где обедал тубулин?

Автор василий андреевич, октября 09, 2023, 10:34:10

« назад - далее »

Шаройко Лилия

Я сейчас котеек накормлю пока они меня саму не съели и вернусь. Я котят Софьи раздала давно, но тут мы еще подкидышей двоих уговорили с трудом переехать с улицы  в дом  в преддверии морозов. В общем они диковатые, тяжелое детство, деревянные игрушки и все такое.
:)
И я потом смогу сосредоточиться на более сложных вещах.

Шаройко Лилия

Цитата: василий андреевич от декабря 09, 2023, 09:23:48Имеем горку-тренд, как данность-упорядоченность от "Него". Эмпирика второго начала такова, что концентрат рассеивается в расширение вселенной в силу большей вероятности (тенденциозности), т.е. "высокий химический потенциал" элементов горки, как единственности своего рода, переходит в кинетику неупорядоченных соударений - получаем Броуновское разбегание, в самых общих чертах выражаемое экспонентой полураспада.
  Обратный процесс "антиБроуновской консолидации" требует "целенаправленных" усилий внешней среды, что с горкой, как тенденцией к росту тренда, решается через растраты внутренней энергии ядерных запасов нашей планеты. Естественно следуя по цепочке причинностей вспять, получим необходимость БВ (иногда божьей воли). ...Как следуя по нашей генетической цепочке, получим митохондриальную Еву, хотя четко знаем, что таковой не было

Я так понимаю речь идет о горке энтропии и второе начало термодинамики здесь понимаю как формулировку в самом общем смысле: 
ЦитироватьУстанавливает существование энтропии как функции состояния термодинамической системы и вводит понятие абсолютной термодинамической температуры, то есть «второе начало представляет собой закон об энтропии» и её свойствах. В изолированной системе энтропия либо остаётся неизменной, либо возрастает, достигая максимума при установлении термодинамического равновесия. Встречающиеся в литературе различные формулировки второго начала термодинамики являются частными следствиями закона возрастания энтропии
https://ru.wikipedia.org/wiki/Второе_начало_термодинамики

Тогда не ясно как при расширении вселенной энтропия может уменьшаться:

ЦитироватьУвеличение количества частиц в системе: При добавлении новых частиц энтропия системы возрастает. Это связано с тем, что увеличение числа частиц увеличивает количество доступных микросостояний, которые могут быть реализованы в системе.

Увеличение объема системы: При увеличении объема системы, количество доступных микросостояний также увеличивается, что приводит к возрастанию энтропии

Правильно ли я понимаю, что "химический потенциал" плотной системы связан с реализованностью возможных связей между частицами, которые при расширении могут в некоторых местах освобождаться как соли в растворе превращаются в ионы и кинетика большего количества объектов создает больше случайных соударений и больше хаоса.
 

Цитата: василий андреевич от декабря 09, 2023, 09:23:48Мне казалось, что тектоническими усилиями Игоря Антонова, удалось избежать прямой ассоциации. Даже, если алгоритмические (задаваемые правила), порождаемые геномом признать, то многократно возрастает роль плазмы-сомы эти правила читающие, как множество семантических нюансов.
Да, у Игоря очень хорошая статья получилась, настолько что я ее до конца осилить так и не смогла, запнулась окончательно о квантовую физику. Но из того, что понято - математический образ процессов эволюции настолько превосходит отличием механизмов от реальных биологических объектов разницу живого и мертвого, что я это все лучше потом там в теме напишу очень подумав над вежливостью формулировок, так как в основном уровень текста и мысли мой превышает.
:)

Цитата: василий андреевич от декабря 09, 2023, 09:23:48Потому назакусь так: если тенденция косного тренда - нивелировка, то тенденция живого, удержание тренда от нивелировки за счет потребности. Потребность - это ощущение-чувствование нехватки средств для достижения цели, которую определим, как сохранность на достигнутом. Геном физически, та молекула, которая сохраняется от нивелировки переадресацией разрушающих раздражений в сому и уже на совесть сомы ложится ответственность за прием, обработку и исторжение обесцененных средовых сигналов. Сигнал - это свободная энергия, плюс, код. Энергия для виталитета, код для менталитета.
  Виталитет обесценивает энергию от концентрированной формы до хаотической с оставлением моржи, менталитет обесценивает коды с оставлением феномена памяти. Памятью компа пусть будет флешка-структура, а вот памятью менталитета никакая материальная структура быть не может!!! Пусть не может, по определению.
  Следовательно, ментальная память - это математическая функция вероятности, эволюционирующая, как тусовка ощущений недостатка материальных структур для ее наблюдения-коллапса.

Как отличается потребность одноклеточных в хемотаксисе предвкушения лигандов от тяги химического вещества в силу стремления соединения связей. Прошу прощения за длинность, приведу в отдельном сообщении свой текст семинарской работы по биофизике если на форуме не найду чтобы просто ссылкой.


Цитата: василий андреевич от декабря 09, 2023, 09:23:48Понимаю, что последний абзац - это вообще аб-зац (что бы не высказаться матом). Но только загоняя себя в подобный мыслительный тупик, можно искать выход путем многократного возвращения к истокам попадания в очередные тупики. Тупики, как флуктуации в белом шуме внутренних ощущений, нет-нет, да один из вариантов сможет проскользнуть средь других, потому что декодируется той сомой, которая подготовлена к адекватной декодировке прошлыми неудачами.
  Получаем белый шум внутри и белый шум снаружи. Взять из внутреннего шума ту флуктуацию, которую затратно можно преобразовать до той флуктуации, которая будет принята средой, значит, выработать полость материального недостатка (потребности) в себе любимом. Этот недостаток лучше всего выразить таким образом, как видение незанятых мест.

  И уже тубулин видит незанятые места, потому что вода внутри трубочки находится в наинизшем состоянии энтропии и, соответственно, вынуждена искать способы ее повышения. А на внешней поверхности трубочки маякуют ПП, срывающиеся в ПД при приеме сигналов из белого шума среды.
  Просто трубочка конкретнее рассуждений о ментальности. Выделить из средового шума только ту энергетическую микро-волну, которая несет знакомо-притягательный код, значит, иметь возможность сосредоточиться на потенциальном ресурсе, который среда без участия трубочки, не может обесценить с повышением общей энтропии.

Да там Картасар уже прикуривает по полной
:)
НО что такое белый шум вот в чем вопрос. Слово сома мне кажется в текстах такого типа лучше увешивать контекстом типа "это братцы тело нейрона", а то его начальные смыслы индуизма совсем другие
ЦитироватьСома или Чандра — бог Луны в индийской мифологии. Считается, что он устанавливает отсчёт времени и властвует над всей вселенной.Бхагавата-пурана характеризует Чандру как жизнь всего живого, называя его Дживой — главным живым существом во вселенной.

Ну т о есть когда в тексте "упорядоченность от "Него" и тп, то общий контекст ваще улетает в стратосферу и три дня лесом надо идти чтобы собрать все сопутствующие ассоциативные связи
:)

Шаройко Лилия

#17
Цитата: Шаройко Лилия от декабря 09, 2023, 23:43:18Как отличается потребность одноклеточных в хемотаксисе предвкушения лигандов от тяги химического вещества в силу стремления соединения связей. Прошу прощения за длинность, приведу в отдельном сообщении свой текст семинарской работы по биофизике если на форуме не найду чтобы просто ссылкой.

Семинар был про биологические молекулы, но приведенные в цитате виды связей и многие виды обычно совершаемой ими работы характерны и для неживой природы


Цитата: Шаройко Лилия от июля 07, 2022, 16:50:32ВИДЫ СВЯЗЕЙ

В биологических молекулах существует несколько видов связей между атомами, определяющих во многом, как конфигурацию молекулы, так и ее преобразования вследствие воздействия внешних сил.

Основные свойства биомолекул определяются простым эмпирическим принципом, который применяется в молекулярной динамике.

Упрощение это не учитывает квантовых эффектов и использует три основные модели.
1. Ковалентные связи, соединяют атомы, образуя стабильные структуры с определенной геометрией.
2. Нековалентные силы контролируют нестабильные взаимодействие внутри молекул и между ними.
3. Свойства воды кардинально модифицируют форму и стабильность биомолекул.

...........

КОВАЛЕНТНЫЕ СВЯЗИ

Ковалентные связи являются самыми прочными и работают благодаря квантовому обобществлению связей в электронах. При физиологических температурах эти связи очень стабильны, для их разрыва требуется значительная энергия. Ковалентная связь имеет очень жестко закрепленную длину, которая варьирует только на доли ангстрема, а вариации углов редко превышают несколько градусов

ВОДОРОДНЫЕ СВЯЗИ

 Суть связи в том, что неподеленное электронное облако имеет избыточный потенциал, который притягивает соседний атом, механизм образования двух электроотрицательных атомов осуществляется через протон и близок к донорно-акцепторному. Эти связи играют главную роль в обеспечении стабильности макромолекул. Квантовые расчеты показывают, что при образовании связи меняется распределение плотности не только у атомов участников связи, но и у всех остальных входящих в комплекс, причем полярность их возрастает, что усиливает взаимодействие остальных связей. При этом образуется комплекс через водородный мостик, наибольшая стабильность связи под прямым углом. Характерны соединения с кислородом, водородом, азотом.

........


ГИДРОФОБНЫЕ СВЯЗИ

В учебнике Биофизика (2016 г.) Рубин А.Б. пишет:
«В условиях сильных гидрофобных взаимодействий разрушение элементов вторичной структуры, погруженных в гидрофобное ядро, энергетически невыгодно. В силу этого изменение плотности в гидрофобном ядре возможно только при движениях участков вторичной структуры (a-спирали и b-листы) как целого.
Именно поэтому изменение плотности в гидрофобном ядре при денатурации не является локальным, а затрагивает, по существу, все гидрофобное ядро целиком со смещением элементов - структурного каркаса. Расширение молекулы вблизи нативного состояния происходит с сохранением грубых черт пространственной структуры».

.........

ВАН-ДЕР ВААЛЬСОВЫ СИЛЫ

Ван-дер-Ваальсовы взаимодействия имеют электромагнитную природу. В зависимости от поляризации или изначального существования дипольного момента существуют типы этих сил.

1. Дипль-дипольное взаимодействие полярных молекул
2. Индукционное взаимодействие диполя полярной молекулы с индуцированным диполем другой молекулы
3. Дисперсионное взаимодействие двух индуцированных диполей молекул.


василий андреевич

Цитата: Шаройко Лилия от декабря 09, 2023, 23:43:18когда в тексте "упорядоченность от "Него" и тп, то общий контекст ваще улетает в стратосферу
"Он" - это та предшествующая нашему наблюдению работа, которая дала тот объект исследования, который и будет подвергаться естественному распаду и всяческим отборам. Как образовался исследуемый концентрат, нужно будет изучать при "возвращении" из будущего в мысленном эксперименте во все более далекое прошлое.
  Например, геоморфолог с географического факультета изучает натуральную горку (или плато), эволюционирующую в рельефное разнообразие за счет положительных (расталкивающих, "энтропийных") сил выветривания-выпогоживания так, будто первоначально горка "от Него". А геоморфолог с геологического факультета, во-первых, введет вместо "Него" тектонические силы, созидающие плато, а уже потом подключит выветривание созидаемого.
  Физик может отвлечься от геоморфологии, поставив в базу совместное действие положительных разрушающих-нивелирующих сил и отрицательных созидающих-консолидирующих. Совместное действие обоих типов сил приводит к учению о эволюции энергетического ландшафта. Потенция-потенциал (подъем над нулем) - это итог действия отрицательных сил, тогда как кинетике отводится роль положительных-разрушительных сил, нивелирующих достигнутое отрицательными.
  Энтропия от Клаузиуса рулит положительными кинетическими силами, хаос этих сил называется теплом, а их порядок работой. Если "рядом" находятся области с высокой хаотизацией (например, костер), измеряемой высокой температурой, и области с низкой хаотизацией, измеряемой низкой температурой (например, лужа), то можно вводить рабочее тело, отбирающее порции тепла от костра и передающее его луже.
  При такой порционной передаче энергии от высокого хаоса костра к низкому хаосу лужи (среда), рабочее тело (система) вырабатывает собственный потенциал-порядок, который можно выразить и как химический потенциал.
  "Чисто" термодинамическая энтропия по Клаузиусу лишь скажет, что часть тепла безвозвратно ушла на бесполезное расширение вселенной и только толика на "возвышение" химического потенциала. Отсюда и растут ноги у идеи БВ, будь то взрыв или воля, как первоначальный концентрат от сингулярности или Высшего Существа. По мне, так нет разницы, ибо до них - неисповедимость, потому и не смущаюсь вводя Его, как толчок-искру к мысленному эксперименту.

  Я обычно не использую понятие химического потенциала, а просто  подразумеваю его, как составную часть энтальпии - суммарная работа среды над системой (отрицательная) и положительная работа системы над средой.
  Но с Вами, дорогая Лилия, через энтальпию получится хуже, чем через химический потенциал, хотя хрен редьки не слаще. Потому далее о химизме, как о работе.

василий андреевич

  Пусть в недрах древней Земли окислы металлов и, скажем так, кремний-водороды (силаны и пр.). Если фактор ограничить только ростом статического давления (но не просто статикой давления), то обратимые хим. реакции сместятся в сторону соединений металлов с кремнием, а вода и тепло пойдут в осадок возгонятся к поверхности планеты. Энтропия повысится за счет рассеяния тепла недрами, а мы получим удивительное вещество - теплую воду.
  Вода - это, во-главном, протонная парочка, которая ради "гендерного союза" отдает свои электроны в аренду кислороду, отчего образуется дипольная молекула с "равенством полов" в образе плюс-минус. "Брачный контракт разнополюстностей" состоялся только потому, что тепло рассеялось из области соединения и стало белым шумом среды обитания водных диполей.
  Энергии флуктуаций тепловой среды достаточно, что бы разбивать междипольные связи (или пусть Ван-дер Ваальсовы), но недостаточно для нарушения ковалентных и водородных - т.е. квантовые эффекты не учитываются, не имеют значения.
  Нестабильность междипольных связей, физически называется хаосом измеряемым в градусах температуры. Сколько энергии положительных сил требуется на разбиение этих связей, столько же энергии отрицательных сил требуется для их восстановления. В общем виде получается кластер из множества диполей, случайным образом варьирующий своими междипольными связями - это и есть состояние воды при максимуме энтропии по Больцману (максимум вероятности состояния внутреннего динамического равновесия или гомеостаз).

  Теперь вводим в воду любую примесь, хоть ион, хоть спирт. Примесь по-любому отвлечет на себя ориентировку части водных диполей, что снизит число вариантов в тусовке чисто водного кластера, а это означает снижение состояния энтропии воды. Вычтя из конечного состояния начальное, получим представление о отрицательной энтропии (негэнтропии), которая условно олицетворяется с системой примесей, а не с общим понижением энтропии "исторической формации", типа было-стало.
  Именно с понижением энтропии формации следует декодировать нашей соображаловкой те сигналы, которые называются гидрофобными. Коагуляция многоатомных спиртов и повышение активности тусовки ионов - это способ водного кластера вернуть себе состояние высокой энтропии. Водная фобия к =С-Н и филия к -О-Н окончаниям молекул загоняет флуктуациями белого шума С-Н внутрь глобулы при оставлении О-Н снаружи.
  А вот с ионами сложнее. Удобнее, как пример, рассмотреть пару катионов натрий-калий. Калий-йон крупнее натрия, а потому йон-калиевые связи тусуются с меньшей активностью нежели натриевые. Получаем, что вероятность выталкивания йон-калия к глобуле выше чем вероятность выталкивания йон-натрия. Тут никакие ионные насосы (затратные) не нужны, за ионные насосы нужна только нобелевка.

  Теперь так. Оба последние поста - это цветочки, которые нужны, что бы состоялась негэнтропийная тубулинка, взращенная гидрофобными силами водной среды под оболочкой из Потенциала Покоя повышенной концентрации йон-калия.
  Далее необходимо родить ягодки, которые позволят приблизить косную тубулинку к разряду живых, допустим, за счет появления у нее такого состояния, которое хоть как-то подводимо под понятие индивидуальной потребности.
  Потребность пожрать - не вопрос к тубулинке, а к среде, которая будет выталкивать в нее все, что повышает энтропию среды и понижает энтропию тубулинки. Потому внутренняя потребность тубулинки должна быть связана с поиском способов повысить свою собственную энтропию так, что бы вода-среда этого не заметила. Не сможет повысить ТАК свою энтропию - будет уничтожена теми экспонентно возрастающими силами всеобщего раздрая, которые мы называем общим термином ЕО.
  Экспонентное возрастание - это уже к Больцману. S=k lnW - формула, поражающая своими следствиями в лоно квантовой механики. Но до этой механики может и не придется докатываться, если удастся приспособить энтропию по Винеру и Шеннону.

Шаройко Лилия

#20
Я вчера перепутала увеличение хаоса и упорядоченности в энтропии сорри. Конечно горка упорядоченности при увеличении системы уменьшается, а энтропия как и хаос растет.

Мы сегодня дома обсуждали как степени свободы воплощаются в увеличении объема системы и что такое увеличение возможностей разных местоположений во вселенной, которая расширяется до такого положения вещей, когда между объектами  миллионы километров.
Это довольно наглядно для понимания как это происходит.

Тут просто жесть некоторая дома была в пик этого всплеска мороза и до этого каскад всяких бурных событий, прямо очень хочется их описать где нить в теме типа Границы контакта с реальностью, но я пока сдерживаюсь

Поэтому

Я немного отдохну от этого постоянного экстрима и когда душевное равновесие восстановится примерно до такого, как одна из самых любимых песен моего детства:
 

то я смогу дальше читать и писать здесь, я большой любитель таких текстов как последние два.

Характерно, что теперь нам дома нравятся вот такие вещи, точнее очень широкий спектр от Зеленой кареты до таких


Этот второй ролик может потому, что похоже на то, что в мире творится, от решительной потребности немедленно удовлетворить свои законные желания удержать тренд любой ценой.
:)
надеюсь все таки так у нас на планете не закончится, типа вначале все белые и пушисты полны высоких стремлений, а в конце даже на черта Лочи не похожи.
В смысле степени свободы одного заканчиваются в относительно замкнутой системе планеты там, где начинаются степени свободы другого, иначе уровень энтропии будет такой,  что мало никому не покажется.

сама музыкальная работа на наш домашний взгляд очень хорошего уровня.

сорри за офтоп