Мутагенез

vit · июня 21, 2020, 11:29:13

на сколько я понял, это только гипотеза объясняющая появление в геноме нескольких повторных одинаковых мутаций в одном месте в одно время. Экспериментальных доказательств слиппед днк нет.

Evol · июня 21, 2020, 12:40:33

Цитата: vit от июня 21, 2020, 11:29:13слиппед днк нет

А рекомбинации ортопоксвирусных ДНК сюда нельзя отнести? Они, вроде, известны давно и я читал, что основным механизмом их формирования считается соскальзывающее ошибочное спаривание, так называемый slipped mispairing.

Evol · июня 21, 2020, 12:47:14

Есть, еще, модель Стрейзингера, см., пожалуйста, Bzymek M, Saveson CJ, Feschenko VV, Lovett ST. 1999. Slipped misalignment mechanisms of deletion formation: in vivo susceptibility to nucleases. J Bacteriol, 181:477-482, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC93401/.

Evol · июня 21, 2020, 12:52:35

Не могу, до сих пор, понять, что Вы пытаетесь обосновать. Возможно, уважаемый vit, Вы хотите предложить собственную концепцию мутагенеза?
Так, не тяните, пожалуйста, изложите ее в деталях. А то, лично у меня, создается впечатление, что Вы пытаетесь поймать оппонентов на каких-то неточностях, скрывая свои наработки.

vit · июня 21, 2020, 17:20:00

Цитата: Evol от июня 21, 2020, 12:40:33
Цитата: vit от июня 21, 2020, 11:29:13слиппед днк нет

А рекомбинации ортопоксвирусных ДНК сюда нельзя отнести? Они, вроде, известны давно и я читал, что основным механизмом их формирования считается соскальзывающее ошибочное спаривание, так называемый slipped mispairing.

к

я понял, что эта модель предложена как вероятное объяснение появления в геноме нескольких повторных одинаковых мутаций в одном месте в одно время. Случайным мутированием это объяснить нельзя. Вы то как считаете, слиппед это реальный процесс или вероятная модель?

василий андреевич · июня 21, 2020, 21:52:14

По мне, так термин случайность вполне годиться, что бы обозначить наследование мутации, не зависимое от обстоятельств ее получения.
В том и весь интерес ситуации, что адаптация мутанта к обстоятельству не может быть обеспечена мутагенезом. Мутант сам должен менять обстоятельства.

Питер · июня 21, 2020, 22:37:58

Цитата: vit от июня 21, 2020, 11:29:13на сколько я понял, это только гипотеза объясняющая появление в геноме нескольких повторных одинаковых мутаций в одном месте в одно время. Экспериментальных доказательств слиппед днк нет.

Нет, это не гипотеза - полимераза ошибается на простых повторах. Причем делает это и in vivo, и in vitro.

Evol · июня 22, 2020, 01:49:52

Цитата: василий андреевич от июня 21, 2020, 21:52:14Мутант сам должен менять обстоятельства.

В том то и дело. Главный пробел в современных представлениях об эволюции - это то, что эволюция организмов, говоря в целом, рассматривается в отрыве от эволюции среды, в которой организмы обитают. Могут ли сообщества заметно изменять окружение? Вот, как мутации с этим связаны?

Evol · июня 22, 2020, 01:50:55

Цитата: vit от июня 21, 2020, 17:20:00Вы то как считаете, слиппед это реальный процесс или вероятная модель?

Ответьте, сначала, на мой вопрос.

Evol · июня 22, 2020, 01:51:50

Повторяю его:

Цитата: Evol от июня 21, 2020, 12:52:35Возможно, уважаемый vit, Вы хотите предложить собственную концепцию мутагенеза?

vit · июня 22, 2020, 11:43:37

Цитата: Evol от июня 22, 2020, 01:51:50
Повторяю его:

Цитата: Evol от июня 21, 2020, 12:52:35Возможно, уважаемый vit, Вы хотите предложить собственную концепцию мутагенеза?

я пока что разбираюсь, нужна ли альтернативная концепция мутагенеза или официальная в порядке...

пока что стало ясно , что опыты Лански с выводами о видообразовании немого выдавали желаемое за действительное и моё скромное, дилетантское опасение, что число мутаций не может превышать его статистической вероятности как то оправдались.

То же касается и слиппеда днк, кроме желания объяснить появление в геноме нескольких повторных одинаковых мутаций в одном месте в одно время, что в принципе понятно, нет других материальных и теоретических оснований его принять.

Если его, слиппед, принять, то нужно забыть про : комплиментарную связь АТ ЦГ, днк полимеразе которая сама узнает и исправляет ошибки на 10 в 7 степени, мутС который после неё многократно проверяет и исправляет ошибки в 2структуре на 10 в 8 степени , если днк стала из-за петли короче, то днк полимераза достраивает недостающий остаток напротив консервативной цепи, а петля удаляется репаратором мут С.
Читал, что в популяции нет ни одной не комплиментарной пары оснований, в днк бывают, но они все исправляются.

Питер · июня 22, 2020, 13:43:27

10 в 7 исправляет. 10 в 7 плюс одну - нет. Вы проехали 100000 км на машине и ни разу не меняли колесо, хотя на дорогах масса острых предметов. запаску выкинули. на 100000+1 км в клочья колесо ... А запаска дома .

Проскальзывание оно не о том, что в этом месте мутация будет всегда. Она о том. что повтор увеличивает опасность такой ошибки.

vit · июня 22, 2020, 16:16:35

Цитата: Питер от июня 22, 2020, 13:43:27
10 в 7 исправляет. 10 в 7 плюс одну - нет. Вы проехали 100000 км на машине и ни разу не меняли колесо, хотя на дорогах масса острых предметов. запаску выкинули. на 100000+1 км в клочья колесо ... А запаска дома .

Проскальзывание оно не о том, что в этом месте мутация будет всегда. Она о том. что повтор увеличивает опасность такой ошибки.

слирред это и есть в клочья колесо, я Вам этот пример ранее приводил

Питер · июня 22, 2020, 17:18:43

Это просто ошибка. Не репарированное повреждение, приведшее к мутации - рваному колесу. Хорошо это или плохо - зависит не от колеса, а оттого, куда вы ехали.

василий андреевич · июня 22, 2020, 20:47:07

Цитата: Evol от июня 22, 2020, 01:49:52Могут ли сообщества заметно изменять окружение? Вот, как мутации с этим связаны?

Если есть гипотеза гидридной Земли Ларина, то почему не быть гипотезе воды, как продукта метаболизма доЛЮКовых организмов? Выбор окислов огромен и достаточно даже одного типа гидрата, допустим, кремния, что бы широкий спектр мутаций находил для фенома подходящую ресурсную среду. А вот водное "отравление" выдвинет уже принцип сохранности на первое место.