Вопрос к биохимикам

Автор Комбинатор, февраля 17, 2014, 17:07:47

« назад - далее »

Комбинатор

Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

Сергей

Цитата: Комбинатор от февраля 17, 2014, 17:07:47
Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

Нереально. Разве что жидкий HF, но он гораздо хуже воды по разнообразию реакций.

Вообще, среда для возникновения репликатора должна быть гетерогенной, с циклическим притоком внешней энергии.

Комбинатор

Цитата: Сергей от февраля 17, 2014, 20:10:31
Цитата: Комбинатор от февраля 17, 2014, 17:07:47
Насколько реальным выглядит существование чего-нибудь типа "мира РНК" в растворителе, отличном от H2O, например, в нефтеподобной среде?

Нереально. Разве что жидкий HF, но он гораздо хуже воды по разнообразию реакций.

Вообще, среда для возникновения репликатора должна быть гетерогенной, с циклическим притоком внешней энергии.


А в чём проявляется разноообразие реакций РНК с водой? Я лично знаю только про гидроилиз, но он скорее мешает, чем помогает при синтезе молекул РНК.
Понятно, что дополнительно нужен источник энергии, но это всё же отдельный вопрос...


Питер

Ответ  простой  -  что   растворяет  нефтеподобная   среда ?
А  оно  вам  надо  ?

Комбинатор

Цитата: Питер от февраля 18, 2014, 09:30:07
Ответ  простой  -  что   растворяет  нефтеподобная   среда ?

Хорошо, согласен, в качестве растворителя полярных молекул, коей и является РНК, нефть это не то, что доктор прописал. А как на счёт аммиачных и аммиачно-спиртовых растворов?



Сергей

Цитата: Комбинатор от февраля 18, 2014, 11:01:49
Хорошо, согласен, в качестве растворителя полярных молекул, коей и является РНК, нефть это не то, что доктор прописал. А как на счёт аммиачных и аммиачно-спиртовых растворов?

Аммиак, конечно, лучше углеводородов растворяет разные типы соединений, но всё равно до воды, с её уникальными свойствами, ему далеко. Как и по другим физическим свойствам, например, с температурой кипения: скорость химических реакций с каждыми 10-ю градусами ускоряется в два-три раза.

Кстати, насчет гидролиза: бытует устойчивый миф о быстром распаде РНК в водных растворах. На самом деле, если в воде нет примесей, даже длинная м-РНК может годами храниться в водном растворе при комнатной температуре без заметного разложения. А быстрый гидролиз вызывают ионы металлов и, главным образом, РНКаза, которая с кожи исследователей легко попадает в воздух, на посуду и сохраняется при даже длительном автоклавировании. Малюсенький, очень древний фермент, но в РНК-то мире его не было. 

Питер

Согласен  с  Сергеем  -    не   плюйте  в  пробирки с  РНК,  готовьте  правильно     растворы  и  посуду  -   и  она  вполне  себе  живет.
А  оно  вам  надо  ?

Комбинатор

Спасибо всем за ответы. Выходит, геотермальные источники, в которые в последнее время принято помещать мир РНК, тоже не очень походят, ведь концентрация ионов металлов там, насколько я понимаю, очень неслабая?

Сергей

Цитата: Комбинатор от февраля 18, 2014, 15:11:19
Спасибо всем за ответы. Выходит, геотермальные источники, в которые в последнее время принято помещать мир РНК, тоже не очень походят, ведь концентрация ионов металлов там, насколько я понимаю, очень неслабая?

Подходят: ведь без ионов металлов никакие известные сейчас каталитические реакции с участием РНК не идут. Просто нужно, чтобы синтез был чуть быстрее распада. Или синтез в одном месте (например на поверхности минерала, а распад - в другом.

Комбинатор

Цитата: Сергей от февраля 18, 2014, 16:48:13
Подходят: ведь без ионов металлов никакие известные сейчас каталитические реакции с участием РНК не идут. Просто нужно, чтобы синтез был чуть быстрее распада. Или синтез в одном месте (например на поверхности минерала, а распад - в другом.

А есть какие-нибудь экспериментальные данные по поводу соотношения скоростей полимеризации и гидролиза РНК в условиях, типичных для геотермальных источников?  Пока чисто интуитивно вариант "синтез в одном месте, а распад - в другом" кажется мне более реалистичным.

василий андреевич

Цитата: Комбинатор от февраля 18, 2014, 17:20:34
Пока чисто интуитивно вариант "синтез в одном месте, а распад - в другом" кажется мне более реалистичным.
Вопрос дилетанта. А почему биохимики так мало уделяют внимания электро-магнитным и фононно-волновым процессам, которые сопровождают реакции синтеза и распада?
  Ведь когда рвется длинная цепь, это означает энергетический выплеск в той волновой форме, которая может быть воспринята соседними молекулами, как однозначная информация для активации конкретных окончаний.
  Но и с водными кластерами, определенным образом ориентированными вокруг молекулы, происходят явления, заставляющие прийти в движение квазиструктуры дальнего порядка.