Интересные новости и комментарии

[aevin]

Биологи продемонстрировали непредсказуемость и необратимость эволюции
http://lenta.ru/news/2015/06/10/argt/
"Биологи из США доказали, что на молекулярном уровне эволюция носит непредсказуемый и необратимый характер. Моделируя эволюцию белка, они показали, что новые мутации зависят от предыдущих, а со временем вернуться назад и убрать накопленные мутации (без вреда для белка) становится все сложнее. Результаты исследования представлены в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Джошуа Плоткин (Joshua B. Plotkin) и его коллеги из Университета штата Пенсильвания работали с самым простым проявлением эволюции: отсекающим отбором, который благоприятствует мутациям, оказывающим лишь незначительное воздействие на жизнь организма в неизменной среде — в отличие от позитивного отбора, поощряющего мутации, которые укрепляют организм в новых условиях.
Ученые взяли белок argT, обладающий простейшей структурой, и начали моделировать десять миллионов лет эволюции. Биологи вводили в argT случайные мутации, отказываясь только от тех, что существенно влияют на устойчивость белка. Также они смотрели, принял бы белок позднейшую мутацию, не получив одну из первых в списке.
Оказалось, что мутации в большой степени зависят друг от друга: многие поздние сдвиги разрушили бы белок, если бы их эффект не смягчали предшествующие. Кроме того, оказалось невозможным отключить ранние мутации, не подвергнув белок риску распада. «Если вы попытаетесь вернуться назад и после серии изменений отключите одну из первых, структура белка начнет рушиться», — поясняет Плоткин.
Зависимость одних мутаций от других, а также их укоренение в структуре белка говорит о том, что ход эволюции крайне сложно предсказать и невозможно развернуть назад. «Мутации, которые приходят первыми, определяют границы допустимого для последующих. История на самом деле направляет эволюцию по определенному пути. Если отмотать назад пленку жизни, пользуясь знаменитой метафорой Гулда, то она окажется совсем другой», — резюмирует Плоткин."

"Попытаться вернуться назад" - это сначала "отключать" самые поздние мутации, а уж потом самые первые. Почему в пояснении Плоткина сначала "отключают" первые мутации? Разве это будет "вернуться назад"? И кроме того, "отключение" - это своеобразная блокировка, т.е. наложение дополнительных связей (внесение дополнительных изменений), а не "расставление" всех без исключения атомов на прежние места (что и было бы настоящим "поворачиванием времени вспять"). Поэтому сетовать на невозможность развернуть назад ход эволюции методами внесения дополнительных изменений в молекулу звучит как-то не логично...

1) Да, здесь он лукавит, чтобы сделать свои результаты более значимыми.

2) Думаю, имеется ввиду back-mutation - точная замена измененного нуклеотида в кодирующем гене на первоначальный нуклеотид (и соотвественно, замена аминокислоты в белке на первоначальную).

[aevin]

2) Думаю, имеется ввиду back-mutation - точная замена измененного нуклеотида в кодирующем гене на первоначальный нуклеотид (и соотвественно, замена аминокислоты в белке на первоначальную).

Точнее, возможна замена и другого нуклеотида в том же кодоне (в рамках набора синонимных триплетов). Лишь бы была восстановлена исходная аминоклислота.

[Питер]

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html
Секвенирование  геномов  человека  бронзового  века  -  100  геномов  от  Сибири  и  Кавказа  до  Европы. 

[Дж. Тайсаев]

http://www.nature.com/nature/journal/v522/n7555/full/nature14507.html
Секвенирование  геномов  человека  бронзового  века  -  100  геномов  от  Сибири  и  Кавказа  до  Европы. 

Спасибо за весьма полезную ссылку. Это мне очень кстати сейчас.

[ArefievPV]

Ученые нашли ген, заставляющий будущий сперматозоид стать яйцеклеткой
http://ria.ru/science/20150612/1069533826.html
"Генетики из Японии нашли в ДНК рыб особый ген-"выключатель", который определяет станет ли половая клетка сперматозоидом или яйцеклеткой, и поменяли его работу таким образом, что в яичниках самок рыб начали формироваться сперматозоиды, а в семенниках самцов – яйцеклетки.
МОСКВА, 11 июн – РИА Новости. Японские генетики обнаружили в ДНК рыб необычный ген, определяющий то, станет ли половая клетка сперматозоидом или яйцеклеткой, и поменяли его работу таким образом, что в яичниках самок рыб начали формироваться сперматозоиды, а в семенниках самцов – яйцеклетки, говорится в статье, опубликованной в журнале Science.
"Мы знали, что гаметы могут превращаться и в сперматозоиды, и в яйцеклетки, но никто и не предполагал, что эти клетки в организме позвоночных животных обладают особым геном-"переключателем", который определяет их судьбу – стать сперматозоидом или яйцеклеткой. Полученные нами результаты показывают, что клетка способна самостоятельно пройти весь этот путь. Это очень важное и неожиданное открытие", — заявил Минору Танака (Minoru Tanaka) из Института общей биологии Японии в городе Оказаки (Япония).
Танака и его коллеги совершили это необычное открытие, наблюдая за развитием половых клеток в семенниках и яичниках рисовой рыбки-оризии (Oryzias latipes). Во время созревания сперматозоидов и яйцеклеток ученые следили за изменениями в уровне активности разных генов, пытаясь найти различия между будущими мужскими и женскими половыми клетками.
Внимание ученых привлек ген foxl3 — "архивная копия" гена foxl2, который отвечает за рост икринок и поддержание их существования в организме будущей матери. Роль и время работы foxl3 мало интересовали биологов до настоящего времени, и оставались неизвестными.
Как выяснили авторы статьи, foxl3 является своеобразным половым "переключателем", активное положение которого означает, что гамета превратится в яйцеклетку и затем – в икринку, а выключенное – в сперматозоид.
Для проверки этого предположения японские биологи пошли на необычный эксперимент – они повредили этот ген в зародышах самок рисовой рыбки, и принудительно "включили" foxl3 в половых клетках будущих самцов.
Данный прием привел к удивительным результатам — когда оризии родились, в семенниках особей сильного пола начали формироваться яйцеклетки, а в яичниках самок – самые настоящие сперматозоиды. Когда половые клетки выросли, ученые извлекли их из тела рыб и проверили, могут ли они дать жизнь новому поколению рыб.
Как оказалось, подобные гаметы были вполне жизнеспособными – "женские" сперматозоиды успешно проникли в яйцеклетки самок из контрольной группы и те дали здоровое потомство, а "мужские" яйцеклетки оплодотворились и превратились в зародыши.
Что это означает? Во-первых,  существование данного "переключателя" может объяснять то, почему некоторые виды змей и рыбы-пилы обладают способностью к самооплодотворению. В пользу этого говорит то, что в утробе самок оризий, несмотря на повреждение foxl3, присутствовало несколько яйцеклеток, которые к концу эксперимента оказались оплодотворенными.
Во-вторых, ген foxl3 или его аналоги в ДНК сухопутных животных можно использовать для природоохранных целей и спасения вымирающих видов. Сегодня биологи предлагают спасать вымирающие виды путем выращивания их яйцеклеток и сперматозоидов из культур стволовых клеток, что может привнести массу мутаций в зародыши и вызвать другие непредсказуемые последствия. Манипуляции геном foxl3 могут снизить этот риск."

[aevin]

Директор Института этнологии и антропологии им. Миклухо-Маклая РАН В.А.Тишков получил Госпремию 2014 г. за достижения в области этнологии и социально-культурной антропологии, разработку метода этнологического мониторинга, предупреждения и разрешения этнополитических конфликтов.

[Micr]

Директор Института этнологии и антропологии им. Миклухо-Маклая РАН В.А.Тишков получил Госпремию 2014 г. за достижения в области этнологии и социально-культурной антропологии, разработку метода этнологического мониторинга, предупреждения и разрешения этнополитических конфликтов.

По духу чисто американский подход. Или НАТОвский, а может еще чей-нибудь, не знаю точно. Но американский однозначно.

[ArefievPV]

Палеогенетика подтвердила важный вклад причерноморско-каспийских степняков в формирование генофонда европейцев
http://elementy.ru/news?newsid=432506
"Два больших международных исследовательских коллектива опубликовали результаты анализа геномов 170 обитателей различных районов Евразии, живших от 8000 до 2000 лет назад. Обе работы показали, что важнейшую роль в формировании генофонда современных европейцев сыграла произошедшая около 4500 лет назад массовая миграция кочевых скотоводов из Причерноморско-Каспийской степи («ямная культура») в Западную Европу, где потомки мигрантов сформировали «культуру шнуровой керамики», она же «культура боевых топоров». С большой вероятностью древнее нашествие степняков непосредственно связано с распространением в Западной Европе индоевропейских языков. Последующие миграции этих популяций в восточном направлении, по-видимому, объясняют происхождение синташтинской и афанасьевской культур, а также тохарских языков. Исследование показало, что генофонд современных европейцев (как западных, так и восточных) складывается из трех частей, смешанных в разных пропорциях у разных народов: первая часть — от палеолитических европейских охотников-собирателей, вторая — от неолитических переселенцев с Ближнего Востока, вместе с которыми в Европу пришло сельское хозяйство, третья — от причерноморских степняков бронзового века."

[Арон.]

Директор Института этнологии и антропологии им. Миклухо-Маклая РАН В.А.Тишков получил Госпремию 2014 г. за достижения в области этнологии и социально-культурной антропологии, разработку метода этнологического мониторинга, предупреждения и разрешения этнополитических конфликтов.

По духу чисто американский подход. Или НАТОвский, а может еще чей-нибудь, не знаю точно. Но американский однозначно.

Я читал публикации Тишкова по Северному Кавказу. Содержание не помню, но впечатление осталось очень разумное.

[Арон.]

Палеогенетика подтвердила важный вклад причерноморско-каспийских степняков в формирование генофонда европейцев
http://elementy.ru/news?newsid=432506
"Два больших международных исследовательских коллектива опубликовали результаты анализа геномов 170 обитателей различных районов Евразии, живших от 8000 до 2000 лет назад. Обе работы показали, что важнейшую роль в формировании генофонда современных европейцев сыграла произошедшая около 4500 лет назад массовая миграция кочевых скотоводов из Причерноморско-Каспийской степи («ямная культура») в Западную Европу, где потомки мигрантов сформировали «культуру шнуровой керамики», она же «культура боевых топоров». С большой вероятностью древнее нашествие степняков непосредственно связано с распространением в Западной Европе индоевропейских языков. Последующие миграции этих популяций в восточном направлении, по-видимому, объясняют происхождение синташтинской и афанасьевской культур, а также тохарских языков. Исследование показало, что генофонд современных европейцев (как западных, так и восточных) складывается из трех частей, смешанных в разных пропорциях у разных народов: первая часть — от палеолитических европейских охотников-собирателей, вторая — от неолитических переселенцев с Ближнего Востока, вместе с которыми в Европу пришло сельское хозяйство, третья — от причерноморских степняков бронзового века."

Есть интересная гипотеза акад.Иванова, что миграция индоевропейцев была вызвана т.н. "Черноморским потопом", произошедшим вследствии прорыва вод Мирового Океана в Чёрное Море 7500 лет назад (или несколько  раньше). Получается, что от этой гипотезы пора отказаться из-за несоответствия дат - 7500 и 4500 лет назад - никак не сходится.

[Арон.]

Палеогенетика подтвердила важный вклад причерноморско-каспийских степняков в формирование генофонда европейцев
http://elementy.ru/news?newsid=432506

Хорошая работа. Расставляет точки над i. Сколько лет велись споры, и вот начались содержательные и обоснованные ответы. Лишнее подтверждение, что наука, рано или поздно, но находит ответы на все нерешённые вопросы. Или, как писал старик Карл Маркс - "Человечество ставит перед собой только те задачи, которые может разрешить.

[Арон.]

Палеогенетика подтвердила важный вклад причерноморско-каспийских степняков в формирование генофонда европейцев
http://elementy.ru/news?newsid=432506

По отдельным народам тут интересно:
а) Баски. Язык у них ДОиндоевропейский, а генетически вклад ямной культуры (= индоевропейцев) тот же. что и остальных  этносов юго-западной Европы.
б) То же эстонцы. Язык у них финно-угорский, а доля праиндоевропейцев та же, что у литовцев, скандинавов и шотландцев.
И ещё у эстонцев максимальный вклад палеолитических охотников-собирателей. Вот, оказывается где остались истинные кроманьонцы !
г) Сардиния. А тут генетика, видать, не менялась со среднего неолита. То ли суровые сардинские мужики никого к себе не пустили , то ли не нужны никому не были  на своей Сардинии - сидят на своём острове и пускай себе сидят.

[aevin]

Директор Института этнологии и антропологии им. Миклухо-Маклая РАН В.А.Тишков получил Госпремию 2014 г. за достижения в области этнологии и социально-культурной антропологии, разработку метода этнологического мониторинга, предупреждения и разрешения этнополитических конфликтов.

По духу чисто американский подход. Или НАТОвский, а может еще чей-нибудь, не знаю точно. Но американский однозначно.

А чисто российский какой? С помощью отца, сына и святаго духа?
Слава богу, если гуманитарные проблемы у нас начинают анализировать технологично.

Работы Тишкова вполне патриотичны. Иначе бы не дали госпремию (надо понимать, за что она вообще дается).

Например, вот отрывок с его сайта:

"Для англоязычного издания  одной своей книги я предложил издателю заголовок «Пожар в умах. Этничность, национализм и конфликты в СССР и после него». Этим выражалась одна очень важная для меня мысль, что этнические конфликты – это не столько по поводу угнетения и неравенства, сколько по поводу идеологии разных «освободительных проектов». Западный издатель не хотел ставить под вопрос «историческую закономерность» распада СССР по этническим границам и поменял местами две части названия. "

[Lion]

А чисто российский какой? С помощью отца, сына и святаго духа?

Российский метод решения этнического вопроса имел три исторических фазы развития:

• до 1917 года -- имперская интеграция;
• от 1917 до 1991 -- советизация;
• в наши дни -- покупка "за бабло".

Распространение православия в этом плане было эффективно, в основном, в ранний доимперский период. Пока шла духовная ассимиляция "язычников". А где-то начиная с присоединения Казани пришлось с этим делом свернуться, мусульман массово "перековать" было невозможно. Но попытки эпизодически продолжались и сильно позже, например, в Польше. Вообще же это классический метод, используемый в те времена во всем мире. В цивилизованной Европе даже официально договорились до принципа "чья земля, того и вера" (точнее сказать, того и церковь), и аннексированные территории обрабатывались дустом церковниками страны-победителя. А сейчас этот принцип неформально трансформировался в "чья земля, того и телевизор"...


Но у нас основным отечественным методом было и остается другое -- интеграция лояльной части этнических элит в вертикаль власти. Взятие на службу. Это если говорить о стратегических методах решения вопроса, а не о примочках для контроля симптоматики... Тот национальный "пожар в умах" в конце восьмидесятых начался с развала вертикали управления страной, которому Горбачев ускорение придал.

[aevin]

А чисто российский какой? С помощью отца, сына и святаго духа?

Российский метод решения этнического вопроса имел три исторических фазы развития:

• до 1917 года -- имперская интеграция;
• от 1917 до 1991 -- советизация;
• в наши дни -- покупка "за бабло".

Третья фаза чем-то напоминает самую раннюю, доимперскую фазу - выплату дани.
Не хочется указывать пальцем, но думаю, все поняли о чем речь.