Homo denisovans

[Арон.]

  Вариант №3:
    "До 4% наших верхне-среднепалеолитических предков были неандертальцами."   Уж тут-то никто не придерётся!
   А то, что диапазон цифр 1-4% заведомо приблизительный и предварительный, и требует уточнения - это верно. Признано, в т.ч. специалистами.

[Дж. Тайсаев]

ну наконец то, вот на нашем любимом сайте антропогенез.ру я нашел вполне понятное объяснение пресловутым 4%, вот здесь http://antropogenez.ru/article/386/ Как я думаю, этот эксперт и есть пользователь Питер. Методика как я понял примерно такая же, как и при определении родства

[Питер]

  Вариант №3:
     "До 4% наших верхне-среднепалеолитических предков были неандертальцами."   Уж тут-то никто не придерётся!
    А то, что диапазон цифр 1-4% заведомо приблизительный и предварительный, и требует уточнения - это верно. Признано, в т.ч. специалистами.

Придерусь.  Было  явно  много  меньше,    возможно  что  скрещивание    неандера   и  предка   современного   человека   было однократным     актом.  Нельзя  просто  так   перейти  от   числа    возникших у  неандера  и  найденных   в  геноме   современного   человек   полиморфных  сайтов  к    числу  неандертальских   предков.  Надо    детально  смотреть  их  распределение  в  геноме,    есть  ли  кластеры     таких  сайтов,  как  они  лежат   относительно    горячих  точек  кроссинговера,   как     они связаны  с  CpG  сайтами.
В  общем    вопросов   больше  чем  ответов,   надо  рыть   сиквенсы.  Но   для    этого  у  меня   не    хватает   мощностей  -  ни    времени (своей  работы  выше  крыши),  ни   вычислительных   мощностей.
Да, Тайсаев   прав  -   Питер=Сломинский    Петр

[Арон.]

   Вариант №5: "Кто-то из наших предков (где-то и когда-то) был неандертальцем".
   Получается, что это наиболее научно строгая формулировка.

[Питер]

   Вариант №5: "Кто-то из наших предков (где-то и когда-то) был неандертальцем".
   Получается, что это наиболее научно строгая формулировка.

Как   ни  странно,  да.   

[идрис]

Как можно представить численность населения в Африке возрастала в теплые времена. Именно тогда происходили массовые миграции населения из нее на север. Когда становилось холодно, то никакие миграции с юга на север в принципе невозможны. Соответственно последняя волна миграции была связана с теплым периодом климата между двумя похолоданиями вюрма (то есть в интервале между 60 и 30 тысячами лет. Логично предположить что еще раньше была небольшая волна миграции с юга в период между 90 и 70тыс. лет назад. А еще раньше в Микулинское межледниковье ситуация могла быть сложной, ведь и на севере становилось теплее и население там увеличивалось. Но и в Африке просто неизбежно население резко возрастало и всякие пустыни в принципе отсутствовали. То есть вероятно была еще более ранняя волна миграции между 120 и 100 тысяч лет назад. В более ранние времена было несколько десятков тысяч лет очень холодных и плохих условий (Днепровское и Московские оледенения) так что миграции с юга на север мало вероятны.

То есть вероятно сапиенс не один раз мигрировал на север и ни один раз оставлял свой след в неандертальцах. Возможно даже последняя волна миграции (60-30 тыс.л.н.) и не приводила к метисации. А имеющиеся следы неандеров в наших генах - это следствие более ранних метисаций.

[Alexy]

Надо    детально  смотреть  их  распределение  в  геноме,    есть  ли  кластеры     таких  сайтов,  как  они  лежат   относительно    горячих  точек  кроссинговера,   как     они связаны  с  CpG  сайтами

Наверное про гены в одном кластере (имеется в виду, как я понял, случай, если между генами нету ни одной горячей точки кросинговера) сразу же проверили - ведь понятно, что в этом случае скорее всего эти гены пришли от одной особи

А причём тут CpG-сайты я не совсем понимаю

[Питер]

CpG  -    горячие  точки  мутаций.  Если   мутация  произошла в  таком  сайте  -    то  весьма   вероятно,  что  она  могла  возникнуть  независимо в  разных    линиях   - у  человека  и   неандера.   А  не  была  получена   ченловеком  от  неандера. 

[идрис]

Вот информация по поводу генома денисовцев

http://science.compulenta.ru/659815/

[Ярослав Смирнов]

Придерусь.  Было  явно  много  меньше,    возможно  что  скрещивание    неандера   и  предка   современного   человека   было однократным     актом.  Нельзя  просто  так   перейти  от   числа    возникших у  неандера  и  найденных   в  геноме   современного   человек   полиморфных  сайтов  к    числу  неандертальских   предков.  Надо    детально  смотреть  их  распределение  в  геноме,    есть  ли  кластеры     таких  сайтов,  как  они  лежат   относительно    горячих  точек  кроссинговера,   как     они связаны  с  CpG  сайтами.

И я придерусь. Возможно, предков-неандертальцев было куда больше. Но при этом: часть "плохих" генов попали под действие естественного отбора и в современных популяциях не встречаются; часть "хороших" генов распространилась в том числе и в африканские популяции.

[Ярослав Смирнов]

Как   ни  странно,  да.   

Ну, почти. Например, пока нельзя исключить возможность (хотя серьёзно рассматривать её оснований нет), что "неандертальские гены" были получены не в результате "вертикальной", а в результате "горизонтальной" передачи генов, например, при помощи ретровирусов.

[langust]

  Вариант №3:
     "До 4% наших верхне-среднепалеолитических предков были неандертальцами."   Уж тут-то никто не придерётся!
    А то, что диапазон цифр 1-4% заведомо приблизительный и предварительный, и требует уточнения - это верно. Признано, в т.ч. специалистами.

Придерусь.  Было  явно  много  меньше,    возможно  что  скрещивание    неандера   и  предка   современного   человека   было однократным     актом.  Нельзя  просто  так   перейти  от   числа    возникших у  неандера  и  найденных   в  геноме   современного   человек   полиморфных  сайтов  к    числу  неандертальских   предков. 

Совершенно верно. Мало того, такой вариант наиболее вероятен. Есть и доказательства, хотя бы и косвенные. Например тот факт, что все неафриканские популяции происходят от одного небольшого племени, которое, возможно отделилось территориально от остальных африканских сапиенсов и в нем произошел дрейф генов таким образом, что у ВСЕХ оказались единственные уникальные аллели мт-ДНК и У-хромосомы. Если, например, на пути  к "Персидскому озеру" численность этого племени особо не менялась в связи с тяжелыми условиями жизни в аридных районах, то достаточно "вливания" генов всего лишь нескольких неандерталок в течение сотен лет, чтобы тот же дрейф распределил их "гены" в популяции примерно в том соотношении, которое наблюдается сейчас. Иначе говоря, достаточно смешения в среднем раз в столетие  "путешествия из Эдема" чтобы племя, состоящее, скажем, из нескольких сотен человек, стало хотя бы немного "неандертальским".

[langust]

А судя по рисунку,



в наш геном этот самый процент мог внести один-единственный неандерталец (или неандерталка ), когда евроазиатское "первоплемя" сапов, например, в количестве около ста человек, "вышло из Африки".

[Ярослав Смирнов]

Совершенно верно. Мало того, такой вариант наиболее вероятен. Есть и доказательства, хотя бы и косвенные. Например тот факт, что все неафриканские популяции происходят от одного небольшого племени, которое, возможно отделилось территориально от остальных африканских сапиенсов и в нем произошел дрейф генов таким образом, что у ВСЕХ оказались единственные уникальные аллели мт-ДНК и У-хромосомы.

Гы. Это далеко не факт. Максимум - вольная интерпретация фактов.

[langust]

Это далеко не факт.

Вы не дружите с теорией вероятностей.