Геногеография

Автор Береника, ноября 09, 2011, 09:32:15

« назад - далее »

Eugene_rus

Цитата: Жан-Люк Пикар от сентября 08, 2012, 14:19:46
Цитата: Eugene_rus от сентября 08, 2012, 14:11:05
Что значит бьют?
С гаплогруппами как-то проще.
Тут согласен. Гаплогруппы малоинформативны, но значительно проще. Как алгебра и высшая математика.

идрис

Смотря для чего. Чтобы подсчитать сдачу в маршрутке использовать высшую математику нерационально. Точно так же чтобы определить родство крупных групп людей друг с другом, надо использовать то что это родство характеризует - гаплогруппы то есть.

Eugene_rus

Цитата: идрис от сентября 08, 2012, 16:47:28
Точно так же чтобы определить родство крупных групп людей друг с другом, надо использовать то что это родство характеризует - гаплогруппы то есть.
Вот как раз тут гаплогруппы и будут неуместны. Могут совпадать гаплогруппы у генетически наиболее отдаленных этногрупп - как например совпадает у большинства басков с камерунцами.
Гаплогруппа применима для использования в генетической генеалогии, а не в этнографии.
В дополнение и если учитывается высокое разрешение, то они проливают дополнительный свет.
Генетика - это Вам не сдача в маршрутке - тут как раз и не нужно все упрощать.

Жан-Люк Пикар

Цитата: Eugene_rus от сентября 08, 2012, 19:17:05
Могут совпадать гаплогруппы у генетически наиболее отдаленных этногрупп - как например совпадает у большинства басков с камерунцами.

Если игнорировать различие субклейдов, то совпадают. А так пример не очень корректен. Было бы интереснее какой-нибудь молодой субклейд увидеть у весьма разных популяций. :)

Eugene_rus

Цитата: Жан-Люк Пикар от сентября 08, 2012, 20:21:18
Было бы интереснее какой-нибудь молодой субклейд увидеть у весьма разных популяций. :)
Это Вы правильно уточнили, субклады у них различные, но поймет это только тот кто в теме основательно разбирается, а не по верхушкам собирает информацию.
К тому же набор субкладов из разных гаплогрупп у разных популяций будет разный.
Суть везде в ньюансах.

Дж. Тайсаев

Цитата: Eugene_rus от сентября 08, 2012, 19:17:05
Могут совпадать гаплогруппы у генетически наиболее отдаленных этногрупп - как например совпадает у большинства басков с камерунцами
У меня вопрос в связи с этим. А разве нет способов выяснить, совпадение гаплогрупп связанно с генеалогической общностью, либо имеет независимый характер?
Шматина глины не знатней орангутанга (Алексей Толстой).

Eugene_rus

Цитата: Дж. Тайсаев от сентября 08, 2012, 21:30:17
Цитата: Eugene_rus от сентября 08, 2012, 19:17:05
Могут совпадать гаплогруппы у генетически наиболее отдаленных этногрупп - как например совпадает у большинства басков с камерунцами
У меня вопрос в связи с этим. А разве нет способов выяснить, совпадение гаплогрупп связанно с генеалогической общностью, либо имеет независимый характер?
Совпадение гаплогрупп может быть связано с большим количеством факторов, но основной из них -
это "Бутылочное горлышко" и соответсвенно случайное совпадение. Причем это характерно особенно для палеолита-мезолита и чуть менее для неолита и позднее.
Учитывая, что миграции вплоть до начала н.э. происходили экстенсивным путем (по мере роста и расширения популяции), то соответсвенно иногда можно проследить путь миграций вплоть до неолита-мезолита, но глубже намного сложнее.
Говорить о совпадении с генеалогической общностью - тоже не корректно, т.к. подразумевает некое прямое наследование "в купе" и гаплоруппы и культуры и языка и истории - а это прослеживается не всегда. Но если брать относительно недавние совпадения в исторические времена (например до 1000 лет назад) то да, чаще всего совпадения гаплогрупп не случайны.

sanj

случайное совпадение? типа в разных популяциях вдруг произошла одна и та же мутация?

Eugene_rus

Цитата: sanj от сентября 09, 2012, 17:29:05
случайное совпадение? типа в разных популяциях вдруг произошла одна и та же мутация?
Нет. В корне не верно.
Если гаплогруппа совпадает, то значит по прямой мужской или женской линии был один общий предок. Другое дело, что доминирование гаплогруппы в популяции могло произойти случайно. Например некий древний этнос представлял из себя к примеру этнос с характерным набором субкладов гаплогрупп, а потом в него влился другой с другим набором субкладов и был ассимилирован, но гаплогруппы и соотвествубщие субклады то их остались. Далее через примерно 500-800 лет когда эти разные субклады и гаплогруппы делит один и тот же этнос с единым генофондом уже в независимости от гаплогруппы. А еще скажем лет через 500 вдруг происходит некий катаклизм, стихийное бедствие или чума и большая часть этого этноса погибает, а у выживших уже будет другой, но "дочерний" по отношению к первым набор субкладов гаплогрупп. Т.е. некоторые могут элиминироваться, а некторые которые ранее неапример занимали небольшой процент - резко увеличить свое процентное соотношение в новом этносе.
Этот процесс происходит практически бесконечно и постоянно.

Жан-Люк Пикар

Цитата: Eugene_rus от сентября 09, 2012, 17:44:39
Если гаплогруппа совпадает, то значит по прямой мужской или женской линии был один общий предок.

На чём это основано? Как исключают вероятность конвергенции?

Питер

Гаплогруппа  -    это  несколько  аллельных   вариантов в  определенном  сочетании. Есть  вероятность,  что  одна  и  та  же   мутация  в  двух  разных    группах  возникла  независимо.  Но  вот  потом  вторая,  третья   -     это  просто  не  вероятно.
А  оно  вам  надо  ?

Eugene_rus

Цитата: Жан-Люк Пикар от сентября 09, 2012, 18:06:06
Цитата: Eugene_rus от сентября 09, 2012, 17:44:39
Если гаплогруппа совпадает, то значит по прямой мужской или женской линии был один общий предок.

На чём это основано? Как исключают вероятность конвергенции?
Учитывается не одна единственная SNP мутация, а серия снипов, т.е. в этой иерархии где один вышестоящий снип объединяет несколько субкладов или гаплогрупп - исключена вероятность совпадения.

sanj

вероятность все же есть, но с увеличением числа снипов она уменьшается, кто нить считал вероятности?

Eugene_rus

Цитата: sanj от сентября 09, 2012, 18:30:45
вероятность все же есть, но с увеличением числа снипов она уменьшается, кто нить считал вероятности?
Какова вероятность, что при бросании монеты она выпадет ребром? И какова вероятность,  что при втором броске опять будем ребром? При третьем, четвертом, пятом,  ... двадцатам? Есть такая вероятность? Есть конечно, но стоит ли её вообще считать?
Теперь немного математики - если при характеристики субклада учитывается минимум 5 снипов (на практике обычно в дереве используется не меньше 10), то примерная вероятночть гомоплазии и независимого появления такого события равно примерно 10^-32 768 степнени. Как видим это ничтожно мало. И это без учета вероятности попадания "бутылочного горлышка" именно на эту особь.

sanj

сорри, а как именно считается?