атлас активности генов в клетках и тканях человека

[Cirill]

ну наверняка все слышали уже, но вот ссылка http://elementy.ru/news?newsid=432228

составление карты экспрессии преподносится как крупное достижение, которое позволит связать ее с различными заболеваниями, что сулит продвижение медицины (не только в статье Наймарк, то же самое говорят в популярных англоязычных статьях)

однако, на мой посторонний взгляд, это все таки не такое уж эпохальное событие, ну да собран воедино значительный массив данных, но что касается медицины серьезное продвижение выглядит сомнительным, разве, что диагностика выиграет, но вроде как и раньше знали функции (и участие в заболеваниях) конкретных участков генома

Может кто-нибудь из специалистов дать оценку "красной цене" этой работы?

[Alexy]

Рис. 2. Упрощенная (sic!) схема синхронной экспрессии (коэкспрессии) взаимоувязанных генов. Всего 4882 группы промоторов (один узел — одна группа, здесь показано 4664 группы), объединяющие 124 090 промоторов во всех тканях. Радиус узла соответствует числу промоторов в группе. Линии указывают значимые связи между группами, цветами обозначены рыхлые ассоциации коэкспрессирующихся групп; подписи представляют основные типы клеток в той или иной ассоциации. Рисунок из обсуждаемой статьи в Nature

Что значит синхронная? Как при исследованиях достигается одновременность?

А в другие моменты времени (или если брать для разных клеток данные за разные моменты времени?) будет совершенно другая картина?

Линии указывают значимые связи между группами

Что подразумевается под связями? То, что группы разные группы генов экспрессируются одновременно?

А направления у ребер этого графа есть?
Наверное же известно, продукты экспрессии каких генов запускают экспрессию других генов?

[Питер]

1. Событие  не  эпохальное
2. Но   очень интересное -    получился    очень     полезный      атлас  активности  промоторов
3.  Главное   -  не  молиться  на   этот  атлас как  на    библию,  четко  понимая то,  какой  анализировался  набор  тканей  и  клеток.    Например,     экспрессия  генов   в  определенном  типе  клеток в  культуре  и in vivo   -   две  большие  разницы.
4.   Еще  раз удивляюсь    Элементам  -    ну  нет в  названии и в  самой  статье  активности  генов  - есть активность  промоторов.  Что    не  совсем    одно  и  то  же

[sanj]

Автор исследования Рено Массарт пишет: «Степень стресса, который испытали матери во время ледяного шторма, коррелировала c количеством метиловых меток на генах их детей. Эти 957 генов, на которых мы нашли марки, связаны преимущественно с функционированием иммунной системы».

http://tvrain.ru/teleshow/lobkov_vechernee_shou/ja_gospod_karajuschij_za_grehi_ottsov_do_chetvertogo_kolena_genetiki_evgenij_rogaev_i_moshe_shif_o_tom_pochemu_vnuki_uznikov_kontslagerej_stradajut_ot_depressii_i_chto_takoe_geneticheskaja_pamjat-376126/

[aevin]

"Самые первые заключения из этой работы были такие. Многие промоторы в клетках млекопитающих составлены из нескольких точек (сайтов) начала считывания. Определяющим для клетки оказывается, с какого из них начинается считывание. В каждой конкретной клетке реально работают лишь немного генов. Важно, что эволюция тканеспецифичных участков промоторов шла быстрее и иными путями, чем неспецифичных участков; последние оказались относительно консервативными."

Не густо ...