paleoforum.ru

Форумы сайта «Проблемы эволюции» => Форум портала «Антропогенез.ру» => Тема начата: rozenfag от декабря 05, 2013, 06:07:48

Название: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: rozenfag от декабря 05, 2013, 06:07:48
Гейдельбергский человек оказался родственником денисовского (http://www.gazeta.ru/science/news/2013/12/04/n_5792909.shtml)

ЦитироватьНемецким ученым удалось восстановить геном жившего 400 тыс. лет назад гейдельбергского человека (Homo heidelbergensis), останки которого обнаружили в испанской пещере Сима де лос Уэсос, сообщается в статье, опубликованной в научном журнале Nature.

Оригинальная статья на английском(для полного доступа требуется подписка):

A mitochondrial genome sequence of a hominin from Sima de los Huesos (http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature12788.html)

Сообщение на сайте Общества Макса Планка:

Oldest hominin DNA sequenced (http://www.mpg.de/7637951/hominin_from_sima_de_los_huesos)

На данный момент это древнейший секвенированный геном человека(хотя всего лишь и митохондриальный).

(http://2.bp.blogspot.com/-YYZqDsoA-ZI/Up9xPJqmsgI/AAAAAAAAJag/y7TpjRM_Lrc/s400/sima.png)
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Питер от декабря 05, 2013, 06:30:32
Если  кому  нужно -  полный  текст  могу  скинуть в  почту,  здесь   выложить  не  могу -  размер  файла  слишком  велик.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Gilgamesh от декабря 05, 2013, 08:06:45
Мы пойдем другим путем.

http://files.mail.ru/C3959C0C4A8E44C190757595BDFC884A
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Лада от декабря 05, 2013, 16:46:14
Антропогенез становится всё более запутанным...
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Murderface от декабря 15, 2013, 12:13:53
А нет информации о том когда будет ядерный геном расшифрован?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 15, 2013, 12:37:51
А человечков с о. Флорес почему не исследуют? ДНК плохо сохранилась?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 15, 2013, 13:02:25
А еще, конечно же, очень не терпится узнать результаты секвенирования ядерного генома сабжевого вида и сравнение с геномами современных людей.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Gilgamesh от декабря 15, 2013, 13:26:59
Цитата: Dessa от декабря 15, 2013, 12:37:51
А человечков с о. Флорес почему не исследуют? ДНК плохо сохранилась?

Да. Тропики клятые.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 16, 2013, 01:11:39
Пока до статьи руки не дошли - скажите, это именно гейдельбергский человек?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dead Cat от декабря 16, 2013, 13:00:59
Уважаемые форумчане, я правильно понял, что гейдельбержец отныне не является предком неандертальца? Неандерталец из каких-до других европейских-ближневосточных эректусов получился??
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 16, 2013, 17:43:03
Цитата: Dead Cat от декабря 16, 2013, 13:00:59
Уважаемые форумчане, я правильно понял, что гейдельбержец отныне не является предком неандертальца? Неандерталец из каких-до других европейских-ближневосточных эректусов получился??

А как можно судить об этом, не имея данных по ядерному геному?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Humulus от декабря 16, 2013, 17:49:08
Цитата: Dessa от декабря 16, 2013, 17:43:03
А как можно судить об этом, не имея данных по ядерному геному?
Видимо, по анализу данных митохондриальных ДНК.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dead Cat от декабря 16, 2013, 18:31:23
Цитата: Dessa от декабря 16, 2013, 17:43:03
А как можно судить об этом, не имея данных по ядерному геному?
Наверно также, как авторы судят о большом родстве с денисовцем:
complete mitochondrial genome sequence of a hominin from Sima de los Huesos and show that it is closely related to the lineage leading to mitochondrial genomes of Denisovans9, 10, an eastern Eurasian sister group to Neanderthals.
Если мтДНК у Денисовца, так сказать, "гейдельбержская", а у Неандертальца - нет, то напрашивается вопрос, кто были "мамами" неандетальцев, кто их Евы :)
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Humulus от декабря 16, 2013, 21:59:21
Жаль, что эту "яму костей" не нашли раньше, был бы не гейдельбергский (не выговорить!), а симаделос-уесоский человек, почти по-русски :)
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Alexy от декабря 17, 2013, 00:33:12
Ежели Сима де лос Уэсос - это в Испании (суде по звучанию и написанию), то из древа, нарисованного в первом сообщении этой темы напрашивается вывод, что неандер наиболее вероятно тоже родом из Африки
Цитата: Dessa от декабря 15, 2013, 12:37:51А человечков с о. Флорес почему не исследуют? ДНК плохо сохранилась?
А какие-то ошметки ДНК сохранились все-таки? Есть ли надежда, что по маленьким ошметкам, принадлежавшим разным клеткам, когда-то воссоздадут целое (полностью какую- то хромосому или даже весь геном)?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: идрис от декабря 17, 2013, 02:10:59
Конечно не имею отношения к антропологии. Но боюсь дело серьезнее, чем какой "вид" чей предок. Посмотрите какие выводы по Дманиси и всем древним черепам. По молодым черепам все ясно что нет никаких отдельных видов сапиенса, неандертальца, денисовца, все эти группы свободно скрещивались и их следы есть в современных людях. Теперь и за средние черепа взялись (условно среднеплейстоценовые). Когда особь "по ряду признаков близкая к неандертальцам" не имеет к неандертальцам отношения, признаки понятное дело внешние, фенотипические то есть. Как я понимаю наши генетики и примкнувшие к ним ребята семимильными шагами пересматривают всю систематику всех видов на генеалогическом древе человека. И вероятно учебники по биологии которые напишут через 10 лет будут радикально отличаться по этому вопросу, от того что написано в современных учебниках.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 17, 2013, 12:33:48
жалко им, наверное, зубик флоресца просверлить
м.б. и не пытались ДНК выделить.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dead Cat от декабря 17, 2013, 15:53:55
Цитата: идрис от декабря 17, 2013, 02:10:59
По молодым черепам все ясно что нет никаких отдельных видов сапиенса, неандертальца, денисовца, все эти группы свободно скрещивались и их следы есть в современных людях.

Ну это имхо уж слишком, ведь нас с неандертальцами и денисовцами отделяли сотни тыс лет эволюции, и никакого свободного скрещивания не было, все копили отличия и удалялись друг от друга, пока не встретились. Нас разделяли с неандертальцами и денисовцами бОльшие сроки изоляции, чем белого и бурого медведей, которые тоже могут скрещиваться, но никто их не считает одним видом.

Вообще странно: в сабже денисовцы называются "сестринской группой" неандетальцам, а согласно их же филогенетическому дереву, с неандертальцами именно мы братья-сестры, а денисовцы и гейдельбержцы наша самая дальняя родня. Пишут, что с денисовцами и гейдельбержцем мы разошлись 0,6-1,3 млн лет назад, а неандертальцами 0,3-0,6.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dead Cat от декабря 17, 2013, 16:22:12
Цитата: Alexy от декабря 17, 2013, 00:33:12
Ежели Сима де лос Уэсос - это в Испании (суде по звучанию и написанию), то из древа, нарисованного в первом сообщении этой темы напрашивается вывод, что неандер наиболее вероятно тоже родом из Африки
Либо:
Сначала одна разновидность эректусов упилила в Европу, где по-пути стала Гейдельберцами, имела какое-то родство с более поздними денисовцами, и никак не является предками Неандертальцев.

Затем очередной какой-то эректус уходит из Африки 0,3-0,6 млн лет назад, оставшиеся в Африке становятся сапиенсами, а этот второй эректус становится неандертальцем.

А уж потом в Европу валим уже мы, заставая там потомков первого поколения мигрантов, в виде Денисовцев, второго, в виде Неандертальцев, и сливаемся с ними в страстных объятьях.

Если это всё не так, то надо признавать, что Неандертальцы сформировались в Африке. Что врядли.

Как было бы здорово, если бы научная редакция портала прокомментировала всё это безобразие :)
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Питер от декабря 17, 2013, 17:04:58
Alexy,    ДНК   даже  выделенная  из  крови  современного  человека,  всегда  принадлежит  разным  клеткам.  Ошметки  -    в  основном  ДНК    из Сима  представлена   короткими  фрагментами (с  длиной  менее  50 пар).  Это  позволяет  читать     фрагменты с  двух  концов в  один  прогон   без    дополнительной  фрагментации  - что  повышает  качество   чтения. С  другой  стороны,  уровень   деаминирования  С   очень  высок  -  что  повышает  вероятность  ошибок  при  чтении.  В  общем     успех   фантастический  -  и  карты   легли  удачно  для  сохранности  ДНК.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dude от декабря 17, 2013, 19:55:41
Вообще, интересно то, что агрессивное освоение территорий с выдавливанием конкурента на периферию, приписываемое сапиенсу в отношении неандертальца, первыми, похоже, произвели неандертальцы в отношении денисовцев :), ибо те, судя по уэсосу, коренные европейцы, но жившие на момент прихода сапиенсов уже в азии, оставив свой дом неандерам.
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 17, 2013, 20:16:33
Цитата: Dude от декабря 17, 2013, 19:55:41
Вообще, интересно то, что агрессивное освоение территорий с выдавливанием конкурента на периферию, приписываемое сапиенсу в отношении неандертальца, первыми, похоже, произвели неандертальцы в отношении денисовцев :), ибо те, судя по уэсосу, коренные европейцы, но жившие на момент прихода сапиенсов уже в азии, оставив свой дом неандерам.

А достаточно ли находок, чтобы говорить, что кто-то кого-то куда-то выселил?
Я так понимаю, есть отдельные пещеры, отдельные останки. Большая часть всего интересного еще не найдена. М.б. они жили бок о бок?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dude от декабря 17, 2013, 20:35:33
Цитата: Dessa от декабря 17, 2013, 20:16:33
Цитата: Dude от декабря 17, 2013, 19:55:41
Вообще, интересно то, что агрессивное освоение территорий с выдавливанием конкурента на периферию, приписываемое сапиенсу в отношении неандертальца, первыми, похоже, произвели неандертальцы в отношении денисовцев :), ибо те, судя по уэсосу, коренные европейцы, но жившие на момент прихода сапиенсов уже в азии, оставив свой дом неандерам.

А достаточно ли находок, чтобы говорить, что кто-то кого-то куда-то выселил?
Я так понимаю, есть отдельные пещеры, отдельные останки. Большая часть всего интересного еще не найдена. М.б. они жили бок о бок?

Про расселение сапиенсов в Европе тоже летописей никто не писал. Та же самая область предположений.  :)
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Dessa от декабря 19, 2013, 19:48:26
Геном неандертальца подтвердил существование неизвестного вида древних людей
http://www.gazeta.ru/science/news/2013/12/18/n_5826725.shtml
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Alexy от декабря 20, 2013, 01:02:38
Цитата: Питер от декабря 17, 2013, 17:04:58Alexy,    ДНК   даже  выделенная  из  крови  современного  человека,  всегда  принадлежит  разным  клеткам.  Ошметки  -    в  основном  ДНК    из Сима  представлена   короткими  фрагментами (с  длиной  менее  50 пар).  Это  позволяет  читать     фрагменты с  двух  концов в  один  прогон   без    дополнительной  фрагментации  - что  повышает  качество   чтения. С  другой  стороны,  уровень   деаминирования  С   очень  высок  -  что  повышает  вероятность  ошибок  при  чтении.  В  общем     успех   фантастический  -  и  карты   легли  удачно  для  сохранности  ДНК
Про ошметки я спрашивал касательно флоресского человечка
Есть ли там хоть какие-то фрагменты ДНК? ли она вся нечисто пропала? Если ошметки ДНК остались, то есть ли надежда когда-либо восстановить из ошметков геном, хромосому или хотя-бы довольно длинный фрагмент хромосомы?
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: Alexy от декабря 20, 2013, 01:05:30
Цитата: Dead Cat от декабря 17, 2013, 16:22:12
Цитата: Alexy от декабря 17, 2013, 00:33:12
Ежели Сима де лос Уэсос - это в Испании (суде по звучанию и написанию), то из древа, нарисованного в первом сообщении этой темы напрашивается вывод, что неандер наиболее вероятно тоже родом из Африки
...
Затем очередной какой-то эректус уходит из Африки 0,3-0,6 млн лет назад, оставшиеся в Африке становятся сапиенсами, а этот второй эректус становится неандертальцем...
Меня вобщем-то не очень интересовало, где кто кем становится, а только где предки неандертальцев отделились от предков всех остальных известных гоминид - по моему скорее всего в Африке
Название: Re: Секвенирована ДНК гейдельбергского человека
Отправлено: chief от декабря 20, 2013, 20:45:59
Цитата: Dessa от декабря 17, 2013, 12:33:48
жалко им, наверное, зубик флоресца просверлить
м.б. и не пытались ДНК выделить.

Пытались, и не раз: http://antropogenez.ru/single-news/article/54/

Пока что глухо... Условия неподходящие.