Слепила программку для Y-Адама и мт-Евы

Автор Злата, декабря 20, 2012, 14:51:32

« назад - далее »

Злата


Работает так. Пишешь:

1. Сколько генотипов вначале
2. Сколько экземпляров каждого генотипа
3. Сколько поколений хочешь симулировать
4. Кнопка AutoSet должна быть включена

Или
1. Кнопка AutoSet должна быть выключена
2. Сам забиваешь в массив стартовое число особей с каждым генотипом

Второй массив лучше не трогать.
Это - вероятности того, что у каждой самки 0,1,2,3,4 дочки (или, соответственно, у отца 0,1,2,3,4 сына
1-я колонка - в нормальной ситуации, численность популяции остается (в среднем) неизменной.

Кнопка Correction если включена - меняет эти вероятности.
Если стало больше 130% - на 2-ю колонку, если стало меньше 70% - на 3-ю.
Это моделирует ситуацию стабильного количества пищевых ресурсов.

Если кому нравится - поделюсь.
Правда, я писала на LabView, придется перевести во что-то более удобоваримое.
Типо макроса на Экселе.

Практика показывает, что через 1000 поколений - НЕ получается, чтоб остался один генотип.
Остается примерно 3.
Шли по лесу и встретили программистку

Питер

И  что    моделирует  эта  программка  ?
А  оно  вам  надо  ?

Micr

Цитата: Злата от декабря 20, 2012, 14:51:32

Практика показывает, что через 1000 поколений - НЕ получается, чтоб остался один генотип.
Остается примерно 3.

Верю (слепо), что при желании можно построить критику как результатов этой программы, так и противоположных результатов. Критику, основанную на неточности моделей.

Злата

Цитата: Питер от декабря 20, 2012, 17:49:56
И  что    моделирует  эта  программка  ?
Моделирует число в каждом поколении самок с такой митохондрией (самцов с такой У-хромосомой).
Красные столбики внизу - растут, уменьшаются.
Можно менять массив (справа вверху) - получатся разные модели.
Можно сделать как модель численно-стабильной популяции, так и растущей (как было с расселением кроманьонцев).
Базовое предположение - что различия в генотипах НЕ значащие. То есть - отбор на них не действует.
Например - это разные кодоны одной аминокислоты.

Впрочем, я не уверена, что даже такая мутация - никак не влияет на выживаемость, то есть на отбор.
Шли по лесу и встретили программистку

Limfil

Цитата: Злата от декабря 20, 2012, 21:28:18
Впрочем, я не уверена, что даже такая мутация - никак не влияет на выживаемость, то есть на отбор.
такая мутация может влиять в принципе на выживаемсть о чём говорит различные предпочтения разными организмами разных кодонов, однако как именно - не ясно, и вообще если митохондриальные гены очень консервативны и там если какие мутации и возможны, то скорее всего нейтральные, то с Y-хромосомой ситуация иная - гены там куда "свежее" и замен как нейтральных так и положительных там может быть больше, правда на этой хромомсоме если не ошибаюсь только три функциональных гена...