paleoforum.ru

Форумы сайта «Проблемы эволюции» => Форум сайта «Проблемы эволюции» => Тема начата: Alexy от февраля 03, 2011, 17:37:40

Название: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 03, 2011, 17:37:40
Цитата: Удина, Животовскийhttp://evolbiol.ru/large_files/darwin_sbornik_2010.pdf (стр 216)
"Эффективная численность популяции при изучении полиморфизма по Y-хромосоме в четыре раза меньше, чем при расчете ее по аутосомным маркерам, — таким образом, полиморфизм по Y-хромосоме подвержен генетическому дрейфу"
А кто-то мог бы объяснить, как и по каким данным в данном случае вычисляли "эффективную численность популяции"?

И почему сделали вывод, что "полиморфизм по Y-хромосоме подвержен генетическому дрейфу"?

Из статейки http://medbiol.ru/medbiol/molevol/0000c5ca.htm это вроде совсем непонятно?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Питер от февраля 04, 2011, 16:10:53
Да  все   просто.  Если   мы   возьмем  популяцию  из   N    челоек,   мужчин-женщины 1 к 1  - то   там  соотношение Х   хромосом  к Y    будет  3 к 1.  А    на 4  аутосомы  - 1 Y.
В  связи с    этим  вероятность  дрейфа  для Y  выше.
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 04, 2011, 17:48:41
Точно! Спасибо
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 06, 2011, 03:05:22
Цитата: Питер от февраля 04, 2011, 16:10:53
А    на 4  аутосомы  - 1 Y.
не понял, как это?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 06, 2011, 15:27:21
у каждого человека по 2 штуки каждой аутосомы

У каждого мужчины только по 1 У-хромосоме

Среди допустим 100 человек  только ~половина мужчин, а значит ~50 У-хромосом,
а аутосом 100*2=200
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 06, 2011, 16:19:25
сорри, аутосома - это неполовая хромосома? или я неверно что-то понял?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: DNAoidea от февраля 06, 2011, 23:53:20
Цитата: sanj от февраля 06, 2011, 16:19:25
аутосома - это неполовая хромосома?
да
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 07, 2011, 15:47:30
тогда как может быть на 4 аутосомы 1 Y хромосома?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 07, 2011, 22:21:56
Тут подсчитываются не все 44 (22 пары) аутосом, а только любая одна определенная пара (например №n) из них
Можно также рассматривать любой определенный участок генома, находящийся не в Х- и в не У-хромосомах

У мужчины на 2 аутосомы №n приходится 1 У-хромосома
У женщины на 2 аутосомы №n приходится 0 У-хромосомы

Сколько  же Y-хромосом у "среднестатистического человека" приходится на его 2 аутосомы №n?
Ответ - 1/2 Y-хромосомы (т е на каждую аутосому №n приходится 1/4 Y-хромосомы)
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: feralis от февраля 08, 2011, 22:50:59
<А    на 4  аутосомы  - 1 Y..>

ясность изложения вполне в духе семейного дуэта Балановских(питер их знает)
не лаконично но лапидарно
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: chief от февраля 08, 2011, 23:58:19
Коллега feralis ушел наезжать на Балановских сюда. А причем тут Балановские вообще?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 09, 2011, 09:11:08
Цитата: feralis от февраля 08, 2011, 22:50:59
не лаконично но лапидарно
Это же вроде синонимы ;)
Цитата: feralis от февраля 08, 2011, 22:50:59ясность изложения ...
Хотел как понятнее, а как вышло - вам судить
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 09, 2011, 15:36:28
Цитата: Alexy от февраля 07, 2011, 22:21:56
Тут подсчитываются не все 44 (22 пары) аутосом, а только любая одна определенная пара (например №n) из них
Можно также рассматривать любой определенный участок генома, находящийся не в Х- и в не У-хромосомах

У мужчины на 2 аутосомы №n приходится 1 У-хромосома
У женщины на 2 аутосомы №n приходится 0 У-хромосомы

Сколько  же Y-хромосом у "среднестатистического человека" приходится на его 2 аутосомы №n?
Ответ - 1/2 Y-хромосомы (т е на каждую аутосому №n приходится 1/4 Y-хромосомы)

ну так и надо было сразу говорить, что сравниваются не все аутосомы а только пара аутосом и пара половых хромосом. ну или участки таковых..
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 09, 2011, 15:40:44
Цитата: Питер от февраля 04, 2011, 16:10:53
Да  все   просто.  Если   мы   возьмем  популяцию  из   N    челоек,   мужчин-женщины 1 к 1  - то   там  соотношение Х   хромосом  к Y    будет  3 к 1.  А    на 4  аутосомы  - 1 Y.
В  связи с    этим  вероятность  дрейфа  для Y  выше.
хотя для этого вывода это неважно, т.к.
при сравнении всех аутосом с половыми или
при сравнении только 2 аутосом с 2 половыми, Y-ков все равно будет меньше.
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: feralis от февраля 09, 2011, 18:36:23
Надо было Питеру расжевать

У женщины две икс- хромосомы а  мужчины одна икс плюс одна игрек
вот и соотношение 1 к 3

А лапидарно это настолько кратко что информация теряется
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: sanj от февраля 09, 2011, 19:05:44
ну вообще насколько я знаю лапидарно, это кратко, сжато, понятно и без потери инфы. вроде происходит от какого-то латинского слова, то ли камень, то ли что-то вытесанное на камне. смысл - кратко, но емко, без излишеств, вроде как на камне высечено.
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: feralis от февраля 09, 2011, 19:13:48
  ;D Стараюсь быть кратким — делаюсь непонятным.

                                                       Гораций

Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 09, 2011, 21:33:42
Ну у меня получилося ещё хуже - даже не кратко
Цитата: feralis от февраля 09, 2011, 18:36:23У женщины две икс- хромосомы а  мужчины одна икс плюс одна игрек
вот и соотношение 1 к 3
А отношение количества любой одной из аутосом к количеству Y = 4 к 1
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: feralis от февраля 09, 2011, 22:55:01
так как икс хромосома тасуется между женщинами и мужчинами то
можно высчитать соотношение мужчин и женщин в бутылочном горле
например мужиков в группе переселившемся из Африки в азию и давшим жизнь
все евроазиатам мира
было в неск раз более чем женщин
сванте намекал что скрещивание на азиатском берегу было с обеими полами
вот жду его работы с новыми находками и зубами неандеров из разных мест
Он всегда недоговаривал дабы иметь задел для следующей сенсации
похоже однако эта новая его работа будет уступать  по сенсационности той где он доказал скрещивание с неандером
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Питер от февраля 10, 2011, 14:13:48
Было  бы  крайне     любопытно  провести    простой      эксперимент  -   вытащить  из  всех    баз  данных   по  митотипам  и Y   хромосомам   по  2-3-5  образцов  из  каждой       выборки.  И  сравнить  эту  картинку с  той,     что  получается  при  анализе  всех     данных. И  тогда  возможно  станет   ясно,  что    анализ    единиц    неандеров   из  разных  точек  мира  может  давать  весьма     ошибочные   результаты,  если  говорить  о  неандерах в  целом.
Идею  дарю.
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Alexy от февраля 10, 2011, 17:24:10
Митотип - то мтДНК?
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Питер от февраля 11, 2011, 09:53:08
Да,   это  конкретный    вариант  мтДНК.  По  аналогии с  генотипом.
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Dessa от февраля 12, 2011, 19:04:48
Т.е. мужчины -  с Марса, женщины с Венеры.
Или Мужчины - сапиенсы из Африки, женщины - неандерталки из Европы?:)))

Вот мужчины! В своей сексуальной неразборчивости и кряжистыми неандерталками не гнушались.:)))

Цитата: feralis от февраля 09, 2011, 22:55:01
так как икс хромосома тасуется между женщинами и мужчинами то
можно высчитать соотношение мужчин и женщин в бутылочном горле
например мужиков в группе переселившемся из Африки в азию и давшим жизнь
все евроазиатам мира
было в неск раз более чем женщин
сванте намекал что скрещивание на азиатском берегу было с обеими полами
вот жду его работы с новыми находками и зубами неандеров из разных мест
Он всегда недоговаривал дабы иметь задел для следующей сенсации
похоже однако эта новая его работа будет уступать  по сенсационности той где он доказал скрещивание с неандером
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: Dessa от февраля 12, 2011, 19:06:21
..удалено
Название: Re: Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)
Отправлено: feralis от февраля 13, 2011, 00:28:24
Notch

Что за аппендикс вы удалили
может в самом деле не нужен