рибозим

Автор pan, сентября 18, 2013, 00:35:45

« назад - далее »

pan

Вопросы, интересные участнику <PAN>

1. Какова же длина самого короткого из известных рибозимов?
2. Какие возражения выдвигались против гипотезы РНК-мира?

3. (Правда, это не совсем биология...) - А известно ли что-нибудь об автокаталитических ЯДЕРНЫХ реакциях (АЯР)?
   При каких условиях они могли бы происходить?
4. И возможны ли при АЯР изменчивость и отбор?

AdmiralHood

Как вы себе представляете автокаталитическую ядерную реакцию? К одному ядру подкатывает другое и вызывает деление первого с появлением копии ядра 2 + прочая дребедень?
Я1 + Я2 = 2 Я2 + прочее?

Единственное, что приходит в голову — это цепная реакция в уране под действием нейтронов, которая приводит к размножению нейтронов. Но это вряд ли можно назвать автокаталитической реакцией, это скорее похоже на вирусную инфекцию :~)
Уверуйте в электричество, племянники!

Дж. Тайсаев

Цитата: AdmiralHood от сентября 20, 2013, 18:53:44
Как вы себе представляете автокаталитическую ядерную реакцию? К одному ядру подкатывает другое и вызывает деление первого с появлением копии ядра 2 + прочая дребедень?
Я1 + Я2 = 2 Я2 + прочее?

Единственное, что приходит в голову — это цепная реакция в уране под действием нейтронов, которая приводит к размножению нейтронов. Но это вряд ли можно назвать автокаталитической реакцией, это скорее похоже на вирусную инфекцию :~)

Я знаю что вы профи, но всё таки посмотрите в инете например про гиперциклы Эйгена, там классический автокатализ, думаю, что всё так и было, иначе времени бы попросту не хватило на абиогенез
Шматина глины не знатней орангутанга (Алексей Толстой).

AdmiralHood

#3
Цитата: Дж. Тайсаев от сентября 20, 2013, 19:04:11
про гиперциклы Эйгена, там классический автокатализ
В том, что автокаталитические циклы на молекулярном уровне существуют, в этом сомнения нет. А вот уровнем ниже — на атомарном уровне — похоже, такие реакции не известны. Да и механизмов, которые могли бы обеспечивать такие реакции, не усматривается.

На молекулярном уровне при репликации молекула либо выступает в качестве матрицы и катализатора в едином лице, либо её копирует какой-то фермент. На уровне атомов не представляю, как отдельный атом может служить матрицей для построения другого или работать в качестве фермента.

Если же предположить вариант молекулярной катализации ядерных реакций — это что-то из серии трансмутации элементов, науке такие случаи ПМЛМ неизвестны.
Уверуйте в электричество, племянники!

pan

Цитата из   http://ru.wikipedia.org/wiki/CNO-%F6%E8%EA%EB

"CNO-цикл — термоядерная реакция превращения водорода в гелий, в которой углерод, кислород и азот выступают как катализаторы. Считается одним из основных процессов термоядерного синтеза в массивных звёздах главной последовательности...."

То есть каталитические ядерные реакции существуют.
Отсюда и вопрос - а как насчет автокаталитических?

pan

#5
И все-таки - вопросы к профи-биологам (сохраняя нумерацию):

5. А сколько всего разных рибозимов обнаружено в экспериментах?
6. При каких максимальных температурах они сохраняют свои автокаталитические свойства?

Ну и неплохо было бы получить ответы на 1 и 2 вопросы...
Спасибо!

AdmiralHood

Structure–function relationships in the hammerhead ribozyme probed by base rescue
http://rnajournal.cshlp.org/content/4/11/1332.full.pdf

На  момент написания статьи (1998 год) самым коротким известным естественным рибозимом был Hammerhead  HH16 (55 нуклеотидов). В литературе есть упоминания о рабозимах того же семейства с менее чем 50 нуклеотидов.
Уверуйте в электричество, племянники!

pan

#7
Рассматривался ли кем-нибудь вариант, когда в первичном бульоне
образовывались закольцованные цепочки из молекул РНК (как более
устойчивые, они могли сохраняться достаточно долго, и даже при
каких-то условиях накапливаться - своего рода "прекурсоры" рибозима),
а затем, при соприкосновении хотя бы двух
таких колец, одно или более из них разрывалось - и получался
уже рибозим?
Если такой ход событий возможен, то, может быть, он вероятнее,
чем просто случайная самосборка рибозима?


pan

Уточнение на вопрос уважаемого
AdmiralHood от 20 сентября 2013.

Попробуем представить себе такой
процесс:

Некое атомное ядро с номером X (X<13),
находясь где-то внутри звезды,
в условиях постоянной бомбардировки
энергичными протонами и альфа-частицами
(а возможно, и другими легкими ядрами)
присоединяет их, из-за чего постепенно
набирает массу и заряд.
Процесс энергетически выгоден, так как
удельная энергия связи нуклонов растет
по мере приближения к X=26
(термоядерный синтез), то есть с некоторой
вероятностью он происходит.
При этом происходят разного рода
побочные реакции (пока их не обсуждаем),
в результате которых иногда получается
нестабильное ядро с номером Z (Z в 2 и
более раз больше, чем X).
Если теперь новое ядро (с номером Z)
развалится на две части, каждая из которых
(возможно, также после некоторой цепи
распадов) будет представлять собою исходное
ядро с номером X (плюс всякие осколки),то,
таким образом, в этом гипотетическом
цикле из одного ядра с номером X
(с некоторой вероятностью) получилось
два таких же плюс побочные продукты.

А далее все повторяется...

Может ли такой сценарий реализовываться
в действительности и можно ли назвать
его автокаталитической ядерной реакцией?