paleoforum.ru

Форумы сайта «Проблемы эволюции» => Форум сайта «Проблемы эволюции» => Тема начата: feralis от марта 08, 2006, 10:30:02

Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от марта 08, 2006, 10:30:02
Решил начать размещение работ представляющих интерес для всех интересующихся эволюцией
Сайта у меня нет а вот публикаций много уже скопилось
Ссылки дохнут вот и качайте прямо с форума
Начну с дерева хордовых из журнала Nature
кстати оно с тех пор и не пересматривалось
Обратите внимание на погрешность обозначеных дат
Далее как будет время размещу и ветки этого дерева в детальном рассмотрении


Да мне интересно как много посетителей форума читает на англиском а то может мне перевод
на русский размещать?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: diletant от марта 08, 2006, 12:05:02
Не сказал бы, что ничего не изменилось в этом дереве... Во-первых, Synapsida и Diapsida не имели общего предка, а разъединились ещё на амфибийной стадии (или даже раньше). Во-вторых, с птицами не так всё однозначно. Далеко не факт, что они в триасе появились. После 1998 года нашли много окаменелостей, подтверждающих происхождение птиц от динозавров.

Погрешности дат интересно распределены.. Чем больше сомнений в родстве групп, тем больше погрешность.. Киты произошли от бегемотов, а не свиней, по тем данным, что я имею, вот и развал по дате огромный. То же с птицами и крокодилами...
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 08, 2006, 16:03:58
Фералис, лучше скооперируйтесь с кем-нибудь, чтобы обеспечить читателям комфортный доступ и удобный поиск: с Александром Марковым (т.е. здесь же, но цивильно), со мной, с Хабилисом. Или сделайте что-нибудь простейшее на народе. Иначе люди, не являющиеся регулярными посетителями этого форума о Ваших документах так и не узнают.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Jan Metlevski от марта 08, 2006, 23:54:22
Feralis, ne mogli by Vy pozhalujsta prosto dat' linki?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Set O. Lopata от марта 11, 2006, 10:55:36
Цитата: "diletant"Не сказал бы, что ничего не изменилось в этом дереве... Во-первых, Synapsida и Diapsida не имели общего предка, а разъединились ещё на амфибийной стадии (или даже раньше).

Опять вы, diletant, за своё  :)  Так мы никогда ни до чего путного не договоримся.
Нельзя же так категорично представлять далеко не общепринятую гипотезу.
Буду продолжать настаивать, что полифилию амниот никто ещё не доказал. Если они разделились на амфмбийной стадии, то у каждой из этих групп должна быть своя сестринская среди амфибий. Если у вас есть данные на этот счёт, прошу поделиться.
Вот, к примеру, девять аутапоморфий амниот по M. LAURIN AND R. R. REISZ (1995)
"2 Frontal contacting orbit. In Seymouria and diadectomorphs, the frontal
is separated from the orbit (0) by a contact between the prefrontal and the
postfrontal (Fig. 3). In all amniote groups except pareiasaurs (Figs 3, 4), the
frontal contributes to the dorsal rim of the orbit (1) and separates the prefrontal
from the postfrontal (Figs 3, 4).
27* Occipital flange of squamosal gently convex (1). See Diadectomorpha.
46* Transverse flange bearing a row of large teeth on its posterior edge.
The transverse flange of the pterygoid of diadectids and Seymouria is covered
in a shagreen of small denticles of uniform size (0). This may be the primitive
condition for cotylosaurs. Most amniotes have a row of large teeth on the
posterior edge of their transverse flange (1), and this may be a synapomorphy
of the group (Figs 7, 8 ). The optimization of this character is ambiguous
because limnoscelids also have a row of large teeth on their transverse
flange. Therefore, this character could also diagnose the Cotylosauria. In
testudinomorphs, there are no fangs on the posterior edge of the transverse
flange, but there is a narrow ventral ridge instead (2). Captorhinids have lost
the row of teeth and reverted to the primitive condition for batrachosaurs (0).
62 Occipital condyle rounded. In Seymouria and diadectomorphs (Fig. 5),
the occipital condyle is much broader than high (0). The occipital condyle
amniotes is more rounded and is almost as high as it is broad (1).
68* Labyrinthodont infolding of enamel absent (Gauthier et al., 1988b).
The teeth of Limnoscelis and Seymouria are infolded (0). This is probably
primitive condition inherited from their distant ancestors. No amniote surveyed
had labyrinthine infolding of the enamel (1). Therefore, the loss of labyrinthine
infolding may be an amniote synapomorphy. However, the teeth of Diadectes
lack labyrinthine infolding. Therefore, the loss of infolding may also be
synapomorphy of cotylosaurs (amniotes and diadectomorphs). Under this second
hypothesis, the infolding of Limnoscelis represents a reversal to the primitive
condition.
82 Axial centrum tilted anterodorsally (Gauthier et al., 1988b). The axial
centrum is oriented along the main axis of the vertebral column
diadectomorphs (Sumida & Lombard, 1991: figs 1 and 2) and Seymouria (0).
The axial centrum of all amniotes surveyed is oriented anterodorsally relative
to the centra posterior to it (Romer & Price, 1940: fig. 44) (1).
94 Cleithrum restricted to anterior edge of scapulocoracoid (Gauthier
al., 1988b). The cleithrum of diadectomorphs (Case, 1911: plate 5) and Seymouria
widens dorsally and covers the anterodorsal corner of the scapula (0). In most
amniotes (Romer & Price, 1940: fig. 55), the cleithrum does not expand nearly
as much dorsally and does not cover the anterodorsal corner of the scapula
1). Testudinomorphs and some captorhinids have lost the cleithrum (2).
95 Presence of three scapulocoracoid ossifications. The scapulocoracoid
diadectomorphs and Seymouria consists of two ossifications, a scapula and
coracoid (0). Amniotes have three centres of ossification, an anterior and
posterior coracoid, and a scapula (1). Testudines and younginiforms independently
reverted to the primitive condition.
115* Presence of astragalus. The tarsus of diadectomorphs and Seymouria
is poorly known, but as far as we know, Seymouria retains a discrete tibiale,
intermedium, and perhaps a proximal centrale (0). Diadectids have an astragalus
that includes incompletely fused tibiale and intermedium, and probably the
fourth centrale (1). The third (proximal) centrale may have remained discrete.
The astragalus of diadectids has been argued not to be homologous to the
amniote astragalus (Rieppel, 1993b) and is coded as a separate condition. The
astragalus of amniotes shows no traces of its possible compound origin (2). The
optimization of this character is ambiguous because its polarity is uncertain."

Вообще, почитайте  работы Robert Reisz из Торонто. Он неплохо про ранних амниот пишет.
http://www.utm.utoronto.ca/~w3reisz/pubs.shtml
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: diletant от марта 11, 2006, 18:58:49
Что-то я слишком радикально сформулировал мысль насчёт дерева - прошу прощения. Имеет место быть, во-первых, неправильное понимание рисунка, а, во-вторых, то, что я высказал не самые популярные идеи, в которых, в общем-то, не разобрался. Короче говоря, невпопад ляпнул :) Бываю излишне категоричен.

feralis, у меня к вам два вопроса. Вот вы говорите, что сумчатые произошли от однопроходных, а я встречал на сайте "Проблемы эволюции" материал, по-моему, Татаринова, где есть схема, на которой яйцекладущие выделились из терапсид независимо от сумчатых и плацентарных. Хотя там и стоял вопрос по поводу такого расхождения. Тем не менее, я уже не раз сталкивался с мнением, что яйцекладущие - это дожившие до сегодняшних дней зверозубые рептилии. Кому верить?

Второй вопрос.. Если черепахи - не анапсиды, то кто они? Сестринская группа к Synapsida+Sauropsida?

Set O. Lopata, полагаю, вы вспомнили нашу дискуссию про кладистику :) Тут стандартная ситуация: "когда мы с женой не можем сойтись во мнении, то поступаем, как говорит она - жена называет это компромиссом" :) От того разговора ничего не изменилось - каждый остался при своём мнении. Так что, "до чего-то путного договориться" - это прийти к одному из мнений, моему или вашему, что малореально. Если из кладистики убрать все таксоны надвидового ранга и перестать считать её систематикой - то она меня вполне устраивает как дерево родственных связей, но не больше.

Про монофилию рептилий поверю вам на слово. К сожалению, сейчас совсем нет времени вдаваться в детали.
Название: Re: 5
Отправлено: Gilgamesh от марта 12, 2006, 03:43:06
Цитата: "feralis"Гильгамешь хочу узнать ваше мнение о переводе веть читатели наши предпочитают русский
Ситуация такова: получая "сократовский" перевод, человек получает сразу все ляпы , допущенные переводчиком и не имеет шанса что-либо восстановить. Если человек получает текст на басурманском языке, то такой проблемы нет. Переводчики сейчас имеются в широком ассортименте - хочешь получать информацию из первых рук, а не из новостных лент? Не жмоться, купи хотя бы пиратский диск (большего, собственно, и не надо) и вперед. Естественно, "Сократ" или "Промт" юзера даст те же ляпы, НО юзер ведь будет видеть и оригинал текста, а также он сможет пользоваться, например Lingvo с колоссальной базой синонимов.
Второй мощнейший плюс непереводных текстов - юзер сможет дословно цитировать, не думая о возможных ляпах.

ЦитироватьА еще хорошо б перевести файлы Акробата на русский
Я не могу-форматирование текста пропадает
Попробую через новый файнридер, он должен кушать акробатов


ЦитироватьВы напрасно думаете что на сервере НАРОД.РУ лучше
Меня поисковик Гугол сюда направил а вот НАРОД он не видел
Сайт нужно индексировать в поисковой машине - автор должен прийти в гугль, постучаться и прописать свой сайт там.
По архивам же поиск не осуществляется.

ЦитироватьВообще-то я хотел с форума уйти ибо ламаркистов-мичуринцев в достатке и в др месте
Что Вас смутило? Т.е. я лично обеспокоен смутностью перспектив интернет-обсуждений и мне важно знать мнения заинтересованных компетентных лиц.

ЦитироватьА систематику изучаю с 1972г
за годы эти повидал деревьев хороших и разных
Если не секрет, кого изучаете.


Цитировать120 миллионов назад началось ветвление плацентарных
Первой отошла линия к слонам и тенрекам
Ещё есть версии о первоначальном отхождении неполнозубых.
[/quote]
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Set O. Lopata от марта 13, 2006, 08:34:00
feralis хорошую мысль подал, как мне показалось. У меня за год тоже много накопилось статей в электронном виде. По филогенетике, в основном. Пока я список сюда пришпилю, если кому-нибудь что-то надо, размещу на форуме или кину в личку.
Кстати, может создать специальную ветку, пришпиленную сверху, где не будет флуда, а только ссылки, м.б. с краткими комментариями от размещающего их?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от марта 13, 2006, 22:05:09
Вот, выкладываю список архивов PDF (статьи по мегафилогении протистов и животных с 2003), как просили. Сами архивы живут на http://herba.msu.ru/shipunov/else/temp, но не очень долго. Размер архивов --- 47 и 83 мегабайт.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: diletant от марта 15, 2006, 00:34:26
Я в середине апреля планирую свой сайт выкладывать в сеть. Разумеется, на хороший платный хостинг. Чисто технически для меня нет никакой проблемы выложить хоть гигабайты различных материалов, но я не планирую этого сразу делать.

Тут проблема с авторскими правами и качеством информации. Если маленький сайт может себе позволить пренебрегать авторским правом, то при некоторой популярности с этим могут возникать проблемы. С точки зрения научных статей я с вопросом авторского права знаком слабо. Может, кто подскажет, как дела с публикацией научных статей обстоят?

А качество информации - это вообще неприятный разговор. Большинство материалов существует в PDF, в абсолютно разном форматировании. Человек, пользующийся сайтом, должен видеть информацию в каком-то едином виде, иначе даже ценная информация становится трудно воспринимаемой. Грубо говоря, всё должно быть красиво, даже несмотря на первичность контента. Англоязычные материалы я вообще не хочу выкладывать, пока не будет сделана английская версия сайта. Соответственно, нужен качественный перевод. Где взять время, чтобы всё переводить? Будет ли этим кто-нибудь заниматься, кроме собственно администрации сайта? Только время покажет.

Вообще, очень трудно сделать некоммерческий проект хорошего уровня. Нужно иметь надёжный источник дохода, массу времени и непробиваемый энтузиазм. Поэтому даже лучшие сайты, посвящённые биологии, - довольно примитивны на фоне высокобюджетных проектов. Сделать научный сайт, чтобы он ещё и деньги приносил, - задача очень непростая. Реально таких проектов единицы: Nature, National Geografic и иже с ними. Единственный малобюджетный выход - создавать сайт силами большого количества людей. Так поступает Википедия. Но у них очень кривенько получается..
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от марта 15, 2006, 07:53:34
Цитата: "diletant"Тут проблема с авторскими правами и качеством информации.
См. мой пост http://www.paleo.ru/forum/viewtopic.php?p=12604#12604
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от марта 15, 2006, 08:19:06
Хочу начать выкладывать здесь информацию про систематику и эволюцию протистов и растений, параллельно буду постить на http://zbio.net/forums/index.php?showforum=64 (про беспозвоночных здесь есть отдельный топик). Все по теме, конечно, не смогу.
Для начала:
1) Вышла работа по систематике клеверов ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WNH-4J90W2X-2/2/5840dbb89333b61e99b61aafb78b0cc5 ). Клеверное дерево ;-) таково, что никаких родов из клевера выделять, как хотели наши горячие головы (типа Роскова) не придется.
2) Вышла работа по систематике гвоздичных ( http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/3/399 ). Получилось много интересного, в частности, два подсемейства из трех надо отменять.
3) Mark Simmons наконец переработал дерево бересклетоцветных ( http://www.ingentaconnect.com/content/aspt/sb/2006/00000031/00000001/art00012 ). Еще четыре группы "болтающихся" цветковых наконец нашли свой sweet molecular home. Осталось всего два-три семейства до полной победы!
3) Наконец, переописали загадочную Mastigamoeba invertens (ее надо называть теперь Breviata anathema,  http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2005.00087.x ). Она, по-видимому, относится к новому типу протистов.
4) Прибыло якобид (весьма специфические свободноживущие родственники лямблии, интересные тем, что где-то рядом может быть корень эукариот) --- http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2005.00081.x
В этих номерах есть и еще много интересного.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 15, 2006, 12:06:03
Фералис,
"Я тут на форуме убедился что люди всеж любят читать на русском"
Так можно опрос провести о предпочтительности переводов либо оригиналов иноязычных статей. Не спорю, сами посты лучше на русском и не балуясь транслитом, но статьи - дело другое, там важна безусловная точность и полнота сохранения информации.

"Гильгамешь так как там насчет кооперации если есть идеи так пиши на ящик"
Хорошо, мне нужно слегка попинать соавторов, т.к. сам я в хтмэле разбираюсь очень плохо. Как только организую правку, так сразу можно будет вывешивать.

"Если кто смотрел рамблер топ-100 то заметил что масса народа толкется на немногих сайтах а внизу этого топа море сайтов где раз-в день кто-то заходит
Надо кому-то собрать все хорошее да и выложить и чтоб не слабее библиотеки Мошкова или сайта о космонавтике Железнякова "
В рунете - прецеденты - "Проблемы эволюции", мамбру. Т.е. начало уже есть, но количество "заточенных" биологов меньше, чем любителей художественной литературы, да и распознавать наши книги сложнее - иллюстрации, таблицы, формулы...

"Я сторонник строгости в деле просвещения "
И это правильно. Лучшая новостная лента - это РЖ, но он платный. Притом серьезно платный.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 15, 2006, 12:32:26
"Человек, пользующийся сайтом, должен видеть информацию в каком-то едином виде, иначе даже ценная информация становится трудно воспринимаемой. Грубо говоря, всё должно быть красиво, даже несмотря на первичность контента. "
Не до жиру, быть бы живу. Т.е. форма - дело третьестепенное, когда тема важна.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от марта 15, 2006, 23:28:32
Вы скажете
-Станем к варягам спиной
лицом повернемся к монголам
Это так эпиграф к моей реакции на желание  Дилетанта не публиковать англиские тексты на своем сайте
Если у варягов достижения а что у нас за 20 лет
Да что не идет вперед то катится назад
А насчет авторского права то пример pharyngula показывает что даже на западе закрывают глаза на такие кражи -веть польза обществу
А это сайт с мировай славой

Да приветствую plantago на форуме института священных окаменелостей
На ботанический форум я конечно зайду вот только перевешаю на ре...извините на теме ламаркистов из местных
Читал я тему начатую сомневающимся Яном-приятно встретить специалиста
Я сам в растениях мало разбираюсь вот и хочу набраться полезного
Вот только есть мнение что дела у ботаников как у животноведов в домолекулярные времена
Митохондрии у растений немые из за особенностей  размножения
А деревья разработаны прекрасно вот только ранги покрупнее не стыкуются
Да было у нас такое с отрядами-думали они из точки взрывом в конце мела произошли но вот митохондрии все и раставили по местам
А вот с видами пролный разброд и сейчас
Даже неясно когда человек от шимпанзе отделился
Погрешность 5-7 миллионов лет назад а о прочих видах и говарить нечего
Вот я и хочу спросить  а как вы эти свои гладкие деревья родства  делаете? И почему с крупными таксонами мрак?

<Маленькая поправка: молекулярщики в принципе не могут адекватно спорить с морфологами>
Согласен веть как говарится
-Они не только говарят на разных языках но и живут в разные эпохи
подход Линнея и современая генетика


Решил сегодня разместить пару статей из журнала Nature
Как видно по скачиваниям он весьма желаем
я и далее хочу публиковать его здесь
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: diletant от марта 16, 2006, 08:24:18
Цитата: "feralis"Вы скажете
-Станем к варягам спиной
лицом повернемся к монголам
Это так эпиграф к моей реакции на желание  Дилетанта не публиковать англиские тексты на своем сайте
Пока у меня вообще нет желания никакие тексты публиковать. Сайт весьма специализированный, и контент, в первую очередь, не текстовый. Чуть позже будут статьи. Но выкладывать PDF'ы в том виде, в котором они по большей части встречаются, я не буду - только HTML-страницы. В любом случае, это произойдёт не раньше, чем появятся люди, кому сайт будет интересен и кто будет принимать участие в его развитии. Сейчас рано об этом говорить - движок сайта дорабатывается и в сеть ничего не выложено

Цитата: "feralis"А насчет авторского права то пример pharyngula показывает что даже на западе закрывают глаза на такие кражи -веть польза обществу
А это сайт с мировай славой
Будем надеяться... Основным наполнением на первом этапе будут иллюстрации, а у них тоже владельцы есть.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 16, 2006, 17:29:39
"вот только перевешаю на ре...извините на теме ламаркистов из местных"
:lol: не дадутся, тут лицом тыкаешь в ошибку и сам же в дураках остаешься. Бесполезно.

"Они не только говарят на разных языках но и живут в разные эпохи
подход Линнея и современая генетика "
Кто прав: морфология или молекулярка? Естественно молекулярная биология, т.к. так говорит молекулярная биология, а ведь она, как известно, всегда права, ведь...
Название: 11
Отправлено: feralis от марта 17, 2006, 23:20:11
Да флуд надо отсечь
правда модератор мог бы взять на себя труд создать отдельную тему по ссылкам что была на самом верху страници
К каждой ссылочке кусочек текста чтоб было ясно что сие
Да и на мои публикациии ссылочку создать а то веть потонет тема со временем а кто там будет ворошить покойные темы

А отрадно что на форуме стало более специалистов
правда то ботаники и их познания в молекулярке явно не передовые
я говарю о практическом опыте ибо сомневаюсь что у них оборудование было 21 века
Думаю б\у в порядке помощи  коллегам из банановых.....
пусть поговорят др с др   ну а мы почитаем

Сегодня размещаю статью о птицах с хорошим деревом.

Кстати кто имеет возможность выложить в Сети выпуски нашей Природы
хороший был журнал да и сейчас можно читать
правда не стоит денег какие за него просят
только частично в Сети есть
И еще вопрос
Кто рискнет высказаться по работам Меклера и Иблис
в двух словах желательно
веть я прекратил подписку на Природу в 1993 г сразу как такие стали там публиковаться
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 18, 2006, 03:47:44
"А отрадно что на форуме стало более специалистов"
Наметилась некоторая кластеризация сообщества, когда кто-то делом занимается,  кто-то проповедями, а кто-то просто развлекается.

"я прекратил подписку на Природу в 1993 г сразу как такие стали там публиковаться"
И, возможно, выбросили ребенка вместе с водой. В конце концов наука должна искать новизну и иногда куда-нибудь забредает, это неизбежный поиск оптимума. В энные времена во всех отечественных изданиях на щит поднимали мичуринскую биологию. Что же теперь - собрать нынешние редколлегии и к сте... на опыты? Вряд ли, права на ошибку не имеет никто, но допускают их все. А Меклера здесь обсуждали кратенько (я тогда только узнал, что это за фрукт), посмотрите на следующих листах, тема не должна далеко погрузиться.
Название: неполнозубые
Отправлено: feralis от марта 19, 2006, 09:27:12
Размещаю статью из NATURE о открытии жаб отделившихся от прочих еще при динозаврах
И статью с прекрасным деревом неполнозубых  исследованием их эволюции

http://www.paleocene-mammals.de/multis.htm
http://www.paleocene-mammals.de/taeniodonts.htm
А это ссылки на историю многобугорчатых и др отряда вымершего
Коротко но очень интересно и ясно
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от марта 19, 2006, 10:50:29
Цитата: "feralis"
Митохондрии у растений немые из за особенностей  размножения
Поясните Вашу мысль, пожалуйста.
Цитировать
А деревья разработаны прекрасно вот только ранги покрупнее не стыкуются
... Вот я и хочу спросить  а как вы эти свои гладкие деревья родства  делаете? И почему с крупными таксонами мрак?
Большинство деревьев --- это хлоропластные гены типа rbcL. А про крупные таксоны, боюсь, Вам никто не ответит. Не повезло ;-)
Название: On-line архив статей
Отправлено: plantago от марта 20, 2006, 07:48:38
Итак, произошло первое обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив, напоминаю, лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы,  кроме "flora", доступны для скачивания:
an --- литература по цветковым растениям (все годы)
os --- литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to --- литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
ts --- литература по теории эволюции и систематики (все годы)
Структура архива и подбор статей обусловлены моими личными предпочтениями. Однако, я старался представить _всю_ доступную в PDF литературу по мегасистематике в 2003 года.
Следующее обновление --- примерно 15 апреля.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от марта 20, 2006, 09:29:18
А новые архивы по составу с прошлыми пересекаются?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от марта 20, 2006, 23:16:53
Цитата: "Gilgamesh"А новые архивы по составу с прошлыми пересекаются?
Они в 5 раз больше ;-) А старые разделы дополнены.
Название: плантаго вопрос
Отправлено: feralis от марта 21, 2006, 22:18:39
лантаго  у меня вопрос
Митохондрии и хлоропласты передаются по женской линии
что мешает использовать митохондрии растений как это делают с михондриями животных определяя их родство?

А моя тогдашняя реплика имела ввиду стабилизацию гибридов межвидовых у растений
путем удвоения числа хромосом
я полагаю это мешает определению родства
Жду комментария специалиста и если не прав то поправте


Сегодня
Акробат и тоже с размеченым датами деревом но уже летучих мышей
похоже летающие ящеры не давали млекам дорогу в небо а как вымерли так те сразу те поднялись на крыло
И разделили небо с птицами взяв себе ночь а день уступив потомкам одной из ветвей динозавров-птицам
впрочем тогда же дневные мыши с крыльями и днем нашли место но и тут они питаются плодами а
птици семенами
Такая радиация в эпоху последних динозавров наводит на мысль что конкуренция ящеров не давала зверозубым развернуться
и еще
В соседних с летучими мышами ветвях отрядов заметно что некоторые имеют локацию
Это киты  землеройки
Думаю уже у мелового предка имелись задатки
Название: Re: плантаго вопрос
Отправлено: plantago от марта 23, 2006, 04:45:48
Цитата: "feralis"что мешает использовать митохондрии растений как это делают с михондриями животных определяя их родство?
Вот что пишут на http://www.jgi.doe.gov/sequencing/why/CSP2005/angiospermmito.html (это Jeffrey Palmer):
===
Plant mitochondrial DNAs (mtDNAs) have long been known to possess many unusual, if not unique, properties. These include the lowest known rates of synonymous substitution (50-100 times lower than that in animal mitochondrial genomes) and exceptionally high rates of inversion and other internal rearrangements. (Two plant mtDNAs can have >99% sequence identity yet be highly scrambled in gene order!) Plant mtDNAs also have complex structural heterogeneity (i.e., a 'master' chromosome and subgenomic chromosomes resulting from high-frequency recombination between large direct repeats). Plant mitochondrial genomes are the largest of all known organelle genomes (200-2,400 Kb, 1-2 orders of magnitude larger than most mtDNAs, rivaling some bacterial genomes). Plant mtDNAs also frequently and persistently incorporate chloroplast and nuclear sequences, some of which are used in the mitochondria (e.g., captured chloroplast tRNA genes--no other organellar genomes take up exogenous cellular DNA like this).
...
Plant mtDNAs are also remarkably active in horizontal transfer of both mobile introns and standard genes; indeed, plant mtDNAs are the only genomes of multicellular eukaryotes found to transfer genes horizontally within a phylum.
===
Вот оно как...
Название: nature
Отправлено: feralis от марта 24, 2006, 20:59:17
я размещаю этот акробат в основном из за дерева приматов Старого света на одной из страниц
И еще
там статья из журнала Nature с деревом плацентарных от 2001 г
обратите внимание на положение слонов и неполнозубых
Название: nature4
Отправлено: feralis от марта 26, 2006, 22:06:29
Сегодня размещаю материал из журнала Nature о датировке таинственного щелезуба которого ранее относили к насекомоядным
о положении смилодона по молекулярным часам
и о отсутствии предков в нас неандерталькой крови т е мы из африки
Название: 9
Отправлено: feralis от марта 28, 2006, 22:51:32
Сегодня публикую гипотезу о болотном происхождении прямохождения у гоминид
Все это вполне здраво да и гориллы кое где живут в заболоченой местности

вторая публикация о таксономии динозавров
Тема совсем не простая-по костям много не прочтешь а вот гадать пожалуста

А третий акробат из Nature
Тут речь о мозгах млекопитающих


У меня к плантаго вопрос
Сейчас изучаю двухтомник Сингер м
Это специалист по мобильным элементам генома
книга 98 г и мне интересно какие вам известны подвижки в этой интереснейшей теме?
веть это генообразование и тут похоже путь к пониманию  популяцио\видообразования

культурные растения\животные в дикой природе неконкурентны
а как это качество устойчивости относится к трансгенным растениям?
я полагаю они еще более нежны и требуют защиты от среды
Название: Новые публикации
Отправлено: plantago от марта 30, 2006, 09:39:51
1) Вышла статья по систематике ситниковых (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1096-0031.2006.00095.x). Juncus никак не удается сделать монофилетическим, придется, видимо, делить этот обычный в нашей флоре род.

2) Еще один ископаемый зверь как следует посеквенирован (http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WNH-4JJ87X8-2/2/6a33847c989b984615ba901102121e58). Вымерший гигантский олень ближе всего к ланям (Dama).

3) Опубликовано подробное описание нового вида недавно описанного типа Cycliophora --- Symbion americanus (http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GJ9-4HYN5B0-1/2/d4488943022ebc0e09058c05584ac885)

4) Сиквенсы 28S и 18S РНК подтверждают монофилетичность странной группы Platyzoa и говорят за полифилию лофофороносных беспозвоночных (http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WNH-4JJ87X8-1/2/43a6578ddb3c687420f36f7c0d135f1d)

5) Статья про молекулярную систематику пшениц и эгилопсов еще раз подтверждает происхождение твердых пшениц путем комбинации двух геномов (!) и предлагает несколько рецептов, как с этим быть систематикам (http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WNH-4JCBND7-2/2/fc0a39d8916cd67626e0c37de191d2bc)

6) Питерские протозоологи выложили на своем сайте текст книги про трихоплакса (http://now.ifmo.ru/publications/trichoplax/trichoplax_text.pdf).

7) Кавалье-Смит после годичного "молчания" снова взялся за переработку системы протистов, на этот раз "царства" Chromista (http://www.springerlink.com/link.asp?id=t5w324231345611g)

Все статьи будут в архиве ~ с 15 апреля.
Название: Re: 9
Отправлено: plantago от марта 30, 2006, 09:42:42
Цитата: "feralis"
У меня к плантаго вопрос
Сейчас изучаю двухтомник Сингер м
Это специалист по мобильным элементам генома
книга 98 г и мне интересно какие вам известны подвижки в этой интереснейшей теме?
Увы, я не очень в курсе. Похоже, что серьезных открытий не сделано.
Цитировать
культурные растения\животные в дикой природе неконкурентны
а как это качество устойчивости относится к трансгенным растениям?
я полагаю они еще более нежны и требуют защиты от среды
Не факт. Знаю про то, что трансгенная кукуруза существенно повлияла на генофонды дикорастущей теосинте в Мексике.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от марта 30, 2006, 22:37:26
Сегодня в публикации
История заселения Европы в генах
"
потом статья с апализом расхождений и разнообразия современного человека
и наконец статья где черепахи ставятся в основание древа архозавров
Посмотрим где всеж эти черепахи наконец останутся спустя годы исследований

А к Плантаго снова вопрос

Как по вашему есть ли некий предел делимости клетки в культуре или в организме?
В организме конечно все управляемо

А каков механизм передачи генов от кукурузы к теосинте?
Опыление?
Может ссылочку бросите на журнал где о таком можно расширить знания
если трансгены так будут делится приобретениями с дикарями то это необратимо повлияет на весь мир природы
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от апреля 02, 2006, 11:40:38
Две интересные публикации:
1) Зоологи из ДВНЦ нашли нового представителя загадочной группы Rhinogradentia --- Dendronasus (см. статью в прикрепленном файле)
2) Хороший обзор по проблеме происхождения эукариот опубликован в Nature (http://www.nature.com/nature/journal/v440/n7084/abs/nature04546.html).
Цитировать
Как по вашему есть ли некий предел делимости клетки в культуре или в организме?
Здесь не спец, ответить не смогу. Задайте вопрос на zbio.net/forums, там Вам наверняка ответят.
Цитировать
А каков механизм передачи генов от кукурузы к теосинте?
Опыление?
Да.
Цитировать
Может ссылочку бросите
Вот здесь много (только они как раз считают, что gene flow незначителен):
http://www.biosci.ohio-state.edu/~asnowlab/reprints.htm
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от апреля 09, 2006, 12:41:38
Новости систематики и эволюции

1) Находка переходной формы между Panderichthys и Ichthyostega --- ископаемой четвероногой рыбы Tiktaalik ( http://www.nature.com/nature/journal/v440/n7085/abs/nature04639.html , http://www.nature.com/nature/journal/v440/n7085/abs/nature04637.html ) проливает новый свет на эволюцию конечностей позвоночных.

2) Классификация миозинов ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/103/10/3681 ) поддерживает таксон альвеолят (Alveolata, класс XIV) и еще более широкий таксон хромальвеолят (Chromalveolata, классы XXII--XXIV, в пику мнению T. Cavalier-Smith о "царстве" Chromista).

3) Andreas Schmidt-Rhaesa ответил ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GJF-4J72YS1-2/2/fea0c24768932659a1c75679dd960a76 ) на критику Pilato et al., 2005 ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GJF-4GGWG7B-1/2/c236f3d90fd4d94256825d4369d19265 ) по поводу существования Ecdysozoa.

4) "Что такое популяция?" --- обзор R.S.Waples & O.Gaggiotti, который может быть многим полезен ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-294X.2006.02890.x )

5) Jenny Xiang с соавторами опубликовала ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt/tax/2006/00000055/00000001/art00006 ) обзор систематики рода Cornus (Кизил). Она категорически отказывается выделять из него роды Chamaepericlymenum, Cynoxylon, Swida etc., что приятно.

6) Опубликована новая система красных водорослей ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1529-8817.2006.00210.x ). Авторы выделяют 7 классов (5 из них --- бывшие бангиевые), IMHO, многовато.

7) Хочу обратить внимание на совершенно сумасшедшую (но не лишенную, как мне кажется, оснований) гипотезу происхождения загадочной группы Dicyemida (паразиты осьминогов): в результате LGT между протистами (инфузориями?) и моллюсками ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B6T2K-4B726M7-3/2/e2b60d5fc42b6b64e969824219aaa382 )!
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от апреля 20, 2006, 01:00:29
Произошло очередное (второе) обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an --- литература по цветковым растениям (все годы)
os --- литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to --- литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
ts --- литература по теории эволюции и систематики (все годы)
Структура архива и подбор статей обусловлены моими личными предпочтениями. Однако, я старался представить _всю_ доступную в PDF литературу по мегасистематике в 2003 года. Представлены все статьи, упоминавшиеся мной в "Новостях".
Следующее обновление --- примерно 15 мая.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от апреля 20, 2006, 07:51:30
"Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения)"
Ну тогда я в очередь.

"Следующее обновление --- примерно 15 мая."
Дело, конечно, хозяйское, но не целесообразней ли будет выпустить тогда an1, os1 и т.д., а не заменять эти архивы с включением новых статей - едва ли кому хочется скачивать одни и те же статьи несколько раз.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от апреля 20, 2006, 22:28:25
Цитата: "Gilgamesh"
Ну тогда я в очередь.
В личке.

Цитировать
Дело, конечно, хозяйское, но не целесообразней ли будет выпустить тогда an1, os1 и т.д., а не заменять эти архивы с включением новых статей - едва ли кому хочется скачивать одни и те же статьи несколько раз.
Именно что хозяйское: иначе у меня не выходит. Можно:
1) Отсортировать по времени щелчком мыши;
2) Использовать продвинутые качалки, которые позволяют задавать паттерн: все файлы называются типа "автор200X.pdf", поэтому введите паттерн "2006" и будет Вам щастье ;-) (это может, к примеру, DownThemAll for Firefox --- https://addons.mozilla.org/firefox/201/ )
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от апреля 28, 2006, 07:19:50
Спасибо за пароль. Увы, придется перезакачивать старые  :?  Может у кого есть возможность вторичного размещения только новых статей?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от мая 13, 2006, 14:00:17
Систематика и эволюция протистов, животных и растений
1) Не очень новая статья ( http://www.bioone.org/perlserv/?request=ge...PF%3E2.0.CO%3B2 (http://www.bioone.org/perlserv/?request=get-abstract&doi=10.1666%2F0094-8373%282005%29031%3C0165%3APPF%3E2.0.CO%3B2) ), но "протерозойские грибы" -- вещь интересная.
2) Происхождение кактусов опять стало привлекать внимание, особенно когда обнаружилось, насколько они близки к Portulacaceae. Интересная статья про возможные пути становления жизненной формы "кактус" в этой группе ( http://www.journals.uchicago.edu/cgi-bin/resolve?AN41282ABS (http://www.journals.uchicago.edu/cgi-bin/resolve?AN41282ABS) )
3) Обзор T. Embley посвящен разоблачению Archezoa ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...1485400q64g7j53 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=g1485400q64g7j53) ). Разоблачение состоялось уже сравнительно давно, но идея "первично безмитохондриальных протист", да еще "с прокариотными рибосомами" оказалась настолько привлекательной, что соотвествующие схемы все еще бродят по учебникам и Интернету.
4) Забавный случай HGT ядерного гена от мятлика к овсянице ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...46115535m283287 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=746115535m283287) ). Чем дальше в лес, тем толще HGT...
5) Впервые посеквенирован экзотический класс моллюсков Monoplacophora ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0602578103v1 (http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0602578103v1) ). Не могу удержаться, чтобы не процитировать:
===
[In Antarctic]... at 3100 m depth, yielded one small specimen (1.7 mm shell length) of the monoplacophoran Laevipilina antarctica Waren et Hain, 1992, one of the 26 known species of this group of molluscs ... and half of the specimen was used for molecular work. Although monoplacophoran DNA was highly degraded ... we were able to amplify and sequence a 1.2-kb fragment of the large nuclear ribosomal subunit (28S rRNA).
===
Вы только представьте, достать с трехкилометровой глубины антарктического моря 1 (один) экземпляр двухмиллиметрового моллюска! И получить "highly degraded" ДНК... Ну и, бардака в молекулярную систему моллюсков добавилось. Попали моноплакофоры внутрь хитонов.
6) И еще про беспозвоночных ( http://www.sciencedirect.com/science?_ob=M...=/sdarticle.pdf (http://www.sciencedirect.com/science?_ob=MImg&_imagekey=B6WNH-4JWDY38-3-1&_cdi=6963&_user=854313&_orig=browse&_coverDate=05%2F05%2F2006&_sk=999999999&view=c&wchp=dGLbVlb-zSkzV&md5=38c2faeef51da3de37f10976dbd5c48e&ie=/sdarticle.pdf) ). Анализ 18S+28S объединил киноринх с приапулидами, жаброногих с Hexapoda, а многоножек -- с хелицеровыми.
7) Морфологи членистоногих считают, что морфология мозга сближает онихофор с хелицеровыми ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...67g8q8t5q577562 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=267g8q8t5q577562) ).
8) Безумные динофлагелляты, меняющие пластиды, как перчатки, исследованы на предмет белков ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...cfadf9b516fdf35 (http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WK7-4J78X07-1/2/86f0ffb849c7832eccfadf9b516fdf35) ). Нашли следы функционирования сразу двух типов пластид, а также показали возможность формирования химерных белков.
9) Отдаленный гомолог метазойного гена Hedgehog, участвующего в эмбриогенезе, найден у хоанофлагеллят ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...t46478064665574 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=pt46478064665574) )
10) И опять ( http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/msl008v1 (http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/msl008v1) ) про динофлагеллят и белки (лучше процитирую):
===
Gene fusion events are considered rare and likely stable, and such an event has recently been used to argue for a root of the eukaryotic tree. Our data, however, show that exact reversals of fusion events do take place and hence gene fusion data are difficult to interpret without knowledge of the phylogeny of the organisms – therefore their use as phylogenetic markers must be considered carefully.
===
Это -- здоровенный камень в огород T. Cavalier-Smith и его новой любимой теории о двух ветвях эукариот: Uniconta и Biconta.
11) Еще одна гипотеза принадлежности вендобионтов. Теперь их сравнивают с гребневиками ( http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/312/5774/731 (http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/312/5774/731) )...
12) По-прежнему очень просто открыть новый тип. Надо взять список D. Patterson
( http://tolweb.org/accessory/Lineages_of_Eukaryotes?acc_id=49 (http://tolweb.org/accessory/Lineages_of_Eukaryotes?acc_id=49) , внизу), найти несеквенированный таксон, научиться его культивировать (это, конечно, сложнее всего) -- и ура! Вот, например, Telonema ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...p2031t11163hthr (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=hp2031t11163hthr) ). Не очень верится только в ее близость к хромистам, о которой твердят авторы статьи. А если серьезно, у меня у самого есть список таксонов, которые почти гарантированно дадут Вам новый тип -- пишите, кому интересно!
13) И off-topic на закуску, просто прикольно, как говорится -- http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...21n896162365208 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=021n896162365208) ...
Название: Re: 5
Отправлено: adada от мая 13, 2006, 19:33:37
Цитата: "Gilgamesh"...получая "сократовский" перевод, человек получает сразу все ляпы , допущенные переводчиком и не имеет шанса что-либо восстановить. Если человек получает текст на басурманском языке, то такой проблемы нет...
...
ЦитироватьА еще хорошо б перевести файлы Акробата на русский
Я не могу-форматирование текста пропадает
Попробую через новый файнридер, он должен кушать акробатов

Я всю ветку до конца не читал, может, дальше есть что-то подобное, но все-таки поделюсь собственным опытом.

Файлы PDF я часто преобразую в DOC  с помощью проги "PDF Transformer", продуктом той же, что и FineReader, компании. Она делает это качественно, с распознаванием языков. Затем в Ворде удаляю мягкие переносы, перевожу ПРОМТом и сохраняю в виде таблицы-билингвы.
Очень удобно потом пользоваться плодами.

+
Только не забывайте удалять ключики из защищенных пэдээфок!
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от мая 21, 2006, 09:34:54
Систематика и эволюция растений и других организмов

1) Вышла статья, посвященная подробному изучению развития "цветка наоборот" -- Lacandonia schismatica ( http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/1/15 (http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/1/15) ). Авторы считают, что здесь мы все-таки имеем дело с настоящим цветком, а не с псевдантием (как думала P. Rudall).

2) Новая классификация пальм -- одного из крупнейших семейств однодольных -- предложена C. Asmussen с соавторами ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...39.2006.00521.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1095-8339.2006.00521.x) ).

3) W. Friedman (известный открытием двойного оплодотворения у Ephedra) описал новый тип женского гаметофита (зародышевого мешка) у покрытосеменных, свойственный базальному таксону -- Amborella trichopoda (  http://www.nature.com/nature/journal/v441/...ature04690.html (http://www.nature.com/nature/journal/v441/n7091/abs/nature04690.html) ). Автор считает (хотя выражается очень осторожно), что он нашел "missing link" между голосеменными и покрытосеменными.

4) Th. Cavalier-Smith опубликовал статью "с большими буквами и цветными картинками", в которой описаны его представления об эволюции всего живого (  http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.as...164755512w92302 (http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=0164755512w92302) ). Очень советую почитать (он, без сомнения, великолепный scientific writer), но имейте в виду, что его концепция эволюции прокариот неоднократно критиковалась как микробиологами, так и специалистами по геномике.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от мая 23, 2006, 04:31:28
Произошло майское обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an -- литература по цветковым растениям (все годы)
os -- литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to -- литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
ts -- литература по теории эволюции и систематики (все годы)
Структура архива и подбор статей обусловлены моими личными предпочтениями. Однако, я старался представить _всю_ доступную в PDF литературу по мегасистематике в 2003 года. Представлены все статьи, упоминавшиеся мной в "Новостях".
Следующее обновление --- примерно 15 июня.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июня 05, 2006, 09:33:30
Систематика и эволюция протистов, животных и растений

1) В статье ( http://www.springerlink.com/link.asp?id=k4w214302j3j8284 (http://www.springerlink.com/link.asp?id=k4w214302j3j8284) ), посвященной таксономическому анализу рода Prunus ("слива"), авторы настаивают на широком понимании рода, с включением туда черемухи (Prunus padus), лавровишни (P. laurocerasus), вишни (P. fruticosa), абрикоса (P. armeniaca), персика (P. persica), миндаля (P. dulcis). Надо сказать, что американские ботаники делали это задолго до "молекулярной эры", потому что в американской флоре -- множество форм, которые нельзя отнести ни к одному из принимаемых европейскими ботаниками родов. Впрочем, еще Линней категорически возражал против разделения рода Prunus. По-видимому, очередь за лапчатками (со включением туда земляник) и грушами (можно включить яблони, и, вероятно, айву). В рамках тех же тенденций багульник (Ledum) давно попал в Rhododendron ( http://www.sekj.org/anb/anb393.htm#183 (http://www.sekj.org/anb/anb393.htm#183) ).

2) Заодно отыскал (2000 года) статью по систематику цитрусов ( http://www.springerlink.com/link.asp?id=tjggcl5wyyu6l69d (http://www.springerlink.com/link.asp?id=tjggcl5wyyu6l69d) ). При чтении имейте в виду, что российско-абхазско-грузинские "мандарины" -- это не "mandarin", а "Okitzu satsuma" (C. unshiu Marc.). Почему так получилось -- не знаю, может, А.Н.Краснов или его последователи чего напутали.

3) G. Brugerolle добавил ( http://www.nencki.gov.pl/pdf/ap/ap917.pdf (http://www.nencki.gov.pl/pdf/ap/ap917.pdf) ) еще один род к Collodictyonida, протистам неясного таксономического положения (отдельный тип?)

4) Молекулярные исследования митохондриального генома вернули трихоплаксу статус самого примитивного многоклеточного животного -- http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0602076103v1 (http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0602076103v1) . Таким образом, прежние идеи молекулярщиков о близости их к кишечнополостным и/или гребневикам не подтвердились.

5) W. Foissner исследовал в деталях феномен космополитического распространения протистов ( http://www.nencki.gov.pl/pdf/ap/ap921.pdf (http://www.nencki.gov.pl/pdf/ap/ap921.pdf) ) и пришел к вполне логичному выводу "Not everything is everywhere".

6) Французские планктонологи попробовали выяснить ( http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?o...=190&Itemid=112 (http://www.sb-roscoff.fr/Phyto/index.php?option=com_docman&task=doc_download&gid=190&Itemid=112) ), что же все-таки кроется за загадочными Alveolata Group I и Group II, которых находят лишь при секвенировании целых проб (environmental sequences). Тем временем B.S.Leander и B.A.Ramey нашли представителя новой группы паразитических альвеолят ("споровиков") -- http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...08.2006.00109.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2006.00109.x)

7) Отсеквенированы эбриевые ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...a3f6acdf442e6c7 (http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GX3-4K1X89F-1/2/32986df10a11510a7a3f6acdf442e6c7) ) -- странные морские жгутиконосцы с эндоскелетом (их всего 2 вида, зато с хорошо документированной палеонтологической историей). Оказалось, что они относятся к той же группе Cercozoa, что и радиолярии-феодарии.

8) Вышла большая работа по молекулярной систематике гастротрих ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...09.2006.00228.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1463-6409.2006.00228.x) ), которые традиционно рассматриваются в группе "первичнополостных червей". Получилось, что гастротрихи относятся к кладе, объединяющей коловраток, микрогнатозой, циклиофор и гнатостомулид. Вся эта клада -- в пределах так называемых "лофотрохозой", чудовищного молекулярного образования, объединяющего почти всех первичноротых, не относящихся к линяющим (Esdysozoa).

9) Как известно, в результате молекулярных исследований цветковых больше всего "не повезло" норичниковым и молочайным. Ботаники школы P. Endress выполнили анализ строения и развития цветка у Picrodendraceae -- одного из семейств, выделяемых из молочайных ( http://www.springerlink.com/link.asp?id=314544256273r08u (http://www.springerlink.com/link.asp?id=314544256273r08u) ). Анализ прежде всего хорош тем, что демонстрирует серьезные намерения морфологов "разобраться" наконец с запутанными отношениями в этой группе.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июня 23, 2006, 08:43:35
Новости систематики и эволюции

1) Новая работа о таксономических отношениях проблематичной группы Hydrocotyloideae ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt/tax/2006/00000055/00000002/art00003 ), "промежуточной" между зонтичными и аралиевыми. Авторы в основном подтверждают уже высказывавшиеся гипотезы.

2) Семейство портулаковых находится на перекрестке дискуссий о парафилии в систематике, потому что, согласно логике кладистики, в него надо включать кактусовые, дидиереевые и базелловые, чего не хотят сторонники традиций (а включать в портулаковые кактусы не хотят даже сами кладисты :) ). Еще одна своеобразная группа -- кергеленско-новозеландские гекторелловые, по-видимому, тоже должна войти в этот набор ( http://www.ingentaconnect.com/content/aspt/sb/2006/00000031/00000002/art00009 )

3) И про парафилию: R. Brummit написал статью под названием "Am I a bony fish?" ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt/tax/2006/00000055/00000002/art00002 ), в которой настаивает на признании парафилетических таксонов.

4) Как-то ускользнула от моего внимания еще одна статья T. Cavalier-Smith, где автор развивает смелую гипотезу о происхождении митохондрий от фотосинтезирующих (sic!) пурпурных бактерий ( http://www.journals.royalsoc.ac.uk/link.asp?id=r5k424547p53q788 )

5) Очередная гипотеза происхождения цветковых основана на геномике арабидопсиса: авторы утверждают, что ключевым событием в истории цветковых была двойная дупликация всего генома ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B6VJ1-4GT7G3R-1/2/82a252a6f1522c1861742ea2295025be )

6) Попытку установить место микроспоридий на филогенетическом дереве грибов предприняли канадские исследователи ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B6T39-4JHMTH2-2/2/7d76e07aa8ff2d30c9b5367f68c7c997 ). Получилось, что микроспоридии -- сестринская группа к "высшим" грибам (аско- + базидиомицетам).

7) Молекулярные исследования подтверждают дифилетичность радиолярий, а также близость к ним своеобразнейшего протиста Sticholonche ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GW3-4K606H8-1/2/0c2fae8b13c146117a7ce5ebe3d3ff5f )

8) Молекулярная систематика амеб развивается быстрыми темпами, причем российские протистологи здесь лидируют. В последней работе С.И.Николаева с соавторами установлена принадлежность замечательного во многих отношениях протиста Multicilia marina ( http://ijs.sgmjournals.org/cgi/content/abstract/56/6/1449 ), который впервые смогли культивировать в лаборатории А.П.Мыльникова (ИБВВ, Борок).

9) Систематика млекопитающих более или менее стабилизировалась, однако в статье японских исследователей ( http://www.pnas.org/cgi/reprint/0603797103v1 ) впервые установлена клада, объединяющая непарнокопытных и рукокрылых, романтически названная "Pegasoferae" :)

10) Ископаемая неогнатная птица из раннего мела (!) найдена в Китае ( http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/312/5780/1640 ). Это заставляет в очередной раз пересмотреть представления о времени возникновения основных групп птиц.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июня 23, 2006, 08:44:47
Произошло июньское обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an -- литература по цветковым растениям (все годы)
os -- литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to -- литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
ts -- литература по теории эволюции и систематики (все годы)
Структура архива и подбор статей обусловлены моими личными предпочтениями. Однако, я старался представить _всю_ доступную в PDF литературу по мегасистематике в 2003 года. Представлены все статьи, упоминавшиеся мной ранее в "Новостях".
Следующее обновление --- примерно 15 июля.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Rashid Mirzadinov от июня 24, 2006, 15:31:36
Цитироватьadada
Май 13, 2006 18:33
....Файлы PDF я часто преобразую в DOC с помощью проги "PDF Transformer", продуктом той же, что и FineReader, компании. Она делает это качественно, с распознаванием языков. Затем в Ворде удаляю мягкие переносы, перевожу ПРОМТом и сохраняю в виде таблицы-билингвы.
Очень удобно потом пользоваться плодами.
+
Только не забывайте удалять ключики из защищенных пэдээфок!

Спасибо! АДАДА!
Скачал ПДФ Трансформер. Однако я как компьютерный "чайник" не понимаю как "удалять ключики от защищенных пдэфок".
Прошу пошагово описать процедуру.
Заранее рахмет-сенькс
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от июня 27, 2006, 18:25:50
Открыт механизм работы иммунной системы насекомых:
http://www.gazeta.ru/science/news/684430.shtml
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июня 30, 2006, 13:06:22
Вроде не ботаническая, и не совсем новая книга, однако вещь интересная и заслуживающая внимания:
Ю.В.Чайковский. Эволюция. М.: Центр системных исследований ИИЕТ РАН. 2003. 472 с. PDF, 4 Mb. Публикуется с разрешения автора ( http://herba.msu.ru/shipunov/school/books/chaikovsky2003.pdf (http://herba.msu.ru/shipunov/school/books/chaikovsky2003.pdf) ). Вот аннотация к книге:
Книга рассказывает про возникновение, развитие и нынешнее состояние науки о биологической эволюции. В отличие от других книг, здесь история наук призвана показать, что наши новые теории обычно коренятся в прежнем знании, в традициях и в мировоззрении. При необходимости даются параллели с идеями эволюции в других науках (космологии, геологии, экономике и др.) и религии. Подробнее других разобраны идеи российских эволюционистов. Эволюционная идея старше европейской науки, а в науку Нового времени вошла за 300 лет до Ч. Дарвина. Ранний эволюционизм был надолго забыт, хотя во многом сходен с новейшим. Чтобы использовать прежний опыт и не повторять ошибок прошлого, ученые должны не просто знать о своих предшественниках, но уметь понимать ход их мысли и суть их споров.
От себя добавлю, что Юрий Викторович -- замечательный историк науки, отличный публицист и просто хороший человек. Его последовательный антидарвинизм не имеет ничего общего с так называемым "креационизмом" (то есть антиэволюционизмом). К сожалению, с работами Ю.В.Чайковского знакомо не так много людей, как этого бы мне хотелось. Рекомендую и две его другие книги -- "Элементы эволюционной диатропики" и "О природе случайности".
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Игорь Антонов от июля 02, 2006, 12:50:26
plantago, большое спасибо за интересную книгу!
Там по тексту встречаются вставки, выделенные синим цветом и представляющие собой редакцию 2006 года. И эти вставки  часто ссылаются на "Дополнения", в которых в конце книги находится новый материал. Но самих  "Дополнений" в  конце книги нет. Видимо, они должны быть  в отдельном файле. Не найдётся  ли у вас возможности выложить также и "Дополнения"?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июля 03, 2006, 02:50:23
Увы, это все, что на настоящий момент можно было выложить. Полный текст нового издания (2006/2007) находится в издательстве, но его публиковать в Интернет нельзя.
Название: virus
Отправлено: feralis от августа 06, 2006, 21:33:28
привет коллеги
Размещаю интенресную статейку из недавнего номера журнала Наука\сша\

О роли вирусов в эволюции и о началах этой эволюции
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от августа 09, 2006, 07:55:33
Цитата: "plantago"
Следующее обновление --- примерно 15 июля.
По техническим причинам следующее обновление архива состоится 15--20 августа.
Название: 1
Отправлено: feralis от августа 12, 2006, 20:29:34
я позволил себе разместить тут уже переведенные Сократом
пару статеек из NATURE

Это
о происхождении плавников
а другая о родстве билатеральных и книдарий
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от августа 14, 2006, 14:28:44
Новости систематики и эволюции

1) Выяснено, что необычное своими актиноморфными (радиальносимметричными) цветками бобовое Cadia отличается от "типичного" Lotus типом экспресии гена   CYC ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/103/32/12017 ) , причем у Cadia, по-видимому, такой тип экспрессии развился независимо от существоваших когда-то актиноморфных предков этой линии бобовых. Таким образом, получено еще одно подтверждение того, что актиноморфность может развиться из зигоморфности буквально "за один прием".

2) У кукурузы найден потенциальный ортолог гена арабидопсиса DRN, отвечающего за формирование семядолей ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B6W8W-4K8Y99V-2/2/ffc4f8204092cd37dad5b0f501451db5 ). В отличие от арабидопсиса, он экспрессируется сравнительно поздно, причем в зоне будущего щитка -- органа, который многие морфологи и считали семядолей у злаков.

3) Выполнен анализ филогении перечноцветных (Piperales) -- одного из порядков примитивных цветковых растений (Wanke et al., http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903 ; "Articles in press"). Практическим следствием является то, что, по-видимому, все же придется делить семейство Кирказоновые (Aristolochiaceae) на два: собственно кирказоновые и копытневые (Asaraceae).

4) Подробно исследована филогения заразиховых -- "светлого пятна" на фоне хаоса групп "норичниковых" и близких семейств ( http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/7/1039 ). Замечательно, что потеря хлорофилла (и переход к полному паразитизму) у заразиховых происходил не один раз.

5) Проанализировано таксономическое разнообразие грибов-эндофитов трех представителей разных групп растений (плаунов, сосновых и цветковых растений) из Канады (Higgins et al., http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903 ; "Articles in press"). Обнаружено большое количество филотипов, относящихся к новым линиям аскомицетов. Еще раз подтверждается, что эндофиты растений -- это очень перспективный "biodiversity hotspot", причем в умеренных широтах их разнообразие несильно отличается от тропического.

6) У маленькой группы протистов-катаблефарид найден фотосинтезирующий представитель -- новый род Hatena ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GX3-4KKFPK1-1/2/2ce2e987157a54f9b092c3d5f29a4ea2 ), в клетках которой в качестве "хлоропласта" выступает зеленая водоросль Tetraselmis (у которой деградируют все органеллы, за исключением собственного хлоропласта). Фотосинтезирующие особи Hatena не имеют пищедобывающего аппарата, а вот после деления водоросль достается только одной из клеток. Вторая клетка становится гетеротрофной и формирует пищедобывающий аппарат заново.

7) Проделан еще один глобальный анализ филогении эукариот (85 белков, задействованы все имеющиеся на настоящий момент сиквенсы из GenBank). Результаты ( http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/msl055v1 ) в целом подтверждают идею Cavalier-Smith о двух ветвях эукариот -- уни- и биконтах. В пределах биконт все методы анализа указывают на раннюю дивергенцию зеленых растений и красных водорослей, а также на относительную продвинутость безмитохондриальных жгутиконосцев-экскават (например, ламблии), которые долгое время считались наиболее примитивными эукариотами. Остальные клады разрешены значительно хуже :(

8) Th. Cavalier-Smith продолжает настаивать на том, что наиболее примитивные бактерии -- зеленые несерные ("Chlorobacteria"), а архебактерии -- наиболее молодая и продвинутая группа прокариот ( http://www.biology-direct.com/content/1/1/19/abstract ). На этот раз использован "transition analysis", который представляет собой, собственно, сравнительно-морфологический анализ на уровне эволюции белков и путей биосинтеза. Статья интересна еще и тем, что журнал "Biology Direct" использует метод он-лайн рецензирования -- в тексте Вы можете увидеть "живые" дискуссии с рецензентами.

9) Впервые выполнена работа по анализу разнообразия так называемых "Korarchaeota" -- некультивируемых представителей особой линии архебактерий, найденных до того лишь в горячих источниках Йеллоустоунского Национального Парка ( http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/72/7/5077 ). Авторы статьи нашли корархеот и в гидротермах Тихого океана. Кроме того, выяснилось, что эта линия весьма разнообразна, и, по-видимому, отличается высоким эндемизмом.

10) Статья А. В. Ересковского и A. K. Dondua ( http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GJF-4KJV309-1/2/b78ab967d5583db22f37f3d2aba39029 ) посвящена эволюции губок. Авторы настаивают на том, что губки вообще не имеют настоящих зародышевых листков (экто- и энтодермы), а, следовательно, также и гаструляции.
Название: 5
Отправлено: feralis от августа 20, 2006, 22:06:48
Фото прекрасного дерева хищных размещаю но сам текст увы не пролазит через лимит разрешенного размера
Ну а второй файл это уже работа с родословной волка
Можно отметить что волки современные произошли вместе с человеком
Это я к вопросу о видообразовании-человек ровесник окружающих его видов
и история их не менее интересна
Этот файл тоже превышает и я ограничился фото
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от августа 22, 2006, 15:44:20
Произошло августовское обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an - литература по цветковым растениям (все годы)
os - литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to* - литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
ts - литература по теории эволюции и систематики (все годы)
* Обновлялся только этот архив. Представлены все статьи, упоминавшиеся мной ранее в "Новостях".
Следующее обновление -- примерно 15 октября.
Название: 7
Отправлено: feralis от августа 26, 2006, 21:20:33
Размещаю в прицепе фото страниц из книги Поля Бейна
50 знаменитых раскопок
Думаю посетителям ветки о неандертальцах будет интересно узнать что крутым охотником сапиенс стал лишь 40 000
лет назад а до того он ловил безобидных животных

Это на страницах посвященных пещерам класис

а два других фото-страници о находке полного скелета австралопитека
Реконстуирована его стопа
Так вот обитал он и  на деревьях но мог и отлично ходить и бегать на 2 ногах
А веть голень его была уже прямоходяща

Читать конечно лучше просмотрщиком фото увеличивая фото до оптимального размера текста

Жду отзывов стоит ли размещать тут подобное
Кстати у меня материалов много и по русски  как сегодня
а я надеюсь что мне пришлют статьи из
журнала человеческой эволюции
я тоже их размещу тут
Название: 8
Отправлено: feralis от августа 26, 2006, 21:28:38
Еще
Название: в полет
Отправлено: feralis от августа 27, 2006, 11:22:40
На форуме кислом мне скучно бывать и в африку я улетаю
......................................
Лучше один раз увидеть чем долго рассуждать о разрушении природы человеком
есть программа бесплатная Google Earth
Скачайте 13 мегов и в полет
На бесплатной версии не будет надписи в центре но правда и с определением масштаба трудности
У меня бета версия ПРО
в прочем они одинаковы
Размешаю фото заповедника гомбе где изучают шимпанзе
Это берега Таньганьики
Зеленые массивы леса это заповедник где не рубят с 1960 г но гляньте за его пределы
Еще фото за пределами заповедника Серенгети
везде я написал какова длина желтой линии-для масштаба
Название: еще серенгети
Отправлено: feralis от августа 27, 2006, 11:31:47
серенгети  и устье конго
Название: tr
Отправлено: feralis от сентября 04, 2006, 23:08:18
!750000 лет назад жили обладатели черепов из грузии правда есть и датировка в 1000000лет
статья  на французком языке 5 мегов и я вырезал из нее часть материала для ознакомления посетителей форума
Ну а кому интересен весь файл качайте-ссылка в самом конце моего конвертика
Этот журнал вообще интересен
Название: h
Отправлено: feralis от сентября 07, 2006, 22:22:51
Публикую классическую статью из нашего журнала Природа за 1982г
Там речь идет о вещах принципиальных и статья ничуть не устарела за эти годы
Всякий любитель поговарить о эволюции должен  с ней ознакомиться

Итак место монофилии и полифилии в эволюции
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от сентября 07, 2006, 22:29:40
еще
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Baryonyx от сентября 11, 2006, 01:14:35
Шишкин, М. А. Индивидуальное развитие и уроки эволюционизма // Онтогенез, т.37, №3, с.179-198, 2006.

Нынешний кризис эволюционизма был предсказуем изначально, поскольку преформационная модель развития, заключенная в идее дискретной наследственности, противоречит системным свойствам онтогенеза. Соответственно, принцип отбора наследственных факторов не может объяснить эволюции. Построенная на нем синтетическая теория содержит неразрешимые противоречия в своих ключевых понятиях. Согласно альтернативной эпигенетической теории, исходящей из целостности живой организации, наследственность есть продукт отбора и выражает телеономическую направленность развития к устойчивому конечному состоянию. Объединение генетической концепции эволюции с признанием целостности развития принципиально невозможно. Причина доминирования генетических взглядов на эволюцию заключена не в их логическом обосновании, а в соответствии механистической традиции XVIII-XIX вв. По этой же причине для эволюционной биологии в целом типично отождествление частных линейных зависимостей с закономерностями эволюции. Следование этому пути в современных поисках "нового эволюционного синтеза" заранее обрекает их на неудачу. Эволюционная интерпретация обобщений генетики возможна лишь на основе их описания в терминах индивидуального развития.

Ключевые слова: система индивидуального развития, наследственность, эволюция, устойчивость, регуляция, редукционизм.


pdf (нераспознанный)
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от сентября 22, 2006, 07:32:49
Произошло сентябрьское (внеочередное) обновление on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an - литература по цветковым растениям (все годы)
os - литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to* - литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
misc* - литература по теории эволюции и систематики (все годы), в том числе статьи Шапошникова (1961, 1966, 1984), а также многое другое
* Обновлялись только эти архивы.
Следующее обновление -- примерно 15 ноября.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от сентября 27, 2006, 08:22:41
Новости систематики и эволюции

1) J. Buckham с соавторами выдвинули новую идею о том, как строить филогении на основании сиквенсов нескольких генов ( http://www.biology-direct.com/content/1/1/26 (http://www.biology-direct.com/content/1/1/26) ). Они справедливо критикуют практику простого соединения последовательностей, и предлагают новую "отметающую" методику, основанную на бутстрепе и анализе главных компонент. Кстати, еще раз советую обратить внимание на этот журнал и почитать их замечательную вводную статью( http://www.biology-direct.com/content/1/1/1 (http://www.biology-direct.com/content/1/1/1) ).

2) Группа A. Simpson исследовала филогенетические отношения апузомонадид ( http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/msl120v1 (http://mbe.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/msl120v1) ) -- своеобразной группы протистов неясного таксономического положения. Наиболее вероятным выглядит предположение, что апузомонадиды -- сестринская группа к "ризариям" (куда, по современным представлениям, относятся многие -- но далеко не все -- амебы). Поскольку апузомонадиды двужгутиковые, а ризарии -- одножгутиковые, идея Th. Cavalier-Smith о разделении всех эукариот на эти группы поставлена под сомнение.

3, 4) "Environmental sequences" дают все новые и новые интересные результаты. Например, исследование пресноводных протистов неожиданно выявило множество новых линий ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...20.2006.01111.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1462-2920.2006.01111.x) ), близких к хитридиевым грибам, возможно, ранга типа. А японские исследователи ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...fb46cdaf1d48499 (http://www.sciencedirect.com/science/article/B7GX3-4KTVPB6-1/2/58832e657712ff73cfb46cdaf1d48499) ) работали с разнообразием протистов в анаэробных местообитаниях и выяснили, что кроме "типичных" анаэробов (экскават и инфузорий), анаэробные представители есть почти во всех группах протистов.

5, 6) Горизонтальный перенос между царствами -- не очень обычная вещь. Один из последних примеров -- обнаружение у губок из отряда Spirophorida интрона cox1, возможно, заимствованного у грибов ( http://www.biomedcentral.com/1471-2148/6/71 (http://www.biomedcentral.com/1471-2148/6/71) ). А я этим летом читал на Botany-2006 стендовый доклад японцев, которые на основании (как мне кажется) похожего случая утверждали ( http://www.2006.botanyconference.org/engin...c=detail&aid=51 (http://www.2006.botanyconference.org/engine/search/index.php?func=detail&aid=51) ), что печеночные мхи, в отличие от всех остальных растений, произошли от грибов. Любопытно в этой связи вспомнить, что и губки, и печеночные мхи просто напичканы эндотрофными грибами.

7, 8) Кстати, об эндофитных грибах. Интересная находка сделана канадскими исследователями -- они выяснили, что эндофит сосны имеет в цикле развития водную (!) стадию ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...4X.2006.02909.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1365-294X.2006.02909.x) ). А "типично" водные лабиринтовые "грибы", как оказалось, имеют наземного представителя -- тканевого паразита злаков ( http://www.mycologia.org/cgi/content/full/97/1/185 (http://www.mycologia.org/cgi/content/full/97/1/185) ).

9) Работа S. Wang и P. Dodson посвящена оценке разнообразия динозавров ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0606028103v1 (http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0606028103v1) ). В настоящее время описан 521 род неавиморфных динозавров, а авторы полагают, что всего существовало около 1850 родов. А мне лично эта статья нравится еще и тем, что "all calculations were performed by using code ... for the statistical software R ( http://www.r-project.org (http://www.r-project.org) )"

10) Ну, и немного о растениях ;) T. Tokuoka и H. Tobe предприняли очередной филогенетический анализ наиболее спорной группировки новейшей систематики цветковых -- порядка Mahlpigiales ( http://dx.doi.org/10.1007/s10265-006-0025-4 (http://dx.doi.org/10.1007/s10265-006-0025-4) , http://www.springerlink.com/content/94688k473404564q (http://www.springerlink.com/content/94688k473404564q) )*. Замечательно, что авторы впервые в истории изучения этой группы получили статистическую поддержку большинства крупных ветвей.

11) Опубликовано молекулярное supertree для сложноцветных ( http://www.compositae.org/picts/Supertree.png.zip (http://www.compositae.org/picts/Supertree.png.zip) ). Самое большое семейство цветковых растений наконец-то получило некоторую основу для переклассификации.

12) Один из последних номеров журнала "Plant systematics and evolution" ( http://www.springerlink.com/content/j6ux1266q32r (http://www.springerlink.com/content/j6ux1266q32r) )* также целиком посвящен филогении цветковых, но на более высоком уровне. Авторы статей поставили очень благородную задачу в дополнение к молекулярным данным найти, наконец, морфологические синапоморфии для "больших порядков" подкласса розид -- и более или менее в этом преуспели.

13) Только что вышедший номер журнала "Taxon" содержит несколько интересных статей, в том числе новую классификацию папоротников, представленную коллективом авторов ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt...000003/art00017 (http://www.ingentaconnect.com/content/iapt/tax/2006/00000055/00000003/art00017) ). Наиболее интересны читателю, наверное, будут "наши" среднерусские папоротники, для которых принята довольно дробная классификация семейств: Dennstaedtiaceae (Pteridium), Aspleniaceae (Asplenium), Thelypteridaceae (Thelypteris), Woodsiaceae (Athyrium, Cystopteris, Diplazium), Onocleaceae (Matteuccia), Dryopteridaceae (Dryopteris, Polystichum), Polypodiaceae (Polypodium) -- все в одном порядке Polypodiales.

14 etc.) Другая интересная статья из этого же номера ( http://www.ingentaconnect.com/content/iapt...000003/art00004 (http://www.ingentaconnect.com/content/iapt/tax/2006/00000055/00000003/art00004) ) предостерегает филогенетиков от использования выборок малого размера, которые могут давать серьезно отклоняющиеся от модельных результаты, особенно при применении байесовых методов. Еще в этом номере есть несколько статей про электронные определительные ключи, но новости и так уже слишком большие получились ;)

---
* Springer теперь имеет новый дизайн и не имеет "linking options". Не знаю поэтому, насколько стабильны эти ссылки. В случае чего пишите.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от октября 09, 2006, 21:39:29
Читаю оглавление AMNH  (Амерского музея естественной истории) и просто офигеваю
http://digitallibrary.amnh.org
Сокровище. Жаль, скачивать страшно долго. Скооперироваться с кем-нить, что ли: скачать по разным темам и обменяться.
Сам узнал от А.Г.Сенникова, а потом дополнительно от М.Рогова, за что обоим спасибо.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Jan Metlevski от октября 09, 2006, 21:58:18
Gilgamesh, что именно Вас там интересует? Напишите, думаю что смогу скачать нужные Вам статьи и переслать их Вам.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от октября 10, 2006, 07:33:29
Самые интересные то я сам себе скачаю, а вот всю подборку желательно кооперативом добывать, т.к. объем ориентировочно в несколько гигов. Что Вам интересно?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Jan Metlevski от октября 10, 2006, 15:35:53
Gilgamesh, у них там примерно 5500 работ; мне все перекачивать незачем. Я могу в любой момент перекачать то что мне надо - работы по систематике и таксономии совок. А Вам разве нужно всё? Там например есть куча работ по энтомологии; они Вам разве нужны?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 11, 2006, 07:47:21
Вот, чтобы два раза не постить:
http://molbiol.ru/forums/index.php?showtopic=124125
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от октября 11, 2006, 17:25:52
Ян, жадность, понимаете ли. Да и мне лично - м.б. не понадобится, но я могу передать их кому-либо или выменять на что-то. + до насекомых добираться далековато, ибо одних тетрапод выше крыши, а они интересны мне, даже для сбора инфы по ним понадобится обмен.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Jan Metlevski от октября 11, 2006, 20:41:21
Gilgamesh, т. е. Вас интересует всё по тетроподам? Давайте так, там у них на сайте есть поисковик, дайте мне ключевые слова по которым Вы хочете найти статьи. Я по ним постараюсь скачать всё што там будет и буду Вам пересылать понемногу. Так пойдет?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от октября 11, 2006, 21:40:34
Ну это уже паразитирование с моей стороны получится, качайте то, что Вам интересно, а тетрапод уже по остаточному принципу (я - наоборот, главное-не пересечься). Да и пересылка лучше большущими кусками (диск от Литвы до Омска и обратно накладно слать).

Впрочем, если у Вас выделенка или иной источник неограниченной закачки и по этой причине будете качать намного эффективней, чем я,, то я могу за скачанный массив отблагодарит своими сканами.

И лучше пригласить кого-нибуть ещё в консорциум и тогда уже через сколько-то месяцев взаимоосчастливиться.
Название: Писал ли Рожнов это? Ваши комментарии?
Отправлено: Atmel от октября 25, 2006, 17:20:31
Действительно ли так считает Сергей Рожнов? Или это утка?:

Экспериментальные данные последних десятилетий и результаты археологических раскопок изобилуют массой фактов, которые несколько разнятся с основными постулатами теории Дарвина, - рассказал заместитель директора Палеонтологического института РАН член-корреспондент РАН Сергей Рожнов. - Пока ее никто не развенчивал, но разговоры на этот счет ведутся. Слишком уж много в ней содержится противоречий и преувеличений тех процессов, которые в реальности имеют лишь частный характер.
Главные претензии протестующих ученых относятся к ложной, по их мнению, оценке роли естественного отбора в ходе эволюции. Мелкие накапливающиеся изменения видов, на которые опирается теория, в реальности практически не происходят. Кроме того, ученым не удалось вывести новые виды животных, экспериментируя с радиационной мутацией. В ходе нескольких поколений вид освобождался от серьезных генетических изменений, вызванных искусственно. Да и археологи так и не смогли за полтора столетия обнаружить останки переходных форм животных. Многие кости обезьяноподобных предков человека оказывались на практике лишь искусными подделками.
http://www.uastar.net/nws.php?id=7325



??????????????
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: e-note от октября 26, 2006, 14:15:20
очень талантливо не закрыты кавычки - непонятно где кончается речь академика, а где начинаются домыслы журналиста.
у меня есть сильные сомнения в корректности цитаты.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atmel от октября 26, 2006, 17:29:34
Цитата: "e-note"очень талантливо не закрыты кавычки - непонятно где кончается речь академика, а где начинаются домыслы журналиста.
у меня есть сильные сомнения в корректности цитаты.
Выяснилось.

Сравниваем: "...I am convinced that Natural Selection has been the most important but not the exclusive means of modification." http://darwin-online.org.uk/
Перевод: "...я убежден, что Естественный Отбор был самым важным, но не единственным средством модификации". http://charles-darwin.narod.ru/introduction.html

Вот ведь как верующие стараются извратить цитаты в свою пользу. Поэтому надо быть корректными в них. :))
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 27, 2006, 04:14:50
Обновлений on-line архива статей по мегасистематике, эволюции и теории систематики больше не будет, потому что он обновляется теперь автоматически. Архив лежит на http://herba.msu.ru/shipunov/else/ref (на самом деле уже не там, но это не имеет значения, потому что работает редирект).
Для доступа нужен логин и пароль, который я распространяю индивидуально (через личные сообщения) и прошу не распространять вторично. Все разделы, кроме "flora", доступны для скачивания:
an - литература по цветковым растениям (все годы)
os - литература по растениям в целом и бактериям (все годы) и по животным и протистам (до 2003)
to - литература по животным и протистам (с 2003) и самые новые поступления по бактериям и растениям
misc - литература по теории эволюции и систематики (все годы), в том числе статьи Шапошникова (1961, 1966, 1984), а также многое другое
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 27, 2006, 04:17:05
Цитата: "Atmel"Сравниваем: "...I am convinced that Natural Selection has been the most important but not the exclusive means of modification." http://darwin-online.org.uk/
Перевод: "...я убежден, что Естественный Отбор был самым важным, но не единственным средством модификации". http://charles-darwin.narod.ru/introduction.html
Вот ведь как верующие стараются извратить цитаты в свою пользу. Поэтому надо быть корректными в них. :))
Не понял, причем здесь Рожнов? Зачем обижать всех верующих? К тому же приведенный выше перевод -- корректный.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от октября 27, 2006, 16:52:26
т.е. меняется только состав "to", а прочие разделы константные, так?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atmel от октября 27, 2006, 17:50:14
Цитата: "plantago"
Не понял, причем здесь Рожнов? Зачем обижать всех верующих? К тому же приведенный выше перевод -- корректный.
Рожнов здесь притом, что приведена его цитата. а вот в каком контексте - здесь и есть манипуляция. Помните, даже месторасложение запятой может резко менять смысл, также как и кавычек, а тем более выдирание из контекта.

Вы лучше поясните, что значит "обижать верующих" (чем, кстати?), и как Вы лично относитесь к теории эволюции? А еще больше мне было интересно, как воспринимает Сергей Рожнов?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 28, 2006, 09:23:03
Цитата: "Atmel"Рожнов здесь притом, что приведена его цитата.
Что-то я, как говорится, "не врубаюсь". В Вашем посте ( http://www.paleo.ru/forum/posting.php?mode=quote&p=22244 , на который я и отвечал, что можно видеть по цитате), приведены две цитаты из Дарвина (оригинал и перевод), но нет цитат(ы) про Рожнова. Цитаты из Дарвина, кстати, приведены без точных ссылок, поэтому нельзя понять, из какого издания "Origin" они взяты (я нашел три издания).
Если же взять приведенную Вами выше цитату про Рожнова (пост http://www.paleo.ru/forum/posting.php?mode=quote&p=22195 , на который я _не_ отвечал), то там нет никаких цитат из Дарвина (ни на форуме, ни в оригинальном сообщении).
Поэтому я не понял, какое отношение имеет первый пост ко второму и задал вопрос. Вы его, к сожалению, не прояснили.
Цитироватьа вот в каком контексте - здесь и есть манипуляция. Помните, даже месторасложение запятой может резко менять смысл, также как и кавычек, а тем более выдирание из контекта.
Отсюда я делаю вывод, что приведенные Вами английская цитата из Дарвина и ее русский перевод все-таки, на Ваш взгляд, различаются. Пожалуйста, укажите, в чем состоит это различие.
ЦитироватьВы лучше поясните, что значит "обижать верующих" (чем, кстати?)
Вы написали следующее:
ЦитироватьВот ведь как верующие стараются извратить цитаты в свою пользу
Мне представляется, что это то же самое, что увидев пьяного на улице в Москве, говорить -- "вот ведь какие пьяницы эти москвичи". Вы не написали слова "все", но оно, к сожалению, обычно подразумевается в этом контексте. Таким образом, мне кажется, что Ваша фраза может быть воспринята как обвинение всех верующих в извращении цитат. Это отрицательная характеристика, которая может быть воспринята как обида.
Цитироватьи как Вы лично относитесь к теории эволюции?
Отношусь хорошо. Для того, чтобы познакомиться с моими взглядами подробней, используйте кнопку "Профиль", а затем "Найти все сообщения этого участника".
ЦитироватьА еще больше мне было интересно, как воспринимает Сергей Рожнов?
Это мне тоже интересно. Если здесь народ не ответит, советую спросить в ЖЖ у К.Ю.Еськова.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 28, 2006, 09:24:21
Цитата: "Gilgamesh"т.е. меняется только состав "to", а прочие разделы константные, так?
В настоящее время меняются (в основном дополняются) только разделы "to" и "misc".
Название: Теория эволюции Северцова
Отправлено: Gilgamesh от ноября 02, 2006, 07:55:11
Презентация книжки А.С. Северцова "Теория эволюции" М Владос 2005. Начну с того, что при указании на авторство Северцова всегда надо указывать инициалы, ибо Северцовы - уже 4м поколения являются виднейшими отечественными биологами (если грубо округлить, такое чередование поколений в жизненном цикле: биогеограф, зоолог - эволюционный морфолог, эволюционный теоретик - зоолог, эколог, - эволюционный теоретик, батрахолог). В случае правоты г-на Ламарка, Северцовым пора бы выработать какие-нибудь морфофизиологические адаптации... к дарвинизму.
Книга - учебник для биологических специальностей вузов, является логическим продолжением "Основ теории эволюции" того же автора, выпущенных в 1987 г. С тех пор текст и иллюстративный материал в столь значительной мере переработаны, что автор счел нужным позиционировать учебник как новую книгу. Сейас книга является альтернативой также недавно переизданному учебнику Яблокова и Ко, книга Северцова мне понравилась больше, но это субъективное впечатление, я на нем не настаиваю.
Из интересностей: Северцов в списке литературы указал таких популярных и обсуждаемых сегодня авторов как К.Ю.Еськов (Да, его "Историю жизни на Земле"), В.В. Жерихин, В.А. Красилов. Особенно же меня порадовло то, что отдельная главка посвящена изложению работ Н.И. Андреева и С.И. Андреевой, омских авторов, выявивших взрывоподобное видообразование у двустворок в условиях аральского экологического кризиса. По сути, это подтверждене концепции прерывистого равновесия. Занесенный в учебник автор становится классиком :))), с чем нужно будет поздравить Андреевх при случае.
Название: o
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:30:59
Всех поздравляю с днем Ивана Сусанина
Веть именно на форуме они флудят и заблуждаются\шутка\
До меня дошли слухи что некто из Сусаниных намерен сам попытаться получить отбором новые виды
Хочу напомнить что уже 100 лет как дрозофилла стала моделью  и как раз за репродуктивный цикл в 10 дней
И должен сказать что используются в генетике не дикие мухи а чистые линии которые ведут род от тех первых мух столетней давности
Так что и о чистых линиях я подвесил файл из учебника генетики
Другие файлы из оного учебника расскажут о мутациях которые тоже изучают в чистых линиях
вообще идея разводить и узучать генетику мух хороша тем что покажет взявшемуся за такое дело гераклу какой океан собрался он вычерпать своей плошкой

Читаю сейчас первый том прокариот созданный большим коллективом западных авторов для студентов и специалистов
В целях рекламы подвесил избранные места
очень интересная книга
Название: г
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:35:56
еще 3 странички о рядах
Название: 3
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:41:03
ну вот и последние 3 странички из журнала природа
Название: г
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:46:52
По ошибке сначала разместил статью из природы о гомологических рядах
Ну вот наконец и о мутациях и чистых линиях
Название: г
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:53:13
чистые линии и прокариоты
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 04, 2006, 19:57:25
последние избранные места из учебника о прокариотах
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Павел Волков от ноября 06, 2006, 16:28:00
Заметка об экземпляре дельфина с задней парой плавников. Атавизм, однако!
http://articles.news.aol.com/news/_a/dolphin-may-have-remains-of-hind-legs/20061104233709990003?ncid=NWS00010000000001
Фото в заметке имеется.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от ноября 07, 2006, 14:12:34
Потрясная заметка! %-)

Интересно, а почему китообразные потеряли заднюю пару плавников после вымирания перед миоценом? (если не вру)  - преимущества второй пары плавников для дельфинов и китов неочевидны, а вред - заметен?
Стабилизация курса движения задними плавниками при изгибах вверх-вниз не так отчетлива, как при из стороны в сторону? А при этом сопротивление воды из-за них растет заметно и резко снижает скорость плавания?

Спрашиваю потому, что современные киты - единственные водные животные, у которых етсь только ОДНА пара парных плавников. Все остальные, от акул до ихтиозавров - две пары. И при этом все остальные - плавают, изгибаясь из стороны в сторону, и только киты - вверх-вниз.

(тюлени и черепахи не в счет)
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Павел Волков от ноября 07, 2006, 16:10:07
А сирены???
Считается, что плавание китообразных и других млеков - это производное галопа. В "Прогулках с чудовищами" прекрасно показан стиль плавания амбулоцетуса - с вертикальными изгибами позвоночника и толчками задних лап. Потом их роль взял на себя хвост.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от ноября 08, 2006, 13:00:43
Да, наверное, это производное галопа млекопитающих... В сущности, это единственный класс, который весь поголовно двигается галопом (кроме нескольких видов-извращенцев и отсутпников  :lol: )
И ага. Про сирен забыл.  :D  Но это не очень суть - сирены плавают точно также, вертикальные изгибы.

В отличие от рыб, амфибий и рептилий - горизонтальные изгибы, и птиц и черепах - вообще нет изгибов и гребут только конечности.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Павел Волков от ноября 09, 2006, 13:53:48
А выдровая землеройка во время плавания машет хвостом из стороны в сторону. Он у неё и сплющен с боков, а не вертикально, как, например, у бобра и утконоса.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от ноября 09, 2006, 15:57:54
Вот она-то, выдровая землеройка, и есть главная извращенка и отступничка!  :lol:
(выдровая землеройка использует рептилийный тип движения при плавании с попеременными гребками лапами и ящерообразными изгибами позвоночного столбпа, если не вру).
Название: g
Отправлено: feralis от ноября 11, 2006, 20:21:38
Тут интересовались родословной собачьего семейства
Вывешиваю акробат где кладограмма есть но без дат
Воо широкополосный доступ установлю тогда поищу еще деревья
Кстати все кошки имели одного предка 15 мильонов лет назад
и человекообразные приматы тоже
Думаю это вообще правило для семейстива-15 мильонов лет
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от декабря 04, 2006, 13:32:04
Новости систематики и эволюции

1) Сложный и многогранный вопрос происхожднения цветка и цветковых растений обсуждают в дискуссионной статье R. Bateman и P. Rudall ( http://jxb.oxfordjournals.org/cgi/content/...ract/57/13/3471 (http://jxb.oxfordjournals.org/cgi/content/abstract/57/13/3471) )

2) Вышло сразу несколько работ по макросистематике и филогении грибов: низших базидиомицетов ( http://www.springerlink.com/content/r400614816r7155x/ (http://www.springerlink.com/content/r400614816r7155x/) ), базидиомицетов в целом ( http://www.sciencedirect.com/science/artic...d79e1b48021c34a (http://www.sciencedirect.com/science/article/B6WNH-4KYF1WN-2/2/1e94bb43c9c055226d79e1b48021c34a) ), сордариевых аскомицетов ( http://www.springerlink.com/content/u185m0p14p42m480/ (http://www.springerlink.com/content/u185m0p14p42m480/) ), леканоровых  -- крупнейшей группы лихенизированных аскомицетов, "лишайников" ( Phylogenetic comparison of protein-coding versus ribosomal RNA-coding sequence data: A case study of the Lecanoromycetes (Ascomycota) / http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903 (http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903) )*. В колонке новостей уже появлялась информация об обзорной статье Nature по филогении грибов в целом. BMC Evol Biol. поместил аналогичною статью, построенную на основе анализа полных геномов ( http://www.biomedcentral.com/1471-2148/6/99 (http://www.biomedcentral.com/1471-2148/6/99) ). Наконец, появилось сообщение об обнаружении ископаемых гломеруломицетов в остатках риниофитов из раннего девона Шотландии ( http://www.springerlink.com/content/t56m33740301v41n/ (http://www.springerlink.com/content/t56m33740301v41n/) )

3) Кажется, решен вопрос о таксономическом положении загадочного животного Xenoturbella bocki ( http://www.nature.com/nature/journal/v444/...ature05241.html (http://www.nature.com/nature/journal/v444/n7115/abs/nature05241.html) ). По всей видимости, она относится к новому, четвертому типу вторичноротых животных (наряду с иглокожими, хордовыми и полухордовыми).

4) Анализ полных геномов на предмет выявления белков, связывающих железо, цинк, марганец и кобальт, позволил, в частности, предположить, что геномы до сих пор сохраняют информацию об относительном количестве этих металлов на древней Земле ( http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0605798103v1 (http://www.pnas.org/cgi/content/abstract/0605798103v1) )

5) Свежий взгляд на эволюционную историю одной из самых примитивных групп растений -- маршанциевых опубликован в Bryologist ( http://www.bioone.org/perlserv/?request=ge...OT%5D2.0.CO%3B2 (http://www.bioone.org/perlserv/?request=get-abstract&doi=10.1639%2F0007-2745(2006)109%5B303%3AUTEHOT%5D2.0.CO%3B2) )

6) Очень интересную статью, посвященную эволюции насекомоядности в пределах порядка гвоздичноцветных (где сосредоточена значительная часть насекомоядных) опубликовали немецкие авторы ( http://www.thieme-connect.com/ejournals/ab...5/s-2006-924460 (http://www.thieme-connect.com/ejournals/abstract/plantbiology/doi/10.1055/s-2006-924460) ) Для меня в свете наших исследований поведения росянки ( http://herba.msu.ru/shipunov/author/volkova_shipunov2005.pdf (http://herba.msu.ru/shipunov/author/volkova_shipunov2005.pdf) ) очень важно то, что росянки стоят наиболее близко к гипотетическим "предкам-липучкам" всей насекомоядной клады гвоздичноцветных.

7) Микотрофные бесхлорофилльные однодольные -- одна из наиболее трудных для молекулярного анализа групп цветковых растений. Авторы работы, посвященной филогении Burmanniaceae s.l., настаивают на полифилетичности семейства ( http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/11/1684 (http://www.amjbot.org/cgi/content/abstract/93/11/1684) ).

8) M. Luwdig на основе анализа гидрогеназ высказал предположение ( http://www.springerlink.com/content/j77l04122n111847/ (http://www.springerlink.com/content/j77l04122n111847/) ), что предками цианобактерий были зеленые несерные бактерии (Chloroflexi).

9) Несколько улучшила состояние молекулярной систематики протистов новая работа Th. Cavalier-Smith с соавторами ( Global eukaryote phylogeny: combined small- and large-subunit ribosomal DNA trees support monophyly of Rhizaria, Retaria and Excavata / http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903 (http://www.sciencedirect.com/science/journal/10557903) )*. В частности, едва ли не впервые найдена поддержка для Excavata -- группы, объединяющей амитохондриальных жгутиконосцев типа лямблии, эвгленовых с кинетопластидами и так тазываемых якобид.

10) Вышел номер Canadian Journal of Zoology, посвященный губкам ( http://pubs.nrc-cnrc.gc.ca/cgi-bin/rp/rp2_...?cjz_cjz2-06_84 (http://pubs.nrc-cnrc.gc.ca/cgi-bin/rp/rp2_tocs_e?cjz_cjz2-06_84) )

11) Важный шаг вреред на пути построения новой системы кольчатых червей сделан в публикации журнала Cladist ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...31.2006.00128.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1096-0031.2006.00128.x) ), хотя лишь чуть более половины узлов опубликованного дерева имеют значимую поддержку.

12) Несколько неидентифицированных групп очень высокого ранга постоянно появляются в "environmental sequences" эукариот из анаэробных местообитаний (см., например, http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...41.2006.00171.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1574-6941.2006.00171.x) ). "Marine Alveolate I", по-видимому, представляют собой паразитов, близких известным паразитическим динофлагеллятам. Видна еще довольно большая группа, близкая к эвгленовым (в широком смысле), но что это такое, покуда совершенно неясно.

13) "Не трогайте голубей!" -- призывают нас авторы статьи из Appl. Envir. Microbiol. ( http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/71/6/3153 (http://aem.asm.org/cgi/content/abstract/71/6/3153) ). Да, микроспоридиоз может быть очень неприятной штукой. Кстати, некоторые из безумных и загадочных микроспоридий, оказывается, имеют обратный "нормальному" порядок расположения субъединиц в rDNA ( http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/1...08.2006.00149.x (http://www.blackwell-synergy.com/doi/abs/10.1111/j.1550-7408.2006.00149.x) )!

---
* Такая странная ссылка, потому что sciencedirect не дает прямых ссылок на те статьи из "Articles in Press", которые представлены лишь PDF-файлами ("Accepted Manuscript")
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 08, 2006, 21:22:59
прицепе
How Neanderthal molar teeth grew

Прошу модератора увеличить массу прикрепляемого файла до не менее 1 мб ибо много статей не проходит в это игольного ушко
Название: t
Отправлено: feralis от декабря 10, 2006, 20:02:06
Sequencing and Analysis of Neanderthal Genomic
Название: 6
Отправлено: feralis от декабря 18, 2006, 19:24:46
A Shot of Oxygen to Unleash the Evolution of Animals

Late-Neoproterozoic Deep-Ocean Oxygenation and the Rise of Animal Life

science
 7 December 2006
один из файлов к сожалению не прошел через ограничение по размеру и я текст скопировал в текстовый документ

http://books.google.com/
и Live Search Books  http://www.searchengineshowdown.com/blog/2006/12/live_search_books.shtml
на этих сайтах море книг но на англиском
Название: o2
Отправлено: feralis от февраля 12, 2007, 21:34:50
The invention of oxygenic photosynthesis was a small step for a bacterium,but a giant leap for biology
and geochemistry.So when and how did cells first learn to split water to make oxygen gas?
Название: u
Отправлено: feralis от февраля 12, 2007, 21:42:25
18 January 2007 NATURE
http://www.nature.com/nature/journal/v445/n7125/pdf/445237a.pdf

Воскрешен из могил на аляске вирус знаменитой испанки
воскрешен чтоб убить под наблюдением подопытных обезьян
Ну вот вам и пример первого вида воспрявшего из мертвых
Ну не вида но вариации гриппа т е вируса
напомню что и секвенирование тоже началось в 1978 г с бактериофага одноцепочного всего в 5386  нуклеотидов
грипп покруче будет и опаснее
Так что дойдет дело и до пещерного льва ну а пещерные медведи недавно жили
вроде на кАВКАЗЕ ЕЩЕ В БРОНЗОВОМ ВЕКЕ
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от февраля 12, 2007, 23:55:04
Я читал, что в Средиземноморьи, в т.ч. и в Закавказьи жили небольшие медведи, вероятно родственные гималайским. Но когда, не помню,  вероятно в Палеолите.
Название: t
Отправлено: feralis от февраля 25, 2007, 20:17:42
22 Февраля 2007

Попутчик

--------------------------------------------------------------------------------

Более, чем половина всех людей заражена бактерией кишки Пилорусы Helicobacter, который может вызвать язвенные болезни и - фактор риска для желудочного рака. Основное исследование наследственной изменчивости в H. пилорусы изолирует показывает, что ключ формируется в распределении своего генетического зеркала разнообразия том своего человеческого хозяина. Хотя на людях, есть непрерывный убыток генетического разнообразия с возрастающим расстоянием из Восточной Африки, напоминая, чтобы люди уже были заражены язвой-причиной бактерии около 58,000 лет тому назад когда они мигрировали из Африки. Люди и H. пилорусы также кажется, иметь распространение из Восточной Африки той же шкалой времени, напоминая, чтобы их ассоциация предшествовала случаю 'из Африки'. Группа также обнаруженная, что генетическая косметика H. пилорусы более разнообразное чем те же самые люди, так что анализ ДНК микроорганизма мог помочь будущей работе.


Начало Африканца для близкой ассоциации между людьми и Пилорусы Helicobacter
http://www.nature.com/nature/journal/v445/n7130/edsumm/e070222-13.html
Название: k
Отправлено: feralis от марта 12, 2007, 22:00:35
много интересных работ вот на этой странице http://www.adelaide.edu.au/acad/publications/
например про присхождение осьминогов
из фото кладограммы следует что еще в юре они сбразовали отдельную ветвь и значить
белеменниты вовсе не их предки
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от марта 12, 2007, 23:38:08
Библиотека Ихтика http://ihtik.lib.ru/philosarticles_22apr2005/
В том числе "Чудов С.В. Устойчивость видов и популяционная генетика хромосомного видообразования" на http://ihtik.lib.ru/dreamhost_biology_4janv2007.html
(тема "книги Онлайн" у меня уже несколько месяцев не работает)
Название: t
Отправлено: feralis от марта 14, 2007, 21:49:46
Origin of avian genome size and structure in
non-avian dinosaurs

это в прицепленом файле
а вот ссылочка на запасы ПДФ о эволюции вшей
http://www.phthiraptera.org/Bibliography/2004.htm
Название: hhy
Отправлено: feralis от марта 18, 2007, 09:39:46
Hydatellaceae - небольшие водные растения, живущие скромными жизнями прочь со света рампы, и обычно принятого, чтобы быть односемядольными цветущими растениями имело отношение к травам. Теперь они подвергнуты самым последним молекулярным методам, и они оказываются закрытые родственники основные покрытосемянные (растение) как например, кувшинка, увеличивая свое значение огромно. Они принадлежат прежде неузнанному происхождению, расширяющемуся около корня покрытосемянных (растение) — радикальное дополнение на три глубоких ветки обнаруживало в 1999, что rekindled интерес среди молекулярных биологов в начале покрытосемянном (растение), что Darwin был назван "отвратительная тайна".

http://www.nature.com/nature/journal/v446/n7133/edsumm/e070315-13.html
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от марта 18, 2007, 22:45:34
попробовал использовать Яндекс,  а не рамблер в качестве поисковика по новосям. Вот что нарыл сразу (но пользоваться неудобно - можно лишь в случае ежедневного просмотра, т.к. там даются большие аннотации, а не только заголовки, как у рамблера)

Теплый климат тормозит эволюцию
18.03 03:49   MIGnews.com
http://www.mignews.com/news/Science/world/180307_32547_98103.html
Новые виды птиц и млекопитающих развиваются и эволюционируют более быстрыми темпами в высоких широтах, чем в тропиках, но и процесс их вымирания там также идет быстрее. Такую гипотезу выдвинули ученые на основании нового исследования. Результаты работы, подробно изложенные в очередном номере журнала Science ....
Название: Ученые требуют покончить с дарвинизмом
Отправлено: Veniamin23 от апреля 04, 2007, 23:03:24
Уже более 600 ученых из разных стран мира засвидетельствовали свой «крайний скептицизм» в отношении догм «теории эволюции» Дарвина. Количество переходит в качество – разочарование в принципе «естественного отбора» охватывает уже не только научный мир.
Инициатором движения за отказ от догм дарвинизма, охватившего научный мир, выступил институт Discovery в Сиэтле, США. Сбор подписей ведется с 2001 года, однако быстрый в последнее время рост числа ученых, желающих официально оформить свою позицию отвержения теории «естественного отбора», стал фактом, значимость которого выходит за пределы научной дисциплины.
«Мы со скептицизмом относимся к заверениям о том, что случайные мутации и естественный отбор являются причиной наблюдаемого многообразия и сложной организации живых существ, - говорится в документе, под которым ставят подписи ученые разных стран. – Необходимо способствовать детальному изучению фактов, трактуемых как подтверждения теории Дарвина».
В документе говорится:
«Результаты научных исследований в различных предметных областях: таких, как космология, физика, биология, искусственный интеллект, полученные в последние десятилетия, заставили ученых подвергнуть сомнению основной догмат дарвинизма – принцип естественного отбора, а также приступить к более подробному исследованию фактов, трактуемых в его пользу.
До настоящего времени общественное телевидение, политика в области образования и учебники утверждают, что теория эволюции Дарвина полностью объясняет сложность организации живых существ. Общественность убеждена, что все научные доказательства подтверждают дарвинизм и что фактически каждый ученый в мире уверен в справедливости теории.
Нижеподписавшиеся ученые оспаривают первое утверждение из вышеперечисленных и служат наглядным подтверждением неверности второго. С тех пор, как институт Discovery в 2001 году начал сбор подписей под этим заявлением, уже свыше 500 ученых сделали этот шаг. Число подписавшихся растет, в нем есть подписи ученых из национальных академий наук США, России, Польши, Чехии, Йельского университета, Принстона, Стэнфорда, Массачусетского технологического института, Калифорнийских университетов в Беркли и Лос-Анджелесе, а также многих других научных центров».
В приложениях к призыву содержится длинный перечень фактов, непосредственно расходящихся с теорией Дарвина – в частности, противоречия между микроэволюцией и макроэволюцией, факт «эволюционного взрыва» в Кембрии, и другие.
К настоящему времени подписали призыв к научной общественности уже свыше 600 видных ученых – биологов, химиков, физиков, а также математиков, медиков, специалистов в области компьютерных технологий и представителей иных научных направлений.
Видное место среди подписантов научного воззвания заняли ученые из российской, венгерской, чешской, индийской, нигерийской, польской академий наук, а также ученые из США. Среди наиболее авторитетных подписантов: профессор Филип Скелл (Philip Skell), национальная академия наук США, а также российский эмбриолог, профессор Лев Белоусов.
Факт роста числа серьезных ученых, готовых открыто порвать с одной из фундаментальных догм современного естествознания, свидетельствует об их серьезной неудовлетворенности положением дел в современной биологии. Масштабы последствий кризиса дарвинизма могут выйти далеко за ее пределы – теория естественного отбора служила естественным же подтверждением правоты фундаментального принципа, лежащего в основе капитализма.
К тому же кризис биологии одним дарвинизмом не исчерпывается – фальсификации результатов исследований и прямая ложь достигли угрожающих масштабов, особенно в генетике. Возможная смена научных парадигм в биологии и в других естественных науках становится вероятной уже в скором будущем. И, вполне возможно, слишком уж близкое родство обезьяны и человека будет подвергнуто сомнению.
Тем временем, как сообщает Live Science, в возрасте 176 лет в зоопарке австралийского города Сидней скончалась черепаха Гарриет. Считалось, что она была одной из трех черепах, привезенных в Австралию лично Чарльзом Дарвином во время путешествия на корабле Beagle.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: DNAoidea от апреля 05, 2007, 00:15:00
Интересная, по-моему, статья о моделировании и занятном правиле Красной Королевы:
http://biology.plosjournals.org/perlserv/?request=get-document&doi=10.1371/journal.pbio.0040265
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от апреля 11, 2007, 07:41:06
http://www.membrana.ru/lenta/index.html?7112
Применение теоретических соображений о естественном отборе в медицинской практике
Название: 6
Отправлено: feralis от апреля 16, 2007, 22:47:51
последний общий предок Наутилус и Осьминог пожившим 415 ± 24 миллион лет тому назад,
http://www.springerlink.com/content/554m4h3563274287/
значить и другие 5 подклассов головоногих  отошли где=то в это время

--------------------------
макаку секвенировали и этому посвящен материал журнала http://www.sciencemag.org/cgi/content/full/316/5822/238
Читайте бесплатно
----------------------------------------------
доказано по белкам что тиранозавр и птици сестринские группы но когда птици отделились от отряда ящеротазовых пока неизвесно


Analyses of Soft Tissue from Tyrannosaurus rex Suggest the Presence of Protein
Mary Higby Schweitzer,1,2,3* Zhiyong Suo,4 Recep Avci,4 John M. Asara,5,6 Mark A. Allen,7 Fernando Teran Arce,4,8 John R. Horner3
We performed multiple analyses of Tyrannosaurus rex (specimen MOR 1125) fibrous cortical and medullary tissues remaining after demineralization. The results indicate that collagen I, the main organic component of bone, has been preserved in low concentrations in these tissues. The findings were independently confirmed by mass spectrometry. We propose a possible chemical pathway that may contribute to this preservation. The presence of endogenous protein in dinosaur bone may validate hypotheses about evolutionary relationships, rates, and patterns of molecular change and degradation, as well as the chemical stability of molecules over time.

http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/316/5822/277
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от мая 28, 2007, 17:12:50
Перенес текст из темы новостей
http://www.paleo.ru/forum/viewtopic.php?p=31775#31775

Выживание наиболее приспособленных или наиболее вероятных?
22.05.07  
http://elementy.ru/news/430520
"теории эволюции открытых систем пока не создано."
"Эрик Смит (Eric Smith), физик из Института Санта-Фе (Santa Fe Institute, Нью-Мексико, США), предлагает новый понятийный аппарат для описания эволюции в частности и жизни в целом.
По его мнению, самоорганизующиеся системы — это особые машины для выравнивания градиентов. Он предлагает рассматривать жизнь как один из частных случаев такой конструкции для быстрого выравнивания градиентов. Если создается градиент каких-то условий, например температурный градиент от тропиков к полюсам, то создаются упорядоченные и предсказуемые атмосферные структуры, а проще говоря — ветер, который выравнивает этот градиент."
"В этом отношении работа живых систем не отличается от работы систем физических или химических. Живые организмы призваны накапливать в себе энергию и рассеивать ее по пространству планеты, быстро избавляя ее от градиентов энергии и материи. Тем самым жизнь не только не противоречит второму закону термодинамики, но даже и всячески его подтверждает. И чем эффективнее организм фиксирует градиент материи и энергии (пищи, тепла, солнечной и химической энергии), чем быстрее он их усваивает и передает по пищевой цепи или просто рассеивает в пространстве, тем более уравновешенной становится система."

" Ученые, работающие в русле этой концепции, уже начали публиковать свои первые исследования. Расчеты строятся на том базовом принципе, что система должна свести к минимуму использование энергии для создания максимума энтропии. В этом смысле живая система или ее отдельные элементы уподобляются текущей реке, пробивающей себе русло поудобнее, чтобы побыстрее вынести воду к своему устью. В рамках этой концепции была удачно смоделирована работа фермента АТФ-синтазы, ответственного за производство энергии в клетке — это работы Родерика Дьюара (Roderick Dewar) и коллег из Лаборатории экологии и физики окружающей среды в Бордо (при Французском национальном сельскохозяйственном исследовательском институте, INRA). С тех же позиций Адриан Бежан (Adrian Bejan) c коллегами из Университета Дьюка (Duke University, Дурхам, Северная Каролина, США) рассмотрел эволюцию способов локомоции у животных."

"Чарльз Лайнвивер (Charles Lineweaver), астроном и астробиолог из Австралийского национального университета в Канберре (Australian National University), считает проблему репликации жизни не более чем уловкой, следствием близорукости биологов в вопросах определения жизни."

"переход от нежизни к жизни получается постепенный, и Лайнвивер надеется найти количественный параметр, описывающий поведение «далеких от равновесия диссипативных систем». А в эту категорию равноправно входят и ураганы, и зеленые растения. По словам Родерика Дьюара, у нас нет оснований придумывать одни физические законы для неживого, а другие для живого, как нет оснований придумывать одну химию для косной материи, другую для живой, — всеми процессами управляют единые потоки материи и энергии."
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июля 02, 2007, 16:20:31
Статья об эволюции обществ. пауков:
American Zoologist 1972 12(3) 419-426 Evolution of Social Behavior in Spiders (Araneae; Eresidae and Theridiidae) ERNST J. KULLMANN
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июля 02, 2007, 16:25:07
Да
ропуроваьр
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июля 02, 2007, 16:27:17
рптьваачитуе нгнл
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июля 02, 2007, 17:04:32
Еще статьи об эволюции обществ. пауков:
Smaller colonies and more solitary living mark higher elevation populations of a social spider 2007
SOCIALITY IN THERIDIID SPIDERSREPEATED ORIGINS OF AN EVOLUTIONARY DEAD END 2006
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июля 02, 2007, 19:36:18
Еще статья об эволюции обществ. пауков:
The age and evolution of sociality in Stegodyphus spiders a molecular phylogenetic perspective 2007
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от июля 18, 2007, 18:51:43
Бабочки эволюционировали за 1 год
http://www.membrana.ru/lenta/?7456
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: zK от июля 20, 2007, 04:43:48
Lowly Origin: Where, When, and Why Our Ancestors First Stood Up (http://books.google.com/books?vid=ISBN0691050864&id=CW3iHtTiEjIC&printsec=frontcover&dq=Lowly+Origin:+Where,+When,+and+Why+Our#PPP1,M1)
Название: w
Отправлено: feralis от декабря 19, 2007, 23:40:41
Советую прочесть
Эта книга суммирует современные представления о мозгах уме и тд и тп
Строже и научнее и быть не может

Николлс Дж.Г., Мартин А.Р., Валлас Б.Дж., Фукс П.А.
От нейрона к мозгу. Перевод с английского
2003. Твердый переплет. 672 с. 999 руб

http://urss.ru/cgi-bin/db.pl?cp=&page=Book&id=6334&lang=Ru&blang=ru&list=1
Название: Re: w
Отправлено: Игорь Антонов от декабря 20, 2007, 22:07:04
Цитата: "feralis"Николлс Дж.Г., Мартин А.Р., Валлас Б.Дж., Фукс П.А.
От нейрона к мозгу. Перевод с английского
2003. Твердый переплет. 672 с. 999 руб
http://urss.ru/cgi-bin/db.pl?cp=&page=Book&id=6334&lang=Ru&blang=ru&list=1
По ссылке остался только  неликвид с дефектом: "переплет поврежден на корешке".
Здесь эта книга выложена в djvu:
http://www.koob.ru/books/nicholls_from_neuron_to_brain.rar
Название: 3
Отправлено: feralis от января 22, 2008, 23:22:41
Анализ ископаемого утконоса озадачил эволюционистов

Результаты палеонтологического анализа ископаемого утконоса противоречат результатам генетического анализа. Один из возможных выводов - утконосы и ехидны эволюционировали гораздо медленнее прочих млекопитающих, сообщает журнал Nature со ссылкой на статью в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences.
Яйцекладущие млекопитающие (однопроходные) делятся на две больших группы: утконосы и ехидны. Генетический анализ (подсчет количества расхождений между генами) показывает, что группы разошлись от 17 до 80 миллионов лет назад (оценка меняется в зависимости от того, какой ген рассматривается).

Ископаемых останков древних яйцекладущих и их предков найдено довольно мало. К ним относятся кости существ вида Teinolophos trusleri , жившего в Австралии более ста миллионов лет назад. До сих пор непонятно, является ли Teinolophos общим предком утконосов и ехидн или же древним утконосом. Вторая гипотеза противоречит результатам генетического анализа.

Группа исследователей под руководством Тимоти Роува (Timothy Rowe) из Техасского университета использовала компьютерную рентгеновскую томографию с высокой разрешающей способностью для анализа трех черепов Teinolophos. Снимки отчетливо показали идущий сквозь челюсть канал, похожий по форме и размеру на канал, соединяющий клюв современного утконоса с нервной и кровеносной системами. У ехидны подобного канала нет. Зубы древнего существа также похожи на зубы утконоса.

Таким образом, получается, что Teinolophos - утконос и ветви утконосов и ехидн разошлись более ста миллионов лет назад. Ошибка генетического анализа, по мнению Роува, объясняется тем, что у яйцекладущих эволюция идет медленнее, чем у прочих млекопитающих. Соответственно, за то же время накапливается меньше мутаций.

Яйцекладущие имеют сравнительно медленный метаболизм, обитают в изолированной среде, где занимают удобную экологическую нишу: естественных врагов у них мало, органы, необходимые для добывания пищи, развиты хорошо. Все это способствует снижению темпов эволюции: у животных нет необходимости изменяться.

Возможно, однако, другая интерпретация результатов Роува, которой придерживается, например эволюционист Дэвид Уэйк (David Wake) из университета Калифорнии в Беркли: Teinolophos - не утконос, а более древнее яйцекладущее, жившее до расхождения групп. Возможно, канал, из-за которого животное было причислено к утконосам, возникал в ходе истории дважды: сначала у ветви Teinolophos, который впоследствии вымер, затем у ветви утконосов, разошедшейся с ветвью ехидн.

Для установления истины необходимы дополнительные палеонтологические данные.
Название: Re: 3
Отправлено: Alexy от января 24, 2008, 14:07:02
Цитата: "feralis"Тогда получается, что Teinolophos - утконос и ветви утконосов и ехидн разошлись более ста миллионов лет назад. Ошибка генетического анализа, по мнению Роува, объясняется тем, что у яйцекладущих эволюция идет медленнее, чем у прочих млекопитающих. Соответственно, за то же время накапливается меньше мутаций.
...Яйцекладущие имеют сравнительно медленный метаболизм, обитают в изолированной среде, где занимают удобную экологическую нишу: естественных врагов у них мало, органы, необходимые для добывания пищи, развиты хорошо.Все это способствует снижению темпов эволюции: у животных нет необходимости изменяться.
Но ведь нейтральные мутации должны бы были накапливаться с определенной скоростью несмотря ни на какие изменения скорости эволюции значимых признаков.

Может в исходной статье на английском речь шла именно о замедленной скорости нейтральной молекулярн6ой эволюции? И перевод несколько неточен?
Название: g
Отправлено: feralis от февраля 01, 2008, 22:54:51
Датские учёные установили ту самую «букву» ДНК, случайная замена которой привела к появлению на планете голубоглазых людей. У них действительно мог быть общий предок, но о том, где и когда он жил, эти результаты – вопреки поднятой в прессе шумихе – не говорят ни слова.

Чем же мы обязаны такому разнообразию окрасок радужки, настоящей палитре, варьирующей от серо-голубого до темно-коричневого?

Цвет радужной оболочки глаза, так же как и кожи, определяется отложением черного пигмента – меланина, только, в отличие от загара, его нельзя приобрести, проведя чуть больше времени на солнце. Он незначительно меняется в течение жизни – все дети рождаются с гораздо более светлым оттенком, окончательно цвет глаз формируется к концу второго года жизни, это связано с биохимическими превращениями пигмента уже в радужке. Но схема его распределения, так же, как и количество, определяются генетически.

Радужная оболочка, радужка, ирис
(латинское iris), тонкая подвижная диафрагма глаза у позвоночных с отверстием (зрачком) в центре; расположена за роговицей, между передней и задней камерами глаза, перед хрусталиком. Практически светонепроницаема.

Содержит
По мере увеличения количества пигмента цвет глаз меняется от красного у альбиносов (при полном отсутствии меланина) через серый, голубой к коричневому. Кстати, и выражение «небесно-голубой» не лишено смысла: причина, по которой глаза с малым содержанием меланина кажутся голубыми, та же, по которой голубым кажется небо – имеет место «рассеяние Рэлея», которому более подвержен свет с короткой длиной волны. Только в случае с небом это рассеяние на молекулах воздуха, а в случае с глазами – на частичках пигмента, лишь частично заполняющих радужку.

Если насчет природы окраски ученые «договорились» ещё пятьдесят лет назад, то понимание генетического механизма, лежащего в основе этих изменений, постоянно меняется.
Это был один из первых признаков человека, для которого было установлено наследование по законам Менделя еще в конце XIX века. Схема достаточно проста: есть вариант гена, кодирующий максимальное количество пигмента, назовём его К (от «карий»), и другие варианты, по мере убывания количества пигмента – З и Г. Случай с альбинизмом, когда пигмента нет совсем, мы пока опустим; глаза альбиносов красные, так как через радужку видна кровь в сосудах глаза.

Альбинизм
-- врождённое отсутствие пигмента кожи, волос, радужной и пигментной оболочек глаза.

В настоящее время считается, что причиной заболевания является отсутствие (или блокада) фермента тирозиназы,
Подобные «варианты» называются аллелями, потому что располагаются в одинаковых участках (локусах) гомологичных хромосом. Поскольку клетки нашего тела диплоидны, то есть содержат 23 пары гомологичных хромосом, то и каждый аллельный ген встречается в каждой клетке в двух вариантах, которые могут совпадать.

Например, если это К и К, глаза будут карими, З и Г – зелеными, а голубыми они будут только в том случае, если оба аллеля будут представлены одним вариантом – Г.
В генетике такой механизм взаимодействия называется доминированием, то есть более «темный» – доминантный ген всегда подавляет более «светлый» – рецессивный. Ведь даже одного «темного» аллеля хватит, чтобы выработать достаточное для коричневой окраски количество меланина.

Как и с цветом волос, и с другими наследуемыми по принципу доминантности признаками, логичным было предположение, что изначально все люди обладали самым «сильным» вариантом, в наших обозначениях их генотип выглядел бы как КК. Потом случайно возникла мутация – Г, то есть организм с генотипом КГ. Естественно, он никак не отличался от своих сородичей, а потому аллель Г потихоньку распространялся среди всей популяции, а если учесть многочисленные близкородственные скрещивания, то достаточно быстро стали рождаться мальчики и девочки с голубыми глазами, то есть генотипом ГГ.

Данная схема появления голубых глаз возникла не вчера и не месяц назад. Более того, уже два десятка лет существует гипотеза, что произошла эта мутация в неолите, не более 10 тысяч, но и не менее 6 тысяч лет назад, когда эта культура дошла до северо-запада Европы. Географические особенности расселения голубоглазых людей и исторические свидетельства указывают и на место её возникновения – земли в районе Чёрного моря, откуда люди расселялись на север и запад Европы. Тем не менее генетических подтверждений такой гипотезе до сих пор не было. Например, было непонятно, является ли мутация общей для всех голубоглазых людей, или она определяется разными дефектами, одинаково приводящими к нарушениям в накоплении меланина в радужке.

Цвет радужки как фактор естественного отбора
Окраску радужки к фактору естественного отбора можно отнести по двум причинам: эстетическим предпочтениям при выборе партнера и риску развития глаукомы. Если считать, что «идеалы красоты» в
В любом случае, данную мутацию можно с определенными оговорками отнести к нейтральным, то есть не влияющим на здоровье и поведение, а следовательно – и на то, сколько потомков оставит её носитель. Поэтому её распространению ничто не мешало. «Оговорками» могут быть, например, эстетические предпочтения второй половины, определяемые скорей эпохой и культурой каждой нации.

Разумеется, знакомая со школы схема конца XIX – начала XX века за прошедшие с тех пор годы претерпела изменения.
Например, совсем недавно, в 2006 году было показано, что зелёный цвет глаз вызван ещё и химической модификацией экспрессии пигмента в глазах. С точки зрения содержания пигмента в радужке – и, соответственно, особенностей наследования – зелёные глаза мало отличаются от карих.

Кроме того, последние работы, опубликованные в начале года American Journal of Human Genetics, показывают, что гены, отвечающие за окраску, располагаются не в одном локусе, а занимают изрядную часть пятнадцатой хромосомы. И хотя ключевым в этом процессе и является ген HERC2, в котором уложены регуляторы других генов, в частности – OCA2, доказать отсутствие влияния со стороны ещё 11,7 кб ДНК ученым, как они не пытались, не удалось.

Отсюда следует, цвет глаз нельзя точно определить, исходя из законов Менделя о полном доминировании, когда один аллель полностью подавляет другой, – здесь принимают участие несколько генов, да и аллели взаимодействуют между собой. Сюда же можно добавить систему генов, отвечающую за распределение этого пигмента и, как следствие, за оттенки глаз.

Недавно появилось первое генетическое свидетельство в пользу гипотезы возникновения «голубоглазой» мутации у побережья Чёрного моря. Датские учёные обнаружили, что эта мутация действительно одинакова у абсолютного большинства всех людей с голубыми глазами. Правда, присутствует эта мутация всё же в нескольких вариантах, так что говорить о едином предке не приходится, но тем не менее значительная часть синеглазых могут быть родственниками.

Стоит отметить, что это наблюдение никоим образом не подтверждает гипотезу черноморского происхождения мутации. Однако она выбивает почву из-под ног противников этой гипотезы, надеявшихся найти союзников в лице генетиков.
Датские ученые проанализировали гены HERC2 и OCA2, ответственные за окраску радужки среди датчан, турок и иорданцев. Работа датчан опубликована в январском номере журнала Human Genetics. «Сузив» область поиска до 166 тысяч пар азотистых оснований, ученые пришли к выводу, что за «основной» цвет глаз ответственен интрон 86 гена HREC2, единственная замена нуклеотида в котором (точечная мутация – SNP, или снип) и привела к появлению светлых глаз.

В ДНК кареглазых людей в позиции rs12913832 на длинном сегменте 15-й хромосомы стоит аденин. Более того, участок генетического кода, соответствующий этой позиции, есть у огромного числа млекопитающих – от мышей и кошек до собак, коров и шимпанзе. А вот у голубоглазых Homo sapiens здесь появился гуанин. Буква А генетического кода поменялась на Г. Лабораторные исследования также показали, что такая замена значительно изменяет активность ферментов, влияющих на экспрессию меланина в радужной оболочке.

Дальнейший анализ выявил, что такая подмена присутствует в 15-х хромосомах голубых людей в четырёх вариантах. Эти гаплотипы учёные незамысловато назвали h1, h2, h3 и h4. Первый тип встречается у 97% обследованных, и находили его не только в Дании, что вряд ли может быть удивительно, но и в таких неголубоглазых странах, как Иордания и Турция. Отличает этот тип от «кареглазых» гаплотипов изменение ещё в пяти позициях того же участка той же хромосомы, а значит, возник этот тип, скорее всего, одновременно с «голубой» мутацией. На остальные три варианта пришлись ещё 3% голубоглазых.

Сейчас учёные полагают, что гаплотипы h2, h3 и h4 могли возникнуть позднее, как результат более поздних мутаций h1. В этом случае речь действительно может идти об общем предке.

Тем не менее ни к месту, ни к времени его рождения эти выводы отношения не имеют.
Если время возникновения мутации ещё можно очень грубо оценить на основе частоты возникновения мутаций (как голубоглазой, так и тех, что отличают h1 от его «кузенов» h2–4), то для установления географических истоков генетическими методами требуются совсем другие входные данные – о распределении этой мутации по планете.
Название: y
Отправлено: feralis от февраля 01, 2008, 23:00:10
Устав работать с человеком, генетики взялись за кошек. Построенное ими «генеалогическое древо» показывает, что некоторые совсем не похожие друг на друга породы состоят в близком родстве, а расселение этих домашних животных по миру шло весьма причудливыми маршрутами.


По оценкам современных учёных, одомашнивание котов произошло тогда, когда первые люди начали переходить от кочевого образа жизни к оседлому, сопряженному с ведением сельского хозяйства и содержанием домашнего скота. Кошки, умевшие ловить мелких грызунов, оказались чрезвычайно полезными для людей, которые выращивали зерновые культуры. Кроме того, немалую роль, видимо, сыграл статус священного животного, которым кошек наделили египтяне.

В конечном итоге кошки и коты стали домашними любимцами, но в полной мере не одомашнились.
Даже сейчас весьма домашние коты проявляют самостоятельность и не прочь поохотиться – даже в том случае, если хозяева ежедневно кормят их.

С развитием человеческой цивилизации, в частности, с появлением длинных торговых маршрутов, коты начали распространяться по свету. В отличие от других домашних животных, кошачьи редко становились мишенью селекционеров, желавших получить породы, особи которых, например, будут эффективнее ловить мышей. Любителей кошек интересовал скорее вид их любимца, его эстетические характеристики, в связи с чем люди часто пытались вывести породы, отличающиеся особым цветом меха.

Из-за этого исследование кошек не так сложно с генетической точки зрения. Если для вывода собачьих пород необходимо было сложное скрещивание, подразумевающее сложные взаимодействия нескольких генов, появление новой породы кошек часто определялось выделением чистой генетической линии с сильной экспрессией того или иного гена.

Сейчас эксперты уважаемой в кошачьем мире американской Ассоциации любителей кошек (CFA) насчитывают около 50 кошачьих пород, 16 из которых признаны «естественными», то есть развившимися в определенных регионах. Остальные появились в последние полвека благодаря усилиям селекционеров.

Как отмечают руководители исследования Лесли Лайонс и Моника Липински из Университета Калифорнии в Дэвисе, свое внимание они сфокусировали на нескольких проблемах. Во-первых, их интересовало то, каким образом кошачьи путешествовали по древнему миру и попадали в такие, казалось бы, отдаленные от «Плодородного полумесяца» районы, как Северная и Южная Америки. Кроме того, учёные изучали разнообразие генетики котов, которая формировалась по мере их расселения по свету. Наконец, исследователи пытались обнаружить некоторую редукцию генетического разнообразия, которая могла произойти у представителей древних или современных пород.

Для проведения подобного масштабного исследования авторы собрали образцы мазков слюны за щекой более чем 1100 котов. Часть котов-доноров принадлежала 17 популяциям «дворовых котов», естественным образом размножающихся на территории Европы, Средиземноморья, Африки, Азии и обеих Америк, а часть принадлежала 22 общепризнанным породам. Среди них оказались представители и «естественных», и выведенных в последние полвека пород.

Образцы ДНК были получены либо на кошачьих конкурсах, либо высылались непосредственно хозяевами. Кроме того, учёные использовали микросателлиты (области повторов в хромосомной ДНК), чтобы определить степень генетического родства тех или иных пород, их географическое происхождение, а также степень генетических потерь, которые стали результатом инбридинга – скрещивания близкородственных животных внутри популяций.

Проведя анализ образцов ДНК, учёные пришли к выводу, что по характеристикам наследственной информации всех современных котов можно разделить на 4 группы.
Они соответствуют определенным регионам Европы, Средиземноморья, Восточной Африки и Азии.

Впрочем, между представителями этих групп существует генетическое родство. Так, американские «дворовые» коты оказались родственны «дворняжкам» Западной Европы, а короткошерстная американская кошка и кошка породы мэйн-кун (обе породы были выведены в США) являются родственными 7 другим западноевропейским породам. Это, впрочем, неудивительно, поясняют исследователи, кошки, завезенные в Новый Свет людьми, за достаточно небольшой временной отрезок не претерпели серьезных генетических изменений, которые бы привели к формированию серьезных отличий от западноевропейских кошек и котов.

Вместе с тем, западноевропейские кошки сформировали несколько плотных групп, хорошо представленных лишь в нескольких регионах. А вот Азиатская группа оказалась достаточно изолированной. По словам учёных, коты, ныне населяющие Юго-Восточную Азию и её окрестности, удалились от «Плодородного полумесяца» достаточно давно и развивались без интенсивного скрещивания с котами других пород.



Исследователям удалось узнать много нового и о конкретных породах кошек. Например, персидская кошка – возможно, самая древняя чистая порода – не приходится близкой родственницей котам с географически близкого ей Ближнего Востока. Как ни парадоксально, но персы генетически более близки кошачьим, проживающим на Западе Европы. Впрочем, известно, что персидская кошка в разное время и в разных странах называлась не только персидской, но и китайской, индийской и даже русской – по названиям стран, откуда они были завезены в Европу, однако в их неевропейском происхождении никто не сомневался. Возможно, в жилах современных европейских котов, несмотря на слабое внешнее сходство, немало крови «персидских» предков.

Стоит заметить также, что многие известные породы, например, персы, используются для выведения новых пород, часто более короткоголовых (имеющих короткий и широкий череп). Например, экзотические короткошерстные коты, которые, по сути, являются персами с «короткой стрижкой», представляют собой вариант новой породы, связавшей две другие, ранее отдельные группы кошек.

Кошки из Сингапура оказались помесью азиатских и западноевропейских котов, коты-итальянцы – помесью средиземноморских и европейских котов, породы из юго-восточной Азии породнились с вьетнамскими «крысоловами». А японские бесхвостые кошки, бобтейлы, также оказались родственны котам Западной Европы, хотя некоторая генетическая связь с восточной, азиатской группой у представителей породы осталась.

Измерение генетического разнообразия
Один из способов количественного измерения степени генетического разнообразия – подсчёт показателя гетерозиготности. Свойством гетерозиготности называют наличие разных аллелей гена в парных
Анализ молекулярной дисперсии позволил учёным вычислить степень генетического разнообразия западноевропейских (и американских), восточноафриканских, средиземноморских и восточноазиатских котов. Самыми разнообразными оказались средиземноморские коты (около 500 аллелей во всех маркерах), и гены именно этих котов оказались лучше всего перемешанными внутри популяции. Возможно, причиной тому служит постоянное движение караванов и судов, происходившее во время интенсивного одомашнивания и расселения котов.

А вот среди чистых пород самой генетически разнообразной оказалась сибирская кошка (показатели гетерозиготности – 0,69 и 0,73).
У неё также ниже всего показатели, численно выражающие степень инбридинга.

«Результаты нашего исследования подтверждают итоги других работ, согласно которым приручение первых кошек произошло в землях «Плодородного полумесяца». Кроме того, наше исследование полезно для людей, разводящих новые породы», – рассказала первый автор исследования, аспирантка Моника Липински.

По словам профессора Лесли Лайонс, курировавшей исследование, в ходе работы учёные обнаружили более 200 генетических нарушений, многие из которых были зафиксированы у представителей чистых пород. Подобная информация, по мнению Лайонс, должна дойти до людей, занимающихся разведением котов, дабы они не создавали породы заведомо больных кошек
Название: u
Отправлено: feralis от февраля 01, 2008, 23:07:04
Изучение генетического родства организмов заставило учёных изменить взгляд на «древо жизни» ядерных организмов. В новой систематике человека объединяют с амёбами, а малярийного плазмодия – с бурыми водорослями. Другие, куда более важные, с точки зрения эволюционистов, изменения, затронут малоизвестные формы – две заполненных ими ветви «древа жизни» сростаются в одну.


На форзаце практически любого учебника биологии красуется визуальное представление классификации всех живых существ. В её основе – принципы, предложенные в середине XVIII ботаником Карлом Линнеем. Норвежские и швейцарские ученые предлагают внести серьезные поправки в следующие редакции, перерисовать «древо жизни» и даже изменить подход в создании новых лекарственных средств.

Если при объединении более-менее похожих существ в маленькие группы (семейство, род, отряд) у ученых обычно не возникает споров, то формирование более крупных таксонов – типов, царств, надцарств – никогда не обходилось без ожесточенных дискуссий.

На Земле можно выделить две основные клеточные формы жизни – прокариот и эукариот (вирусы относятся к неклеточным). Принципиальное различие двух описанных групп в форме организации генетического материала. Если у прокариот (бактерии и археи) он свободно «плавает» в цитоплазме в виде замкнутого кольца или еще более коротких цепочек, то эукариоты, также называемые ядерными, обладают сложной системой организации ДНК с белками в форме хромосом, которые, в свою очередь, отграничены от всей остальной цитоплазмы мембраной ядра.

Как правило, их делят на животных, растения, грибы и всё остальное – группу простейших, у которых биологи даже не могут найти иной общей черты, кроме непохожести ни на грибы, ни на растения, ни на животных. Вокруг простейших было сломано больше всего копий. Отдельных их представителей то разделяли по трём главным царствам, то выделяли в них равноправные с растениями и животными царства, число которых подбиралось к десятку.

Параллельно с делением на царства учёные также ввели разделение на супергруппы, которые больше отражают не схожесть организмов, а их происхождение. Деление действительно параллельно, и в одну и ту же группу могут попадать клады, относящиеся к разным рангам биологической систематики.

В основе и таксономии, и «дерева жизни» лежит принцип родства, ранее устанавливаемый на основании многочисленных исследований структуры, свойств и биохимических особенностей организмов – короче говоря, внешних или внутренних признаков. Современная генетика позволяет сделать это куда более достоверным, а главное, быстрым способом.

Сейчас, как никогда раньше, создались идеальные условия для пересмотра традиционного эволюционного древа и классификации живых существ.
Специалистам из университетов Осло и Женевы для этого даже не понадобилось проводить новых экспериментальных исследований. Взяв за основу 5000 генов, они определили 123, варианты которых в той или иной форме встречаются у всех живых существ. За этим последовало более детальное сравнение, потребовавшее вычислений с помощью практически всей компьютерной сети главного университета Норвегии.

Результаты потрясли даже самих ученых, а они уже взбудоражили остальную научную общественность. Группы эукариот генетики предложили полностью «переделить».

Они утверждают, что всех ядерных существ надо разделить на четыре супергруппы вместо пяти, использовавшихся до сих пор.
Среди растений, по мнению биологов из Осло, должно найтись место также зеленым и красным водорослям. Опистоконты, ранее включавшие животных (и человека) и грибы, должны принять в свою супергруппу амёб. Третья группа – экскаваты, к которым отнесены многие человеческие паразиты, а также некоторые типы водорослей.

Четвёртая, новая группа объединила простейших, прежде относившихся к двум другим супергруппам. С названием её биологи оригинальничать не стали, обозвав её SAR – от групп страменофил, альвеолятов и ризарий (Stramenophiles, Alveolates и Rhizaria), объединившихся в новой супергруппе.

Кладистика
направление филогенетической систематики. Характерные особенности кладистической практики состоят в использовании так называемого кладистического анализа (строгой схемы аргументации при реконструкции родственных
Правда, ученые признают, что и в их «ясной» картине есть изъян: пока некуда пристроить одну из ветвей хромальвеолятов, недостаточно совпадающую по геному с остальными «родственниками» из SAR.

Хотя от эволюционистов обычно не требуют «материальной» составляющей их работы, авторы всё-таки считают, что среди практического применения новой теории – изменение подхода в создании новых лекарственных препаратов, зачастую основывающемся на сравнении разных видов. В частности, объединив в одну группу с малярийным плазмодием коричневых и кремниевых водорослей, они планируют дать микробиологам и эпидемиологам новые модели для исследования.

Фундаментальная составляющая открытия куда значительней. Как отметил Кьетилл Якобсен, чем больше мы знаем о ветвях Древа жизни, тем больше мы можем сказать о развитии жизни:

«В определенном смысле мы работаем в генетической археологии. Возможно, так и удастся установить истоки разнообразия жизни на Земле».
Название: s
Отправлено: feralis от февраля 01, 2008, 23:15:36
Когда вымерли все крупные животные, саблезубые кошки лишились возможности охотиться. Их постигла участь собственных жертв.

Саблезубые кошки, также иногда именуемые саблезубыми тиграми, обладали сравнительно слабым укусом, что, впрочем, не мешало им охотиться на бизонов и мамонтов. К такому выводу пришли австралийские учёные, создавшие компьютерные модели черепов саблезубых кошек. По словам исследователей, доисторические кошки использовали тактику охоты, сильно отличающуюся от той, которой пользуются их ближайшие современные родственники – львы, но именно благодаря этому могли охотиться на очень крупных животных.

Smilodon
род ископаемых животных семейства кошачьих (Felidae) подсемейства Machairodontinae, включающего все виды, известные широкой публике как саблезубые кошки и саблезубые тигры. Жили в Северной и Южной Америке, близкие родственники других саблезубых кошек, живших в Евразии. Обитали в период от нескольких миллионов до нескольких тысяч лет назад. Имели крупные саблевидные верхние клыки длиной до 40 см.
Самые известные виды рода Smilodon - S. fatalis, S. populator, S. gracilis.

Называть их саблезубыми тиграми, тем не менее, не очень корректно, поскольку тигры относятся к другому роду в семействе кошачьих.
На сегодняшний день палеонтологи обладают обширными данными о представителях вида Smilodon fatalis. По их данным, саблезубые кошки гуляли по территориям Северной и частично Южной Америки от 2,5 до 8 тысяч лет назад. Размерами особи не превосходили современных африканских львов, хотя весили гораздо больше своих потомков – вес кошки мог доходить до 270–360 кг. Клыки хищников достигали 40 см в длину.

В течение последних 150 лет среди ученых было распространено мнение, что доисторические кошки, которые, как считалось, охотились на бизонов, лошадей и, возможно, даже мамонтов, убивали свои жертвы, вонзая в них клыки на бегу. Так сейчас охотятся потомки вымерших животных – львы.

Теперь же австралийские учёные из университетов Ньюкасла и Нового Южного Уэльса смогли создать компьютерную модель черепа Smilodon fatalis, на примере которой им удалось показать, что кошки этого вида обладали слабым укусом, что, впрочем, не мешало им быть сильными и опасными хищниками.

В ходе исследования учёные использовали фрагменты окаменелостей черепа Smilodon fatalis и обыкновенного льва (Panthera leo). Как утверждают сами исследователи, модель черепа доисторической кошки составили из более чем двух миллионов элементов, что гораздо больше, чем в каком бы то ни было предыдущем исследовании. Именно поэтому результаты этих последних разработок наиболее точно представляют реальные возможности кошек.

В результате удалось создать компьютерные модели черепов Smilodon fatalis весом 230–250 кг. Затем учёные провели своеобразные виртуальные «краш-тесты» для саблезубых кошек, пользуясь программой, похожей на те, что применяют инженеры при расчетах нагрузок и внутренних напряжений в зданиях или мостах. В ходе тестов учёные высчитывали силу укуса и нагрузку на разные части черепа, что позволило им продемонстрировать, каким образом эти животные атаковали и кусали свои жертвы.

Выяснилось, что сила укуса Smilodon fatalis в лучшем случае равнялась тысяче ньютонов – около сотни килограммов силы, тогда как у львов этот показатель втрое выше.
Кроме того, проверив нагрузки на зубы и другие фрагменты костей черепа в разных режимах программы, учёные пришли к выводу, что коты не могли убивать на бегу крупных животных, как это сейчас делают львы. В то время как современные хищники семейства кошачьих могут без вреда для челюстей и черепа вонзать клыки в движущиеся трёхсоткилограммовые жертвы, череп их доисторический предков не выдержал бы такого способа охоты даже на животных, чей вес не превышал 100 килограммов.

По словам исследователей, Smilodon fatalis должен был использовать другую тактику охоты – такую, которая позволяла бы ему убивать крупных животных, например бизона или мамонта, без риска для себя.

Как предположил руководитель исследования Колин Макгенри из Университета Ньюкасла, существующие данные о комплекции саблезубых кошек позволяют предположить, что Smilodon fatalis сидели в засаде, поджидая именно тех животных, охота на которых могла быть успешной. Так, кошки не охотились на быстроногих газелей и антилоп, поскольку большая мышечная масса не позволяла им развить такую же высокую скорость.

Smilodon fatalis дожидались крупных и неповоротливых животных, сбивали их с ног, пользуясь при этом преимуществами своего массивного тела, а затем уже наносили точный и аккуратный смертоносный укус в область шеи.

«Саблезубая кошка обладала крайне мощным телом, с помощью которого она могла повалить на землю животное даже очень большого размера. Затем, скорее всего, кошки перекусывали шею жертвам, и практически моментально после этого животные погибали», – считает Макгенри.

По его словам, то, что саблезубые кошки не охотились на мелких животных, предопределило их исчезновение в конце последнего ледникового периода.
«Когда вымерли все крупные животные, кошки лишились возможности охотиться. Их постигла участь собственных жертв», – отмечает Макгенри.

Ознакомиться с результатами исследования австралийских учёных можно в номере журнала Proce of the National Academy of Sciences от 2 октября.
/www.gazeta.ru/science/2007/10/03_a_2213504.shtmledings
Название: н
Отправлено: feralis от февраля 04, 2008, 23:45:45
Останки экзотического существа возрастом 80 миллионов лет впервые официально представил публике один из авторов открытия Фелипе Мескита де Васконсейос (Felipe Mesquita de Vasconcellos) из федерального университета Рио-де-Жанейро (Universidade Federal do Rio de Janeiro — UFRJ).
Окаменелости этого раннего крокодила (или крокодилоподобного создания) были обнаружены в 2004 году в бразильском городке Монте-Альто (Monte Alto). На днях их выставили на всеобщее обозрение на конференции в UFRJ.
Теперь бразильские палеонтологи установили, что данное животное, названное Montealtosuchus arrudacamposi, вполне может оказаться промежуточным звеном в цепочке эволюции крокодилов. "Это существо имеет сочетание морфологических признаков, общих как для доисторических крокодилов, так и для тех, которые существуют сегодня", — пояснил Мескита де Васконсейос.

Montealtosuchus arrudacamposi походит на смесь крокодила и динозавра-теропода, который вдруг опустился на удлинившиеся передние лапы."     
   
Найденное "чудовище" насчитывало в длину 1,6 метра.
Любопытно, что, в отличие от крокодилов нынешних, Montealtosuchus arrudacamposi обладал довольно длинными ногами и был, по словам учёных, чрезвычайно подвижным.
Жил этот хищник на суше в аридном климате, который преобладал на территории нынешней Бразилии 80 миллионов лет назад.
Подробности открытия можно найти в пресс-релизе университета и статье (PDF-документ, подписка) самих исследователей Montealtosuchus arrudacamposi в журнале Zootaxa.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от февраля 12, 2008, 17:36:18
Прочёл замечательную книгу "Археи" Л.И. Воробьёвой. Очень рекомендую всем. Несмотря на то, что мы знаем об археях ещё очень мало, но даже эта информация о самых древних клеточных существах очень и очень интересна и полезна. Имперору внимательно читать главу 17 "Происхождение и эволюция ранних форм жизни".
Название: Re: y
Отправлено: Alexy от февраля 13, 2008, 20:16:45
Цитата: "feralis"Вместе с тем, западноевропейские кошки сформировали несколько плотных групп, хорошо представленных лишь в нескольких регионах. А вот Азиатская группа оказалась достаточно изолированной. По словам учёных, коты, ныне населяющие Юго-Восточную Азию и её окрестности, удалились от «Плодородного полумесяца» достаточно давно и развивались без интенсивного скрещивания с котами других пород.
Жаль, что нету никаких датировок расхождений кошачьих митохондриальных и У-хромосом, распространенных в разных регионах Азии, Европы и Африки, которые наверное были сделаны.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от марта 13, 2008, 01:41:49
Спасибо! Крайне интересно!
У этих гномов с Палау проверяли Мт- и Y-хромосомы?
А у флорентийских хоббитов?
Название: k
Отправлено: feralis от марта 13, 2008, 23:56:35
К сожалению генетический материал быстро распадается в условиях тропиков
Так что насчет хоббитов можно уверенно сказать что их гены до нас не дошли
а о гномах не знаю но думаю что тоже самое
Даже древние египтяне исторического периода стерильны в этом отношении
и только фараоны и другие ВИП сохранили этот материал для исследований ибо
лежали в относительной прохладе и главное в температурной стабильности
Консервация остатков тоже стирает генетические следы
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: mastax от марта 15, 2008, 14:17:34
Взял вчера в библиотеке книгу А.Г.Васильева "Эпигенетические основы фенетики: на пути к популяционной мерономии" (2005, Екатеринбург).
Книга трудная для чтения, но очень даже не пустая. Мне трудно пока понять, насколько идеи автора оригинальны и адекватны, но фактологию он приводит довольно внушительную и интересную. Речь идет о так называемом популяционном онтогенезе и популяционной эпигенетики. В основе идей автора лежит принцип, что все особи в популяции должны иметь общий набор программ или основных траекторий развития, которые имеют совершенно разные вероятности осуществления.

Автор в предисловии пишет, что на него большое влияние оказали опыты Шапошникова с тлями и Васильевой с дрозофилами, в которых были показаны случаи "приобретенного наследования".  Увы, в который раз приходится сожалеть, что никто не подходил к опытам Шапошникова критически. Если Васильева повторяла свои эксперименты с тепловым шоком многократно, нашла генетическое объяснение своему открытия, то Шапошников даже не смог повторить свой эксперимент (и никто не смог). Есть БОЛЬШИЕ сомнения относительно чистоты его эксперимента. Впрочем, к самому Васильеву никаких претензий нет, его материал выглядит довольно убедительным.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от марта 15, 2008, 15:18:00
А там как-то обсуждается проблема накопления вредных мутаций и возможности ее преодаления?

Эта книга есть в элект. виде?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: mastax от марта 15, 2008, 17:46:58
В электронном виде не нашел
Понятие "вредный" автор трактует иначе - скорее нереализованный в данной среде
Название: g
Отправлено: feralis от марта 20, 2008, 00:23:29
Измерения черепа "хоббитов" относят их к отдельному древнему виду
Череп «хоббита», обнаруженного не так давно в Индонезии, судя по всему всё же принадлежал отдельному виду, отделившемуся от ветви человека разумного более миллиона лет назад, и является свидетельством существования около 18 тысяч лет назад ранее не описанного вида людей.

Данные о находке на острове Флорес сразу послужили причиной для появления множества противоречивых теорий. Поначалу их причислили к новому виду человека H. floresiensis, однако позже были высказаны опровержения этой идеи; и небольшой рост и другие особенности строения организма этих высших приматов были объяснены с позиций особенностей островного развития вида современного вида Homo Sapiens. Кроме того, считалось, что один из обнаруженных скелетов принадлежит к неполноценно развитому организму.

Палеонтологи из Университета имени Джорджа Вашингтона надеялись поставить точку в этом споре. Ученые изначально сомневались, что останки могут принадлежать Homo sapiens: слишком мал размер его черепной коробки - всего 400 куб. см против 1400 куб. см у современного человека. Даже больной или карликовый человек имел бы больший мозг. В своей работе исследователи измерили несколько параметров черепа одного из найденных «хоббитов», а затем сравнили их с параметрами черепов примерно трех тысяч наших современников и тридцати доисторических гоминидов. Как оказалось, более всего «хоббиты» походят на человека прямоходящего - H. erectus, жившего в Африке примерно 1,7 миллионов лет назад.

Ученые не поленились провести и обратный эксперимент – они провели экстраполяцию скелетов современных и ископаемых людей до размеров «хоббитов», для того, чтобы установить, как изменятся те или иные их параметры. Выяснилось, что лучше всего соответствует карликовым людям уменьшенный скелет человека умелого (H. habilis), так же гулявшего по просторам Земли примерно 1,7 миллионов лет назад; это самый примитивный вид людей, известный на сегодняшний день.

Авторы работы полагают, что их открытие позволяет говорить о еще одной ветви развития человека, отделившейся на ранней стадии эволюции видов Homo и просуществовавшей вплоть до самого последнего времени, когда человек разумный уже вовсю занимался колонизацией Америк. Работа ученых опубликована в последнем выпуске Proceedings of the National Academy of Sciences.

Впрочем, и у этой гипотезы появилось немало противников, доводы которых сводятся в основном в недостаточности тех параметров черепа «хоббитов», которые сопоставляли ученые из Вашингтона. Кроме того, швейцарский нейробиолог из Цюрихского университета, Кристоф Цоликофер заявил в интервью Science, что ученым необходимо было учесть вероятность проявления так называемой микроцефалии – генетического расстройства, выражающегося в очень маленьких размерах черепа человека; это сделано не было.

Судя по всему противостояние идей вокруг карликового вида гоминидов продолжается
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от апреля 13, 2008, 00:22:01
В американском штате Орегон найдены древнейшие свидетельства присутствия людей, они на тысячу лет старше древнейшей культуры Северной Америки. Обнаружены окаменевшие фекалии, которым около 14 тысяч лет. Генетический анализ показал, что эти следы оставили предки современных индейцев.

Абсолютное большинство учёных полагают, что из всех обитаемых континентов Америку люди заселили в последнюю очередь, и сделали они это около 20–30 тысяч лет назад, перейдя из Азии на восток по Берингийскому мосту. Однако до сих пор специалисты спорят о том, когда именно случился переход человека через этот перешеек. Так же жарко обсуждается и характер этого переселения – было ли оно однократным или происходило в несколько этапов.

Новая работа бразильских и американских генетиков по анализу гаплогрупп митохондриальной ДНК (мтДНК) коренных американцев позволила более детально описать хронологию заселения обеих Америк, а также предложить альтернативный прежним взглядам путь продвижения человека по новой земле.

Из подобных работ, проведенных в прошлом, известно, что у подавляющей части коренного населения Нового Света встречаются всего пять из трёх десятков основных митохондриальных гаплогрупп, выделяемых в настоящее время генетиками. Четыре из них – A, B, C и D – встречаются также у коренного населения Азии, что позволяет предположить, что в миграции на территорию Аляски и далее по всей Америке участвовало именно древнее население северо-восточной части евразийского континента.

В то же время непостоянная по региону и частоте проявления гаплогруппа Х позволяет многим ученым предположить существование независимого пути миграции в Америку. Кроме того, ряд специалистов высказывает мнение о том, что наличие данной группы свидетельствует о миграции сюда представителей древней солютрейской культуры, распространённой в Европе на территории Испании и Франции

Как было недавно показано учеными из Университета Флориды, переход древних переселенцев по Берингийскому мосту произошел задолго до начала стремительного освоения Америк. Дело в том, что ледяной покров Аляски на протяжении многих тысяч лет просто не позволял первым переселенцам двинуться дальше.

Тем не менее, одновременно бытует и версия, что продвижение все же было возможным – люди шли вдоль побережья Тихого океана, так как уровень мировых вод в те времена был существенно ниже. Сторонники этой точки зрения утверждают, что поднявшиеся в последние тысячелетия воды просто скрыли возможные археологические свидетельства, которые могли бы подкрепить идею.

Новую работу, принятую к публикации в American Journal of Human Genetics, отличает масштаб исследования.
Учёные провели полное секвенирование мтДНК 86 коренных американцев. Результаты анализа позволяют им утверждать, что все народы, населявшие Америку до прихода европейцев, произошли от единственной популяции, и таким образом показывают несостоятельность теорий о независимых многократных миграциях людей в Новый Свет.

Кроме того, по мнению бразильских генетиков – и вопреки многим ранее предложенным теориям, расселение будущих индейцев по территории Америк действительно происходило и в ледниковый период, когда ледовый барьер, перегородивший большую часть Аляски, еще не растаял.
Одновременно бразильцам удалось не только развенчать теорию нескольких независимых миграций, но и более точно определить дату прихода человека на территорию Аляски, а также уточнить путь продвижения на юг первых переселенцев, ставших родоначальниками американской культуры.

Количество матерей-прародителей (об отцах по мтДНК судить сложнее), от которых произошли американские индейцы, было очень небольшим. Оценки этого числа из генетических моделей, построенных на базе разных по типу генетических маркеров, колеблются от нескольких десятков до нескольких тысяч человек. Данные, полученные учеными, позволили предложить непротиворечивую модель генетического развития популяций и обосновать происхождение всех гаплогрупп (A2, B2, C1, D1, и X2a), встречающихся у коренных американцев, от одной и той же исходной популяции азиатских людей.

Согласно построенным на основе анализа мтДНК моделям, отделение будущих американцев от азиатов произошло в районе Берингийского моста в период последнего оледенения, от 23 тысяч до 19 тысяч лет назад. После перехода через перешеек, который ныне стал Беринговым проливом, новая популяция начала быстро расти и заселила береговые территории Америки примерно за три тысячи лет, закончив освоение тихоокеанского побережья примерно 15–16 тысяч лет назад.

При этом учёные нашли в генетических данных свидетельства длительного промежуточного периода.
Более 5 тысяч лет разделяют изоляцию будущих американцев от азиатов и начало быстрого роста американского генетического разнообразия, соответствующего процессу колонизации Америки.

Суммируя продолжительность этого периода и некоторые достоверные археологические свидетельства ранних арктических поселений людей в этом регионе в районе 30 тысяч лет назад, ученые приходят к выводу, что


приход человека на американскую землю произошел еще до оледенения в процессе изменения климатических условий.
Авторы соглашаются с ранее полученными данными о том, что в течение нескольких тысяч лет эти переселенцы жили на территории Берингии. Кроме того, исследователи показали, что популяция, изолированная в Берингии в течение нескольких тысяч лет, претерпевала постепенное уменьшение численности. Это может быть связано с ухудшением здесь климатических условий. Впрочем, число женщин в ней не опускалось ниже примерно тысячи человек.

По оценкам специалистов, в период с 17-го по 13 тысячелетия до нашей эры популяция коренных американцев, напротив, демонстрировала резкий рост численности и генетического разнообразия, что может быть связано с быстрым продвижением на юг и колонизацией Америки. В то же время установлено, что ледяной барьер Аляски упал не ранее, чем за 12 тысяч лет до начала новой эры, потому ученые полагают, что продвижение коренных жителей американского континента на юг началось вдоль побережья Тихого океана. Большая его часть была свободна ото льдов, и климат позволял здесь жить крупным животным, на которых могли охотиться люди.

Еще более любопытным является тот факт, что окончание периода бурного роста генетического разнообразия и расширения популяции совпадает с возрастом археологических находок в районе древних поселений индейцев в местечке Монте-Верде на юге Чили. Таким образом, за несколько тысяч лет американские племена смогли преодолеть 13 тысяч километров вдоль западного побережья Америки.

Учёные также косвенно выступили против причастности древних европейцев к появлению у американцев гаплогруппы семейсва X. Они считают, что она также принадлежит исконным «праамериканцам», замечая, что и в остальных уголках света эта гаплогруппа демонстрирует низкие частоты проявления.

В наше время в Восточной Сибири не осталось ни одной сибирской народности, в значимых количествах проявляющей наличие гаплогруппы. Возможно, такая картина наблюдается в следствие эффекта генетического дрейфа, который быстрее «затирает» именно редкие генетические группы. Прежде учёным уже удалось показать близость американцев к ненцам и якутам, однако число коренных народов Сибири столь велико, что для определения самых родных «братьев» американских индейцев понадобятся ещё долгие и долгие исследования.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от апреля 18, 2008, 19:46:26
"Братья по разуму" маловероятны
http://www.gazeta.ru/news/science/2008/04/17/n_1207957.shtml
(газетное изложение)
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: вз от апреля 21, 2008, 13:08:31
Analysis of Chimpanzee History Based on Genome Sequence Alignments

Jennifer L. Caswell et al.


http://www.plosgenetics.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pgen.1000057
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: grumbler от апреля 28, 2008, 00:01:40
Цитата: "Ярослав Смирнов"Прочёл замечательную книгу "Археи" Л.И. Воробьёвой. Очень рекомендую всем. Несмотря на то, что мы знаем об археях ещё очень мало, но даже эта информация о самых древних клеточных существах очень и очень интересна и полезна.
Все-таки сейчас скорее признается, что археи и эубактерии- сестринские группы, а Cavalier-Smith вообще считает их поздно возникшей  группой, а в основание ставит зеленые несерые бактерии ( http://journals.royalsociety.org/content/0164755512w92302/fulltext.pdf ) или их общих предков с цианобактериями.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от апреля 28, 2008, 23:43:18
Грамблер, спасибо.

Интересная новость: в британии в очередной раз происходят изменения в популяции белок.
http://www.lenta.ru/news/2008/04/28/squirrels/
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от мая 14, 2008, 09:14:00
Новости систематики и эволюции
К сожалению, у меня нет возможности одновременно обновлять свою систему природы и постить сообщения на форум. Поэтому с июля 2007 года я перестал регулярно сообщать сюда о "новостях систематики и эволюции". Тем, кто хочет быть в курсе этих новостей:
1) Система организмов* обновляется раз в две-три недели. Разумеется, "новейшие достижения" отражаются в ней с авторской точки зрения. Можно также смотреть список изменений**
2) Список литературы*** обновляется еще чаще, где-то раз в полторы-две недели. Соответственно, можно найти все записи "2008" и "in press" и быть в курсе дела.
3) Он-лайн архив**** обновляется постоянно. Каждую папку можно отсортировать по времени и посмотреть новые поступления.
===
* http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.pdf (http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.pdf)
** http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.chlog (http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.chlog)
*** http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.bib (http://herba.msu.ru/shipunov/os/current/synat.bib)
**** Для доступа к архиву просьба написать мне личное сообщение
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от июня 23, 2008, 18:14:13
Концепция "эгоистичного гена" Докинза подтверждена экспериментально:
http://www.sciencedaily.com/releases/2008/06/080620115905.htm
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от июня 25, 2008, 15:15:01
Извините, а Вы читали, что там написано и что написано у Докинза? Одно с другим связано весьма слабо. Речь идет не об эгоистичных, а об альтруистичных генах.
Ссылка на нормальную статью (насколько я могу понять, должна скачиваться свободно): http://www.genetics.org/cgi/rapidpdf/genetics.108.087270v1.pdf
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от июня 25, 2008, 16:26:09
Цитата: "plantago"Извините, а Вы читали, что там написано и что написано у Докинза? Одно с другим связано весьма слабо. Речь идет не об эгоистичных, а об альтруистичных генах.
Ссылка на нормальную статью (насколько я могу понять, должна скачиваться свободно): http://www.genetics.org/cgi/rapidpdf/genetics.108.087270v1.pdf

Я бы сказал, что это, скорее, в духе идеи "разумного эгоизма" Чернышевского. Данный ген включает другие гены, ответственные за стерильность, так как это в конечном способствует его более эффективному размножению. Пусть подавляющее количество его копий будет при этом гибнуть, оставшиеся доли процента, штампуемые маткой, с запасом компенсируют эти потери.
То есть, всё встаёт на свои места, если под "геном" понимать не конкретную его физическую реализацию в клетках конкретной пчелы, а некую идею, ("мем" по Докинзу), которую он олицетворяет. То есть, нужно отделить конкретный носитель информации от самой информации.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от июня 25, 2008, 20:04:17
Комбинатору. Ну мем (или мим) это точно другое, это генетический аналог человеческих идей, а не генов. Кроме идеи мима у Докинза только одна оригинальная идея в даном вопросе, это мысль о том, что эволюция это борьба генов за выживание, а не организмов. Моё личное мнение, это нельзя ни доказать, не опровергнуть. Это две стороны одной медали. А если брать его абсолютизацию эгоистической эволюции, то здесь нет ничего собственно оригинального, что можно подтвердить экспериментально, это просто радикальный дарвинизм.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от июня 25, 2008, 20:34:51
Цитата: "Дж. Тайсаев"Комбинатору. Ну мем (или мим) это точно другое, это генетический аналог человеческих идей, а не генов. Кроме идеи мима у Докинза только одна оригинальная идея в даном вопросе, это мысль о том, что эволюция это борьба генов за выживание, а не организмов. Моё личное мнение, это нельзя ни доказать, не опровергнуть. Это две стороны одной медали. А если брать его абсолютизацию эгоистической эволюции, то здесь нет ничего собственно оригинального, что можно подтвердить экспериментально, это просто радикальный дарвинизм.

Вряд ли Докинз подразумевал, что каждый конкретный ген в каждой конкретной особи спит и видит, как бы ему получше размножиться. Скорее, ген, это ИДЕЯ (утрированно - глаз, уха, крыла и т.д.), а борьба генов за выживание, это борьба представляемых ими мемов-идей. Во всяком случае, я воспринял его идеи именно так.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от июня 27, 2008, 21:40:27
(не новость и не совсем об эволюции, но интересно)
Гипотеза обитаемых миров
http://www.astronet.ru/db/msg/1209520
(если на Титане есть жизнь, то с неизбежностью она преобразовала бы планету)
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от июня 27, 2008, 21:54:48
(и еще астрономическое)
Жизнь (или преджизнь или органические соединения) возникает в волнах плотности в протопланетном облаке
http://wsyachina.narod.ru/earth_sciences/life_genesis_8.html
оригинал в пдф лежит на
http://www.sciencefirsthand.ru/content0.shtml
(и вообще там популярные статьи по эволюции часты)
Название: h
Отправлено: feralis от июня 30, 2008, 08:07:26
Генетики сумели разнести ныне живущие виды птиц по ветвям эволюционного древа. В результате водоплавающие и сухопутные обрели разных предков, сокола разделили с ястребом, а ночные охотники за насекомыми — козодои — «удочерили» дневных любителей нектара — колибри. Стоит ли из-за этого переписывать учебники биологии — пока неясно, но это открытие в очередной раз подтвердило справедливость теории эволюции
http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/320/5884/1763
водные» фламинго и поганки с утками и пеликанами находятся в таких же родственных связях, как и с другими пернатыми. Учёным удалось показать, что эти водоплавающие птицы произошли от разных предков, независимо освоивших новую среду обитания.

Плавательные перепонки, жировые железы, обеспечивающие несмачиваемость перьев, особенности строения клюва и прочие приспособления, позволившие этим видам эффективно использовать водоемы не только как источник пропитания, но и как место обитания, развились у этих групп независимо.

Это ещё раз подтверждает единство принципов эволюции, а кроме того, высокую вероятность появления новых признаков. Ведь то, что эти группы птиц сохранились до наших дней, подтверждает, что для природы было быстрей наделить пернатых в разных уголках планеты вышеописанными свойствами, нежели создать одного «приспособленного» предшественника и затем расселять его по разным водоемам
Название: h
Отправлено: feralis от июня 30, 2008, 08:19:22
Изучение генетического родства организмов заставило учёных изменить взгляд на «древо жизни» ядерных организмов. В новой систематике человека объединяют с амёбами, а малярийного плазмодия – с бурыми водорослями. Другие, куда более важные, с точки зрения эволюционистов, изменения, затронут малоизвестные формы – две заполненных ими ветви «древа жизни» сростаются в одну
http://www.apollon.uio.no/vis/art/2007_4/Artikler/The_Tree_of_Life

Специалистам из университетов Осло и Женевы для этого даже не понадобилось проводить новых экспериментальных исследований. Взяв за основу 5000 генов, они определили 123, варианты которых в той или иной форме встречаются у всех живых существ. За этим последовало более детальное сравнение, потребовавшее вычислений с помощью практически всей компьютерной сети главного университета Норвегии.

Результаты потрясли даже самих ученых, а они уже взбудоражили остальную научную общественность. Группы эукариот генетики предложили полностью «переделить
Они утверждают, что всех ядерных существ надо разделить на четыре супергруппы вместо пяти, использовавшихся до сих пор
Среди растений, по мнению биологов из Осло, должно найтись место также зеленым и красным водорослям. Опистоконты, ранее включавшие животных (и человека) и грибы, должны принять в свою супергруппу амёб. Третья группа – экскаваты, к которым отнесены многие человеческие паразиты, а также некоторые типы водорослей.

Четвёртая, новая группа объединила простейших, прежде относившихся к двум другим супергруппам. С названием её биологи оригинальничать не стали, обозвав её SAR – от групп страменофил, альвеолятов и ризарий (Stramenophiles, Alveolates и Rhizaria), объединившихся в новой супергруппе
Правда, ученые признают, что и в их «ясной» картине есть изъян: пока некуда пристроить одну из ветвей хромальвеолятов, недостаточно совпадающую по геному с остальными «родственниками» из SAR.
Название: 5
Отправлено: feralis от августа 01, 2008, 08:28:15
http://dnatree.ru/index.php?name=Forums&file=viewtopic&t=26&postdays=0&postorder=asc&start=0
здесь знающие люди обсуждают статью о потомках Чингисхана
Название: и
Отправлено: feralis от августа 12, 2008, 08:04:49
Люди доили животных уже девять тысяч лет назад. Это заключение было сделано после радиоизотопного анализа останков посуды, найденных на Ближнем Востоке и юго-восточной части Европы. До сих пор у ученых не было доказательств того, что люди научились получать молоко от животных так давно. Результаты работы опубликованы в журнале Nature. Пресс-релиз можно найти на сайте Университета Бристоля.
Большая группа исследователей, ведущим из которых был Ричард Эвершед (Richard Evershed), проанализировала 2225 черепков, которые с наибольшей вероятностью являются останками посуды, в которой готовили или хранили пищу. Чтобы определить, наливали ли в древнюю посуду молоко, исследователи определяли наличие на фрагментах посуды некоторых жирных кислот. Жирные кислоты определенной структуры входят в состав жира молока. Ученые оценивали соотношение различных изотопов углерода в обнаруженных органических останках.
Самые древние следы молока были найдены на фрагментах посуды из северо-западной Анатолии (территории современной Турции). Эта область относится к региону так называемого Плодородного полумесяца, где климат благоприятствует разведению животных(считается, что именно в странах Плодородного полумесяца около десяти тысяч лет назад было "изобретено" скотоводство).

Авторы работы полагают, что одновременно с тем, как люди научились доить коров и коз, они освоили технологии створаживания молока и изготовления сыров. Для большинства людей характерна непереносимость лактозы - отсутствие фермента, расщепляющего лазтозу, или молочный сахар. Люди с лактозной непереносимостью могут употреблять только переработанные молочные продукты.

http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature07180.html
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от сентября 02, 2008, 19:59:13
Купил по случаю учебник по теории эволюции Северцева (я вижу их целая династия!!! Может мне взять псевдоним Шмальгаузен для публикаций :D ). На первый взгляд всё вроде складно и к тому же для биологических вузов, но не отпускает пока во всяком случае впечатление, что мне продали то, что у меня уже есть, а есть если честно не много. Может быть дальше чемто удивит!
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от сентября 02, 2008, 20:16:17
Прочитал на днях фантастическую  повесть Еськова "Дежа вю". Замечательное произведение, всем рекомендую, это и немножко кибернетика и биология, и антиутопия и фэнтэзи и любители виртуальных миров найдут здесь что то, а главное, это произведение настоящего биолога. Сначала, если честно я думал это однофамилец, потом, понял нет, тот самый Кирил Юрьевич. Всем рекомендую, если честно сюжет немного кажется детским, но затягивает с первых строк и не отпускает до конца. И главное всё там я нахожу из своего мира, такое близкое и к счастью далёкое, например когда печатали на старых компьютерах СМ подпольно произведения Стругатских и Булгакова например.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от сентября 03, 2008, 15:27:05
Это оно:    mds.radio.super.lv/Kirill_Es'kov_-_Dezha_vju.mp3   ?
Разве там есть биология?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от сентября 03, 2008, 22:22:15
Alexy. Ну во-первых пишется биологом и от имени героя биолога, во-вторых, там упоминается кибернетическая постановка проблемы фон Неймана и обосновывается её связь с биогенезом и избыточностью информации в ДНК.

А за ссылку спасибо!
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от сентября 03, 2008, 22:37:00
Да не за что. К сожалению идиотская музычка делает прослушивание не очень приятным
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от сентября 18, 2008, 04:18:26
Вот интересная публикация в сегодняшней Nature про необходимость пересмотра СТЭ.
Название: y
Отправлено: feralis от сентября 29, 2008, 23:01:19
Биологи из Университета Пьера и Марии Кюри установили, что один из генов, необходимых для умения жалить, мог появиться в геноме медуз благодаря бактериям, сообщает Nature News. Работа ученых опубликована в журнале Current Biology.
Анализ филогенетического дерева бактерий (дерева, представляющего генетические взаимосвязи между различными видами) показал, что изучаемый ген кишечнополостных пришел именно оттуда. Данный ген присутствует у всех кишечнополостных со стрекательными клетками, и, по крайней мере, у одного вида медуз - Clytia hemisphaerica - он активен.

Подобное явление называется горизонтальной передачей генов. В отличие от вертикальной передачи, которая происходит от родителей к потомку, горизонтальная передача является для сложных организмов достаточно редким явлением. Одним из примеров является японский жук Popillia japonica, который приобрел несколько генов от своих паразитов. В настоящее время ученые затрудняются объяснить собственно механизм передачи гена, а также его необыкновенную "мобильность" (то что он присутствует у всех кишечнополостных со стрекательными клетками).

Некоторые ученые уже подвергли данную работу критике. Они утверждают, что ген мог достаться кишечнополостным от далекого предка. При этом некоторые предковые организмы могли со временем его утратить.

http://www.current-biology.com/content/article/abstract?uid=PIIS0960982208008981
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от октября 14, 2008, 11:18:08
В смысле: все остальные 6 видов соврем. медведей раньше разошлись с бурым медведем, чем он разошелся с б. пандой?
Название: h
Отправлено: feralis от октября 15, 2008, 21:22:25
к сожалению у меня лишь предварительная информация и придется ждать
публикации более развернутой
а насчет медведей я нигде не встречал достойного доверия дерева их родства
вообще если гигантопитек откололся от орангутана 11 мильонов лет назад
и тоже имел бамбуковую диету и адаптированую к ней зубную систему то можно допустить что
медведи одновременно стали осваивать эту экологическую нишу
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от октября 15, 2008, 23:32:41
Рекомендую быть осторожнее с сообщениями о геноме панды. Во-первых, работают над ним в основном китайцы, а это чревато ошибками. Во-вторых, остальные медведи пока не секвенированы. В-третьих, mapping только начался -- сообщают о предварительных результатах, по-видимому, в основном для того, чтобы отчитаться о деньгах (проект был рассчитан на полгода). Наконец, публикаций пока нет, даже в китайских журналах -- это самое существенное.
Название: 7y
Отправлено: feralis от октября 30, 2008, 22:33:25
Расшифровка мтДНК пещерного медведя помогла восстановить историю деления медвежьего семейства

Ныне живущие и не очень похожие друг на друга белый и бурый медведи роднее друг другу, чем вымерший 15 тысяч лет назад пещерный медведь – любому из них. По данным генетического анализа, последний общий предок этих медведей жил в начале плейстоцена, около 1,6 миллиона лет назад. Соответствующая работа опубликована в Proceedings of the National Academy of Sciences.

Команда французских и голландских учёных под руководством Жана-Марка Элалуфа определила полную последовательность генетических «букв» в митохондриальной ДНК, извлечённой из сегмента грудины пещерного медведя. Эта кость около 32 тысяч лет пролежала под землёй, в знаменитой палеолитической пещере Шове на юге Франции, открытой в 1994 году. В мтДНК, собранной из нескольких перекрывающихся фрагментов, оказалось 16 810 пар азотистых оснований. Восстанавливать последовательность из фрагментов молекулы пришлось не потому, что секвенировать её методом стрельбы было проще, а потому, что цельной мтДНК выделить не удалось.

Определив генетический код клеточной органеллы, передающийся лишь по женской линии, учёные сравнили её с мтДНК бурого медведя и построили филогенетическое древо семейства Ursidae, в котором нашлось место и пещерному медведю. На основании современных представлений о скорости синонимических замен нуклеотидов в ДНК – так называемого метода генетических часов – учёные сделали оценку, что разделение ветвей пещерного медведя и ветви, на которой находятся бурый и белый медведи, произошло около 1,6 миллиона лет назад; точность этого значения учёные оценивают примерно в полмиллиона лет.

В результате, историю эволюции современных медведей учёные представили следующим образом . Ещё в миоценовую эпоху от всего семейства отделилась ветвь, потомков которой мы сейчас знаем, как очкового медведя, обитающего в Южной Америке. Затем, примерно 3 миллиона лет назад, выделилась ветвь медведей-губачей, населяющих Индостан. Вскоре после этого оставшаяся линия разделилась на ветвь гималайского, малайского (бируанга) и американского чёрного (барибала) медведей с одной стороны и ветвь белого, бурого и пещерного медведей – с другой. Последнее разделение на виды – между западным подвидом бурого и белым медведем произошло от 200 до 500 тысяч лет назад.

Предполагается, что пещерный медведь пришёл в Европу около 300 тысяч лет назад с Ближнего Востока. Самый поздние известные учёным останки вымершего животного датируются примерно 13-м тысячелетием до нашей эры. До сих пор полностью расшифровать мтДНК вымершего животного удавалось лишь для новозеландской птицы моа, вымершей несколько столетий назад, нескольких мамонтов, сохранившихся в вечной мерзлоте и неандертальца. Учёные надеются, что их пример подвигнет коллег на попытки восстановить мтДНК других вымерших животных, особенно пещерных – хотя условия здесь не так способствуют сохранности тканей, как вечная мерзлота, тьма пещер защищает двойную спираль от разрушения ультрафиолетом

http://www.pnas.org/content/early/2008/10/24/0806143105
Название: s
Отправлено: feralis от ноября 27, 2008, 21:50:01
Самая древняя из известных черепах не обладала спинным панцирем. Обнаружившие её окаменелости в юго-западном Китае палеонтологи считают, что это не только один из самых древних представителей отряда, но и прямое доказательство морской теории происхождения всех черепах. Хотя не исключено, что от панциря вновь описанный вид отказался ради большей подвижности и маневренности.

Мощный панцирь и отличные плавательные навыки делают взрослых черепах практически неуязвимой добычей даже для самых страшных хищников морей и океанов. Поэтому биологи предпочитают отлавливать объекты для исследования на суше, или вовсе добывать окаменелости из горных пород. Правда, сделать выводы об особенностях кровообращения или дыхания последних, опираясь только на строение скелета, весьма непросто.

Чунь Ли и его коллеги, обнаружившие в горных породах юго-западного Китая несколько полностью окаменевших скелетов, возраст которых составляет 220 миллионов лет. Так что ученым, во-первых, не пришлось, как это водится у палеонтологов, «достраивать» весь скелет на основании черепа и нескольких позвонков, а во-вторых, сделанные ими выводы действительно справедливы для целого вида, названного Odontochelys semistestacea.
Вся уникальность уместилась в названии, дословно переводимом как «зубастые полупанцирные» – в отличие от всех известных до сегодняшнего дня сородичей, находки Ли и коллег обладают лишь полным грудным щитом, и хотя их череп имеет характерный клювовидный выступ, зубы у одонтошелиса еще остались.
Спор о происхождении панциря черепах – один из самых древних среди эволюционистов.
Даже когда с источником окостенения всё вроде бы стало ясно – ребра и нейральный гребень на спине, время и назначение панциреобразования оставалось загадкой. Например, самый древний до сегодняшнего дня «немец» Proganochelys quenstedti, живший 206 миллионов лет назад, давности обладал полноценными зубами и мощной раковиной, при наземном образе жизни помогавшей не только защититься от врагов, но и неплохо сэкономить на испарении воды.

Но отсутствие «наземной» переходной формы делает эту гипотезу весьма сомнительной, ведь даже легкая броня накладывает серьезные ограничения на передвижение, а то, что возникший панцирь изначально обеспечивал хорошую защиту, маловероятно.
Авторы публикации в Nature с помощью описанного ими «зубастого полупанцирного» решили доказать «морскую» гипотезу происхождения черепах.
Черепахи
отряд пресмыкающихся, существующий на протяжении 250 миллионов лет. Содержит около 230 видов, группируемых в 12 семейств и 2 подотряда, распространённых по всей земле и живущих как в воде, так и...
Геологическое окружение окаменелостей Odontochelys semistestacea не оставило сомнений в среде обитания, а вот с доказательством его права на первородство ученым пришлось повозиться.

Во-первых, на его верхней челюсти присутствует весь комплект зубов, в отличие от всех претендентов на первенство, найденных до сегодняшнего дня. Во-вторых, слитное окостенение на спине затронуло только нейральный гребень, защищающий спинной мозг, ребра не срослись, да и «сшивки», соединяющие у современных черепах спинной панцирь и грудной щит, отсутствуют.

Тем не менее одно слабое место в этой логической цепочке все-таки нашлось – неизвестно, первично ли отсутствие спинного панциря.
Не исключено, что у Odontochelys semistestace были полностью панцирные предки, а он отказался от цельной защиты в пользу скорости и маневренности.
Лёгкие секреты крокодильей грации
Аллигаторы обладают удивительным механизмом маневрирования. Как выяснили американские учёные, под водой они перемещают свои лёгкие – к голове, хвосту или в сторону. Возможно, ради этого...
Пролить свет на этот вопрос могло бы изучение отсутствующей на окаменелостях мускулатуры, ведь черепахи, образно говоря, слившие свои ребра для образования панциря, тем самым лишились возможности использовать грудную клетку для дыхания, подвижность которой компенсируется другими, отсутствующими у остальных рептилий пучками мышц.

В любом случае Odontochelys semistestace остается самым древним, самым примитивным и наверняка одним из самых первых существ в черепашьем роду, за пару сотен миллионов лет приспособившемся к обитанию в пустынях, скалах, пресных и морских водоемах.

http://www.nature.com/nature/journal/v456/n7221/edsumm/e081127-13.html
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atli от января 09, 2009, 02:30:56
В этом году у эволюции двойной юбилей: 200 лет Дарвину и 150 лет "Происхождению видов". В связи с этим январский номер Scientific American посвящён эволюции. Там есть очень интересные публикации, причём в более-менее популярном стиле, характерном для SciAm.
http://www.sciam.com/sciammag/
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atli от января 09, 2009, 02:41:46
Вот, к примеру, очень симпатичное дерево эволюции гоминид(ов).
http://issuu.com/sciam/docs/2009-01_human_hominid/3?mode=embed&documentId=081216232351-235371316ee34c1eafe9105786f91475&layout=grey
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от января 09, 2009, 12:58:21
Цитата: "Atli"Вот, к примеру, очень симпатичное дерево эволюции гоминид(ов).
http://issuu.com/sciam/docs/2009-01_human_hominid/3?mode=embed&documentId=081216232351-235371316ee34c1eafe9105786f91475&layout=grey
Весьма любопытная таблица, но есть несколько сомнительных моментов.
1. Почему хабилис у них хомо, а не австралопитек.
2. Насколько я помню эргастер настолько близок к эректусу, что многие его относят к его архаичной форме, а тут эректус вынесен куда-то далеко и более того уже как бы и не имеет никакого отношения к нашим предкам (кстати я подозревал подобное, поскольку эректусы были первыми мигрантами и были уничтожены последующей более прогрессивной волной антецессоров и его потомками, поэтому может правда, что они потомки непосредственно эргастеров).
3. Почему эректус стоит практически на одном уровне с неандером, а флореский человек даже впереди?
4. Кстати мне до сих пор непонятно почему грузинского человека (которого Лордкипанидзе нашел) всё же отнесли к регрессивной форме эректуса (первоначально его обозвали то ли георгикус, то ли джорджианус не помню), а флореского человека всё таки выделили в отдельный вид?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atli от января 09, 2009, 14:01:30
Дж. Тайсаев
Там же "менее очевидные связи" отмечены пунктиром. И они, надо сказать, преобладают! :D
На остальные вопросы, надеюсь, прольют свет специалисты. Однако о флоресском человеке авторы прямо пишут, что это наиболее поздний представитель рода Homo (помимо сапиенса, разумеется).
Название: Ядерный геном мамонта отсеквенирован примерно на 70%
Отправлено: olenellus от января 09, 2009, 21:31:07
Ядерный геном мамонта отсеквенирован примерно на 70%

Webb Miller, Daniela I. Drautz, Aakrosh Ratan, Barbara Pusey, Ji Qi, Arthur M. Lesk, Lynn P. Tomsho, Michael D. Packard, Fangqing Zhao, Andrei Sher, Alexei Tikhonov, Brian Raney, Nick Patterson, Kerstin Lindblad-Toh, Eric S. Lander, James R. Knight, Gerard P. Irzyk, Karin M. Fredrikson, Timothy T. Harkins, Sharon Sheridan, Tom Pringle, Stephan C. Schuster.
SEQUENCING THE NUCLEAR GENOME OF THE EXTINCT WOOLLY MAMMOTH
Nature. V456. 387-390. 20 November 2008.

Резюме статьи:
В 1994 году две независимые группы выделили ДНК из нескольких мамонтов плейстоценовой эпохи и отметили различие между отдельными образцами. В след за этим были опубликованы последовательности ДНК для нескольких вымерших видов. Однако такая древняя ДНК обычно разорвана и повреждена, и до настоящего времени исследования были направлены на изучение коротких митохондриальных последовательностей, не давая больше доли процента ядерного генома. В этой работе мы описываем 4,17 миллиардов нуклеотидов последовательности для различных мамонтовых образцов, 3,3 миллиарда из которых принадлежать геному шерстистого мамонта (Mammuthus primigenius), и, таким образом, составляет широкий набор общегеномных последовательностей для вымершего вида. Наши данные подтверждают высказанные ранее предположения, что геном слоновых по размеру привышает 4 миллиарда нуклеотидов. Оцененная скорость дивергенции между мамонтом и африканским слоном составляет половину от этой же величины, полученной для человека и шимпанзе. Наблюдаемое количество нуклеотидных различий между двумя отдельными мамонтами составляет примерно одну восьмую от этой же величины между ними и африканским слоном, что соответствует разделению между мамонтами 1,5 - 2 миллиона лет назад. Оценочная вероятность различия ортологичных аминокислот слона и мамонта составляет 0,002, что соответствует примерно одному аминокислотному остатку на белок. Были обнаружены различия в положениях аминокислот мамонта и африканского слона, инвариантных для нескольких миллиардов лет суммарной эволюции млекопитающих. Данное исследование показывает, что последовательность ядерного генома вымерших видов может выявить популяционные различия, не видные из палеонтологической летописи, и, возможно, даже обнаружить генетические факторы, повлиявшие на вымирание.

Выделение ДНК проводили из шерстяного покрова вымороженных останков животных. Такая ДНК, во-первых, лучше сохраняется, во-вторых, её легче очистить. Один 20000-летний мамонт выдал 3 миллиарда нуклеотидов. Остальные последовательности получены с других мамонтов. Проект сильно зависит от проекта по секвенированию генома африканского слона, так как даже для лучшего образца около 4% последовательности оказалось бактериальной ДНК. Для другого мамонта доля бактериальной ДНК в полученных последовательностях составляла около 16%, а средняя длина непрерывных последовательностей всего около 150 нуклеотидов, что затрудняет сборку протяжённых участков.

Работа продолжается. В ближайшем будущем можно ожидать многократное покрытие частей генома, в которых мамонт отличается от африканского слона. Возможно, мечта Зимина о мамонте в Плейстоценовом парке не такая уж и несбыточная.

Если кому-нибудь нужен поиск по базе данных последовательностей мамонтовго генома, то поиск с помощью алгоритма BLAST доступен по этой (http://mammoth.psu.edu/) ссылке.

Оригинал статьи (http://www.nature.com/nature/journal/v456/n7220/pdf/nature07446.pdf). Не уверен, что она в свободном доступе. Если нет, у меня есть скаченный вариант.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от января 11, 2009, 00:07:31
Большое спасибо за столь интересный материал!

Там, где говорится о 1,5-2 млн. лет дивергенции между самими мамонтами - это расхождения между разными видами мамонтов или между членами одного и того же вида шерстистого мамонта?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Atli от января 11, 2009, 18:14:55
Журнал Science запустил блог по эволюционной тематике
http://blogs.sciencemag.org/origins/
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от января 12, 2009, 06:50:38
ЦитироватьТам, где говорится о 1,5-2 млн. лет дивергенции между самими мамонтами - это расхождения между разными видами мамонтов или между членами одного и того же вида шерстистого мамонта?

А они сами ещё не в курсе. Нашли 2 линии внутри шерстистых мамонтов, но е знаюст: это внутривидовой полиморфизм или свидетельство существования двух видов шерстистых мамонтов.

Сами авторы пишут:

ЦитироватьAlthough no functional differences were observed between the different mtDNA genomes, the deep phylogenetic split between the two clades and their apparent coexistence, in combination with statistical evidence that indicates the demise of clade II up to 30,000 thousand years before the demise of clade I on mainland Siberia, raises questions about the evolutionary relationship between the two clades.On the one hand, the data could simply represent natural variation within a single species, driven by an early maternal lineage split that was retained in later history, with the clade II sequences disappearing because of genetic drift. A number of extant mammalian taxa show similar patterns of genetic variation within single continuous populations, includingmoose (14), reindeer (15), andAsian elephants (16), and several ancient DNA studies have shown similar patterns of clade extinction in taxa such as cave bears (17), brown bears (18), wolves (19), and arctic fox (20). On the other hand, in light of the incompleteness of most fossil mammoth remains and our inability to make observations on living mammoths to provide behavioral or other cues that aid in the resolution of the taxonomic relationship between living mammals, the genetic data may provide evidence of something more, specifically the existence of sympatric mammoth species that
underwent asynchronous extinction events.

http://www.bx.psu.edu/miller_lab/dist/mammoth_pnas.pdf

Я склоняюсь к первому варианту - сосуществование 2х видов на протяжении не менее миллиона лет, при отсутствии выявленных морфологических отличий выглядит сомнительным. Скорее всего, это следы  дрейфа генов.
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: b-graf от января 12, 2009, 21:23:10
(не публикация, а объявление)

Эволюционные основы агрессии и примирения у человека
Анонс лекции Марины Бутовской
http://www.polit.ru/lectures/2009/01/10/butovskya.html
15 января в Билингве
Название: Re: Ядерный геном мамонта отсеквенирован примерно на 70%
Отправлено: Alexy от января 13, 2009, 13:52:15
Цитата: "olenellus"Проект сильно зависит от проекта по секвенированию генома африканского слона
А почему африканского? Почему ученые решили секвенировать первым его, а не индийского?
Название: интересные публикации о эволюции
Отправлено: olenellus от января 13, 2009, 20:21:24
Честно говоря, не знаю, почему первым решили секвенировать африкаского, но в этом же проекте на очереди лесной и азиатский слоны. Слонов вообще решили секвенировать как представителей афротериев.
Название: 1
Отправлено: feralis от февраля 14, 2009, 11:33:33
http://en.wikipedia.org/wiki/Neanderthal_genome_project

Учёные представили первые результаты полной расшифровки ядерного генома неандертальца. Они могли говорить, не выносили молочной диеты и не могли передать нам микроцефалию и болезнь Альцгеймера. Впрочем, самое интересное нас ожидает в официальной публикации генома, намекнули генетики.
В четверг вечером, во время пресс-конференции в Лейпциге, Сванте Пеэбо не мог спокойно усидеть на стуле и беспрерывно тряс коленками. Шведский профессор, директор отдела генетики знаменитого немецкого Института эволюционной антропологии, рассказывал о результатах проекта расшифровки генома неандертальца, начало которого он сам определил серединой 2006 года.
На деле эту историю можно проследить минимум на десяток лет дальше в прошлое. В конце 1990-х годов Пеэбо и его сотрудникам удалось прочитать несколько крохотных обрывков ДНК, извлечённой из останков ближайшего вымершего родственника современного человека. Всего несколькими годами раньше коллеги шведа посчитали бы такую задачу невыполнимой – уж слишком быстро главная биологическая молекула разлагается после гибели своего носителя, и слишком быстро её место занимают ДНК сотен и тысяч видов бактерий и грибов, тотчас принимающихся за переработку костей в материал для более примитивной жизни.
Но задуманное Пеэбо удалось. Сначала учёные установили все 16,5 тысяч нуклеотидов в митохондриальном геноме исчезнувшего 30 тысяч лет назад неандертальского человека, потом показали, что способны расшифровать и несколько миллионов генетических «букв» из его ядерной ДНК, длиной не уступающей человеческой. А потом систематически взялись за расшифровку полного ядерного генома.
В четверг Пеэбо объявил, что первый этап работы завершён: нуклеотидов прочитано уже больше, чем полная длина генома (3,7 миллиарда против 3,2).
В день 200-летнего дарвиновского юбилея учёный посчитал себя вправе чуть-чуть нарушить неписаную научную этику, рассказав журналистам о своей работе прежде, чем она была опубликована в рецензируемом научном журнале. Впрочем, самое «вкусное», намекнул генетик, он и его коллеги оставили для статьи в Science, которая должна выйти в ближайшие месяцы.
Чистота
Что нуклеотидов прочитано на 20% больше, чем их есть в геноме, не должно смущать – просто некоторые участки ДНК были прочитаны в нескольких копиях. Генетики вообще любят считывать каждое место по 10–20, а лучше по 30–40 раз, чтобы гарантированно выявить ошибки секвенирования, неизбежно возникающие в процессе считывания. Эта кратность называется средней глубиной покрытия.

Чтобы достоверно иметь не более одной ошибки на 10 000 пар азотистых оснований, современным методам нужно секвенировать даже хорошо сохранившуюся ДНК с 12-кратным запасом. Для скоростных методов секвенирования третьего поколения глубину покрытия приходится увеличивать до нескольких десятков, а то и сотни (как у Complete Genomics).
В случае с полуразрушенным геномом неандертальца большая глубина особенно актуальна, но пока вместо покрытия в 30–40 учёные едва добрались до 1,2. Более того, в реальности им к настоящему моменту удалось увидеть лишь 63% неандертальского генома, так что исследована ДНК весьма неравномерно: 37% её длины (примерно 1,2 миллиарда пар нуклеотидов) мы не видели ни разу, а оставшиеся 63% (2 миллиарда пар) – в среднем дважды.
Важнее всего было удостовериться, что исследуемая ДНК принадлежит неандертальцам, а не сотням исследователей, которые десятилетиями изучали строение неандертальских костей, держа их в своих руках.
Чтобы оценить степень загрязнения, учёные воспользовались двумя методами – по фрагментам Y-хромосомы и по фрагментам митохондриального генома. Основная часть 3,7 миллиардов нуклеотидов считаны с женских костей. Y-хромосом в геноме женщины, даже неандертальской, быть не должно вовсе, а для мтДНК неандертальца мы знаем 133 отличия от мтДНК человека. По этим признакам учёные оценивают степень загрязнения в 0,2–0,5% «и в любом случае меньше 1–2%», уверяет Пеэбо.
Однако даже те образцы, что оказались не тронуты человеком, вполне по вкусу грибкам и бактериям. Чтобы вычленить 3,7 миллиарда «букв» неандертальского генома, учёным пришлось прочитать больше 100 миллиардов пар нуклеотидов: в лучших фрагментах лучших образцов доля интересующей ДНК лишь немногим превышала 4%. Будь эти кости чистыми, кратность прочтения неандертальского генома составляла бы сейчас более чем благопристойные 25–30 раз. Впрочем, отличить ДНК грибов и бактерий относительно легко.
Образцы
Подбирая подходящий источник генетического материала, Пеэбо и его коллеги перебрали свыше 200 проб из 70 образцов, обнаруженных в 16 разных точках Европы и Центральной Азии. И большая часть из них были отбракованы – доказать отсутствие загрязнения человеческой ДНК было практически невозможно.
В итоге учёные остановились на четырёх источниках. Львиная доля данных (более 99%) получена при анализе ДНК из неандертальских костей, найденных в хорватской пещере Виндия. В первую очередь кусочка умершей 38 тысяч лет назад женщины, который до сих пор не показался антропологам особенно интересным, а потому сохранился почти не тронутым человеком современного типа.


Кроме хорватской неандертальки Пеэбо и его коллеги прочитали 5 миллионов пар нуклеотидов в костях неандертальца из испанской пещеры Эль-Сидрон. По просьбе генетиков, дабы не занести в образцы свою ДНК, археологи в пещере работали в специальных костюмах биологической защиты и замораживали кости сразу по извлечении их из грунта, где те пролежали 43 тысячи лет.

Третьим неандертальцем был ребёнок из Мезмайской пещеры в Краснодарском крае, образцы тканей которого предоставили антропологи Любовь Голованова и Владимир Дороничев из петербургской Лаборатории доистории. К настоящему моменту с костей погибшего в возрасте всего пары недель неандертальца прочитаны 20 миллионов пар нуклеотидов. На этого младенца у учёных особые надежды: он гораздо древнее остальных образцов (возраст костей оценивается в 60–70 тысяч лет), и его изучение сможет пролить свет на развитие самих неандертальцев.
Сванте Пеэбо удалось заполучить даже кусочек Неандертальца с большой буквы – того самого, найденного в долине реки Неандер человека, который определил весь вид и дал ему название.
С фрагмента кости, хранящейся в одном из музеев Бонна, учёные прочитали 2 миллиона пар нуклеотидов. Возраст образца – примерно 40 тысяч лет, из которых 150 он провел в музее.
Отличные неандертальцы
С помощью 2 миллиардов (если исключить повторяющиеся фрагменты) «букв» генетического кода учёные подтвердили результаты трёхгодовой давности, полученные на в тысячу раз меньшем материале. Последовательности ДНК Homo neanderthalensis и H. sapiens современного типа совпадают почти на 100%.
В таких случаях сами отличия удобнее считать не в абсолютных величинах, а по отношению к разнице между современным человеком и его ближайшим дожившим до наших дней родственником – шимпанзе; с ними у нас общие 99% ДНК.
Отличие генома неандертальца от опорного генома человека составляет 12,8% разницы человек-шимпанзе.
Но не стоит думать, что «неандертальцы – обезьяны на одну восьмую». Эти 13% вполне ложатся в рамки вариации человеческого генома по популяции в целом. Например, среди одних только французов эта вариация составляет 8,1% разницы между человеком (точнее, опорным геномом) и шимпанзе. Среди китайцев вариация – 8,6%, среди пигмеев бамбути – 10,5%. Но никто же не утверждает, что французы – обезьяны на 8%, а африканцы – на 11%.
Интегрально по геному неандертальцы от нас почти не отличимы. Но дьявол, как известно, в деталях, и именно многочисленным подробностям Пеэбо и его коллеги посвятили статьи, которые сейчас находятся в процессе рецензирования. Часть секретов руководитель работ раскрыл, оговорившись, что не будет пока «отбирать у статьи слишком многого», сославшись на то, что не может выложить журналистам всё и должен оставить что-то и для статьи.
Например, главный генетик лейпцигского института сходу отказался подтвердить или опровергнуть ползущие от конференции к конференции слухи об обнаружении генетической инверсии на 7-й хромосоме нашего дальнего родственника. У человека подобная инверсия приводит к редкому синдрому, иногда заканчивающемуся заторможенным развитием мозга и лёгким недоразвитием пальцев. Говорить на эту тему руководитель проекта не стал.
Однако в известные нам теперь 63% неандертальского генома попали ещё несколько очень интересных генов.
Например, Foxp2, который часто называют «геном речи». Мутации в этом гене обычно выливаются в неспособность управлять своим речевым аппаратом и воспринимать слова (притом что в остальном такие «мутанты» остаются нормальными людьми). Таким образом, Foxp2 с речью как-то связан, хотя понятно, что единичный ген не может отвечать за столь сложную конструкцию, как человеческая речь, – телевизор вон тоже перестаёт работать, даже если в нём сгорит всего одна микросхема.

Неандертальцы могли говорить
Учёным удалось выделить из ядерной ДНК неандертальца ген, который у нас отвечает за развитие речи, и он оказался в точности идентичным человеческому. Не исключено, правда, что гоминид, из костей...

Известно, что человеческий вариант белка Foxp2 отличается от шимпанзиного в двух позициях, и чуть более года назад учёные умудрились «попасть» в этот ген, прочитав всего 2% генома испанского неандертальца (вероятно, те самые 5 миллионов пар нуклеотидов из пещеры Эль-Сидрон, о которых шла речь выше). Тогда оказалось, те же две «человеческие мутации» присутствуют и у неандертальца из Эль-Сидрона. Как рассказал Пеэбо в четверг, по крайней мере одна из этих замен присутствует и в геноме хорватского неандертальца; вторая в область покрытия не попала. Так что Foxp2 не мог помешать говорить ни неандертальцу, ни нашему общему с ним предку.
Если только Foxp2 не появился у неандертальцев за счёт скрещивания с человеком.
По словам Пеэбо, вопрос о передаче генов человеком современного типа неандертальцу пока открыт.
Точно можно утверждать лишь, что ген Lct фермента лактазы, благодаря которому большая часть жителей Европы могут пить молоко не только в младенческом возрасте, мы неандертальцам не передавали – у тех особей, кости которых достались Пеэбо, такой способности не было. Впрочем, это и не удивительно: по современным оценкам, у самих людей она появилась 10–20 тысяч лет назад, когда неандертальцев в Европе и след простыл.
В обратную сторону – от неандертальца к человеку – передачи генов не было. Учёный заявил, что на данный момент можно уверенно говорить, что у человека неандертальских генов практически нет и, хотя точной оценки он пока дать не может, доля неандертальского наследия в геноме человека, «если и есть, ничтожна». Ранее это было показано для митохондриального генома, теперь для ядерного.
В частности, не передали нам неандертальцы генов микроцефалии, которая у потомков живших бок о бок с H. neanderthalensis европейцев встречается гораздо чаще, чем у африканцев. Не от них нам достались и гены τ-белка, формированием спутанных филаментов которого заканчивается амилоидный каскад при болезни Альцгеймера.
Впрочем, археологи, которые куда лучше генетиков могут разобраться во взаимоотношениях человеческих племён по оставшимся от них материальным свидетельствам, и так не видят никаких указаний на возможность скрещивания в прошлом между нашими прямыми предками и неандертальцами.
Неандерталец для человека
Пеэбо тем временем уже замахивается на исследование вопроса о скрещивании между неандертальцем и его возможными предшественниками на территории Европы. Были ли таковые или H. neanderthalensis стал первым колонизатором «старушки» – мы пока не знаем.
Учёный пообещал, что в ближайшие месяцы будет опубликовано ещё немало интересных результатов по неандертальскому геному. А пока идёт редакционный процесс, учёные работают как заведённые. Пеэбо поставил себе цель достичь 15–20-кратного покрытия генома, что позволит создать надёжную базу отличий неандертальца от человека.
После этого генетика неандертальца сможет стать персональной, как стала в последние годы человеческая генетика. А учёные смогут понять, насколько разнообразными были наши канувшие в лету родственники. Данные по мтДНК 6 особей H. neanderthalensis, полученные при расшифровке ядерного генома в качестве побочного продукта, пока свидетельствуют не в пользу этих древних людей.
Их генетическое разнообразие не дотягивает до разнообразия человечества, хотя вполне на уровне отдельных его рас.
Возможно, история расселения нашего предшественника очень напоминала нашу. Только из Африки они вышли один раз и дальше западной Евразии уходить не стали.
Данные об отличиях наших ближайших вымерших родственников от нас и друг от друга помогут разобраться и в нашей собственной истории. Они высветят гены, которые последние сотни тысяч лет, уже после разделения видов, находились под влиянием положительного отбора и помогли достичь того доминирующего положения на планете, которое мы сейчас занимаем. В конце концов, именно для того, чтобы разобраться в себе самих, мы и изучаем эту историю.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от декабря 17, 2009, 12:45:48
Спасибо Фералис!

А что-то новое о геноме неандертальца с тех пор было опубликовано?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 20, 2009, 19:41:29
Alexy
откопали значить вымершую тему

Сванте
сообщал о расшифровке полудюжины геномов митохондрий неандертальцев живших в разное время
из результатов  вытекает вывод о маленьком размере популяций неандера
да жил он в субтропиках не зная инструмента для шитья одежды хотя зубами шкуры явно выделывал для зимних накидок

метательного составного оружия не знал как и неметательного
словом тяжко жить на краю ойкумены
похоже кто выбирает на жительство окраины тот по определению записывается в дикари

жить надо там где жить хорошо
хорошая жизнь и творить помогает
призываю Плантаго в свидетели

думаю жители россии могут вполне представить себя на месте неандеров
и никаких перспектив впереди

еще интересное сообщение было
оказалось что когда небольшая группа кромов переправилась через Аденский пролив в аравию
в ней мужчин было в несколько раз более женщин
и длилось это исторически долгое время\изоляция данной группы от прочих кромов\
именно в это время была заложена генетическая база обитателей евразии
а веть если предки индейцев пришли в мир непуганых зверей то в аравии наверняка жили неандеры
наверное переселенци брали в бою их женщин но детей небыло
впрочем проблему как мы знаем переселенци решили причем без связи с африкой откуда
новые группы пришли на уже обжитое место и много тысяч лет спустя

p.s.
к сожалению тема вымерла по личным причинам
не о публикациях а о вечном пришлось думать
проблемы со здоровьем

как говарили эллины

прежде всего справедливость
первое дело здоровье
ну а слаще цель к которой стремиться душа
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от декабря 20, 2009, 21:12:53
Цитата: feralis от декабря 20, 2009, 19:41:29
сообщал о расшифровке полудюжины геномов митохондрий неандертальцев живших в разное время
из результатов  вытекает вывод о маленьком размере популяций неандера
да жил он в субтропиках не зная инструмента для шитья одежды хотя зубами шкуры явно выделывал для зимних накидок
Гы. Т.е. мамонтовая тундростепь по нынешним временам уже субтропики?
Цитироватьметательного составного оружия не знал как и неметательного
Гы. Т.е. голыми руками мамонтов давил, а все оружия мустьерской культуры позже подбросили?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от декабря 21, 2009, 10:58:24
Цитата: Ярослав Смирнов от декабря 20, 2009, 21:12:53
Гы. Т.е. голыми руками мамонтов давил, а все оружия мустьерской культуры позже подбросили?

Меня больше удивляет, как это удалось узнать на основе расшифровки его генома? ;)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от декабря 21, 2009, 13:59:26
Цитата: Комбинатор от декабря 21, 2009, 10:58:24
Меня больше удивляет, как это удалось узнать на основе расшифровки его генома? ;)
Ну так по нынешним временам на основании расшифровки генома и не такое узнать можно. ;(
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 21, 2009, 20:37:07
юмористы да там про геном я писал строчку и то митохондрий

как кроманьонци били мамонта известно и оружие их развитое тоже и что жили они в тундростепи типа Сунгирь
вы великие знатоки генных технологий и охотничих приемов поясните мне дураку
как орудиями неандеров можно завалить мамонта
тут вопрос упирается в материальную часть которую вы явно не знаете
путаете технику Сунгирских мамонтобойцев кромов и их современников в Испании
явно мамонтятины не евших
да  на лазурном берегу и теплее было
климат же мог меняться за неск тысячелетий от субтропиков до лесостепи

и слейте ссылки на исследования меню неандера а то у вас Рома представления
100 летенй давности
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от декабря 21, 2009, 20:56:34
Feralis, касаемо орудий - у неандертальцев ведь, кажется были тяжелые неметательные копья с каменными наконечниками. т.е. как таковое составное оружие было, другой вопрос, что оно сильно отличалось от сапиентного.
По диете пусть ищут, кому не лень, мне влом файл цеплять в сеть и потом сюда прилеплять. Ели они преимущественно мясо крупных позвоночных. На одной стоянке в Бельгии зафиксирован белок пресноводной рыбы, и еще где-то - какие-то морепродукты. Но доминировало мясо травоядных, и даже определенно мясо мамонтов присутствовало. Практически напрочь нет растительных следов в диете, питание сопоставимо с питанием гиен и является более хищническим, чем у волков.
Насчет субтропиков Вы, наверное, погорячились. В Вюрме нестчастных выдавили объединенные усилия климата и сапиенсов с севера на крайний юг Европы, но даже там был всего лишь умеренный климат, а не субтропический. Впрочем, в арктических условиях неандертальцы явно не жили - культурных адаптаций не было, а биологические, при всей уникальности для Хомо, все же не достаточны оказались, наверное. Спать голым на снегу неандер мог бы, наверное, куда комфортнее сапиенса - при -5. Но не при -55.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Vladimirkox от декабря 21, 2009, 21:24:13
Цитироватьзнатоки ..... охотничих приемов поясните мне ....
как орудиями неандеров можно завалить мамонта
Пырнуть в брюхо, спрятаться в щели, дождаться перитонита у добычи ;) ...
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 21, 2009, 22:26:23
Nestor notabilis
вы конечно по неандеру более меня знаете
в климате нынешней абхазии неандеры думаю выжили б
читал я книги о индейцах и прочих  в т ч огнеземельцах
эти как раз только плащами и обходились и то лишь мужчины
правда на зиму они мигрировали к берегу океана обо там и зимой и летом температуры прохладно
стабильные
обезьяны с острова хокайдо тоже зимуют у термальных вод а кормятся тем чем их кормят ибо
скорее всего они тут живут благодаря японцам
так что насчет мягких зим  я и говарил о субтропиках
кстати когда олединение достигло апогея неандеры и вымерли
некуда было отступать-на юге море

а вот ваш тезис о тяжелых копьях с каменным наконечником оспорю
мне пришлось както читать работу о находке на одном колющем орудии из камня смолы которой возможно
неандеры крепили его к древку
деревянные копья были
дубины и орудия для руки тоже
но наличие топоров на древке и составных копий извольте доказать
я думаю находки этих орудий принадлежат кромам
т е приведите примеры находок железно доказаных как неандертальских

о диете
дробышевский упоминает еще австралопитеков со следами гипервитаминоза на костях
это от пережора  печени хищников
скорее это не охотники а падальщики способные отбить добычу у хищьников

нестор ну не могу представить охотника с таким инструментом
кстати огнеземельци дубинами били морских зверей а это хищьники и растительного ели почти ничего

Vladimirkox
мамонт не танк из окопа достанет
сейчас в ходу в африке стрелы для такой охоты
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nestor notabilis от декабря 22, 2009, 04:52:39
Насчет сомнения в способности к активной охоте - это Вы зря. Активно охотятся уже обезьяны, я думал, Вы это знаете. Сегодня охотятся. Падальщиком неандерталец быть не мог по очень простой причине - слишком большой. Биота не прокормит такого дармоеда, будь любезен добывать пищу сам. Либо жри траву. Траву он не жрал.

Доказательств не приведу , т.к. не читал специально посвященную вопросу неандертальских копий с каменными наконечниками статью, все только по слухам. Но если упомянуто, что у них была техника прикрепления наконечника к копью, причем сложная, неизвестная сегодня, к примеру (эту смолу из бересты очень трудно изготовить) в фильме о неандертальцах - у меня пока нет оснований этому не верить. Или вы имели в виду какие-то другие составные копья, типа гарпунов с отделяющимся острием и линем? Если такие - то, конечно, ничего подобного не найдено и вряд ли было. Такие штуки - признак верхнего палеолита, его и сапы освоили очень поздно.

Слонов убивают копьями, Фералис. А не стрелами. Копьями, пешком по земле. И слон ничего не может сделать. - Ему перерезают сухожилия задних ног. Это охота не простая, но выгодная и ею занимаются регулярно.

Почитайте выкладки Вана в теме о неандертальцах, там много интересного сказано. Здесь, в этой теме, - это все злостный флуд, за который я бы сам себя забанил навсегда. И вас тоже.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от декабря 22, 2009, 11:45:33
Цитироватьметательного составного оружия не знал как и неметательного
вроде всё правильно?

Насколько я помню,
у неандеров вроде были только полностью деревянные копья, острый деревянный конец которых просто обжигался для крепости

А наконечников вроде не было
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от декабря 22, 2009, 14:16:22
Цитата: Alexy от декабря 22, 2009, 11:45:33
А наконечников вроде не было
Были. Остроконечники - важная часть мустьерской культуры, причём если смотреть по следам износа, значительная их часть использовалась именно как наконечник копья. Кстати, на каком-то из неандертальском скелете есть и ранения от колющего оружия.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дж. Тайсаев от декабря 22, 2009, 14:27:29
Я где то читал, что неандерам был известен секрет приготовления сверхкрепкого клея, которым они как раз наконечники и приклеивали
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Vladimirkox от декабря 22, 2009, 19:55:00
ЦитироватьПочитайте выкладки Вана в теме о неандертальцах, там много интересного сказано. Здесь, в этой теме, - это все злостный флуд, за который я бы сам себя забанил навсегда. И вас тоже.
Так - то, оно - так. Но народ - обсуждает,  значит - актуально. Может модератор и перенесет часть постов в соответствующую тему  ::), а тогда и я своё сообщение подредактирую  ;).
Цитироватьмамонт не танк из окопа достанет
Если хватит длины хобота или ноги (ну... чтоб раздавить). Не подскажите ли глубину погребения неандертальцев?  У меня гипотеза: то что имело прикладное значение, в последствии могло использоваться с ритуальными целями.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 22, 2009, 21:03:16
нестор
тема эта дохлая никто в нее более по делу не пишет так что раз
спамеры вынудили тут выложиться про неандера то продолжим

на слонов в современной африке охотятся браконьеры если не пулями то стрелами но никак не копьями
я уже писал как готовят трупной яд
смазывают стрелы и стреляют издалека и не только в слонов
употребляют и духовые трубки с маленькими стрелками причем к лошадям крадутся одевшись
антилопой или павианом
яд вызывает заражение крови и за добычей наблюдают дня три

падальшик это не собиратель дохлых престарелых животных
гиена активно отнимает добычу у львов и леопардов
и я не отрицаю доказаной охоты неандера на козлов и др животных
думаю неандер мог в единоборстве дубиной или ножем положить медведя прикрывшись накидкой от когтей
в цирках византии народ смотрел  как голыми руками управляются с тигром
могу описать
но мамонт это круто

я не отрицаю что поздний неандер мог иметь приметивные копья с наконечником но
они не выдерживают сравнения с наконечниками кромов его современников
тут главная трудность-жесткое крепление
а наконечники неандеров удобны для кисти руки но никах не крепления к древку
с таким копьем против медведя идет самоубийца
даже в Сунгире кромы имели выпрямленые копья из бивней мамонта-цельные
дерево понятно сгнило но нет в могилах каменных наконечников
каменный наконечник явно появился после костяного\для копья\
именно на кости отработали кромы технологию крепления а потом перенесли на камень
а клей нужен чтоб тугое крепление из жил сцементировать
индейци кловис применяли наконечники вставляемые в расщеп древка и они отделялись легко
т е древко было многоразовым
оно падало в него вставляли новый камень с отчетливым местом крепления и метали продолжая погоню
за стадом

вы сами глянте на инструмент неандера и представте как его надежно закрепить
да и наконечник копья должен быть узким дабы пробить шкуру
где-то читал что кромы освоили составное оружие типа топор 40 000 лет назад



да книгу о жизни шимпанзе в Гомбе у меня есть и охота там описана на свиней и обезьянок

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от декабря 25, 2009, 12:11:00
Цитироватьв Сунгире кромы имели выпрямленые копья из бивней мамонта-цельные
А как и чем их выпрямля?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Роман Джиров от декабря 25, 2009, 14:10:01
Цитата: Alexy от декабря 25, 2009, 12:11:00
Цитироватьв Сунгире кромы имели выпрямленые копья из бивней мамонта-цельные
А как и чем их выпрямля?
Знаю, как гнуть коровий рог или кости: самый примитивный способ- греем в костре пару-тройку минут и гнем куда нужно, пока не остыло, или пресуем. Он пластичный где-то при 120 градусах. Если нужны костяные плоские тонкие пластины для поделок- берем рог, полую внутри часть, греем, и пока горячий разрезать острым ножом конус вдоль и развернуть и под пресс. Остывает- твердеет. Главная проблема- поживей все делать, руку набить, а то дольше греешь- горит, а чуть остынет- теряет пластичность, а так ничего особо сложного. Лучше, конечно, не на открытом огне греть, но в крайнем случае- и так сойдет.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 25, 2009, 19:08:12
редкая это была находка и для культур кромов а для неандера и вовсе неизвестная
слабо была развита у неандеров обработка кости
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от января 02, 2010, 09:36:48
http://www.springerlink.com/content/u862x6w2j773
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от января 02, 2010, 10:24:39
Спаибо. Очень интересное и познавательное название статьи.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от января 02, 2010, 13:43:46
Пожалуйста.
Статья в приложении.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от января 02, 2010, 14:11:35
Теперь - точно спасибо :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Павел Волков от января 02, 2010, 14:32:42
Не люблю самоцитироваться, но скидывал я на сайт свой книгу Я. Малины и Р. Малиновой "Природные катастрофы и пришельцы из космоса". И там есть заметка про выпрямление бивней мамонта и рогов оленей.

ЦитироватьВыпрямление бивней мамонта

С древнейших времен наряду с камнем наши предки использовали для изготовления орудий труда кости, рога, бивни мамонтов и слонов. При изготовлении простых орудий из кости они ограничивались скалыванием и шлифовкой, для получения более сложных предметов, а также украшений сырье сначала необходимо было размягчить, затем придать ему определенную форму и наконец вновь сделать твердым. Уже охотники раннего палеолита умели путем размягчения выравнивать бивни мамонта. Этот способ обработки кости был известен ремесленникам и более поздних эпох истории развития человечества, однако никаких письменных свидетельств до нас не дошло. Очевидно, секреты производства сохранялись в глубокой тайне. Соучек считает наличие такой технологии еще одним доказательством существования в далеком прошлом знаний очень высокого уровня, причем таких, которые нам приходится как бы вновь открывать для себя. Но на вопрос, откуда могли взяться такие знания, он отвечает: «К сожалению, мы не можем даже предположить, откуда они взялись»119.
Однако мы не только предполагаем, но и точно знаем откуда. О том, как сделать кость мягкой, стало известно в 1953 году, когда польский археолог Казимеж Журовский высказал свою идею, возникшую совершенно случайно. Все началось с любимейшего блюда Журовского — бифштекса по-татарски, который он всегда ел с горчицей. Однажды в блюдце с горчицей он забыл ложечку из слоновой кости, а когда через некоторое время вынул ее оттуда, она оказалась мягкой, как резиновая. Журовский понял, что причиной размягчения является кислота, содержащаяся в горчице. От коллег-археологов он узнал, что при раскопках они часто находят растения, содержащие щавелевую кислоту, а в одном из городищ обнаружили яму, полную заготовок из рогов оленей, которая явно походила на резервуар для их размягчения. Журовский сделал настой из листьев щавеля и погрузил в него кости, рога и кусок бивня слона. Спустя шесть недель их можно было резать, как дерево. Вынутые из раствора, они через четыре дня вновь затвердели120.
----------------------------------------------------------------------
119. Soucek L. Tuseni stinu, c.d., s. 33.
120. Zurowski K. Uwagi na temat obrobki rogu w okresie wczesnosredniowiecznym. «Przeglad Archeologiczny», 9, 1953, s. 395 — 402.

Жаль, что эта информация почему-то малоизвестна... А полезно было бы обратить внимание на признаки этой технологии при раскопках на стоянках древних людей на территории России. Ведь в захоронении в Сунгире как раз такие копья и нашли.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ван от января 02, 2010, 15:04:14
Павел Волков

Щавель без надобности. Достаточно вспомнить, что экскременты травоядных имеют кислую реакцию (а уж если в яму их свалить, то закиснут ещё сильнее через несколько дней). Так что бивни мамонтов проще всего было размягчать мамонтовским же навозом, благо недостатка в этом добре тогда не ощущалось.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от января 03, 2010, 19:46:53
Цитата: Gilgamesh от января 02, 2010, 14:11:35
Теперь - точно спасибо :)

Присоединяюсь. :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: S.N. от января 04, 2010, 03:05:30
Цитата: plantago от января 02, 2010, 13:43:46
Пожалуйста.
Статья в приложении.
А у меня почему-то распакованный файл не читается.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от января 08, 2010, 20:42:52
открытие удалось сделать польским палеонтологам в районе Свентокшистских гор в самом центре Польши. Там на массивном камне ими была обнаружена дорожка, протоптанная свыше 395 млн лет тому назад тетраподами, одними из первых живущих на суше позвоночных животных. Считается, что именно эти двухметровые, похожие на ящериц существа стали предками современных млекопитающих, земноводных и пресмыкающихся. На каменной тропке хорошо сохранились отдельные следы, показывающие, что тетраподы уже имели развитые лапы с выдающимися отдельными пальцами.

Находка в Свентокшистских горах стала сенсационной сразу по двум причинам. Во-первых, выяснилось, что тетраподы жили на 18 млн лет раньше, чем это до сих пор считалось в палеонтологической науке. Во-вторых, открытие польских ученых поставило крест на теории о том, что первыми вышедшими из океана на сушу существами были так называемые эльпистостегиды - наполовину рыбы, а наполовину сухопутные позвоночные.

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Nitrochemist от января 08, 2010, 20:52:47
Цитата: feralis от января 08, 2010, 20:42:52
открытие удалось сделать польским палеонтологам в районе Свентокшистских гор в самом центре Польши. Там на массивном камне ими была обнаружена дорожка, протоптанная свыше 395 млн лет тому назад тетраподами, одними из первых живущих на суше позвоночных животных. Считается, что именно эти двухметровые, похожие на ящериц существа стали предками современных млекопитающих, земноводных и пресмыкающихся. На каменной тропке хорошо сохранились отдельные следы, показывающие, что тетраподы уже имели развитые лапы с выдающимися отдельными пальцами.

Находка в Свентокшистских горах стала сенсационной сразу по двум причинам. Во-первых, выяснилось, что тетраподы жили на 18 млн лет раньше, чем это до сих пор считалось в палеонтологической науке. Во-вторых, открытие польских ученых поставило крест на теории о том, что первыми вышедшими из океана на сушу существами были так называемые эльпистостегиды - наполовину рыбы, а наполовину сухопутные позвоночные.
Мда. Однако хорошо навострились возраст пород определять. Немного рискованно на мой взгляд переносить эволюционные реперные точки.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: plantago от января 08, 2010, 21:00:25
А можно попросить здесь приводить ссылки на оригинальные публикации? Ведь тема именно так называется...
http://www.nature.com/nature/journal/v463/n7277/full/nature08623.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Комбинатор от января 13, 2010, 11:34:15
Может быть не совсем по теме, но и новую тему ради этого вроде открывать как то глупо. Не подскажет ли кто нибудь, можно ли как-нибудь на халяву ознакомиться со статьёй:
F. U. Battistuzzi and S. B. Hedges, "A Major Clade of Prokaryotes with Ancient Adaptations to Life on Land," Mol. Biol. Evol. 26 (2), 335–343 (2009).
?



Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от января 18, 2010, 19:49:19
сознаю свою вину
меру
тяжесть
глубину ;)

..................
первого января в журнале Science появилась статья, авторы которой установили причину рака, уничтожающего тасманийских дьяволов – самых крупных из обитающих на планете в настоящее время сумчатых хищников. До сих пор считалось, что заболевание, уничтожившее более 80 процентов этих животных, имеет вирусную природу. В новом исследовании показано, что дьяволы страдают от "нападения" самих раковых клеток. При укусе клетки передаются от больного животного к здоровому и начинают активно размножаться. Довольно быстро образующиеся на морде дьявола наросты лишают его возможности есть и пить (не говоря уже о размножении). По мнению ученых, изначально перерождение клеток произошло у единственного зверька, но очень быстро болезнь поразила всю популяцию
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: f_evgeny от января 19, 2010, 10:00:21
Цитата: feralis от января 18, 2010, 19:49:19При укусе клетки передаются от больного животного к здоровому и начинают активно размножаться. Довольно быстро образующиеся на морде дьявола наросты лишают его возможности есть и пить (не говоря уже о размножении). По мнению ученых, изначально перерождение клеток произошло у единственного зверька, но очень быстро болезнь поразила всю популяцию
Ничего себе, почти как в кино про вампиров.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Vladimirkox от января 19, 2010, 10:46:47
ЦитироватьПри укусе клетки передаются от больного животного к здоровому и начинают активно размножаться.
Это сообщение должно сильно озадачить трансплантологов,  :-[ по поводу отсутствия барьера по гистосовместимости.
Напомню, для успешного пассажа перевиваемой опухоли на крысах, число клеток неоплазмы должно превышать определенный минимум, чтобы вызвать супрессию иммуноцитов.

Может, не клетки, а вирус, типа - папиломы?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от января 19, 2010, 22:40:16
Да нет, именно раковые клетки. А совместимость у них очень высокая из-за малого размера популяции и большого количества близкородственных скрещиваний.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от января 20, 2010, 22:03:35
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature07728.html

Европейские ученые установили, что транскрипция в геноме с одного и того же промотора может идти в обоих направлениях.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: duben от января 24, 2010, 19:42:22
По поводу всплывавшей здесь темы о костяных орудиях неандертальцев:

http://www.nbuv.gov.ua/portal/Soc_Gum/kdu/2008_11/04.pdf

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от февраля 03, 2010, 21:26:48
 
Исследователи уточнили время вымирания последних популяций неандертальцев, живших на Иберийском полуострове. Согласно новым данным, опубликованным в журнале PLoS ONE, Homo neanderthalensis исчезли уже 37 тысяч лет назад. Краткое содержание работы исследователей приведено в пресс-релизе университета Бристоля.
Предположение, что на Иберийском полуострове популяции неандертальцев сохранялись намного дольше, чем в других частях мира, было выказано палеонтологом Жоао Зильяо (Joao Zilhao) около 20 лет назад. С тех пор эта гипотеза стала достаточно популярной, однако ученые расходились во мнении, когда именно исчезли последние представители вида H. neanderthalensis.

В новой работе Зильяо и коллеги провели более тщательную датировку возраста артефактов, обнаруженных в одной из португальских пещер. Анализ найденных предметов свидетельствует, что в ней обитали уже не неандертальцы, а люди. Из этого факта ученые заключили, что на момент, когда пещеры были заселены предками современных людей, H. neanderthalensis в окрестностях уже не было.

Полученные в новом исследовании результаты противоречат некоторым более ранним оценкам, согласно которым популяции неандертальцев могли сохраняться на Иберийском полуострове вплоть до временной отметки в 28 тысяч лет назад
http://www.plosone.org/article/info%3Adoi%2F10.1371%2Fjournal.pone.0008880#top
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от февраля 03, 2010, 23:56:30
Цитата: feralis от февраля 03, 2010, 21:26:48
В новой работе Зильяо и коллеги провели более тщательную датировку возраста артефактов, обнаруженных в одной из португальских пещер. Анализ найденных предметов свидетельствует, что в ней обитали уже не неандертальцы, а люди. Из этого факта ученые заключили, что на момент, когда пещеры были заселены предками современных людей, H. neanderthalensis в окрестностях уже не было.
Интересно, если неандертальцы не люди, то что означает буковка "Н." ?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Inry от февраля 08, 2010, 16:32:49
Цитата: feralis от января 18, 2010, 19:49:19
дьяволы страдают от "нападения" самих раковых клеток. При укусе клетки передаются от больного животного к здоровому и начинают активно размножаться.
То есть, фактически имеем новый вид - паразит. Отличается от прародителя по всем критериям. Грабли для таксономии: с одной стороны (анатомия, гистология) это - одноклеточное простейшее, как малярия. С другой (по происхождению) - сумчатое позвоночое. Деэволюция в дэйствии.
http://ru.wikipedia.org/wiki/Лицевая_опухоль_дьявола (http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9B%D0%B8%D1%86%D0%B5%D0%B2%D0%B0%D1%8F_%D0%BE%D0%BF%D1%83%D1%85%D0%BE%D0%BB%D1%8C_%D0%B4%D1%8C%D1%8F%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D0%B0)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от апреля 30, 2010, 20:59:49
Обнаружен горизонтальный перенос от грибов к тлям. Интересно, чем был перенос осуществлён - ретровирусом или каким-то другим механизмом?
http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/328/5978/624
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Валерий Чернухин от мая 11, 2010, 21:16:53
Цитата: Ярослав Смирнов от апреля 30, 2010, 20:59:49
Обнаружен горизонтальный перенос от грибов к тлям. Интересно, чем был перенос осуществлён - ретровирусом или каким-то другим механизмом?
http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/328/5978/624
Конкретно для этого случая не знаю, но вообще у эукариот вряд ли ретровирусам отведена ведущая роль в горизонтальном переносе генов.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: DNAoidea от мая 12, 2010, 01:22:54
Цитата: Inry от февраля 08, 2010, 16:32:49
То есть, фактически имеем новый вид - паразит. Отличается от прародителя по всем критериям. Грабли для таксономии: с одной стороны (анатомия, гистология) это - одноклеточное простейшее, как малярия. С другой (по происхождению) - сумчатое позвоночое. Деэволюция в дэйствии.
http://ru.wikipedia.org/wiki/Лицевая_опухоль_дьявола (http://ru.wikipedia.org/wiki/%D0%9B%D0%B8%D1%86%D0%B5%D0%B2%D0%B0%D1%8F_%D0%BE%D0%BF%D1%83%D1%85%D0%BE%D0%BB%D1%8C_%D0%B4%D1%8C%D1%8F%D0%B2%D0%BE%D0%BB%D0%B0)
да, интересная штука. И судя по внезапности явления, сходству симптомов, все эти опухоли имеют единое происхождение, а не возникали много раз независимо. В самом деле как бы новый паразитический вид - тем более, что и клетки опухоли не дифференцированные. Интереснее будет (хотя конечно такого не надо), если он на других животных тоже начнёт переходить... Но вообще - возврат к одноклеточности уже вроде как бы - так образовались если не ошибаюсь микроспоридии... и ещё один - к почти одноклеточности - это Мезозои, но наверняка в обоих случаях возврат был не такой резкий.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от мая 31, 2010, 19:21:25
Вышла из печати научно-популярная книга Александра Маркова "Рождение сложности". Ждем в магазинах.

http://macroevolution.livejournal.com/26084.html

(http://www.ozon.ru/multimedia/books_covers/1001665283.jpg)

UPD не заметил сразу в посте АВ интересную ссыль http://velobos.livejournal.com/242617.html там анонсы ещё нескольких книг. Нацеливаюсь на переслегинскую, книгу Шубина читаю на инглише.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: идрис от июня 03, 2010, 00:42:54
Вот нашел материал

http://www.inauka.ru/news/article101672.html

Там написано, что найдены место где человек питался морепродуктами порядка 2 млн лет назад и что это могло служить мощным точком в его эволюции. Единственный очаг древних людей (возраст ориентировочно 1 млн, как предполагает проф.Амирханов), который я видел в Аникабе тоже располагался на берегу небольшой древней реки. Так что может быть наши предки начали есть рыбу, а там много все полезного и процесс пошел . Кстати едят ли остальные обезьяны рыбу или так делает только человек.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Alexy от июня 03, 2010, 11:02:12
А Аникаб(а) это где?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Дятел от июня 03, 2010, 12:04:32
Цитата: идрис от июня 03, 2010, 00:42:54
Так что может быть наши предки начали есть рыбу, а там много все полезного и процесс пошел . Кстати едят ли остальные обезьяны рыбу или так делает только человек.
Некоторые едят, но процесс у них никак пойти не может. Наверно не знают, что "там много все полезного".
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: идрис от июня 03, 2010, 13:09:30
Это центральные нагорья Дагестана. Там в осевых зонах синклиналей залегают песчаники - ориентировочно караган. На них залегает толща грубообломочного галечника - ориентировочно апшерон-ранний плейстоцен. В этом галечнике найдено множество каменных орудий. Экспедиция там работает уже 4 года. Вторая экспедиция под руководством акад. Деревянко работает в районе реки Дарваг-чай. Там они вроде как нашли орудия по их мнению в верхах акчагыльских пород. Но меня терзают сомнения по поводу такой датировки. По поводу Айникаба у Амирханова даже один аспирант как раз по этому участку работает.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от июня 03, 2010, 22:09:31
DNAoidea

секвенирование многое проясняет
интересная статья в природе за 8 2009

D.melanogaster — один из
наиболее изученных в генетич
ском отношении видов — стала
столь знаменита, что зачастую
ее упоминают даже в биологиче
ской литературе просто по на
званию рода — «дрозофила» или
даже всего семейства — «плодо
вая мушка». Однако к роду Dro
sophila она была отнесена в свое
время по морфологическим
признакам, теперь же, когда
прочитаны геномы 12 видов
плодовых мушек выяс
нилось, что D.melanogaster сов
сем из другого рода — Sophop
hora. Тем не менее, чтобы не
вносить путаницу, ее решили по
ка не переименовывать.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от июня 06, 2010, 21:29:08
Ожидается выход альтернативного перевода "Расширенного фенотипа" Докинза
http://antongopko.livejournal.com/20134.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от июня 06, 2010, 22:14:36
П Р И Р О Д А • № 7 • 2 0 0 9 стр 68
На острове Сокотра масса каменных орудий Олдувайской культуры
интересно что после ее исчезновения никаких следов человека до 1 тыс до нашей эры
Но веть даже при регрессиях океана остров оставался островом о чем
говарит его уникальная эндемичная фауна
А чем питались люди тут тогда
охотится просто не накого
остается собирательство на берегу
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: идрис от июня 08, 2010, 11:26:04
Вот интересная статья
http://beta.novoteka.ru/?s=science#nnn15036603
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от июня 10, 2010, 08:35:16
http://www.ozon.ru/context/detail/id/5115625/

(http://www.ozon.ru/multimedia/books_covers/1001665283.jpg)

http://www.ozon.ru/context/detail/id/5173646/

(http://www.ozon.ru/multimedia/books_covers/1001728576.jpg)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от августа 03, 2010, 22:07:32
для буратино желающих узнать толкование своего ДНК

ДНК тесты врут

http://www.mygenome.ru/news/352/

Интернет-сервисы, предлагающие пользователям узнать тайны своих организмов и информацию о генетических заболеваниях с помощью тестов ДНК, частенько врут своим клиентам. К этому выводу пришли сотрудники Главного контрольного управления США (GAO), проанализировав работу таких сервисов.

Во время расследования у 4 проверяемых компаний заказали 10 тестов ДНК, предоставив исполнителям как реальные данные участвовавших в эксперименте людей, так и ложную информацию (к образцам прилагались лживые даты рождения, принадлежность к определенной расе и этносу и т.д.).

Многие результаты, предсказывавшие, в том числе, и предрасположенность к заболеваниям, оказались не соответствующими действительности (факт соответствия проверялся специалистами-генетиками). Кроме того, анализы ДНК одного и того же человека, проведенные в разных компаниях, давали разные результаты – иными словами, каждый специалист «пел» что-то свое.

Более того, в некоторых случаях результатом работы таких сервисов становился пугающий диагноз (высокая вероятность рака) и побуждение клиентов к дополнительным "консультациям специалистов" - то есть по сути жульнический маркетинг. Да и за сами ДНК-тесты стоят немаленьки денег, от 300 до 1000 долларов.

Информацию о проверенных компаниях передали в Управление контроля качества пищевых продуктов и лекарств, а также в Федеральную комиссию по торговле, сообщает The Register. Издание также отмечает, что под критику GAO попала и компания 23andMe, со-основателем которой является жена Сергея Брина, Анна Войжитски, а директором - Эстер Дайсон. В 2008 году журнал Time назвал эту компанию "главным открытием года". А в этом году им не везет. Буквально месяц назад компания тоже попалась на серьезном проколе - система «перепутала анализы».


Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от августа 07, 2010, 21:26:07
В последнем номере Нейче есть интересные статьи
Например о симбиозе водорослей и клеток саламандры
http://www.nature.com/news/2010/100804/full/466675a.html
но симбиозом таким особо не удивишь
а вот сообщение о находке кота-крокодила меня просто свалило
http://www.nature.com/nature/journal/v466/n7307/full/nature09061.html
Крокодил имеющий зубы зверозубых и жующий пищу
Да веть это отметает сам принцип определения клады по зубам.
Ситуация как с растениями складывается
Впрочем такое уже было когда нашли копытное хищьное

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 01, 2010, 20:35:07
Ученые объявили о завершении пилотного этапа проекта «1000 геномов». Цель проекта, начатого в 2008 году — описать изменчивость человеческой ДНК в разных популяциях. За пилотный этап ученые провели полное или частичное секвенирование геномов около 800 человек и описали множество новых генетических вариаций, а также количественно оценили, в какой степени мы генетически отличаемся друг от друга.

Пилотный этап включает три отдельных проекта. Первый: полностью секвенировали с малым (х2−х6) перекрытием (это означает меньшую точность данных) геном 179 человек. Из них 59 относятся к популяции йоруба в Нигерии, 60 жителей штата Юта европейского происхождения и 30 японцев. Второй: полностью секвенировали с высоким (х42) перекрытием (с высокой точностью) геном шести человек из двух семей (йоруба и потомков европейцев из Юты), каждая состоит из родителей и дочери. И третье: частично секвенировали геном 679 человек из семи популяций Африки, Европы и Азии. Для этого выбрали 8140 экзонов (кодирующих участка) из 906 генов.

Одна из главных целей биологии и медицины – понимание связи между генотипом и фенотипом
до сих пор отсутствует глубокое понимание вклада генетики в фенотип человека.
Семейный проект позволил оценить скорость возникновения новых мутаций в половых клетках – она равна примерно 10−8 на пару оснований на поколение.

Популяция африканев продемонстрировала наибольшее число вариаций (в том числе новых). У африканцев ученые нашли 63% и 44% новых SNP (в первом и третьем проектах), а среди европейцев – 33% и 22%. Это свидетельствует о большем генетическом разнообразии африканского населения.

каждый человек несет в среднем 50−100 мутаций, связанных с наследственными заболеваниями (они находятся в базе данных Gene Mutation Database (HGMD).
По словам авторов, их работа позволяет хотя бы начать разбираться в том, как формировался геном человека под влиянием естественного отбора. Оценив степень расхождения между популяциями, ученые пришли к заключению, что большинство локальных адаптаций (к местным условиям среды) возникало с изменением частоты уже существующих мутаций, а не с появлением новых
http://www.mygenome.ru/news/382/
http://www.sciencemag.org/cgi/content/summary/330/6004/574
http://www.nature.com/news/2010/101027/full/4671026a.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 01, 2010, 20:50:39
статья о заселении новой гвинеи 50000 лет назад
http://www.sciencemag.org/cgi/content/summary/330/6000/41

а тут http://www.sciencemag.org/cgi/content/abstract/330/6000/51
выяснилось высокая вероятность наличия землеподобных планет у звезд типа солнце


в ливии нашли примата возрастом 37 мильонов лет и он родом из азии как и все приматы африки
http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7319/abs/nature09425.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Cirill от ноября 02, 2010, 06:55:49
Цитата: feralis от ноября 01, 2010, 20:50:39
в ливии нашли примата возрастом 37 мильонов лет и он родом из азии как и все приматы африки

???
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: V.V.P от ноября 02, 2010, 11:50:35
Цитата: Gilgamesh от июня 06, 2010, 21:29:08
Ожидается выход альтернативного перевода "Расширенного фенотипа" Докинза
http://antongopko.livejournal.com/20134.html
А чем будет отличаться эта книга от вот этой:
http://ethology.ru/library/?id=234
?
:)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от ноября 02, 2010, 12:03:51
 ::) может альтернативный перевод будет отличаться альтернативным переводом?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: V.V.P от ноября 02, 2010, 12:28:35
Спасибо. Но если я правильно понимаю, на "Этология.Ру" содержится полностью эта книга, и можно при необходимости пользоваться оттуда. То есть, я имею в виду без сокращений. Верно?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от ноября 02, 2010, 21:00:53
Да. Просто человек решил перевести книгу ещё раз. Это ведь не возбраняется? Многие иностранные книги имеют несколько переводов, в этом нет ничего удивительного.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от ноября 04, 2010, 08:07:53
Новая книга из серии Элементы - "Мозг и душа: Как нервная деятельность формирует наш внутренний мир" (Making Up the Mind: How the Brain Creates Our Mental World by Chris Frith)

(http://ast.ru/images/docs/frit1.jpg)

Жизнерадостное резюме переводчика: "Человек — это не душонка, обремененная трупом, как считал Эпиктет. Это просто живой труп, а душонка — одно из его свойств."
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: mastax от ноября 04, 2010, 11:42:09
Незлин Л.П. Золотой век сравнительной морфологии: лазерная сканирующая микроскопия и нейрогенез трохофорных животных // Онтогенез. 2010. Т.  41. С. 370-380.

Применение методов иммунохимического маркирования нейрональных элементов и лазерной конфокальной микроскопии значительно расширило возможности сравнительной морфологии и позволило нам проследить нейрогенез различных трохофорных животных не уровне отдельных идентифицированных нейронов и их проекций. Оказалось, что многие из общепринятых представлений о нервной системе личинок и построенные на этой основе филогенетические теории не соответствуют действительности. Сравнительный анализ показывает, что ортогональный мозг у репрезентативных представителей группы Lophotrochozoa отсутствует на всех стадиях развития. У трохофор, принадлежащих к разным таксономическим группам внутри Lophotrochozoa, обнаружены принципиальные отличия в строении и развитии нервной системы, которые свидетельствуют о том, что личинки-трохофоры в этих группах не гомологичны, а сходство между ними обусловлено, вероятнее всего, конвергенцией. Наши результаты ставят под сомнение идею трохофоры как анцестральной формы, общей для трохофорных животных. Необходимо исключить из филогенетических дискуссий ортогон как базовый план строения нервной системы и трохофору как анцестральную форму, общую для Lophtrochozoa. 
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от ноября 04, 2010, 14:47:21
Только 40 ведущих учёных получат гранты Минобрнауки - конкурс продолжается
http://strf.ru/material.aspx?CatalogId=221&d_no=34654

Биология
Alexey S. Kondrashov

ФГОУ ВПО "Московский государственный университет имени М.В.Ломоносова"

http://strf.ru/material.aspx?CatalogId=222&d_no=34521
Горе от ума
Медицина уничтожила эволюцию: теперь выживает не наиболее приспособленный, а своевременно обратившийся к врачу.
Это приводит к тому, что количество вредных мутаций в генофонде возрастает с каждым поколением. Биолог Алексей Кондрашов успокаивает: от этой проблемы человечество, скорее всего, не вымрет, максимум – поглупеет.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от ноября 04, 2010, 14:48:19
Цитата: Gilgamesh от ноября 04, 2010, 08:07:53
Новая книга из серии Элементы - "Мозг и душа: Как нервная деятельность формирует наш внутренний мир" (Making Up the Mind: How the Brain Creates Our Mental World by Chris Frith)

(http://ast.ru/images/docs/frit1.jpg)

Жизнерадостное резюме переводчика: "Человек — это не душонка, обремененная трупом, как считал Эпиктет. Это просто живой труп, а душонка — одно из его свойств."

Хочу. Уже в продаже? :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от ноября 04, 2010, 18:02:21
переводчик пишет (по ссылке) - да
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от ноября 07, 2010, 00:46:39
Возможно, коллегам будет интересно.
Опубликовали мы обзорчик "Эволюция мозга человека: от австралопитеков к сапиенсам", подготовленный С. Дробышевским. http://antropogenez.ru/brain-evolution/
ЦитироватьПоказательны изменения объёма мозга в процессе эволюции гоминид. Стоит отметить два важных феномена: во-первых, скачок объёма мозга у "ранних Homo" по сравнению с австралопитеками, произошедший около 2,5 миллионов лет назад, с последующим резким ускорением прироста массы мозга (у разных групп австралопитеков за время от 7 до 1 миллиона лет назад размеры мозга почти не изменились); во-вторых, смена тенденции увеличения мозга на уменьшение, произошедшая в конце раннего верхнего палеолита...
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 07, 2010, 19:25:03
несравненно более сильное развитие зрительных полей в древности, что, вероятно, объясняется большей зависимостью от окружающей среды.
,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

то была цитата по ссылке

интересно а изучал ли кто зрение ныне живущих приматов в сравнении с человеком
если у древних людей зрительные доли более развиты то можно предполагать и большее количество колбочек-палочек в сетчатке глаза
веть у птиц именно такая зависимость

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от ноября 07, 2010, 21:07:34
Цитата: feralis от ноября 07, 2010, 19:25:03
несравненно более сильное развитие зрительных полей в древности, что, вероятно, объясняется большей зависимостью от окружающей среды.
,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

то была цитата по ссылке

интересно а изучал ли кто зрение ныне живущих приматов в сравнении с человеком
если у древних людей зрительные доли более развиты то можно предполагать и большее количество колбочек-палочек в сетчатке глаза
веть у птиц именно такая зависимость

Если интересно, могу переслать Ваш вопрос автору исследования.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 08, 2010, 19:34:28
да хочется услышать ответ из уст самого автора
тем более что глазници неандеров явно под глаза большего размера
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Irina73 от ноября 10, 2010, 13:48:01
Перевод на русский язык книги Richard Dawkins - The Greatest Show on Earth - The Evidence for Evolution (2009) / Ричард Докинз - Величайшее зрелище на Земле: доказательство эволюции идет здесь http://notabenoid.com/book/10903/
Желающие и имеющие возможность могут присоединиться (в том числе к редактированию).
С уважением ко всем.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от ноября 14, 2010, 14:50:42
Настоящий материал был напечатан в PSYCHOLOGIES.
На OZON.ru публикуется с любезного разрешения редакции PSYCHOLOGIES .
Александр Марков «Рождение сложности»
ноябрь 2010


За дверью каждого открытия нас ждет Бог, сказал венгерский физик, нобелевский лауреат Лео Сцилларт. Доктор биологических наук и замечательный популяризатор своей науки Александр Марков распахивает эту дверь для читателей. Его книга - попытка объяснить небиологу, чего достигла современная биология. Первое, в чем она по-прежнему уверена: эволюция существует. Второе, и это стало ясно недавно: эволюция происходит не внутри одного отдельно взятого вида, а внутри сложного симбиотического сообщества. И какая-нибудь листовая тля изменяется на протяжении тысячелетий не сама по себе, а одновременно с миллионом бактерий-симбионтов. А еще эволюция непредсказуема, но совершенно не случайна. Ее направление задает устройство химических веществ, но иногда какая-нибудь случайная мутация может вызвать целый каскад мутационных изменений, и в результате появляются совершенно новые формы жизни, которых никто не ждал. Но произошел ли человек от обезьяны? Об этом ученый пообещал рассказать в следующей книге.


Ждем следующую книгу! :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от ноября 14, 2010, 20:47:23
<стало ясно недавно: эволюция происходит не внутри одного отдельно взятого вида, а внутри сложного симбиотического сообщества. И какая-нибудь листовая тля изменяется на протяжении тысячелетий не сама по себе>
Я то думал что это еще Вернандскому было ясно с его размышлениями о биосфере
кстати рассуждения Маркова о отборе между кладами спорны и отдают сидромом гулда :-[

как я и писал ранее
палеонтологи образуют свою популяцию в науке как и генетики

< еще эволюция непредсказуема, но совершенно не случайна.>

вторая половина этой цитаты противоречит первой

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от ноября 19, 2010, 00:32:17
Цитата: feralis от ноября 08, 2010, 19:34:28
да хочется услышать ответ из уст самого автора
тем более что глазници неандеров явно под глаза большего размера

Подумалось- а есть ли зависимость между размером глазного яблока у разных современных людей и количеством палочек и колбочек в сетчатке. И вообще, насколько варьирует число палочек и колбочек у разных людей. Или люди достаточно однородны по этому признаку?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ромашишка1971 от ноября 19, 2010, 02:07:00
Цитата: Notch от ноября 19, 2010, 00:32:17
Цитата: feralis от ноября 08, 2010, 19:34:28
да хочется услышать ответ из уст самого автора
тем более что глазници неандеров явно под глаза большего размера

Подумалось- а есть ли зависимость между размером глазного яблока у разных современных людей и количеством палочек и колбочек в сетчатке. И вообще, насколько варьирует число палочек и колбочек у разных людей. Или люди достаточно однородны по этому признаку?
Я думаю, что данная сылка будет интересна: Биологи открыли новые отличия в глазах людей (http://www.membrana.ru/lenta/?5403)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от ноября 19, 2010, 10:03:05
Опубликована галерея эндокранов гоминид: http://antropogenez.ru/endocasts/
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от декабря 01, 2010, 17:15:45
Альтернативный перевод "Расширенного фенотипа" таки вышел

http://macroevolution.livejournal.com/41720.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: V.V.P от декабря 02, 2010, 10:59:28
Цитата: Gilgamesh от декабря 01, 2010, 17:15:45
Альтернативный перевод "Расширенного фенотипа" таки вышел
http://macroevolution.livejournal.com/41720.html
Таки, да. Вот, только, к сожалению, исключительно в Москве. Буду ждать, когда у нас появится (если дойдет). Куплю сразу же.

А, вообще, мне интересно вот что. Почему самые продаваемые книги, на которых издательствам можно заработать хорошие деньги, никто не хочет переиздавать? Где логика?! Что я, например, только не делал, чтобы найти Стивена Оппенгеймера "Изгнание из Эдема"! Всё впустую. Приходится теперь печатать с электронного варианта на собственном принтере.

Взять того же Докинза. Всего две книги изданы: "Бог как иллюзия" и "Расширенный фенотип". Но это же далеко не все, что он написал. Возьмите, переведите, издайте миллионными тиражами, и заработайте на продажах серьезные деньги! Не хотят. Странно всё это.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от декабря 02, 2010, 14:22:29
Опубликовали материал об эволюции пропорций человеческого тела: http://antropogenez.ru/proportions/
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Gilgamesh от декабря 02, 2010, 17:47:33
ЦитироватьБуду ждать, когда у нас появится (если дойдет). Куплю сразу же.

Для этого есть Озон и т.п.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Молодой от декабря 06, 2010, 12:47:54
Расследование: остановилась ли эволюция человека?
http://rnd.cnews.ru/reviews/index_science.shtml?2010/11/08/415086_1
Очень интересная на мой взгляд статья.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 07, 2010, 22:06:01
Да это отличная статья
я скопирую текст стaтьи тут веть даже на нашем форуме многие сомневаются в современной эволюции человека
................................
Остановилась ли эволюция человека? Многие ответят на этот вопрос положительно. Действительно, если эволюция - это естественный отбор, "выживание сильнейших", то как может эволюционировать человек, подчинивший себе природу, с помощью сельского хозяйства способный прокормить себя и все свое потомство, а при нынешних достижениях медицины - обеспечивающий выживание тех, кто раньше не смог бы дотянуть до репродуктивного возраста?

Даже если забыть этот довод и сбросить со счетов влияние цивилизации, возникшей в последние 10 тыс. лет - палеоантропологические исследования показывают, что уже 50-100 тыс. лет назад наши предки анатомически не отличались от нас самих, в том числе и в таком важном аспекте, как объем мозга. Это позволяет предположить, что человечество достигло "эволюционного плато" - состояния, при котором отбор несет стабилизирующую функцию, лишь отсеивая особенно неудачные отклонения от найденного оптимума.

Однако эта позиция достаточно уязвима. Незаметность эволюции не говорит о том, что она не происходит вообще - это медленный процесс, отслеживать который в человеческой популяции в реальном времени почти невозможно. К тому же предположение об остановке эволюции человека приводит к выводам, которые противоречат современным исследованиям человеческого генома.

В простейшем определении, эволюция - это процесс изменения частот аллелей в популяции с течением времени. Большая часть эволюционных изменений сводится к замещению одних аллелей другими под давлением естественного отбора. Для того чтобы ответить на вопрос, идет ли эволюция человека, достаточно найти признаки изменения частот аллелей в геноме. Одним из надежных признаков таких изменений является любопытное явление, когда новый аллель закрепляется в популяции настолько быстро, что вместе с ним закрепляются и те аллели, которые близко расположены на хромосоме и поэтому часто наследуются вместе с ним. В результате в геноме образуется участок с очень низкой вариативностью - одинаковый почти у всех особей в популяции. Генетики обнаружили около 100 таких участков в геноме современного человека. Что интересно, в геноме афроамериканцев обнаружено только 9 из них, что хорошо согласуется с теорией африканского происхождения homo sapiens: у африканских популяций было более 100 тыс. лет для выработки адаптаций к местным условиям жизни, а все остальные попадали в новые среды обитания, к которым было нужно интенсивно приспосабливаться.

Аллели - разные варианты одного и того же гена, расположенные в одинаковых участках гомологичных (парных) хромосом и определяющие альтернативные варианты развития одного и того же признака. В геноме конкретного человека обычно содержатся два аллеля. Если оба аллеля в геноме одинаковы, то геном называется гомозиготным, а если аллели разные - гетерозиготным по данному признаку. Каждая половая клетка содержит один аллель, и при слиянии половых клеток новый организм наследует по одному аллелю от каждого родителя. Мутация изменяет структуру исходного аллеля, т. е. приводит к появлению нового варианта признака. Существование в популяции организмов нескольких аллелей одного гена обеспечивает ее генетическое разнообразие и имеет важное адаптивное значение.

Исследования последних лет нашли несколько ярких примеров эволюции современного человека.

Высотная болезнь

Так, например, народы, переселившиеся в высокогорные районы планеты, столкнулись с проблемой недостатка кислорода. Кислородное голодание - опасное состояние, которое приводит к головокружению, утомлению, бессоннице, а в тяжелых случаях - к отеку легких и смерти. Акклиматизация лишь частично помогает избавиться от симптомов.


В Тибете дети с "гемоглобино-насыщенным" генотипом выживают более чем в два раза чаще "обычных".

Недавние исследования обнаружили возможную генетическую адаптацию к условиям кислородной недостаточности у коренного населения Тибета, живущего на высоте 4 тыс. метров над уровнем моря. В одном из таких исследований было обнаружено, что у части тибетцев насыщение крови кислородом на 10% выше нормального. Эта особенность оказалась наследуемой так, что можно предположить ее зависимость от всего одного гена.

Как выяснилось, частота зачатий и успешных родов не зависят от генотипа матери по данному признаку, зато от него зависит детская смертность. В среднем на каждую семью приходится 0,48 смертей для матерей с "гемоглобино-насыщенным" генотипом и 2,53 матерей с "обычным". Число выживающих детей варьируется от 3,79 в среднем у "гемоглобино-насыщенного" генотипа до 1,64 у обычного. Следовательно, у населения Тибета прямо сейчас происходит быстрое замещение аллелей - эволюция в действии.

Малярия

Малярия - болезнь, вызываемая внутриклеточными паразитами рода Plasmodium, которые в одном из периодов своего жизненного цикла проникают внутрь красных кровяных телец, где быстро размножаются, разрушая клетку-хозяина и выделяя в кровь токсичные отходы жизнедеятельности. Симптомы малярии включают в себя жар, тошноту, обезвоживание, анемию, в тяжелых случаях отказ внутренних органов, впадение в кому и смерть. Несмотря на успехи медицины и ведущиеся мероприятия по борьбе с малярией, в наше время ареал распространения болезни оценивается в 27% суши, а число случаев заболевания - до 500 млн в год.


Так как красные кровяные тельца - основное место обитания и размножения паразита, можно ожидать, что отбор будет поощрять адаптации, изменяющие структуру и функции именно этих клеток. Действительно, известно несколько аллелей, обеспечивающих защиту от малярии, среди них аллель серповидно-клеточной анемии (гемоглобина S), альфа- и бета-талассемии, гемоглобина C и гемоглобина E. Здесь видны признаки сильнейшего давления отбора. Во-первых, обилие аллелей говорит о том, что отбор поддерживает почти любую форму адаптации к болезни. Во-вторых, давление настолько сильно, что несмотря на то, что почти все эти адаптации весьма дорого обходятся своим носителям, они все равно поддерживаются отбором.

Лучше всего изучено влияние аллеля серповидно-клеточной анемии. Серповидно-клеточная анемия - тяжелое врожденное заболевание, которым страдают носители гомозиготного набора аллеля, кодирующего производство гемоглобина S - особой дефектной формы гемоглобина, которая имеет свойство "слипаться", деформируя эритроцит (отсюда название болезни) и нарушая его функцию. Несмотря на очевидную вредность мутации, аллель гемоглобина S широко распространен в популяциях, где высока заболеваемость малярией. В чем же причина? В том, что гетерозиготы - носители одного аллеля гемоглобина-S и одного аллеля гемоглобина-A - не страдают от анемии и в то же время обладают высокой (>90%) резистентностью к малярии. Получается, что в подверженных малярии регионах гомозиготы AA страдают от малярии, гомозиготы SS - от анемии, а отбор поддерживает гетерозиготов. Такая ситуация называется гетерозисом.

Почти все остальные адаптации, дающие устойчивость к малярии, очень похожи: это мутации, которые были бы безусловно вредны и отсеяны естественным отбором, если бы не длительный контакт человека с малярией. Счастливым исключением можно назвать мутацию, которая вызывает отсутствие на поверхности эритроцитов особых белков - антигенов группы Даффи. Эти белки используются одним из возбудителей малярии - P. vivax - для закрепления на клеточной мембране перед вторжением в эритроцит. Почти все выходцы из Африки являются "Даффи-отрицательными" и хорошо защищены от этой формы малярии при том, что наличие этой мутации не приводит к анемии.

Непереносимость лактозы

Лактоза - углевод, который в природе встречается только в молоке млекопитающих. Лактозу человек усваивает с помощью особого фермента - лактазы, который в больших количествах вырабатывается в первый год жизни, после чего его синтез идет на спад. У большинства взрослого населения Земли лактаза не синтезируется и нет возможности усваивать лактозу в значительных количествах; пределом считается 11 гр лактозы (эквивалент примерно 200 мл молока) в сутки при условии принятия небольшими дозами вместе с едой.

Это может показаться удивительным для европейца, но у большинства представителей многих народов: американских индейцев, австралийских аборигенов, обитателей южной Африки и юго-восточной Азии - употребление цельного молока вызывает расстройства пищеварительной системы: вздутие живота, колики, диарею, тошноту и рвоту. Да и среди европейцев процент людей с лактазной недостаточностью довольно высок (10-15%). Однако процесс брожения, используемый при получении кисломолочных продуктов, расщепляет лактозу, поэтому все эти люди могут употреблять кисломолочные продукты.

Способность усваивать лактозу в зрелом возрасте возникла у человека дважды - в Европе и северной Африке. На независимое возникновение указывает то, что мутации произошли в разных частях генома, хотя проявляются они одинаково (в биологии это явление называется полиморфизмом). То, что две разные мутации независимо возникли и распространились в разных регионах - надежный признак действовавшего на человека сильного давления отбора. Дважды независимо возникшая способность к усвоению лактозы - лучший известный нам пример конвергентной эволюции современного человека.

СПИД

Пандемия СПИДа, начавшаяся в 80-х года прошлого века, стала одним из ключевых демографических факторов современности. Почти 40 млн человек заражены неизлечимой болезнью, летальность которой близка к 100%. Эпидемия СПИДа в южноафриканском регионе, где процент заражения взрослого населения приближается к 25%, привела к падению средней продолжительности жизни почти на 10 лет.



Как было показано на примере малярии, с эволюционной точки зрения пандемию можно рассматривать как фактор отбора, который должен поощрять мутации, обеспечивающие защиту от болезни. Обычно защита достигается изменением структуры белков, играющих важную роль в процессе заражения клетки.

Такие мутации существуют. Для присоединения к T-лимфоцитам вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) использует особые белки на поверхности клетки: так называемые С-С рецепторы хемокина CCR5 и CXCR4. Наиболее изучена мутация CCR5-Δ32, приводящая к отсутствию рецепторов CCR5 на мембране T-лимфоцитов. Гомозиготные носители мутации имеют полный иммунитет к ВИЧ, в то время как гетерозиготные получают только немного (на 2-3 года) замедленное развитие болезни. Эта мутация встречается в основном у населения Северной Европы и очевидно не связана с эпидемией СПИДа. Возможно, ее распространение связано с болезнью, возбудители которой использовали похожие механизмы для заражения клеток. К несчастью, в южноафриканской популяции крайне редки мутации, отключающие рецепторы CCR5 и CXCR4. Это, возможно, вносит свой вклад в развитие пандемии в регионе.

Обычно отключение действующего гена, такое как при мутации CCR5-Δ32, оказывается вредным и исчезает под давлением отбора. Но, как показывает пример развития резистентности к малярии и СПИДу, в условиях контакта с инфекцией, использующей кодируемый геном белок в своих целях, отключение гена может быть преимуществом.

Таким образом, возникновение цивилизации не только не оградило человечество от естественного отбора, но и само стало фактором отбора. Освоение новых территорий потребовало приспособления к новым условиям жизни, переход к сельскому хозяйству вызвал изменение питания и поощрил изменение пищеварительной системы, увеличившаяся плотность населения подвергла человека большему риску заражения инфекционными болезнями. Все это дает возможность говорить о том, что, хотя рассмотренные примеры и не позволяют говорить о тех изменениях, которые обычно подразумеваются под "эволюцией человека": росте объема мозга, изменении черт лица, переходе к прямохождению, возникновении речи - эволюция человека не остановилась, но может быть даже ускорилась в последние 5-10 тысяч лет.

Егоров Олег / CNews
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от декабря 07, 2010, 23:14:18
Опубликовали интервью с Александром Марковым: http://antropogenez.ru/interview/186/
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 22, 2010, 21:58:27
 
Биологи восстановили последовательность ДНК гипотетического предка всех живых организмов и проследили эволюционную историю основных семейств генов. Статья ученых опубликована в журнале Nature
в новом исследовании ученые составили математическую модель наследования генов и их изменений во времени, включающую вертикальное наследование, горизонтальную передачу (то есть передачу генов организму, не являющемуся прямым потомком), удвоение генов и их потерю. В результате авторы смогли определить, когда появилось множество генов, характерных для современных обитателей планеты. Оказалось, что около 27 процентов из них образовались в период от 3,3 до 2,8 миллиарда лет назад - примерно одновременно с так называемой кислородной катастрофой, убившей большую часть тогдашних жителей Земли.

Исследование этих генов показало, что большая часть этих генов отвечает за транспорт электронов через мембраны. Этот механизм необходим для дыхания - то есть процесса получения энергии с участием кислорода. Кроме того, электронный транспорт задействован в процессе фотосинтеза.
http://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/abs/nature09649.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 22, 2010, 22:04:46
 
В Испании обнаружены останки семейства неандертальцев из 12 человек, которые были съедены другими представителями этого вида. Статья с описанием находки опубликована в журнале Proceedings of the National Academy of Sciences, а коротко о ней пишет BBC News.
Ученые работали в пещере в испанской провинции Астурия, где им удалось обнаружить кости шестерых взрослых неандертальцев, трех подростков, двух детей младшего возраста и одного младенца. На всех найденных костях присутствуют следы от использования орудий, при помощи которых каннибалы, в частности, доставали костный мозг. Исследователи полагают, что все семейство Homo neanderthalensis было убито и съедено их сородичами.

Анализ митохондриальной ДНК (ДНК, которая содержится в клеточных органеллах под названием митохондрии и передается по наследству от матери к дочери) позволил выяснить, что все взрослые мужчины-неандертальцы являются родственниками по материнской линии, а все женщины генетически не состоят в родстве друг с другом или с мужчинами. Этот факт подтверждает гипотезу о том, что H. neanderthalensis выбирали для спаривания представительниц других групп неандертальцев, в то время как сами они после взросления оставались в той же группе, где родились.

http://www.pnas.org/content/early/2010/12/14/1011553108.abstract
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 22, 2010, 22:09:35
Внешний вид живущих в Африке слонов довольно заметно отличается в зависимости от того, где именно обитают животные. Хоботные, которые населяют леса, имеют более длинные и прямые бивни по сравнению со слонами из саванн. Кроме того, у слонов из лесов округлые уши, не имеющие заострения в нижней части, характерного для обитателей саванн. Наконец, лесные слоны в среднем на один метр ниже и весят в полтора раза больше
Авторы новой работы сравнивали между собой большие фрагменты ядерной ДНК не только двух спорных групп слонов, но также родственных им азиатских слонов и вымерших хоботных (при этом ядерная ДНК мастодонта была получена впервые). В итоге ученым удалось установить эволюционные взаимосвязи между всеми изученными животными, и получить большое количество генетических данных, которые подтверждали вывод о том, что L. africana africana и L. africana cyclotis - это два разных вида, разделившиеся в промежуток между 6,7 миллиона лет назад и 1,9 миллиона лет назад.

http://news.sciencemag.org/sciencenow/2010/12/researchers-split-african-elepha.html?ref=hp
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 23, 2010, 19:59:12
Ученые расшифровали ДНК нового вида людей

Ученые прояснили место человека из Денисовой пещеры - нового вида людей, останки которого были найдены в 2008 году, в эволюции рода Homo. Выводы исследователей опубликованы в журнале Nature, а коротко работа описана на портале ScienceNOW.
Фрагмент фаланги мизинца нового вида был найден в 2008 году при раскопках в Денисовой пещере в Алтайском крае. Изначально ученые решили, что перед ними осколок кости неандертальца. Группа исследователей из института эволюционной антропологии в Лейпциге под руководством Сванте Паабо (именно в его лаборатории был расшифрован геном неандертальца) попросила переслать им найденную кость.

Ученые выделили из нее митохондриальную ДНК (относительно короткий фрагмент ДНК, который содержится в клеточных органеллах митохондриях и передается от матери к дочери) и сравнили ее с митохондриальной ДНК современных людей и неандертальцев. Анализ показал, что человек из Денисовой пещеры не принадлежит ни к одному из этих видов.

В своей новой работе Паабо и коллеги провели анализ геномной ДНК нового вида людей - им удалось расшифровать ее последовательность с достаточно высокой степенью надежности. Сравнение ДНК с геномами нескольких популяций людей и неандертальскими геномами позволило ученым уточнить место человека из Денисовой пещеры на эволюционном древе людей. По мнению авторов новой работы, представители изучаемого вида отделились от ветви, ведущей к неандертальцам, около 640 тысяч лет назад.

Они дважды скрещивались с Homo sapiens - один раз сразу после выхода из Африки, но до расселения по Европе, и второй раз - когда родственники человека из Денисовой пещеры, проживавшие в восточной Азии, встретили современных людей, направлявшихся из Африки в Меланезию и Папуа Новую Гвинею. Анализ ДНК меланезийцев показал, что они несут от 4 до 6 процентов генов нового вида людей.
http://www.nature.com/nature/journal/v468/n7327/full/nature09710.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Ярослав Смирнов от декабря 24, 2010, 12:35:14
Прочтён ядерный геном (точнее, его часть) человека из Денисовой пещеры.
http://elementy.ru/news?newsid=431483
В принципе, в очередной раз подтвердили очевидные вещи - митохондриальная ДНК в принципе не показывает скрещивания.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: crdigger от декабря 24, 2010, 19:56:40
http://www.ynet.co.il/articles/0,7340,L-4003991,00.html
Только иврит.В пещере Кесем (Kessem cave) около Рош а Айна нашли сапиенса возрастом 400000 лет :).
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 25, 2010, 21:09:17
 
Исследователи обнаружили останки самых древних наземных растений - возраст спор печеночника, найденных в Аргентине, составляет 472 миллиона лет. Работа ученых появилась в журнале New Phytologist, коротко о ней пишет портал BBC News.
Авторы исследования собирали образцы древней породы в Андах на северо-западе Аргентины и в лаборатории обрабатывали их растворами кислот. Таким способом ученые смогли обнаружить окаменевшие споры печеночников - примитивных наземных растений, которые, как считается, первыми колонизировали сушу.

Возраст породы, в которой были обнаружены споры, составляет от 473 до 471 миллиона лет. Анализ показал, что споры принадлежат растениям как минимум из пяти родов - это означает, что первые печеночники вышли на сушу раньше, чем 473 миллиона лет назад, и к этому времени успели дать несколько эволюционных ветвей потомков. Исследователи не исключают, что растения вышли на сушу в начале ордовикского периода или даже в конце кембрийского.
http://news.bbc.co.uk/earth/hi/earth_news/newsid_9079000/9079963.stm
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 26, 2010, 19:32:52
Природа журнал за июнь 2007г

в статье рассказывается о 40 летних экспериментах по моделированию одомашнивания

Лисы на звероферме вполне дикого нрава веть отбор ведется по ценности шкуры
Но предположили что древний человек взял за критерий дружелюбность зверей

для селекции каждый год отбирали 10% самок и неск % самцов
и получили вполне дружелюбных зверьков уже на 6 поколение
а на 40 поколение были вполне домашние лисы как собаки
И с собаками их роднит многое
например вислоухость и завитые хвосты
даже потеря сезонности в течке и любопытство уже не ограниченное щенячим возрастом

Очевидно аллели генов отвечающие за агрессивность как водится влияли на работу многих генов
внешний вид зверьков изменился в тч форма черепа приобретя признаки отличающие собак от волков
это и укорочение черепа(тут приходит мысль о укорочении челюстей у человека в ходе его эволюции
может эволюция человека тоже в некоем смысле одомашнивание)

изменилиь и звуковые сигналы лис(тут напрашивается аналогия с рождением человеческого языка))
кстати у собак появился лай и на всю жизнь сохранилось щенячье поскуливание


В древности пытались одомашнить лису для борьбы с грызунами но тут она была вытеснена хорьками а потом и кошкой



Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 26, 2010, 21:10:08
http://www.livescience.com/animals/shelter-cavemen-competition-cave-bear-extinction-100827.html

Сравнив 59 последовательностей митохондриальной ДНК U. spelaeus с 40 образцами ДНК, полученной из митохондрий современных и ископаемых бурых медведей U. arctos, ученые пришли к выводу, что численность первых начала сокращаться уже около 50 тысяч лет назад, а уже 24 тысячи лет назад эти животные окончательно вымерли. Эти данные противоречат гипотезе о том, что пещерные медведи исчезли из-за изменения климата.

Выходит что лишь появление в Европе кроманьонцев вытеснило пещерных медведей а вот совместная жизнь
с неандертальцем к вымиранию медведей не вела
Может неандер был плохим охотником и не рисковал помериться силой с пещерным медведем
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 28, 2010, 20:21:40
Сванте Паабо дал интервью

Лента.ру: Сколько времени занимает выделение ДНК из ископаемых образцов?

Сванте Паабо: На собственно выделение ДНК и ее обработку перед расшифровкой (со временем ДНК деградирует, и для того, чтобы снизить вероятность ошибок при расшифровке, возникающих из-за деградации, ученые обрабатывают ДНК особыми ферментами – прим. "Ленты.Ру") уходит всего около десяти дней. На расшифровку нужно несколько недель, и точный срок зависит от того, насколько большие последовательности вы секвенируете (синоним определения последовательности ДНК - прим. "Ленты.Ру"). Основная часть времени уходит на анализ полученных данных, особенно в случае работы с геномной ДНК. На то, чтобы сравнить короткие фрагменты, скажем, ДНК неандертальца с ДНК шимпанзе и ДНК представителей множества современных популяций людей, уходят долгие месяцы.

Каково обычно в образцах соотношение ДНК древних людей к микробной ДНК и ДНК исследователей, которая, очевидно, попадает на образцы при работе с ними?

Типичным является, когда древней ДНК в образце содержится не больше нескольких процентов. Все остальное - это ДНК бактерий. Но в случае кости из Денисовой пещеры содержание искомой ДНК составляло около 60 процентов. Это совершенно уникальный случай.

Что касается загрязнений нуклеиновыми кислотами исследователей, то оно обычно не превышает одного процента от количества ДНК древнего человека. Соответственно, от общего количества ДНК в образце это составляет сотые доли процента.

Как вы выбираете кости для анализа? Существуют ли какие-то признаки, по которым вы угадываете, насколько хорошо сохранилась ДНК в образце?

Мы пытаемся выделять ДНК из всех костей, которые выглядят хорошо сохранившимися и которые не были найдены в почве с высокой степенью кислотности - кислота разрушает ДНК. На самом деле, совершенно непонятно, почему одни кости сохраняются лучше других - иногда сохранность образцов бывает очень разной, даже если они были найдены в одной пещере. Например, ДНК, выделенная из кости мизинца человека из Денисовой пещеры оказалась в куда более лучшем состоянии, чем ДНК, которую мы выделили из найденного там же зуба.

Наверняка бывает такое, что вам не удается выделить ДНК из исследуемых образцов. Каково примерно соотношение удачных попыток к неудачным?

Обычно удачной оказывается одна попытка из десяти, да и то в случае, если исследуемые кости были найдены в местах с более или менее удовлетворительными условиями "хранения".

Вы планируете выделять ДНК из останков других представителей рода Homo кроме неандертальцев и "денисовцев"?

Если у нас появится доступ к таким останкам, то мы, без сомнения, попытаемся это сделать.

Вы изучали, какие именно гены у человека разумного, неандертальца и "денисовца" общие? Какие белки они кодируют? И планируете ли вы более детально исследовать этот вопрос?

Да, мы проверили несколько интересующих нас генов, в частности, так называемый "речевой ген" FOXP2, который задействован в процессах формирования речи и языка. Оказалось, что у современных людей, неандертальцев и "денисовцев" в последовательности этого гена встречаются одинаковые изменения. Считается, что эти изменения отвечают за некоторые характерные особенности нашей речи. В ближайшем будущем мы намерены получить более надежный вариант расшифровки ДНК "денисовца" и исследовать этот момент более пристально.

Возможно ли по генетическим данным определить, какого пола были неандертальцы и "денисовцы", скрещивавшиеся с представителями H. sapiens? В одной из ваших предыдущих работ вы исследовали митохондриальную ДНК неандертальца (ДНК, которая находится не в ядре, а в клеточных органеллах - митохондриях и передается только от матери к дочери) и на основании полученных данных заключили, что два вида не смешивались. Означает ли это, что все предки изученного неандертальца по женской линии тоже были неандертальцами, а не H. sapiens? И можно ли из этого заключить, что межвидовые контакты двух видов происходили по схеме: женщина-человек и мужчина-неандерталец?

Это возможный вариант, но лично я полагаю, что в межвидовых контактах принимали участие мужчины и женщины с обеих сторон. Дело в том, что на X-хромосоме (женской половой хромосоме – в геноме мужчин она присутствует в одной копии, а в геноме женщин - в двух) мы находим столько же признаков скрещивания двух видов, сколько и на остальных хромосомах. Митохондриальная ДНК может не нести никаких признаков межвидового скрещивания просто потому, что она представляет собой единичный маленький фрагмент генома, на котором просто случайно не оказалось следов "влияния" неандертальцев и "денисовцев" (средняя доля генов H. neanderthalensis в ДНК современных людей составляет около 2,5 процента, а "денисовцев" - 4,6 процента).

Каковы генетические отличия H. sapiens и H. neanderthalensis? Вы изучали, какие гены есть у неандертальцев, но отсутствуют у современных людей, и наоборот?

Нет, мы не изучали этого, потому что надежность расшифровки гена неандертальца пока недостаточна для проведения подобных исследований. Вот после того, как мы улучшим имеющиеся последовательности, мы начнем задавать такие вопросы. Но, в любом случае, здесь речь не идет об отсутствии каких-то генов - разница между двумя видами заключается в небольших изменениях, которые влияют на работу генов. По крайней мере, это верно для большинства генов.

Вы не могли бы прокомментировать значение термина "вид" применительно к представителям рода Homo? Согласно определению, представители различных видов не могут оставлять плодовитое потомство, но в случае с изученными "разновидностями" людей это, очевидно, не так.

Лично я считаю, что термин "вид" вообще не имеет смысла, потому что достаточно четкого его определения не существует. В наших статьях мы никогда не употребляем его. И по этой же причине мы не стали давать "денисовцу" латинского названия, которое само по себе принуждает указать, является ли он отдельным видом или нет (в латинских названиях видов первое слово указывает на род организма, а второе - на его вид - прим. "Ленты.Ру").

По вашему мнению, каковы были отношения между различными разновидностями рода Homo? Они действительно могли различать, что тот или иной индивид является представителем другого вида, ой, то есть просто "иным"?

Я не знаю, как они определяли, кто есть кто - в наших работах мы только показали, что у людей, неандертальцев и "денисовцев" общее происхождение и что они скрещивались друг с другом. На вопросы о том, как все эти разновидности людей взаимодействовали между собой, вам лучше ответит археолог или палеонтолог.

Какие исследования вы планируете провести в будущем?

Мы намерены довести качество расшифровки геномов неандертальцев и "денисовцев" до уровня генома шимпанзе. Кроме того, мы думаем изучить, где еще на территории Азии проживали родственники человека из Денисовой пещеры.

Какую реакцию ваши исследования вызвали у научного сообщества и далеких от науки людей? Была ли она ожидаемой или удивила вас?

После того, как мы опубликовали последовательность неандертальского генома, нам стало поступать огромное количество писем, в которых люди писали, что они являются неандертальцами, и предлагали сдать свою кровь для исследований. Практически всегда неандертальцами себя ощущали мужчины. Женщины же писали, что неандертальцами являются их мужья.

Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от декабря 28, 2010, 23:04:14
 
Исследователи уточнили возраст "митохондриальной Евы" - женщины, которая была ближайшим предком всех людей вида Homo sapiens. Согласно новым данным, учитывающим последние достижения в области популяционной генетики, Ева жила около 200 тысяч лет назад. Ранее возраст гипотетической женщины оценивали в 140 тысяч лет. Работа ученых опубликована в журнале Theoretical Population Biology
http://www.sciencedaily.com/releases/2010/08/100817122405.htm
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: crdigger от декабря 29, 2010, 01:16:27
А как вообще сохраняется оригинальная ДНК вместе с бактериями миллионы лет,они ДНК не едят?
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Vuto от декабря 30, 2010, 17:05:31
Цитата: crdigger от декабря 29, 2010, 01:16:27А как вообще сохраняется оригинальная ДНК вместе с бактериями миллионы лет,они ДНК не едят?
Как правило ДНК не сохраняется. Иногда находят обломки ДНК, но как правило они бактериального содержания, даже если окаменели яйца динозавров.
А сохраняются ДНК элементарно - изоляцией, собственно, как и ископаемые останки. Мумии и т.д.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от января 05, 2011, 12:18:26
Рождение сложности
А Марков

http://mirknig.com/engine/go.php?url=aHR0cDovL2RlcG9zaXRmaWxlcy5jb20vZmlsZXMvNm1vbGVuMDhu

http://depositfiles.com/ru/files/6molen08n

Вот статейка про геном неандертальца (файл внизу)
.........................................................................
<А как вообще сохраняется оригинальная ДНК вместе с бактериями миллионы лет,они ДНК не едят?>

Едят но крошки не доедают а нам более и не надо
Кстати пока рекорд востановления генома всего 400 000 лет
и тут север с его холодом открывает возможности
Днк стирается консервацией костей(столько материала загубили в прошлом)
высокая температура дробит остатки на мелкие фрагмента
вообще перепады температуры
кислотность почвы и тд и тп
Вообще это как востановление мозаики из оставшихся и перемешаных фрагментов
По мере роста знаний генома и дальнобойность реставрации во времени увеличивается
кстати за метод клонирование фрагментов дали Нобелевку
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от января 28, 2011, 23:29:17
http://www.eurekalert.org/pub_releases/2011-01/uoa-tsd012711.php

Некоторые динозавры могли пережить планетарную катастрофу, уничтожившую популяцию гигантских ящеров. Такой вывод группа исследователей представила в статье в журнале Geology. Коротко результаты работы приведены в пресс-релизе университета Альберты.
В настоящее время наиболее общепринятой считается гипотеза о том, что динозавры исчезли с Земли в период от 65,5 миллиона до 66 миллионов лет назад. Наиболее вероятной причиной массового вымирания гигантских ящеров считается падение на Землю метеорита. Поднявшаяся пыль закрыла планету от солнечного излучения, что привело к вымиранию большого количества растений. Соответственно, вслед за растениями погибли травоядные животные, а затем и хищники
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: siniavin от января 30, 2011, 19:47:10
ого интерестно...
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: V.V.P от января 31, 2011, 12:19:20
Цитата: feralis от января 28, 2011, 23:29:17
Наиболее вероятной причиной массового вымирания гигантских ящеров считается падение на Землю метеорита. Поднявшаяся пыль закрыла планету от солнечного излучения, что привело к вымиранию большого количества растений. Соответственно, вслед за растениями погибли травоядные животные, а затем и хищники
Объясните, пожалуйста, как получилось так, что от падения метеорита динозавры вымерли, а крокодилы остались жить, дожили до наших дней и прекрасно себя чувствуют? Мне кажется в этой связи, что метеорит слишком избирательно уничтожил флору и фауну Мезозоя. Странно, не правда ли? :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от февраля 01, 2011, 18:53:27
<метеорит слишком избирательно уничтожил флору и фауну Мезозоя. Странно, не правда ли? >

Я  противник всех теорий включающих катастрофизм и с вами согласен но
авторы упомянутой работы имеют др мнение
И вообще указал на их работу как еще один удар по метеоритной теории гибели клады динозавров тем более что речь идет о птицетазовых
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от февраля 03, 2011, 21:07:37
 
Телескоп "Кеплер" обнаружил планеты размером с Землю, обращающиеся в обитаемой зоне своих звезд, а также систему, состоящую из светила и шести планет. Таковы результаты пяти месяцев работы телескопа - с мая по сентябрь 2009 года, специально "заточенного" для поиска экзопланет.
В общей сложности "Кеплер" нашел 1235 внесолнечных планет. Размер 68 из них сравним с размером Земли, а 288 относятся к классу так называемых Суперземель (то есть они больше нашей планеты, но существенно меньше газовых гигантов Солнечной системы). Еще 662 планеты по диаметру сравнимы с Нептуном, 165 - с Юпитером, а 19 из найденных небесных тел больше этого газового гиганта.

В так называемой зоне обитаемости своих звезд располагаются 54 из обнаруженных "Кеплером" планет. Зоной обитаемости называют такое расстояние от светила, внутри которого на планетах может присутствовать жидкая вода - необходимый элемент для возникновения жизни земного типа. Размер пяти планет из обитаемой зоны сравним с размером Земли - то есть, они являются наиболее перспективными кандидатами для поисков живых существ.

Еще одна интересная находка телескопа - похожая на Солнце звезда Kepler-11, вокруг которой обращаются шесть планет. Это самая большая из известных планетных систем (не считая Солнечной системы).
В общей сложности "Кеплер"смотрит на 4,5 миллиона светил.

http://www.nasa.gov/home/hqnews/2011/feb/HQ_11-030_Kepler_Update.html


Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от февраля 04, 2011, 20:06:23
У микроскопического речного рачка дафнии оказалось больше генов, чем у любого другого животного из тех, чьи геномы уже расшифрованы
Расшифровка генома дафнии в общей сложности заняла 10 лет. Ученые выяснили, что в геноме D. pulex содержится как минимум 30,9 тысячи генов - для сравнения, в геноме человека насчитывается около 23-25 тысяч генов. Исследователи показали, что многие гены являются результатом дупликации - то есть удвоения последовательности уже существующих генов. Этот процесс в ДНК дафний протекает, в среднем, втрое активнее, чем в ДНК других живых существ. Также D. pulex "неохотно" расстаются со старыми и зачастую неработающими генами - их содержание в геноме рачков также примерно втрое больше, чем в ДНК других организмов.

Ученые полагают, что большое количество генетического материала необходимо дафниям для того, чтобы оперативно реагировать на изменения окружающей среды. Множество различных генов представляют собой ресурс для мутаций - появляющиеся в них изменения позволяют D. pulex подстраивать свой организм под изменяющиеся условия.

http://www.livescience.com/animals/water-flea-genome-environmental-testing-110203.html
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: алексаннндр от февраля 05, 2011, 19:55:32
Чтобы повкуснее были, наверное! :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: feralis от февраля 11, 2011, 20:04:07
 
Стопы австралопитеков были устроены так же, как стопы современных людей. Такой вывод сделали ученые по итогам анализа костей Australopithecus afarensis, найденных в Африке. Сходное устройство стопы означает, что австралопитеки, как и люди, могли долгое время ходить по земле, но плохо лазали по деревьям. Работа исследователей опубликована в журнале Science, а коротко о ней пишет портал ScienceNOW.
Австралопитеки - высшие приматы, которые считаются прямыми предками человека. Они обитали на Земле в период от 4 до 2 миллионов лет назад. Самым известным представителем этой группы гоминид считается Люси - самка австралопитека, жившая 3,2 миллиона лет назад. Ее скелет сохранился достаточно хорошо, однако в нем отсутствуют стопы - анатомия которых является важным диагностическим признаком, позволяющим установить место особи на эволюционном древе.

Авторы новой работы анализировали кости 35 австралопитеков, которые были найдены в Эфиопии в течение последних 15 лет. Среди останков были обнаружены кости плюсны, в частности, длинная кость, которая соединяет большой палец с остальной стопой. Ее анатомия очень сильно отличается у обезьян, проводящих основную часть времени на деревьях, и у людей, ноги которых приспособлены для длительных перемещений по плоской поверхности.

У обезьян кость, связывающая большой палец со стопой, расположена плоско по отношению к поверхности земли. При этом средняя часть стопы у лазающих по деревьям животных очень подвижна, поэтому они могут прочно обхватывать ветви деревьев. У человека эта кость повернута вдоль длинной оси и находится под углом к земле. Она входит в систему костей, которые формируют подъем стопы, который играет роль амортизатора при длительной ходьбе, но при этом люди не могут так эффективно лазать по деревьям.

Новые результаты, возможно, позволят объяснить происхождение загадочных следов, найденных в Танзании возле города Лаэтоли. Возраст отпечатков составляет около 3,6 миллиона лет, но при этом они очень напоминают отпечатки, которые бы оставил человек, пройдя по мокрому песку. Многие специалисты сомневались, что такие "современные" следы мог оставить австралопитек.


http://news.sciencemag.org/sciencenow/2011/02/lucy-had-a-spring-in-her-step.html?ref=hp
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Молодой от февраля 11, 2011, 21:55:38
feralis тоже похоже новости google юзает :)
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: chief от февраля 12, 2011, 00:49:29
В статье ошибка, речь идет не о кости, " которая соединяет большой палец с остальной стопой", а о 4-й метатарзалии.

Мы тоже об этом опубликовали новость:  http://antropogenez.ru/single-news/article/58/
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от февраля 12, 2011, 18:57:15
Обнаружен ген отвечающий за конкуренцию между клетками многоклеточных.

http://www.cnio.es/es/news/docs/eduardo-moreno-developmental-cell-16jun10-en.pdf

A Cell-Cell Communication Code Reveals the Fitness of a Cell to its Neighbours
Madrid, June 16th, 2010
– Scientists of the Spanish National Cancer Research Centre (CNIO) discover a protein called Flower that marks the weaker cells for elimination in favour of their fitter neighbours

During development, a cell compares its metabolic rates with neighbouring cells
and, as a result, the best adapted cells "win" and proliferate at the expense of
neighbours that "lose" and are eliminated. This process of cell competition was
first described in the fruit fly, in larval structures called imaginal discs that give
rise to adult body parts, such as the wings. Cell competition may serve as a way
to ensure that only the fittest cells contribute to the growing organism. However,
all the known regulators of cell competition are also known to affect cell growth
and survival in general, so it has been hard to determine what benefit animals
derive from this particular type of cellular melee.
...

"Taken together, our results suggest that Flower isoforms generate the scaffold
that is required and sufficient to label cells as winners and losers during
competitive interactions among cells," concludes Dr. Moreno. "The extracellular
code composed by the Flower isoforms may have biomedical implications
beyond cell competition because imbalances in cell fitness also appear during ageing, cancer formation and metastasis." Indeed, the specific role for Flower in
cell competition makes it a unique focus for future study to understand the
function of cell competition in isolation from other signals that control tissue
growth.
Название: Re: интересные публикации о эволюции
Отправлено: Dessa от февраля 12, 2011, 19:02:42
Есть вид крокодилов, который может впадать в спячку и проводит ее в норах под землей, переживая неблагоприятный период, например, засуху. М.б. так он и падение метеорита пережил.:)

Цитата: V.V.P от января 31, 2011, 12:19:20
Цитата: feralis от января 28, 2011, 23:29:17
Наиболее вероятной причиной массового вымирания гигантских ящеров считается падение на Землю метеорита. Поднявшаяся пыль закрыла планету от солнечного излучения, что привело к вымиранию большого количества растений. Соответственно, вслед за растениями погибли травоядные животные, а затем и хищники
Объясните, пожалуйста, как получилось так, что от падения метеорита динозавры вымерли, а крокодилы остались жить, дожили до наших дней и прекрасно себя чувствуют? Мне кажется в этой связи, что метеорит слишком избирательно уничтожил флору и фауну Мезозоя. Странно, не правда ли? :)