Эффективная численность популяции (в молекулярной филогении и генеалогии)

Автор Alexy, февраля 03, 2011, 17:37:40

« назад - далее »

Alexy

Цитата: Удина, Животовскийhttp://evolbiol.ru/large_files/darwin_sbornik_2010.pdf (стр 216)
"Эффективная численность популяции при изучении полиморфизма по Y-хромосоме в четыре раза меньше, чем при расчете ее по аутосомным маркерам, — таким образом, полиморфизм по Y-хромосоме подвержен генетическому дрейфу"
А кто-то мог бы объяснить, как и по каким данным в данном случае вычисляли "эффективную численность популяции"?

И почему сделали вывод, что "полиморфизм по Y-хромосоме подвержен генетическому дрейфу"?

Из статейки http://medbiol.ru/medbiol/molevol/0000c5ca.htm это вроде совсем непонятно?

Питер

Да  все   просто.  Если   мы   возьмем  популяцию  из   N    челоек,   мужчин-женщины 1 к 1  - то   там  соотношение Х   хромосом  к Y    будет  3 к 1.  А    на 4  аутосомы  - 1 Y.
В  связи с    этим  вероятность  дрейфа  для Y  выше.
А  оно  вам  надо  ?



Alexy

у каждого человека по 2 штуки каждой аутосомы

У каждого мужчины только по 1 У-хромосоме

Среди допустим 100 человек  только ~половина мужчин, а значит ~50 У-хромосом,
а аутосом 100*2=200

sanj

сорри, аутосома - это неполовая хромосома? или я неверно что-то понял?


sanj


Alexy

Тут подсчитываются не все 44 (22 пары) аутосом, а только любая одна определенная пара (например №n) из них
Можно также рассматривать любой определенный участок генома, находящийся не в Х- и в не У-хромосомах

У мужчины на 2 аутосомы №n приходится 1 У-хромосома
У женщины на 2 аутосомы №n приходится 0 У-хромосомы

Сколько  же Y-хромосом у "среднестатистического человека" приходится на его 2 аутосомы №n?
Ответ - 1/2 Y-хромосомы (т е на каждую аутосому №n приходится 1/4 Y-хромосомы)

feralis

<А    на 4  аутосомы  - 1 Y..>

ясность изложения вполне в духе семейного дуэта Балановских(питер их знает)
не лаконично но лапидарно

chief

Коллега feralis ушел наезжать на Балановских сюда. А причем тут Балановские вообще?

Alexy

Цитата: feralis от февраля 08, 2011, 22:50:59
не лаконично но лапидарно
Это же вроде синонимы ;)
Цитата: feralis от февраля 08, 2011, 22:50:59ясность изложения ...
Хотел как понятнее, а как вышло - вам судить

sanj

Цитата: Alexy от февраля 07, 2011, 22:21:56
Тут подсчитываются не все 44 (22 пары) аутосом, а только любая одна определенная пара (например №n) из них
Можно также рассматривать любой определенный участок генома, находящийся не в Х- и в не У-хромосомах

У мужчины на 2 аутосомы №n приходится 1 У-хромосома
У женщины на 2 аутосомы №n приходится 0 У-хромосомы

Сколько  же Y-хромосом у "среднестатистического человека" приходится на его 2 аутосомы №n?
Ответ - 1/2 Y-хромосомы (т е на каждую аутосому №n приходится 1/4 Y-хромосомы)

ну так и надо было сразу говорить, что сравниваются не все аутосомы а только пара аутосом и пара половых хромосом. ну или участки таковых..

sanj

Цитата: Питер от февраля 04, 2011, 16:10:53
Да  все   просто.  Если   мы   возьмем  популяцию  из   N    челоек,   мужчин-женщины 1 к 1  - то   там  соотношение Х   хромосом  к Y    будет  3 к 1.  А    на 4  аутосомы  - 1 Y.
В  связи с    этим  вероятность  дрейфа  для Y  выше.
хотя для этого вывода это неважно, т.к.
при сравнении всех аутосом с половыми или
при сравнении только 2 аутосом с 2 половыми, Y-ков все равно будет меньше.

feralis

Надо было Питеру расжевать

У женщины две икс- хромосомы а  мужчины одна икс плюс одна игрек
вот и соотношение 1 к 3

А лапидарно это настолько кратко что информация теряется