У меня вопрос к специалистам. Насколько работоспособны закономерности предложенные Меклером и Идлис - см. статью "Общий стехиометрический код - путь к биотехнологии и универсальной медицине 21 века" в журнале Природа №5 за 1993 год. Каково мнение специалистов в этой области. :?: :?: :?:
Оно не работает. Были попытки сделать экспериментальную проверку меклеровского алгоритма предсказания 3d структуры белков - но от них он всегда уходил. Свернутые им структуры всегда появлялись ПОСЛЕ рентгена. И никогда ДО - хотя ему это предлагали.
Говорил красиво, зажигательно и очень убелительно.
А это вообще про что?
Меклер .Меклер .... А не тот ли это Меклер ,что носился с идеей экстракорпорального синтеза противораковых антител ? В начале 70х гг. ? Выяснилось ,что это афера - нам на пат.физе рассказывали. После он уехал в Израиль. Если это тот самый персонаж ,то скорей всего опять за старое взялся...
http://www.zavtra.ru/cgi/veil/data/zavtra/00/350/62.html
http://nanoworld.pointclark.net/01/DATA/IMAGES/BOOKS/MEKLER/index.htm
Питер
Даже если после рентгена – сами то закономерности работали или нет? В «Природе» утверждается что работали.
Вопрошающий
Это по всей видимости он. Я встречал в Интернете информацию что он попал там в Израиле в прескверную историю.
Павел. в том и суть, что проверки не было. Меклер очень красиво крутил форму из полосок бумаги - но вот от проверки уходил. Раасказывал, что вот он месяц назад белочек свернул - а тут и статья с структурой, и все как у него. А вот чтобы наоборот - сначала свернул, всем показал - а потом статья - таки не было такого. И главное - алгоритма нет, боляся что сопрут-с.
Питер
Интересен вопрос не о личности Меклера. Интересно идея мертвая или нет. Константин дал ссылку на статью в природе http://nanoworld.pointclark.net/01/DATA/IMAGES/BOOKS/MEKLER/index.htm
Там есть и картинки и текст. Есть и комментарии маститых ученых и до и после статьи, которые не исключают верность выдвигаемых положений, даже говорят что сходится кое что. Идея мертвая или нет – вот в чем вопрос?
Идея - мертвая. Там ничего нет. Свернуть белок можно - хотя и не с супер высокой точностью, алгоритмы есть и ищутся. Но они идут не от идей Меклера.
Идея - мертвая. Там ничего нет. Свернуть белок можно - хотя и не с супер высокой точностью, алгоритмы есть и ищутся. Но они идут не от идей Меклера.
Аминокислоты делятся по принадлежности к "одной и той же компоненте связности графа А-A-кода" на три группы:
1)M, H, V,Y,N,D,I
2)Q, L, E, K, F
3)W, P, R, S, G, A, T, C
По Меклеру связи при образовании третичной структуры белка могут образовывать только аминокислоты из одной и той же группы.
Разве расположение связей, определяющих третичную структуру, и пространственное прилегание друг к другу аминокислот не могут быть проверены экспериментально?
Наблюдаются ли в реальных белках связи между аминокислотами разных групп?
Проверить можно. У нас белковики пробовали - ничего статистически значимого нет. И что вы понимаете между связями ?
Плюс к этому алгоритм у Меклера не так прост, но в деталях его знает только автор.
Можно прооверить так:
если два участка белковой цепи (в одном из которых находятся АК-ты только из одной группы, а в другом из другой) прилегают друг к другу пространственно, то значит там существуют связи "не по Меклеру".
При такой проверке могла бы быть опровергнута (или нет) обнародованная часть алгоритма Меклера (приведена в моем предыдущем сообщении).
(Ведь неизвестные детали алгоритма Меклера состояли в уточнении, какие пары аминокислот, из пар, удовлетворяющих обнародованным правилам, будут образовывать связь в нативной структуре белка.)
Т.е для опровержения достаточно одного негативного примера.
Опять вопрос о терминах. Что такое прилегают ? На каком расстоянии мы будем считать, что эти прилегание - а вот это уже нет ?
Цитата: "Питер"На каком расстоянии мы будем считать, что это прилегание - а вот это уже нет ?
Можно обойтись без определения прилегания.
Искусственно создавать АК-ные последовательности трех видов - так чтобы в один искусствееный белок входили аминокислоты одной из трех групп.
Если между белками разных групп происходит слипание, то значит там существуют связи "не по Меклеру".
Я недавно вдруг вспомнила фамилии Меклер и Идлис.
Когда-то я читала о них в журнале "Знание-Сила", году в 90-м или около того.
Они говорили, что дайте нам компьютер и мы победим СПИД.
В те времена "простому человеку" комп был совершенно не по карману. Они искали спонсора.
Сейчас я спросила у Гугла про эти имена - и попала сюда.
Надо же...
Сходила по ссылкам.
Значит уехал в Израиль в 93-м... В 70 лет.
Ну, здесь пособие по старости вполне сносное, чтоб за несколько месяцев (полгода) скопить на компьютер.
Не на 286-ю, какие были во времена той статьи в ЗС, а на "пентюх".
Так ничего и не получилось ?
Абыдно, да...