вот что я не пойму тут - если мы измеряем количество разных (и по возможности нейтральных) мутаций, накопившихся со времени расхождения групп, то как знать, что они не были представлены в общем предке обоих видов? ведь если мутаии нейтральные, то их должно много гулять по популяции, и довольно много разных могло быть унаследованно потомками. частично помогают вещи типа внутригенного кроссинговера и анализа по множеству генов (второе больше, но проводить анализ по количеству генов больше, чем 5-6 уже затруднительно), но всё равно до конца это проблемы не решает, накладывая дополнительные ограничения - из-за очень низкой частоты внутригенного кроссинговера. Хотя на временных промежутках порядка 100 тыс поколений перемешивание разных исходных аллелей из изначальной популяции будет достаточным.
Можно иногда даже встретить схемы, показывающие такой казус. Вот например из
Roger Lewin. Human evolution : an illustrated introduction. 2005
(http://img413.imageshack.us/img413/3909/19742485.jpg)
Просто желательно пользоваться несколькими генами и искать наиболее непротиворечивое сочетание их филогений. Если по одному гену - ну тогда нужно принимать допущение о соответствии эволюции гена эволюции таксонов, но держать и фигу в кармане насчет полиморфизма.
Думается, что отчасти именно это отражает закон гомологических рядов Вавилова.
Gilgamesh - спасибо! понятно, что анализ по одному гену мало что даёт, ну митохондриальные ещё куда ни шло - возможностей для полиморфизма меньше, но всё равно есть... однако - разве допущение о соответствии эволюции гена эволюции таксонов не идёт в разрез о нейтральности анализируемых мутаций? эволюция таксона тоже ведь должна быть нейтральна, а это уже... очень смелое допущение... (в принципе нейтральность очень часто - не более чем удобное допущение - ну и что с того, что форма белка та же или позиции третьи или кусок не доходящий до укладки в готовый белок - могут быть и регуляторные последовательности и неравномерное использование кодонов и т. д. и т. п.)
Цитата: PVOzerski от ноября 29, 2010, 10:10:55
Думается, что отчасти именно это отражает закон гомологических рядов Вавилова.
то есть?.. как бы мысль улавливаю, но самый краешек...