paleoforum.ru

Форумы сайта «Проблемы эволюции» => Форум сайта «Проблемы эволюции» => Тема начата: pan от сентября 18, 2013, 00:35:45

Название: рибозим
Отправлено: pan от сентября 18, 2013, 00:35:45
Вопросы, интересные участнику <PAN>

1. Какова же длина самого короткого из известных рибозимов?
2. Какие возражения выдвигались против гипотезы РНК-мира?

3. (Правда, это не совсем биология...) - А известно ли что-нибудь об автокаталитических ЯДЕРНЫХ реакциях (АЯР)?
   При каких условиях они могли бы происходить?
4. И возможны ли при АЯР изменчивость и отбор?
Название: Re: рибозим
Отправлено: AdmiralHood от сентября 20, 2013, 18:53:44
Как вы себе представляете автокаталитическую ядерную реакцию? К одному ядру подкатывает другое и вызывает деление первого с появлением копии ядра 2 + прочая дребедень?
Я1 + Я2 = 2 Я2 + прочее?

Единственное, что приходит в голову — это цепная реакция в уране под действием нейтронов, которая приводит к размножению нейтронов. Но это вряд ли можно назвать автокаталитической реакцией, это скорее похоже на вирусную инфекцию :~)
Название: Re: рибозим
Отправлено: Дж. Тайсаев от сентября 20, 2013, 19:04:11
Цитата: AdmiralHood от сентября 20, 2013, 18:53:44
Как вы себе представляете автокаталитическую ядерную реакцию? К одному ядру подкатывает другое и вызывает деление первого с появлением копии ядра 2 + прочая дребедень?
Я1 + Я2 = 2 Я2 + прочее?

Единственное, что приходит в голову — это цепная реакция в уране под действием нейтронов, которая приводит к размножению нейтронов. Но это вряд ли можно назвать автокаталитической реакцией, это скорее похоже на вирусную инфекцию :~)

Я знаю что вы профи, но всё таки посмотрите в инете например про гиперциклы Эйгена, там классический автокатализ, думаю, что всё так и было, иначе времени бы попросту не хватило на абиогенез
Название: Re: рибозим
Отправлено: AdmiralHood от сентября 22, 2013, 03:19:43
Цитата: Дж. Тайсаев от сентября 20, 2013, 19:04:11
про гиперциклы Эйгена, там классический автокатализ
В том, что автокаталитические циклы на молекулярном уровне существуют, в этом сомнения нет. А вот уровнем ниже — на атомарном уровне — похоже, такие реакции не известны. Да и механизмов, которые могли бы обеспечивать такие реакции, не усматривается.

На молекулярном уровне при репликации молекула либо выступает в качестве матрицы и катализатора в едином лице, либо её копирует какой-то фермент. На уровне атомов не представляю, как отдельный атом может служить матрицей для построения другого или работать в качестве фермента.

Если же предположить вариант молекулярной катализации ядерных реакций — это что-то из серии трансмутации элементов, науке такие случаи ПМЛМ неизвестны.
Название: Re: рибозим
Отправлено: pan от сентября 23, 2013, 21:57:27
Цитата из   http://ru.wikipedia.org/wiki/CNO-%F6%E8%EA%EB

"CNO-цикл — термоядерная реакция превращения водорода в гелий, в которой углерод, кислород и азот выступают как катализаторы. Считается одним из основных процессов термоядерного синтеза в массивных звёздах главной последовательности...."

То есть каталитические ядерные реакции существуют.
Отсюда и вопрос - а как насчет автокаталитических?
Название: Re: рибозим
Отправлено: pan от сентября 23, 2013, 22:11:24
И все-таки - вопросы к профи-биологам (сохраняя нумерацию):

5. А сколько всего разных рибозимов обнаружено в экспериментах?
6. При каких максимальных температурах они сохраняют свои автокаталитические свойства?

Ну и неплохо было бы получить ответы на 1 и 2 вопросы...
Спасибо!
Название: Re: рибозим
Отправлено: AdmiralHood от сентября 24, 2013, 03:47:50
Structure–function relationships in the hammerhead ribozyme probed by base rescue
http://rnajournal.cshlp.org/content/4/11/1332.full.pdf

На  момент написания статьи (1998 год) самым коротким известным естественным рибозимом был Hammerhead  HH16 (55 нуклеотидов). В литературе есть упоминания о рабозимах того же семейства с менее чем 50 нуклеотидов.
Название: Re: рибозим
Отправлено: pan от сентября 27, 2013, 21:46:36
Рассматривался ли кем-нибудь вариант, когда в первичном бульоне
образовывались закольцованные цепочки из молекул РНК (как более
устойчивые, они могли сохраняться достаточно долго, и даже при
каких-то условиях накапливаться - своего рода "прекурсоры" рибозима),
а затем, при соприкосновении хотя бы двух
таких колец, одно или более из них разрывалось - и получался
уже рибозим?
Если такой ход событий возможен, то, может быть, он вероятнее,
чем просто случайная самосборка рибозима?

Название: Re: рибозим
Отправлено: pan от октября 02, 2013, 22:26:30
Уточнение на вопрос уважаемого
AdmiralHood от 20 сентября 2013.

Попробуем представить себе такой
процесс:

Некое атомное ядро с номером X (X<13),
находясь где-то внутри звезды,
в условиях постоянной бомбардировки
энергичными протонами и альфа-частицами
(а возможно, и другими легкими ядрами)
присоединяет их, из-за чего постепенно
набирает массу и заряд.
Процесс энергетически выгоден, так как
удельная энергия связи нуклонов растет
по мере приближения к X=26
(термоядерный синтез), то есть с некоторой
вероятностью он происходит.
При этом происходят разного рода
побочные реакции (пока их не обсуждаем),
в результате которых иногда получается
нестабильное ядро с номером Z (Z в 2 и
более раз больше, чем X).
Если теперь новое ядро (с номером Z)
развалится на две части, каждая из которых
(возможно, также после некоторой цепи
распадов) будет представлять собою исходное
ядро с номером X (плюс всякие осколки),то,
таким образом, в этом гипотетическом
цикле из одного ядра с номером X
(с некоторой вероятностью) получилось
два таких же плюс побочные продукты.

А далее все повторяется...

Может ли такой сценарий реализовываться
в действительности и можно ли назвать
его автокаталитической ядерной реакцией?