Мутагенез

Питер · июля 30, 2020, 11:42:54

Репрессируется он белком, который связывается с промотором в присутствии кислорода. При инсерции IS3 появляется новый промотор из МЭ, который не зависит от уровня кислорода в среде.
Мы уходим опять от ГПГ. Прыжок МЭ внутри клетки - мутация или нет ? Или этот такой вот ГПГ ?

Что такое ссср знаю, про сср не понял.

vit · июля 30, 2020, 12:16:49

но в присутствии О2 цит+ тоже должен ситт репрессировать?

сср это сайт-специфическая рекомбинация, с помощю которой ис3 и врезается по месту и обратимо.

ЦитироватьПрыжок МЭ внутри клетки - мутация или нет ?

для меня - нет, а Лански считает что таки да!

гпг возможна была при дупликации ситт.

Питер · июля 30, 2020, 12:23:21

Я согласен с Лански. Любое наследуемое изменение структуры генома - мутация. При этом он ниоткуда не приходит, чистое внутриклеточное событие.
Не идет экспрессия с этого промотора - но появляется новый в ИС3. Он и работает

ГПГ - ну и как чужая ДНК поступает в клетку ? В какой форме ?

vit · июля 30, 2020, 12:33:39

Цитата: Питер от июля 30, 2020, 12:23:21
Я согласен с Лански.

кто бы сомневался...

ЦитироватьНе идет экспрессия с этого промотора - но появляется новый в ИС3. Он и работает

любой ген имеет экспрессора и репрессора, экспрессор-ис3, а репрессор - ?

ЦитироватьГПГ - ну и как чужая ДНК поступает в клетку ? В какой форме ?

https://naukatv.ru/news/23629

Питер · июля 30, 2020, 12:49:59

Есть конститутивные гены без репрессора. И в данном случае промотор ИС3 - конститутивный. Работает везде и всегда.
То что это не коли - вас не смущает ? Совсем другая группа бактерий ....

vit · июля 30, 2020, 13:00:50

не путайте ген и экспрессор, ген цитт включается экспрессором ис3 при О2 и цитрате, как цитт выключается без цитрата?

ЦитироватьТо что это не коли - вас не смущает ? Совсем другая группа бактерий ....

к12 пока в кастинге не участвовала. но принцип тот же

Питер · июля 30, 2020, 13:40:38

Никак. Констиутивный промотор он и есть конститутивный.
Что такое экспрессор - не понимаю, не придумывайте термины.

Вот есть два позвоночных млекопитающих - кашалот и человек. Один ныряет на 1000 метров, другой нет. Но если кашалот может - то и человек должен как позвоночный млекопитающий. А еще он должен летать - мышки же летают ...
А принцип тот же ...

vit · июля 30, 2020, 16:25:42

вещество индуктор здесь не подходит, ис3 экспрессирует цитт - экспрессор.Промотор здесь ни при чем, Однако в результате дупликации одна из двух копий citT попала под управление промотора другого, соседнего гена (rnk). При помощи генно-инженерных экспериментов авторы показали, что промотор гена rnk обеспечивает работу контролируемого им гена в аэробных условиях.

как выключается цитт если нет цитрата?

Многие организмы (в первую очередь прокариоты) участвовали в горизонтальных переносах как "проточные" емкости. Если бы в процессе эволюции энтеробактерия Escherichia coli только приобретала, но не теряла гены, то размер ее генома должен был бы удвоится за 100 млн. лет с тех пор как произошла дивергенция с близкородственной бактерией Salmonella. Этот расчет сделан на основе применения метода "молекулярных часов". Но размер генома E.coli почти не изменился за это длительное время: геномный анализ выявил не только приобретение большого числа генов, но и отсутствие многих "старых" генов, обнаруживаемых у сальмонеллы. "Захваченные" гены могут сохраниться в геноме, но могут и подвергнуться элиминации или переносу в клетки другого организма.https://evolbiol.ru/shestakov.htm

Питер · июля 30, 2020, 17:05:57

Что за экспрессор ?

vit · июля 30, 2020, 17:43:20

Почти все гены то экспрессированны то нет, процесс экспрессии начинается с промотора, но если ген не экспрессирован, то на операторе сидит репрессор и мрнк не может начать экспрессию. В данном случае у нас в качестве фактора экспрессии выступает ис3. ИС3 запускает экспрессию цитратного оперона. Но так как в статье указано, что фенотип цит+ был обратим, значит ис3 уходит обратно когда в среде появляется глюкоза..

Питер · июля 30, 2020, 18:06:30

Вы мне сиквенс покажите этого обратиомого клона ... Тогда поговорим.
И точную фразу из статьи, где говорится о том, что уже клон меняет фенотип при глюкозе в среде.

vit · июля 30, 2020, 18:28:24

E. coli Cit(+) mutants grew in clumps and in long incompletely divided chains, a phenotype that was reversible in rich media.
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26833416/

ну и по теории мгэ прыгают туда обратно

Следовательно, можно считать, что МГЭ непосредственно участвуют в экспрессии генов, контролирующих признаки, вселекциииэволюции http://www.bionet.nsc.ru/vogis/pict_pdf/2011/15_2/2.pdf

Питер · июля 30, 2020, 20:52:05

И вы уверены, что reversible относится к cit+ - а не к фенотипу не полностью поделившихся цепей.

vit · июля 31, 2020, 10:22:32

а там что несколько новых видов было?

любой метаболический оперон включается и ВЫключается, по другому не бывает! еще в 82 году было написано что потребление цитрата с О2 связано с галопероном - естественно фенотит цит+ обратим.

Питер · июля 31, 2020, 10:36:07

Еще раз - есть конститутивно экспрессирующиеся гены.

Мутагенез

vit

vit

vit

vit

vit

vit

vit