 20:21:43 »
Хорошая тема. Я делала анализ в 23andme.  Оказалось, что я компаундная гетерозигота по гену MTHFR. Две мутации ,: 677 и 1298. Нарушен обмен фолиевой кислоты- нужно принимать метилфолат, а не фолиевую кислоту. Приходится выписывать витамины из Америки. И действительно, у меня был высок уровень гомоцистеина в крови ( продукт обмена фолиевой кислоты, который накапливается при мутациях). Начала принимать " правильные" витамины- он понизился до нормы. Для чего это делала? Мелочь- подготовка к беременности. 😏 А эти мутации влияют на усвоение фолатов, которые, в свою очередь, важны для здоровья ребёнка.

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #12 : Октябрь 25, 2018, 21:15:43 »
Очередной    развод    на   деньги,    извините.
Из SNPedia,
"Our Take on The MTHFR Gene," is a 23andMe blog posting (January 5, 2017), a meta-analysis finding that the past two decades of scientific evidence as it relates to specific MTHFR-influenced health conditions to be inconclusive or conflicting, with two exceptions, 1. women with two copies of C677T variant, 2. a very rare variant that may cause homocystinuria. Their takeaway, "Based on the existing data, scientists at 23andMe have concluded that people should not interpret their genotypes at the common MTHFR variants as having an effect on their health."
А  оно  вам  надо  ?

Оффлайн Dessa

  • Участник форума
  • Сообщений: 1288
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #13 : Октябрь 25, 2018, 22:09:47 »
. У гетерозигот тоже нарушен метаболизм фолатов и повышенный уровень гомоцистеина в крови у женщин- гетерозигот может вызывать трудности при зачатии. Его лучше снизить.   А прием биодоступной формы фолиевой кислоты вместо обычной никому не повредит.

Оффлайн Питер

  • Участник форума
  • Сообщений: 1572
    • Просмотр профиля
Re: Гемостаз
« Ответ #14 : Октябрь 25, 2018, 22:34:47 »
Ясно  написано  -   гомозиготы.    По   гетерозиготам небольшое  и    клинически  не  значимое  снижение активности   фермента.   Ну  воля  ваша  и  деньги    тоже  ваши,   пейте   что    хотите.
А  оно  вам  надо  ?