Этот белок есть у миноги и у иксодового клеща. А у ланцетника - не могу найти.
Откуда он появился? С учетом http://elementy.ru/images/news/evolution_tree_new_748.jpg
Кстати, в той таблице не всё согласуется с ранее полученными данными
Я вот вообще не понял, что вы хотели сказать. И где вы искали искомый ген в геноме ланцетника ?
Искал - там http://www.ebi.ac.uk/ebisearch/search.ebi?db=ensembl_gene&t=dscam
Знаю, что геном ланцетника расшифрован (картинка оттуда, из публикации о завершении полной расшифровки генома), но DsCAM в нем не показан.
Хотел не сказать, а спросить:"Возможна ли горизонтальная переноска гена, кодирующего столь крупный протеин?"
Ensembl для этого не достаточен - надо лезть в Бласт и делать поиск по гомологии. Лучше в белковый бласт - но задача в любом случае не тривиальная, слишком большие временные разрывы и гомология будет слабой.
Насчет горизонтального переноса - не думаю, ну нет его практически у эукариот.
ЦитироватьА оно вам надо?
Надо.
Потому что
Цитировать
VladimirKox - 30.01.2013 19:19
Цитировать
Это - обратная сторона медали. Я сейчас под впечатлением от А.Маркова "Эволюционные корни Добра и Зла" и Докинза "Хорошие парни выживают всегда" (Эгоистичный ген.)
Но, выжив, и увеличив число своих потомков, вмести с вирусами на них паразитирующими, эти "хорошие парни" обеспечивают вымирание менее продвинутым. Вероятно, "мертвые зоны" возле ключевых мутаций - последствия межвидовой вирусологической войны, отыскивающей все более слабые места у реликтовых видов.
ЦитироватьLeMor - 30.01.2013 23:06
Да. Но, тут есть интересная проблема, до которой пока не доходят руки - Преодоление вирусами межвидового барьера
.
http://www.neuroscience.ru/entry.php?276-%D0%90%D0%B4%D0%B0%D0%BF%D1%82%D0%B8%D0%B2%D0%BD%D1%8B%D0%B9-%D0%BC%D1%83%D1%82%D0%B0%D0%B3%D0%B5%D0%BD%D0%B5%D0%B7-%D0%B8-%D0%B0%D0%B4%D0%B0%D0%BF%D1%82%D0%B8%D0%B2%D0%BD%D0%BE%D0%B5-%D0%BF%D0%BE%D0%B2%D0%B5%D0%B4%D0%B5%D0%BD%D0%B8%D0%B5
Цитироватьнадо лезть в Бласт и делать поиск по гомологии.
Понял.
ЦитироватьЛучше в белковый бласт
Не понял.
Цитироватьну нет его практически у эукариот
ъ
А как же бделлоидные коловратки?
Ну бластов есть два - нуклеотидный и белковый. В одном случае гомология ищется по нуклеотидной последовательности, во втором - по аминокислотной, с разными алгоритмами поиска.
Насчет коловраток - ну есть такой тупик эволюции. Очень своеобразная группа, очень странный вариант бытия. Но магистраль лежит все-таки не там. Это как диминуция хроматина - да, есть. Но строить на ней какие-то большие построения - зачем ?