Добрый вечер. Я натолкнулся на следующую заметку на Антропогенезе.ру:
https://antropogenez.ru/article/386/
"Об употреблении слова "гены" в популярной литературе и в СМИ"
У меня возник такой вопрос, почему доля унаследованных от неандертальцев SNP так высока? то есть понятно, что это не сплошные куски генома, а "точки", но суммарно количество этих точек приводит к тем цифрам в 1-3% генома. Что здесь не так? Почему так много? Как правильно понимать?
И еще вопрос, по одному документальному фильму:
Бенце Виола: "... у большинства современных людей родившихся вне Африки есть гены неандертальцев...". Понятно уточнение: что не гены, а полиморфизмы, но почему у большинства, а не у всех?
https://youtu.be/q_eXDgI1zHk
смотреть c 5:00
А до вас мой ответ в личку дошел ?
Цитата: Питер от апреля 18, 2020, 07:51:42
А до вас мой ответ в личку дошел ?
нет, потому я и разместил вопрос здесь
Цитата: Питер от апреля 18, 2020, 07:51:42
А до вас мой ответ в личку дошел ?
Посылали ли вы ответ повторно? я ничего не получил, можете разместить его здесь?
Цитата: Cirill от апреля 17, 2020, 14:08:52У меня возник такой вопрос, почему доля унаследованных от неандертальцев SNP так высока? то есть понятно, что это не сплошные куски генома, а "точки", но суммарно количество этих точек приводит к тем цифрам в 1-3% генома. Что здесь не так? Почему так много? Как правильно понимать?
Не совсем так. Эти проценты ОНП относятся не ко всей длине генома (3 на 10 в 9) - а к числу описанных в геноме ОНП. Их сейчас примерно 15-20 миллионов (10 в 6) Так что проценты небольшие. Итого 3% ОНП - всего 3 на 10 4 нуклеотидов от неандеров. Это нижняя оценка - если есть два ОНП от неандера и между ними 100 п.н. - то все 100 п.н. от него любимого.
Почему не у всех - слишком их все-таки мало.
Цитата: Питер от апреля 24, 2020, 11:10:06
Цитата: Cirill от апреля 17, 2020, 14:08:52У меня возник такой вопрос, почему доля унаследованных от неандертальцев SNP так высока? то есть понятно, что это не сплошные куски генома, а "точки", но суммарно количество этих точек приводит к тем цифрам в 1-3% генома. Что здесь не так? Почему так много? Как правильно понимать?
Не совсем так. Эти проценты ОНП относятся не ко всей длине генома (3 на 10 в 9) - а к числу описанных в геноме ОНП. Их сейчас примерно 15-20 миллионов (10 в 6) Так что проценты небольшие. Итого 3% ОНП - всего 3 на 10 4 нуклеотидов от неандеров. Это нижняя оценка - если есть два ОНП от неандера и между ними 100 п.н. - то все 100 п.н. от него любимого.
Почему не у всех - слишком их все-таки мало.
теперь понятно, благодарю
а все таки есть еще вопрос: а почему обязательно цепочки пар нуклеотидов не могут быть распределены следующим образом: одно-нуклеотидный полиморфизм от неандертальца, следом 25 п. н. от неандера, следом 25 п.н. от сапиенса, следом 25 п.н. от неандертальца, следом ОНП неандертальца.
Проще говоря: почему фрагмент неандертальца должен быть обязательно "закавычен" полиморфизмами? почему не может быть ситуации, когда полиморфизм обнаруживается только с одной стороны?
Если мы посмотрим на геном, то там будет масса ОНП. Берем конкретный ОНП и два фланкирующих его с разных сторон ОНП. Если первый ОНР неандера и два фланкирующих ОНП от сапиенса - то мы точно знаем, что ОНП о неандера. А вот сколько с ним п.н. справа и слева от неандера - мы не знаем. Но если они не отличаются у сапиенса и неандера - то какая разница откуда они. А если у нас есть 4 ОНП - два в центре от неадера и фланки от сапиенса - то скорее всего весь участок между ОНП от неандера тоже от неандера.
Цитата: Питер от апреля 24, 2020, 13:18:45
Если мы посмотрим на геном, то там будет масса ОНП. Берем конкретный ОНП и два фланкирующих его с разных сторон ОНП. Если первый ОНР неандера и два фланкирующих ОНП от сапиенса - то мы точно знаем, что ОНП о неандера. А вот сколько с ним п.н. справа и слева от неандера - мы не знаем. Но если они не отличаются у сапиенса и неандера - то какая разница откуда они. А если у нас есть 4 ОНП - два в центре от неадера и фланки от сапиенса - то скорее всего весь участок между ОНП от неандера тоже от неандера.
то есть, по сути счет процентов идет по доле неандертальских ОНП в валовом ОНП? а идентичные участки не принимаются в рассмотрение.