:) Здравствуйте!
Можете помочь в прочтении этой статьи: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24452534/
We confirmed that chokeberry inhibits the amidolytic activity of thrombin
Что значит "amidolytic activity of thrombin" говоря простым языком?
Правда ли что черноплодка сгущает кровь?
Еще, если у Вас есть время :) помогите разобраться с терминами в описании методов
Methods: Adenosine 5'-diphosphate (ADP)-induced aggregation was measured with turbidimetric method. Spontaneous and ADP-activated platelet adhesion were investigated using a colorimetric method. The global assay of coagulation and fibrinolysis was performed with the use of optical clotting and lysis (CL) test. Thrombin (0.5 IU/mL) and tissue plasminogen activator (60 ng/mL) were used to obtain a CL curve. The activity of thrombin and plasmin was determined by means of chromogenic substrate (S-2238, S-2251) RESULTS: The aronia extract contributed to the reduction in spontaneous and ADP-activated platelet adhesion. A significant increase in overall potential of CL as well as significant changes in key parameters of these processes (T t-thrombin time, F vo-initial plasma clotting velocity, and L max-maximum lysis) was reported. Chokeberry extract significantly inhibited the amidolytic activity of thrombin and plasmin.
Пользуйтесь, например, https://translate.google.com
Прилично переводит.
Например,
"We confirmed that chokeberry inhibits the amidolytic activity of thrombin"
=
"Мы подтвердили, что черноплодная рябина подавляет амидолитическую активность тромбина. "
Остальное:
"Методы. Агрегацию, вызванную аденозин-5'-дифосфатом (АДФ), измеряли турбидиметрическим методом. Спонтанную и АДФ-активированную адгезию тромбоцитов исследовали колориметрическим методом. Общий анализ коагуляции и фибринолиза проводили с использованием теста оптического свертывания и лизиса (CL). Тромбин (0,5 МЕ / мл) и тканевый активатор плазминогена (60 нг / мл) использовали для получения кривой CL. Активность тромбина и плазмина определяли с помощью хромогенного субстрата (S-2238, S-2251). РЕЗУЛЬТАТЫ: Экстракт аронии способствовал снижению спонтанной и АДФ-активируемой адгезии тромбоцитов. Сообщалось о значительном увеличении общего потенциала ХЛ, а также о значительных изменениях ключевых параметров этих процессов (T t-тромбиновое время, F vo-начальная скорость свертывания плазмы и L max-максимальный лизис). Экстракт черноплодной рябины значительно подавлял амидолитическую активность тромбина и плазмина."
Я собственно не понял что такое амидолитическая активность. Тромбин может проявлять как антикоагулянтную так и коагулянтную активность, о какой из двух речь?
Тогда не знаю.
Могу предположить, что как-то связано с амидолитическим методом (pharma. amidol method - при количественном определении активности Анти-Xa и Anti-IIa scipion, см. https://www.multitran.com/m.exe?s=амидолитический метод&l1=2&l2=1#google_vignette).
О амидолитической активности речь идёт в http://www.renam.ru/wp-content/uploads/2017/02/Metody-opredeleniya-aktivnosti-geparina.-2015.pdf ...
Отъедание амидогруппы субстрата при определении активности фермента.
Цитата: Питер от октября 22, 2021, 16:01:12
Отъедание амидогруппы субстрата при определении активности фермента.
Я слаб в химии, мне эти слова ничего не говорят
Ну в гугле же не забанили ?
https://yandex.ru/images/search?pos=3&img_url=https%3A%2F%2Fimage2.slideserve.com%2F3890074%2Fslide8-l.jpg&text=%D0%B0%D0%BC%D0%B8%D0%B4%D0%BE%D0%B3%D1%80%D1%83%D0%BF%D0%BF%D0%B0%20%D1%8D%D1%82%D0%BE&lr=213&rpt=simage&source=wiz
Я же говорю , слаб в химии, не представляю как эти реакции соотносятся с процессами коагуляции в организме
Пептидная связь — вид амидной связи, возникающей при образовании белков и пептидов в результате взаимодействия α-аминогруппы (—NH2) одной аминокислоты с α-карбоксильной группой (—СООН) другой аминокислоты. Тромбин - сериновая протеаза, которая ест пептидную связь, в образовании которой принимает участие серин.
Теперь делаем синтетический субстрат. Серин (условно, можно взять аналоги) -амидная связь - краситель. В присутствии тромбина эта связь рвется, краситель уходит и его в свободной форме можно как-то померять.
В итоге берете плазму крови, караете бусцветный субстрат - плазма окрашивается в зависимости от активности тромбина в плазме.
Цитата: Питер от октября 23, 2021, 11:05:05
Пептидная связь — вид амидной связи, возникающей при образовании белков и пептидов в результате взаимодействия α-аминогруппы (—NH2) одной аминокислоты с α-карбоксильной группой (—СООН) другой аминокислоты. Тромбин - сериновая протеаза, которая ест пептидную связь, в образовании которой принимает участие серин.
Теперь делаем синтетический субстрат. Серин (условно, можно взять аналоги) -амидная связь - краситель. В присутствии тромбина эта связь рвется, краситель уходит и его в свободной форме можно как-то померять.
В итоге берете плазму крови, караете бусцветный субстрат - плазма окрашивается в зависимости от активности тромбина в плазме.
И снова вопросы: как понять "ест пептидную связь"? Как достигается адресность сериновой протеазы?
Цитата: Питер от октября 23, 2021, 11:05:05
Пептидная связь — вид амидной связи, возникающей при образовании белков и пептидов в результате взаимодействия α-аминогруппы (—NH2) одной аминокислоты с α-карбоксильной группой (—СООН) другой аминокислоты. Тромбин - сериновая протеаза, которая ест пептидную связь, в образовании которой принимает участие серин.
Теперь делаем синтетический субстрат. Серин (условно, можно взять аналоги) -амидная связь - краситель. В присутствии тромбина эта связь рвется, краситель уходит и его в свободной форме можно как-то померять.
В итоге берете плазму крови, караете бусцветный субстрат - плазма окрашивается в зависимости от активности тромбина в плазме.
Но в целом я вас понял. Спасибо за ответ
Любая протеаза есть пептидную связь. Но у разных протеаз есть своя специфичность - они могут узнавать любые пептидные связи или связи, образованные определенными аминокислотами - серином, треонином, аргинином и так далее. Есть протеазы, которые едят белок с конца - одни с N, другие с С.
По итогу черноплодка оказывает коагулянтное или антикоагулянтное действие?
Кирилл, не знаю. И вы делайте различия - одно дело накапать нечто в пробирку и посмотреть, что там с тромбмном, и другое дело ложкой есть черноплодку. Это две очень большие разницы.