Мутагенез

[Питер]

Экспрессия  гена   ИЗМЕНЯЕТСЯ   без    мутации.   Если  вы    поместите   две   клетки с  идентичным  геномом  в  разную  среду   -     экспрессия  гена   будет  разной    за  счет   ответа  на  внешнюю   среду.

[vit]

Экспрессия  гена   ИЗМЕНЯЕТСЯ   без    мутации.   Если  вы    поместите   две   клетки с  идентичным  геномом  в  разную  среду   -     экспрессия  гена   будет  разной    за  счет   ответа  на  внешнюю   среду.

наконец то вы поняли

[vit]

 Питер, а почему вы так упорно не хотите описать рэг коли при анаэробной утилизации цитрата?

[vit]

Reinterpreting Long-Term Evolution Experiments: Is Delayed Adaptation an Example of Historical Contingency or a Consequence of Intermittent Selection? https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26883821/

Быстрая эволюция, по-видимому, включает отбор дубликатов всего цитрусового локуса, которые слишком нестабильны, чтобы вносить вклад, когда отбор осуществляется короткими импульсами.

не похоже на описание случайного мутагенеза

[Питер]

Мы  в  системе  с    цитратом  имеем  мутации.   
У  нас  нет  роста    на  среде с   цитратом    без  мутаций  -     в  среде с  кислородом    связывние   с  ним  активирует  репрессор,  который   блокирует  промотор    цитратного  оперона.  Перенсете  клетки  в   строго   анаэробные   условия   -     цитратный  оперон  начнет  работать.

При    мутации          появляется  новый  промотор    для   этого   оперона,  который  не   чувствителен к   кислороду.   Либо  за  счет  переноса  гена      транспорта  citT   под  другой  промотор,  или  за  счет     переноса  в   этот  оперон   другого  промотора.  Как   итог  -    цитрат  используется     независимо   от  уровня   кислорода.

[Питер]

Там  есть  слово   "ОТБОР".    Есть  много    разных  мутаций   -    но  отбор  подхватывает   только      определнный   важный    для   данного  фенотипа  набор  мутаций.  Ленски  секвенировал   не   citT+     клетки  и  видел  там    накопление          мутаций     по  всему  геному    E. coli.

[Alexeyy]

Reinterpreting Long-Term Evolution Experiments: Is Delayed Adaptation an Example of Historical Contingency or a Consequence of Intermittent Selection? https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26883821/

Быстрая эволюция, по-видимому, включает отбор дубликатов всего цитрусового локуса, которые слишком нестабильны, чтобы вносить вклад, когда отбор осуществляется короткими импульсами.

не похоже на описание случайного мутагенеза

Без случайности и отбора по ней и такая эволюция была бы невозможной. Это - не не случайная эволюция, а направленная.

[vit]

При мутации появляется  новый  промотор    для   этого   оперона

у каждого гена и оперона свой строго специфичный промотор и

Коровая РНК-полимераза бактерий (состоящая из субъединиц α2ββ'ω) может инициировать транскрипцию в любом месте генома. Однако, в клетке инициация происходит только в промоторных участках. Такая специфичность обеспечивается σ-субъединицей (σ-фактор), которая в комплексе с коровым ферментом образует холофермент. Основным σ-фактором клеток Escherichia coli является σ70-субъединица[1].

Классический (σ70) промотор представляет собой две консервативные последовательности длиной по 6 нуклеотидов, расположенные выше сайта начала транскрипции на 10 и 35 п.о., разделенные 17 нуклеотидами. https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9F%D1%80%D0%BE%D0%BC%D0%BE%D1%82%D0%BE%D1%80


вы хотите сказать что все это мутации прошли случайно за 12 делений?

[vit]

Ленски  секвенировал   не   citT+     клетки  и  видел  там    накопление          мутаций     по  всему  геному    E. coli.

амплификации еще были?

[vit]

Без случайности и отбора по ней и такая эволюция была бы невозможной. Это - не не случайная эволюция, а направленная.

в любом механизме даже швейцарских часах есть случайности и отбор

[Alexeyy]

Ну так давайте и будем называть вещи своими именами, чтобы и самим не путаться и других не путать. Например, Антон, по крайней мере до недавнего времени, полагал, что (с некоторых пор) случайность (в смысле ненаправленная случайность) абсолютно не играет никакой роли (через отбор) в механизме самонаправления эволюции.

[vit]

Ленски  секвенировал   не   citT+     клетки  и  видел  там    накопление          мутаций     по  всему  геному    E. coli.

В нескольких повторных опытах тот же эффект был достигнут без дупликации — благодаря встраиванию мобильного генетического элемента IS3 в кодирующую часть гена citG, расположенного по соседству с citT (на рисунке слева). В этом мобильном элементе как раз имеется подходящий промотор.https://elementy.ru/novosti_nauki/431898/V_dolgosrochnom_eksperimente_zafiksirovano_poetapnoe_formirovanie_evolyutsionnogo_novshestva

[vit]

Антон

[vit]

 В этом мобильном элементе как раз имеется подходящий промотор.https://elementy.ru/novosti_nauki/431898/V_dolgosrochnom_eksperimente_zafiksirovano_poetapnoe_formirovanie_evolyutsionnogo_novshestva

интересно что он там до этого делал

[Питер]

Знаете   ли,      огромная   часть   мобильных   элементов  имеет   собственные   промоторы.   Которые   нужны  им  для     экспрессии       собственных   генов   транспозона.  Которые  им   нужны    для   своего  размножения.
Встройка     мобильного   элемента   -  однократное    мутационное   событие.  Не   было   элемента   -  появился.   При  этом  происходит  комплекс   разрывов   хромосом,  достройки   концов,  лигирования   -  но   это    единый  процесс  встройки.