Мутагенез

Автор vit, мая 25, 2020, 18:43:18

« назад - далее »

vit

наверно нужно промежуточные выводы по прокариотам начать формулировать:

- Одиночные, точечные мутации, которые по СТЭ - главный механизм эволюции, случающиеся из-за ошибок репарации репликации днк, являются крайне редкими и исправляются на 10 000 000 000 000 000 на 1 деление. Таких больших геномов не существует, поэтому и такие мутации крайне редки.

- Вероятность множественных точечных мутаций( дуплекации, амплификации и т.п..) уменьшается в пропорциональной зависимости от числа повторов мутаций - в расчетах, в реальности близки к 0.

-  Дуплекации, амплификации и др. множественные повторения части генома, являются следствием: разных форм горизонтального переноса генов, действия оперонов, мобильных генэлементов и др.. и не являются случайными мутациями...

Alexeyy

Цитата: vit от июля 21, 2020, 11:53:25Дуплекации, амплификации и др. множественные повторения части генома, являются следствием: разных форм горизонтального переноса генов, действия оперонов, мобильных генэлементов и др.. и не являются случайными мутациями...
А какие мутации яляются случайными? В смысле что такое случайные мутации?

Цитата: vit от июля 21, 2020, 11:53:25Одиночные, точечные мутации, которые по СТЭ - главный механизм эволюции
А где в постулатах СТЭ написано, что одиночные, точечные мутации - главный механизм эволюции?

Питер

В   геноме  человека  есть  масса   дупликаций  и  делеций   и  нет  горизонтального  переноса .   
Дупликация   -   это  не  много  точковых  мутаций    в  одном   месте.  Это    всего-навсего  одна      рекомбинация.   ОДНА.
А  оно  вам  надо  ?

vit

Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 12:13:35
В смысле что такое случайные мутации?
при случайных явлениях отсутствует причинно-следственная связь, а если она есть - значит это не случайное явление. Т.е. если колям дать цитрат и они быстро, т.е. быстрее, чем расчет случайной вероятности, научатся его купать то это не случайная мутация.

Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 12:13:35
А где в постулатах СТЭ написано, что одиночные, точечные мутации - главный механизм эволюции?
случайность мутаций это главный принцип стэ, случайными могут быть только одиночные мутации...

василий андреевич

  Случайно то событие, которое не прогнозируется в виде пространственно-временной координаты. Концентрация случайных событий прямо пропорциональна хаотической составляющей среды, например, тепла. Насколько место тепла может выполнять стрессовый фактор?

vit

прогнозируется все , что может произойти

Alexeyy

Цитата: vit от июля 21, 2020, 17:08:36
Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 12:13:35
В смысле что такое случайные мутации?
при случайных явлениях отсутствует причинно-следственная связь, а если она есть - значит это не случайное явление. Т.е. если колям дать цитрат и они быстро, т.е. быстрее, чем расчет случайной вероятности, научатся его купать то это не случайная мутация.
А как же в стохастических закономерностях? Там причинная связь есть, но она там – не детерминированная – стохастическая. Что ли события этих закономерности, в соответствии с этим определением, называть не случайными? Тогда почему закономерности называют стохастическими? В https://ru.wikipedia.org/wiki/Стохастичность пишут, что стохастичность означает случайность.


Цитата: vit от июля 21, 2020, 17:08:36
Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 12:13:35
А где в постулатах СТЭ написано, что одиночные, точечные мутации - главный механизм эволюции?
случайность мутаций это главный принцип стэ, случайными могут быть только одиночные мутации...
Но тогда в постулатах СТЭ не написано, что одиночные, точечные мутации - главный механизм эволюции, а то, что это, действительно, так – это, на Ваш взгляд, следствие постулатов СТЭ, а не их содержание. Да и разве в постулатах СТЭ есть вообще понятие об одиночной мутации?

Питер

При     любом  отборе  есть  причинно-следственная   связь.    Есть  фактор   отбора   -   появятся "правильные"     варианты.   Другое    дело,  что       будет   создана   СЛУЧАЙНЫМ   образом  масса   разных   генетических   вариантов   -  а    узнаем  мы   только  отобранный.     Все    прочие    пойдут  в  педальное   ведро  эволюции. 
А  оно  вам  надо  ?

vit

Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 17:56:18
  А как же в стохастических закономерностях? link=topic=11439.msg244735#msg244735 date=1595322815]
Да и разве в постулатах СТЭ есть вообще понятие об одиночной мутации?
имеется ввиду что случайные явления определяются в их плоскостях, напр. если мы говорим о мутациях днк, то рассматриваем случайный характер ошибок которые делает днк-полимераза и мут-репараторы, а не броуновское движение.
ЦитироватьДа и разве в постулатах СТЭ есть вообще понятие об одиночной мутации?

Механизмы мутагенеза

Последовательность событий, приводящая к мутации (внутри хромосомы) выглядит следующим образом: происходит повреждение ДНК (если повреждение ДНК не было корректно репарировано, оно приведет к мутации); в случае, если повреждение произошло в незначащем (интрон) фрагменте ДНК или если повреждение произошло в значащем фрагменте (экзон) и, вследствие вырожденности генетического кода, не произошло нарушения, то мутации образуются, но их биологические последствия будут незначительными или могут не проявиться.

Мутагенез на уровне генома также может быть связан с инверсиями, делециями, транслокациями, полиплоидией и анеуплоидией, удвоением, утроением (множественной дупликацией) некоторых хромосом и т. д.

В настоящее время существует несколько подходов, использующихся для объяснения природы и механизмов образования точечных мутаций. В рамках общепринятой, полимеразной модели считается, что единственной причиной образования мутаций замены оснований являются спорадические ошибки ДНК-полимераз. В настоящее время такая точка зрения является общепринятой[5]. https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D1%83%D1%82%D0%B0%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7#%D0%9C%D0%B5%D1%85%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B7%D0%BC%D1%8B_%D0%BC%D1%83%D1%82%D0%B0%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7%D0%B0


vit

Цитата: Питер от июля 21, 2020, 15:09:26
В   геноме  человека  есть  масса   дупликаций  и  делеций   и  нет  горизонтального  переноса .   
Дупликация   -   это  не  много  точковых  мутаций    в  одном   месте.  Это    всего-навсего  одна      рекомбинация.   ОДНА.

у прокариот нет рекомбинации, есть репарация ошибок разрыва хромосомы - разрывы случайны, а рекомбинация это закономерный процесс при кроссинговере у эукариот и гпг у прокариот.

ЦитироватьПри     любом  отборе  есть  причинно-следственная   связь.
мы говорим про мутагенез , а не отбор.

Alexeyy

Цитата: vit от июля 21, 2020, 19:14:11
ЦитироватьДа и разве в постулатах СТЭ есть вообще понятие об одиночной мутации?

Механизмы мутагенеза

Последовательность событий, приводящая к мутации (внутри хромосомы) выглядит следующим образом: происходит повреждение ДНК (если повреждение ДНК не было корректно репарировано, оно приведет к мутации); в случае, если повреждение произошло в незначащем (интрон) фрагменте ДНК или если повреждение произошло в значащем фрагменте (экзон) и, вследствие вырожденности генетического кода, не произошло нарушения, то мутации образуются, но их биологические последствия будут незначительными или могут не проявиться.

Мутагенез на уровне генома также может быть связан с инверсиями, делециями, транслокациями, полиплоидией и анеуплоидией, удвоением, утроением (множественной дупликацией) некоторых хромосом и т. д.

В настоящее время существует несколько подходов, использующихся для объяснения природы и механизмов образования точечных мутаций. В рамках общепринятой, полимеразной модели считается, что единственной причиной образования мутаций замены оснований являются спорадические ошибки ДНК-полимераз. В настоящее время такая точка зрения является общепринятой[5]. https://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9C%D1%83%D1%82%D0%B0%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7#%D0%9C%D0%B5%D1%85%D0%B0%D0%BD%D0%B8%D0%B7%D0%BC%D1%8B_%D0%BC%D1%83%D1%82%D0%B0%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7%D0%B0
Ну это же википедийная статья по механизму мутагенеза, а в этой цитате нет никакой отсылки к постулатам СТЭ, в которых бы вводилось понятие единичной мутации.

Цитата: vit от июля 21, 2020, 19:14:11имеется ввиду что случайные явления определяются в их плоскостях, напр. если мы говорим о мутациях днк, то рассматриваем случайный характер ошибок которые делает днк-полимераза и мут-репараторы, а не броуновское движение.
А разве броуновское движение не может провоцировать ошибки? По идее, слишком интенсивное броуновское движение будет мешать репликации: ведь в пределе (очень высокие температуры) броуновское движение вообще репликацию сделает невозможной и, в конце концов, оно будет вносить столь большой хаос, что начнёт приводить к распаду макроструктур.


vit

Цитата: Alexeyy от июля 21, 2020, 19:27:44

А разве броуновское движение не может провоцировать ошибки?

считается что общие факторы оказывают одинаковое влияние на процесс в целом

василий андреевич

Цитата: vit от июля 21, 2020, 17:53:59прогнозируется все , что может произойти
Понятно. Если кто-то кое-где у нас порой... "одна бабка в автобусе сказала".

Alexeyy

Цитата: vit от июля 21, 2020, 19:37:59

материалом для эволюции являются мутационная и рекомбинационная изменчивость;

Да, но там же (в основных положениях СТЭ по ссылке) ничего не говорится о единичной мутации.