Мутагенез

[василий андреевич]

достаточно с них живой клетки

Ну тогда Вам и отвечать за ихних генных инженеров 
  Обменяться генами в том мире было проще чем сходить к зубному в нашем? Но ведь любой геном избыточен по отношению к тем условиям, что нужны радетелям адаптогенеза. И гпг становится столь же маловероятен, как и "удачная" мутация.
  Синтез сложности архималовероятен. Но он состоялся. Следовательно, не синтезом единым живем. Геному надо так распадаться на части, что бы распад приводил к неизбежному синтезу. Жаль, что ничего путнее присказки "свита делает короля" и туманных рассуждений о росте информации за счет отторжения избыточной, я предложить не могу.

[Alexeyy]

Вы согласны с постулатом изменчивости в стэ?

В смысле, что она существует? Конечно.

[vit]

достаточно с них живой клетки

Ну тогда Вам и отвечать за ихних генных инженеров 
  Обменяться генами в том мире было проще чем сходить к зубному в нашем? Но ведь любой геном избыточен по отношению к тем условиям, что нужны радетелям адаптогенеза. И гпг становится столь же маловероятен, как и "удачная" мутация. 

https://www.youtube.com/watch?v=QEQ_jqA_f1M&t=36s

[vit]

Вы согласны с постулатом изменчивости в стэ?

В смысле, что она существует? Конечно.

изменчивость по стэ=сэс=эб=г и др. современных дисциплин связанных с видообразованием, происходит за счет стойких, необратимых изменений генотипа - мутаций, мутации бывают точечными и рекомбинантными, ну и делециями, но их пока не рассматриваем. Любое современное, академическое определение мутации относится к стэ.


В настоящее время существует несколько подходов для объяснения природы и механизмов образования мутаций. Общепринятой, в настоящее время, является полимеразная модель мутагенеза. Она основана на идее о том, что единственной причиной образования мутаций являются случайные ошибки ДНК-полимера.


https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D1%83%D1%82%D0%B0%D1%86%D0%B8%D1%8F

[Питер]

Из   той  же   вики

Связь мутаций с репликацией ДНК
Многие спонтанные химические изменения нуклеотидов приводят к мутациям, которые возникают при репликации. Например, из-за дезаминирования цитозина напротив гуанина в цепь ДНК может включаться урацил (образуется пара У-Г вместо канонической пары Ц-Г). При репликации ДНК, напротив урацила в новую цепь включается аденин, образуется пара У-А, а при следующей репликации она заменяется на пару Т-А, то есть происходит транзиция (точечная замена пиримидина на другой пиримидин или пурина на другой пурин).

Связь мутаций с рекомбинацией ДНК
Из процессов, связанных с рекомбинацией, наиболее часто приводит к мутациям неравный кроссинговер. Он происходит обычно в тех случаях, когда в хромосоме имеется несколько дуплицированных копий исходного гена, сохранивших похожую последовательность нуклеотидов. В результате неравного кроссинговера в одной из рекомбинантных хромосом происходит дупликация, а в другой — делеция.

Связь мутаций с репарацией ДНК
Спонтанные повреждения ДНК встречаются довольно часто, такие события имеют место в каждой клетке. Для устранения последствий подобных повреждений имеются специальные репарационные механизмы (например, ошибочный участок ДНК вырезается и на этом месте восстанавливается исходный). Мутации возникают лишь тогда, когда репарационный механизм по каким-то причинам не работает или не справляется с устранением повреждений. Мутации, возникающие в генах, кодирующих белки, ответственные за репарацию, могут приводить к многократному повышению (мутаторный эффект) или понижению (антимутаторный эффект) частоты мутирования других генов. Так, мутации генов многих ферментов системы эксцизионной репарации приводят к резкому повышению частоты соматических мутаций у человека, а это, в свою очередь, приводит к развитию пигментной ксеродермы и злокачественных опухолей покровов. Мутации могут появляться не только при репликации, но и при репарации — эксцизионной репарации или при пострепликативной.

[vit]

Из   той  же   вики

У-Г вместо канонической пары Ц-Г

Из   той  же   вики
Урацил (2,4-диоксопиримидин) — пиримидиновое основание, которое является компонентом рибонуклеиновых кислот и как правило отсутствует в дезоксирибонуклеиновых кислотах, входит в состав нуклеотида. В составе нуклеиновых кислот может комплементарно связываться с аденином, образуя две водородные связи.[5]

у-г не может образовать правильную 2структуру и легко обнаружиться мутрепараторами.

то что вы скопировали является ошибками-случайностями, они конечно могут произойти, но должны соответствовать случайным закономерностям.

[Питер]

Что    такое    случайность-закономерность ?

[vit]

Появление/повторение и т.д.  случайного события должно соответствовать статистической вероятности. Классический пример с 6-гранным кубиком, каждая из его сторон, при случайном вбрасывании, выпадает с вероятностью 1 к 6, т.е. 100%/6=16%.

любое достоверное различие гововит о неслучайности=закономерности.

[Питер]

Это  все   случайность,  а  не    закономерность.

[vit]

а 46 из 46 и 12 из 187 это закономерность

[Питер]

Представьте    себе    простую    ситуацию.
Клетки  (миллион)    переместили    на  новую   среду,  в  котором  из  всей   еды    есть  только   соединение   Х.  У   нее   в  геноме    есть   100   генов. Только     один   из   этих  генов  связан   с  поеданием  Х.   Мы   ждем     неделю,   отбираем   выросшие   колонии (их  немного)    -   и  о   чудо,   разные     по    точной  молекулярной  природе мутации   есть  только в  гене  поедания   Х.  Причем  все  они       повышают    поедание  Х.  Закономерность  или   случайность ?

[vit]

нужно число опытов х 46 и генов х80=8000 как вы недавно писали и получиться
8000х46=40000х1500 (дуплекация генов в цитт)= 1/60 000 000 , а у ХВ 1/1 - конечно случайность

46 новых видов за неделю

еще в 82м писали что это действие галооперона тогда про цитоперон не знали 

на это можно бы было не обратить внимания, если бы опытов было 1000и, с 1 мутантом в 1 нуклеотидной замене, но амплификации по 1500 н. это уж слишком для случайности...

[Питер]

Вы  считаете   число  генов   и  число  опытов     -  но    почему-то  забываете     о  числе   подопытных. У    99,99999999 ....     вошедших в  опыт   клеток    ничего    не  произошло.   А    произошло  -  естественно,  по  гену  citT.     Замените   цитрат  на    другое  вещество  -    у  вас       будет  идти  отбор  по  другому   гену.   И  тоже   будет  видимость  закономерности  ....

[vit]

У    99,99999999 ....     вошедших в  опыт   клеток    ничего    не  произошло.   

это голословное утверждение, не соответствует результатам опыта, если бы вы были правы, мы бы не имели 46 из 46

[Питер]

Авторы   работы    работали  не  с  единичными  клетками    -   а  с   бактериальной   кульутрой    в   жидкой   среде.
Из  Ховфегена
Cells were resuspended in 50 ml of M9C broth in 250-ml Erlenmeyer flasks to give a final concentration of 5.0 × 107 to 7.0 × 107 CFU/ml and incubated at 37°C with aeration at 160 rpm.
То  есть   от  50   до 70   миллионов   клеток\мл    .  Ниже  там  в   подписях   к  рисункам      есть   указания   более  точные      -  про  сотни   тысяч  клеток  на   одну   колбу.
А    вышли   -  единичные  citT+    колонии.  Причем   опять  же  не  сразу   вдруг  ...