мусорная днк

Автор Cirill, февраля 04, 2022, 12:53:58

« назад - далее »

Cirill

 :)

Какой процент и локализация действительно мусорной днк
?

Alexeyy

Если под мусорной ДНК имеете в виду не кодирующую белок часть, то сильно по разному бывает. У птиц, например (для облегчения полёта) некодирующая часть дико урезалась.
Но сейчас концепция мусорной ДНК - модифицируется: все больше выясняется, что не кодирующая часть тоже выполняет какую-то (регуляторную) роль. Т.е., строго говоря - не мусорна.
  Так что ответ сильно зависит от того, что понимать под мусорной ДНК. есть мнение, что мусорной ДНК - вообще нет. И ответ на это вопрос сильно меняется по мере появленя новых данных. 

василий андреевич

  А если вопрос поставить так: что происходит с некодирующими белок участками?
  По идее, нарушения в них, доведенные до мутации, не окажут рокового влияния, а потому будут клонироваться.

Иваныч

Цитата: василий андреевич от февраля 05, 2022, 05:14:39А если вопрос поставить так: что происходит с некодирующими белок участками?
  По идее, нарушения в них, доведенные до мутации, не окажут рокового влияния, а потому будут клонироваться.

НЕКОДИРУЮЩАЯ (мусорная) ДНК

- управляет производством регуляторных молекул РНК, которые, в свою очередь, контролируют репликацию и транскрипцию ДНК;                                                                             
- отмечает точки программированной перестановки генетического материала;                                   
- влияет на правильное сворачивание и поддержание архитектуры хромосом внутри клеточного ядра;             
- контролирует процессинг, сплайсинг, трансляцию РНК, репарацию ДНК;                                       
- регулирует процесс эмбрионального развития и даже иммунологические реакции.

василий андреевич

  Иваныч, ну а вывод то какой из списанного для ликбеза?
  Вы кого собрались просветить Викой?

Иваныч

#5
Цитата: василий андреевич от февраля 02, 2023, 05:56:58Иваныч, ну а вывод то какой из списанного для ликбеза?
  Вы кого собрались просветить Викой?

Можно аналогичные цитаты из указанного вами источника?

Долгое время эволюционные биологи утверждали, что это подавляющее большинство ДНК, также "мусорной" ДНК, на самом деле существует только для того, чтобы "эволюция" копалась в ней, создавая новые существа из старых. Но растущее накопление данных радикально противоречит этой версии.

Исследование, опубликованное в "Genome Research", подтверждает идею о том, что "фенотип индивидуума (набор видимых признаков) сильно зависит от SNV, которые не изменяют последовательность белка". SNV - это "однонуклеотидные варианты" или различия ДНК между геномами.

Это добавляет доказательств в поддержку вывода о том, что большая часть ДНК полезна. 
И где теперь эволюционное "предсказание" о зависимости от некодирующей ДНК, как "мусорного ведра" генетических битов?  :P
В мусорном ведре, конечно...

Иными словами, учёные нашли новую функцию "некодирующей ДНК". Это еще раз подтверждает то, что большая часть ДНК полезна.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20067941/

василий андреевич

Цитата: Иваныч от февраля 02, 2023, 17:55:22Это добавляет доказательств в поддержку вывода о том, что большая часть ДНК полезна
"Большая часть и полезна" - это категории из нравится-ненравится. Топик стартер написал действительно мусорная и он, как и мы, знает что мусор, это то, что полезно для мусорщика.
  Потому суть вопроса была о такой локализации "пустых" символов, которая в перспективе может стать кодирующей.
  Суть моего ответа была в том, что вероятность мутации, как нарушения, пропущенного отбором, в некодирующей части много выше, нежели в кодирующей. Или, принцип энтропии, как увеличение вариабельности, сказывается именно на "мусорной" части.
  А вот есть ли принцип "самоорганизации" мусора в Боинг кода - это вопрос с неизвестным мне ответом.

Иваныч

Топик стартеру, как и некоторым комментаторам, не мешало бы знать, что любое громкое утверждение, не подкреплённое фактами, является пустышкой...

Термин «мусорная ДНК» появился ТОЛЬКО потому, что, в отличие от «нормальной», она не кодирует белок. Проще говоря, по началу ученые не находили ни одного способа ее применения.  Только потому, что ни одна функция не была известна.
Но это вовсе не означает, что функций нет вообще. Недавние открытия показывают много сфер применения этой структуры, и по ходу продолжения исследований, их обнаруживается все больше.

Ещё одним из примеров является способность «мусорной ДНК» переходить к хромосомам с разорванными нитями ДНК, проскальзывать в разрыв и восстанавливать повреждение — важная функция в поддержании жизнеспособности ВСЕЙ клетки.
Учёные даже засняли на видео, как фрагменты «мусорной ДНК», могут действовать в качестве «выключателей» для генов. Видео позволяет видеть усилители, когда они находят и соединяются с геном, чтобы начать его активацию. https://www.eurekalert.org/news-releases/765106

Работа была опубликовано в журнале Nature Genetics: https://www.nature.com/articles/s41588-018-0175-z


Дарвинист

Цитата: василий андреевич от февраля 03, 2023, 07:33:05Суть моего ответа была в том, что вероятность мутации, как нарушения, пропущенного отбором, в некодирующей части много выше, нежели в кодирующей. Или, принцип энтропии, как увеличение вариабельности, сказывается именно на "мусорной" части.

Так это, как я думаю, и есть квантовая механика. Накопление, так сказать, "мусора" как способ редуцировать неопределенность, и не просто квадратичным образом, а с уширением. 

Дарвинист

#9
Даже линия водорода может работать с уширением до ридберговских параметров.
А эти параметры дают преимущество - периферия системы становится более чувствительной к изменениям во внешней среде. Опять же, редукция волновой функции...

Если не ошибаюсь, этим преимуществом и обладает система, организованное как общество..

василий андреевич

Цитата: Дарвинист от февраля 07, 2023, 03:03:16Если не ошибаюсь, этим преимуществом и обладает система, организованное как общество..
Да. И такие состояния могут быть описаны не только с точки зрения квантово-механической, но и информационной системы, правда информацией придется называть потенциальную функцию, рождающуюся, как Ридберговское взаимодействие, а "редукция" происходит в "квантовой критической точке" при фазовом переходе второго рода.
  Особо интересно, что "при ненулевом фазовом температурном переходе, флуктуации, которые развиваются в критической точке, регулируются классической физикой, потому что характерная энергия квантовых флуктуаций всегда меньше, чем характерная тепловая (неупорядоченная) энергия Больцмана kТ". (Списано мной из Вики: "квантовая критическая точка)

  В принципе, можно перевести и на биологический язык в той ужасающей форме, что белок кодирующие гены в стрессовой для клетки ситуации становятся "возбужденным мусором", организующим такие каналы дальней связи, в которых рождается новая информация, не содержащаяся в старых данных.