Антропогенез и мозг.

[Konof]

Вся   сила в  гемоглобине ...
Попытка  ставить  телегу   (цитоскелет)  впереди   лошади  (ядра) бессмысленна.

Покажите пальцем на того негодяя, который ставит цитоскелет впереди "ядра"? Более того, выше я даже акцентировал на том, что цитоскелет, как и весь остальной "клеткодом" - продукт адаптации информационных молекул к изменениям среды. Но цитоскелет, появившись, взял на себя на столько важнейшие функции, что играет огромную (возможно-равную ДНК) роль не только в структурной организации многоклеточных организмов, но и, вполне возможно, в репликации самой ДНК (то, что управляет  экспрессией генов -уже научный факт). Так что, нет у нас "первых", есть "дружба и сотрудничество!", синергия, такскаать!) Вы вопрос то изучите.

[Питер]

Ну   раз  вы  все  изучили  -  то в  молекулярных  терминах  КАК  цитоскелет  регулирует  экспрессию  генов 

[Konof]

Ну   раз  вы  все  изучили  -  то в  молекулярных  терминах  КАК  цитоскелет  регулирует  экспрессию  генов 

Вы всегда предпочитаете отвечать вопросом на вопрос? Я очень мало, чего изучил, конечно, но я старюсь всегда изучать то, что пишут оппоненты, прежде чем задавать им чванливые вопросы с высоты своего высокомерия. Здесь, как я начинаю подозревать, предпочитают "чатиться" по последним фразам в  постах? Молю, разубедите меня в этих подозрениях!

[Питер]

(то, что управляет  экспрессией генов -уже научный факт).

Раз  факт  -  то   можно  его   подтвердить   конкретной ссылкой  на   публикацию\обзор  ?  Вопроса   не  было   -  было указание   изучить.

А   пока  вам  на  почитать
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32620673/

[Konof]

А   пока  вам  на  почитать
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32620673/

На почитал, за почитал, не поленился, и даже под почитал. Пришёл в озадаченность - а Вы то сами читали? Особенно вот это:

and could even have evolutionary implications.

Так и в чём спич? Мы с Савельевым по кругу правы!)))
Обращаю так же, Ваше Высочайшее Внимание, что эпигенетика пока что доказательно работает только на соматических клетках, то есть в пределах развития и функционирования индивидуйного организьма. По поводу наследования эпигенетических эффектов (пока что) , как и в данном случае, только догадываются. Ну, и ещё очень радует, что таки есть и работают продолжатели идей Юрия Марковича Васильева. Пусть и в забугорье на чуждом нам наречии.)
Одного не могу никак дождаться: когда же вы сможете внятно сформулировать свои претензии ко мне?  А то и ярлычков понавешали, и интеллигентно пооскорбляли, и поэкзаменовали походя... А вот шоп прямо и в глаза, таки никак!) А вас рекомендовали как единственного тут вменяемого, между прочим! Дальше боюсь даже думать в эту сторону...

[Питер]

Как  с   эпицитоскелетом,  так  и с  эпигеномом  есть  одна   большая    общая   проблема   -  и  то  и  другое   будет  специфично   для  определенного  типа соматических  клеток.  И  надо   как-то    сформулировать     инструкцию   для  генома  герминативных  клеток -    что в   эпи- процессах в  соме   хорошо   и  что   надо    сохранить.    И    вариант  стохастики  (рисунок  2  из  статьи)   выглядит  более  реальным,  чем   сложные   схемы   передачи  информации  о   правильном   эпифенотипе  через     герминативные  клетки.   Да,    есть  яйцеклетка  с   цитоплазмой и  своим   эпифенотипом  -  но  именно     своим ...

[Alexeyy]

эпигенетика пока что доказательно работает только на соматических клетках, то есть в пределах развития и функционирования индивидуйного организьма. По поводу наследования эпигенетических эффектов (пока что) , как и в данном случае, только догадываются.

Нет. Такие эффекты (наследования приобретённых в процессе жизни признаков) известны.

[Konof]

эпигенетика пока что доказательно работает только на соматических клетках, то есть в пределах развития и функционирования индивидуйного организьма. По поводу наследования эпигенетических эффектов (пока что) , как и в данном случае, только догадываются.

Нет. Такие эффекты (наследования приобретённых в процессе жизни признаков) известны.

Очень хотел бы конкретные примеры и ссылки.

[Питер]

Да,    и  наследование   должно  быть в  4   и  далее поколении.   Алексей,   и  правда  такой  пример      хотелось  бы  увидеть.

[Konof]

Как  с   эпицитоскелетом,  так  и с  эпигеномом  есть  одна   большая    общая   проблема   -  и  то  и  другое   будет  специфично   для  определенного  типа соматических  клеток. 

Будет. Предполагаете? Я вот даже предположить не могу. Только смутные догадки. Почему только для определённого типа? Цитоскелет и межклеточный матрикс практически универсум.

И  надо   как-то    сформулировать     инструкцию   для  генома  герминативных  клеток -    что в   эпи- процессах в  соме   хорошо   и  что   надо    сохранить. 

Да, без отбора "сформулировать" вроде и некому. Но вы мыслите в рамках эволюционной классики в данном случае, то есть передачей "инструкции" от поколения к поколению многоклеточного организма. Я же "предполагал" некую "обработку" информации без выхода на соматику в течнии многих поколений, и некий , неизвестный механизм информационного "отбора" (конструирования) через информационную сеть цитоскелета именно. С последующим "выплеском" готовой соматической "конструкции" после очередного полового размножения.  Мутно? Я тоже так думаю)

И    вариант  стохастики  (рисунок  2  из  статьи)   выглядит  более  реальным,  чем   сложные   схемы   передачи  информации  о   правильном   эпифенотипе  через     герминативные  клетки. 

Да, так.

Да,    есть  яйцеклетка  с   цитоплазмой и  своим   эпифенотипом  -  но  именно     своим ...

Бипотенциальные гонады отделяются от мезонефроза только с 3 недели эмбрионального развития. Обратите внимание - не сразу после оплодотворения и первого деления(только в этом случае фенотип яйцеклетки не передавался бы на сому)! Это означает, что эпифенотип яйцеклетки(да и просто цитоплазматический фенотип) получают не только закладывающиеся примерно в это время яйцеклетки будущих самок, но и все соматические клетки организма.  При чём, и самцов тоже. Разница только в том, что с самцами клеточный фенотип и умирает. А вот с самками передаётся и передаётся...

[Alexeyy]

эпигенетика пока что доказательно работает только на соматических клетках, то есть в пределах развития и функционирования индивидуйного организьма. По поводу наследования эпигенетических эффектов (пока что) , как и в данном случае, только догадываются.

Нет. Такие эффекты (наследования приобретённых в процессе жизни признаков) известны.

Очень хотел бы конкретные примеры и ссылки.

Перый раз о таком примере прочитал на Мединформе, наверно, лет 10 назад: там рассказывалось о наследуемых изменениях, связанных с голодом. Вскоре ещё о кое-каких примерах услышал (точно не помню каких) и узнал, что их - не мало. Кое о каких примерах где-то в нескольколетней лекции Марков Рассказывает (где-то эту лекцию выкладывал на этом форуме; а, вот здесь: https://paleoforum.ru/index.php/topic,12152.0.html). 
  Об участии амилоидов в эпигенетическом наследовании говорится в (Namy O. et al. 2008 со ссылкой на Shorter J., Lindquist S. 2005).
Известен случай наследования прямо по Ламарку приобретённого иммунитета бактерии против вируса (см. Марков А. В. 2019: 17:10-18:28): у бактерии есть система иммунитета, состоящая в том, что она берёт кусочек ДНК вируса и вставляет в свой геном в специальное для этого место и если бактерия потом выживет, то этот кусочек потом использует как образец вируса по которому она быстро идентифицирует и уничтожает его в случае, если тот опять нападёт. Но т.к. кусочек потом передаётся потомкам, то это - пример того, как приобретенный в течении жизни признак (иммунитет) наследуется потомкам.
Относительно недавно, удалось даже, косвенно, установить самонаправление мутаций у байкальских рачков. А именно: на основе ряде базовых молекулярно-эволюционных закономерностей было доказано, что в нескольких тысячах генах близкородственных видов рачков происходили мутации, которые были связаны с адаптацией к окружающей среде и причём эти адаптивные параллельные мутации были более распространены по сравнению со случаем, которые бы возникали чисто случайно и независимо от окружающей среды (Сколтех 2020 с ссылкой на Burskaia V. et al. 2020). Что, таким образом, и означает наличие у рачков адаптивных мутаций, вероятность которых увеличивается под действием окружающей среды.

В обзорной работе (Steele E. J. et al. 2019) по передаче информации к половым клеткам также рассказывается о том, что вейсмановский барьер проницаем не только для соматических РНК, но и для соматических ДНК и что оказывает наследственное влияние на последующие поколения (там же). Где также отмечается, что (благодаря самонаправлению эволюции) «Эволюционные адаптивные изменения могут быть очень быстрыми и направленными - мгновенная адаптация к изменяющейся среде в пределах одного или двух поколений. Быстрое обновление генов ДНК, передаваемых потомкам. И. Матич (Matic I. 2019) недавно рассмотрел эти стратегии скоростных гипермутаций как, позволяющие выжить популяциям живых систем в непредсказуемых средах» .

Ж. А. Шапиро ещё в 1992 году пришёл к заключению, что основное, эволюционное изменение генома - результат естественной генной инженерии; т.е. инженерии, которую осуществляет сама клетка с помощью использования клеточной биохимической системы для мобилизации и реорганизации структур ДНК (Wikipedia, Natural genetic engineering со ссылкой на Shapiro J. A. 1992). Он так и говорит про «Клеточное познание и принятие клеточных решений» (Shapiro J. A. 2012).
  Много всяких наследуемых, приобретённых при жизни признаков сейчас известно....
Вот ещё пример таких изменений (в том числе, в ДНК) был обнаружен в экспериментах с мышами: у их самцов был выработан рефлекс избегать запах ацетофенона (природное ароматическое соединение; например, есть в аромате черемухи) с помощью разрядов тока и оказалось, что у их потомства от необученных самок эффект обучения так или иначе присутствовал (Романовская Т. 2015 со ссылкой на Dias B. G., Ressler K. J. 2014).
У меня разных примеров ещё, может, с десяток накопилось.  Игорь Антонов (участник этого форума - см. выше ссылку), наверно, ещё не мало примеров может привести.

Namy O., Galopier A., Martini C., Matsufuij S., Fabret C., Roussel J. P. 2008. Epigenetic control of polyamines by the prion [PSI+]. Nat. Cell Biol. №10, pp. 1069–1075.

Shorter J., Lindquist S. 2005. Prions as adaptive conduits of memory and inheritance. Nat Rev Genet №6, pp. 435–450.

Марков А. В. 2019. Теория эволюции. Догмы современной теории эволюции. 10 сент.,  www.youtube.com/watch?v=LS6lVtUvKV8 .

Сколтех 2020. Творческий кризис молекулярной эволюции: адаптивные мутации повто-ряются. https://www.skoltech.ru/2020/08/tvorcheskij-krizis-molekulyarnoj-evolyutsii-adaptivnye-mutatsii-povtoryayutsya/ .

Burskaia V., Naumenko S., Schelkunov M., Bedulina D., Neretina T., Kondrashov A., Yampolsky L., BazykinG. A. 2020. Excessive parallelism in protein evolution of Lake Baikal amphipod species flock. Genome Biology and Evolution, evaa138, Published: 11 July, https://doi.org/10.1093/gbe/evaa138 , https://academic.oup.com/gbe/advance-article/doi/10.1093/gbe/evaa138/5870375 .

Steele E. J., Gorczynski R. M., Lindley R. A., Liu Y., Temple R., Tokoro G., Wickramasinghe D. T., Wickramasinghe N. C. 2019. Throughout the Cosmos. Progress in Biophysics and Molecular Biology Volume 149, December, Pages 10-32,  https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0079610719301129 , https://doi.org/10.1016/j.pbiomolbio.2019.08.010 .

Matic I. 2019. Mutation rate heterogeneity increases odds of survival in unpredictable
environments. Mol. Cell 75, 421e425. https://doi.org/10.1016/j.molcel .

Wikipedia, Natural genetic engineering. https://en.wikipedia.org/wiki/Natural_genetic_engineering .

Shapiro J. A. 1992. Natural genetic engineering in evolution. Genetica. 86 (1–3): 99–111, https://doi.org/10.1007%2FBF00133714 , http://shapiro.bsd.uchicago.edu/Shapiro.1992.Gentica.NatGenEngInEvo.pdf .

Shapiro J. A. 2012. Cell Cognition and Cell Decision-Making. Huffington Post. Updated May 19, 2012, http://www.huffingtonpost.com/james-a-shapiro/cell-cognition_b_1354889.html .

Романовская Т. 2015. Дарвиновские геммулы преодолели вейсмановский барьер. Эле-менты. https://elementy.ru/novosti_nauki/432386 .

Dias B. G., Ressler K. J. 2014. Parental olfactory experience influences behavior and neural structure in subsequent generations. Nature Neuroscience volume 17, pages89–96,  http://www.nature.com/neuro/journal/v17/n1/abs/nn.3594.html .

[Дарвинист]

Вот ещё пример таких изменений (в том числе, в ДНК) был обнаружен в экспериментах с мышами: у их самцов был выработан рефлекс избегать запах ацетофенона (природное ароматическое соединение; например, есть в аромате черемухи) с помощью разрядов тока и оказалось, что у их потомства от необученных самок эффект обучения так или иначе присутствовал (Романовская Т. 2015 со ссылкой на Dias B. G., Ressler K. J. 2014).

Не было там стойких изменений структуры ДНК, нет смысла писать обратное. Было гипометилированию гена обонятельного рецептора, воспринимающего ацетофенон, сохранявшееся всего пару месяцев, стоит внимательнее почитать источник.

[Дарвинист]

И уважаемый Konof, не особо настаивайте на идее наследования через цитоскелет. Мало того, что пока это не в полной мере изученный вопрос - он заставляет меня, например, припомнить о лысенковской идее признания наследственных свойств за "всей клеткой". Можно оказать медвежью услугу исповедующим идеалы неоламаркизма.

[Дарвинист]

И еще - я, лично, не вижу ничего необычного в том, что в природе может существовать несколько уровней передачи наследственной информации, тот же эпигенетический. Хорошо разграниченных между собой, со своими специфическими процессами.

[Дарвинист]

всего пару месяцев, стоит

Пару поколений, прошу прощения.