Мутагенез

Питер · августа 13, 2020, 10:28:04

Цитата: vit от августа 13, 2020, 10:18:18Цитировать (выделенное)
Ну так что - для каждого гена свой ИС ?
похоже каждому промотору свой МЭ.

Цитата: vit от августа 13, 2020, 10:18:18биология это наука наблюдательно-описательного характера,

Таки наблюдательно-описательный характер биологии говорит, что это не так. У E. coli примерно 500 ИС на 5000 генов.

Таки случайный твист по клаве нужен в образовательных целях. Могу вырезать кусок ДНК из бласта - это не поменяет сути вопроса. Сколько возможных сайтов встраивания в моем кусочке ?

vit · августа 13, 2020, 10:43:46

Цитата: Питер от августа 13, 2020, 10:28:04
Таки наблюдательно-описательный характер биологии говорит, что это не так. У E. coli примерно 500 ИС на 5000 генов.

конкретные подсчеты здесь не актуальны, у нас есть результат Ленского и Хофвегена, которые говорят что исов хватает на всех- броня крепка и ис3 наши быстры!
У нас есть репрессоры всех оперонов, репрессор состоит из куска днк для спецопознавания своего специфичного оператора и белков для активности, фактически это тот же ис или мэ, ну или составная часть к нему.

Питер · августа 13, 2020, 10:46:37

Цитата: vit от августа 13, 2020, 10:21:48правильно! но активация должна иметь смысл, случайные вставки принесут больше вреда чем пользы, правильная вставка 1, все остальные губительны, поэтому по стэ отбор должен работать на точность транспозиции, что он и сделал.

Опять же наблюдательно-описательная наука говорит о том, что в режиме миллионов клеток потеря сотен тысяч клеток в результате "плохих" транспозиций не является страшной опять же для популяции и вида. И если у пациента с гнойным перитонитом выживает в результате траспозиции одна бактерия при использовании антибиотика Х - то сепсис все равно будет.

Питер · августа 13, 2020, 10:50:27

Ну да, чего считать-то ? Не важно, сколько клеток было в эксперименте. Не важно, что кроме ИС есть другие механизмы. Не важно, что связывание того же lac репрессора имеет в основном случайное связывание с ДНК. Все - не важно. Важна только трактовка Vit,

При этом все-таки 500 ИС и 5000 генов - как быть с вашим утверждением, что для каждого гена свой ИС ?

василий андреевич · августа 13, 2020, 10:51:09

Цитата: vit от августа 13, 2020, 10:21:48по стэ отбор должен работать на точность транспозиции, что он и сделал.

Вопрос "не случайности" сводится к сигналу от конкретного места генома, пребывающему в состоянии возбуждения. Как, через каких агентов, средовые факторы могут отразиться на геноме?
Допущение "знаний" (информации) о среде в геном - абсурдно. И ему, геному, пофиг, какое изменение в среде так отразилось на феноме, что он испытывает стресс. Если вставка садится на случайное место и не репарируется, то грош цена такой мутации. Следовательно, пропускается до мутации только избранная. Чем избранная? (если статистика, конечно, как обычно, не врет)

vit · августа 13, 2020, 10:59:47

Цитата: Питер от августа 13, 2020, 10:46:37
Опять же наблюдательно-описательная наука говорит о том, что в режиме миллионов клеток потеря сотен тысяч клеток в результате "плохих" транспозиций не является страшной опять же для популяции и вида.

являясь плохими они включены в отбор, поэтому убираются , а остаются хорошие - безопасные.

vit · августа 13, 2020, 11:14:19

Цитата: Питер от августа 13, 2020, 10:50:27
связывание того же lac репрессора имеет в основном случайное связывание с ДНК.

вы неправильно прочитал, лак1 связывается неспецифично с днк и начинает по ней ползать, чтобы найти свой оператор.

ЦитироватьПри этом все-таки 500 ИС и 5000 генов - как быть с вашим утверждением, что для каждого гена свой ИС ?

Может быть не ис, а любой мэ или гпг. Решение в том, что ис или др. активно и специфично вставляется белком в нужный сайт для адаптации.

А 500 на 5000 или др. - это не важно:
1. цифры могут быть неправильные
2. 500 на1 сломаный промотор хватит. Всего похоже 700 оперонов есть, значит 700 промоторов, не все из них сломаны. 3.транспозазы тоже специфичны - циттранспозаза тащит ис3 на цитоперон.

Вариантов много.

Вообще эта система похожа на днк-рнк -полимеразу, скроее всего из них эти днк-белок комплексы и развились.

vit · августа 13, 2020, 11:21:17

Цитата: василий андреевич от августа 13, 2020, 10:51:09

Вопрос "не случайности" сводится к сигналу от конкретного места генома, пребывающему в состоянии возбуждения. Как, через каких агентов, средовые факторы могут отразиться на геноме?

хоть догма гласит, что информация передается от днк к белку, а не наоборот, отбор действует на белок и таким образом осуществляется обратная информация.

Evol · августа 13, 2020, 12:20:56

Цитата: vit от августа 13, 2020, 11:21:17хоть догма гласит, что информация передается от днк к белку, а не наоборот, отбор действует на белок и таким образом осуществляется обратная информация.

Вот это да!!!?

vit · августа 13, 2020, 12:21:48

МГЭ не может сам двигаться, значит транспозаза его активирует

vit · августа 13, 2020, 12:22:49

Цитата: Evol от августа 13, 2020, 12:20:56
Вот это да!!!?

вам тролить не надоело!!!?

троллинг, если сами не понимаете, это когда 0 информации и много эмоций

Evol · августа 13, 2020, 12:25:46

Может, тему в ненаучный перенести...

vit · августа 13, 2020, 12:27:42

Цитата: Evol от августа 13, 2020, 12:25:46
Может, тему в ненаучный перенести...

на каждом форуме есть свой троль

типа шут гороховый

Evol · августа 13, 2020, 12:50:46

vit, до прямых оскорблений я не опускался.
С тем Вы дали мне основание обратиться к администрации форума для того, чтобы обратить внимание на использованное Вами выражение.

vit · августа 13, 2020, 12:56:52

хоть догма гласит, что информация передается от днк к белку, а не наоборот, отбор действует на белок и таким образом осуществляется обратная информация.

если ктото из нормальных пользователей тоже не понял, поясню.

днк программирует белок, прошла мутация и новая, плохая днк стала прогроммировать плохой белок, клетка от этого пострадала в отборе и не дала потомства, соответственно плохой белок сделал так что плохая днк исчезла. Вот вам и обратная связь!

только троль :'(может это не понять.