Подборка гипотез возникновения жизни

Автор Panteley_nt, декабря 25, 2019, 21:41:54

« назад - далее »

Питер

Ну    опять   по  тому  же  месту.   ОК,   в  луже  плавают  пептиды.  Миллионы  лет.  Они  реплицируются   или  нет  ?
В   луже   плавают  короткие   РНКовые  олиги.  И   тоже    миллионы  лет.  ОНи    реплицируются  или  нет  ?
И  кто  из  них        может в  принципе   реплицироваться  ?

Есть  простая  логика   -  есть     РНКовый   олиг.     Который   может       давать  дуплекс  с  выступающими  концами.  Которые   могут   достраиваться  за  счет   комплементарности  и  наличия    хотя  бы   минимальной полимеразной   активности.
Этот    дуплекс   может в  том  числе  сорбировать  на  себе  свободные  аминокислоты.   И  тем  самым   смздавать  уже  пару   РНК-пептид.  В  этой  паре  может   возникнуть   каталитическая  активность  уже    у  пептида  ...    И   так   далее.
А   ДНК   где-то  совсем    не  в  деле.

В  общем  ваш   первый   вариант, – сначала РНК доэволюционировала до репликации, а потом «ареалы обитания» РНК и пептидов «пересеклись» и пошла коэволюция (то бишь, формирование «конгруэнтности») РНК с пептидами;
А  оно  вам  надо  ?

василий андреевич

Цитата: Питер от июля 21, 2022, 10:45:48Пептиды  не    умеют самореплицироваться.  И  самый  СУПЕР  пептид  не  может  размножиться. Будет  набор  уникальных  пептидов  -    которые  поживут  немного  и  помрут.
О,Кей. Как раз то, что надо.
  Как говорится, "без завещания можно жить по-джентльменски, но джентльмен не может без завещания умереть". Или, что проку в репликаторе, если он умрет, не завещав белкам-пептидам множиться?
  Имеем, допустим, комплекс из трех пептидов со сроками жизни, кратными один-два-четыре, т.е. как цельночисленные отношения. Это означает, что распад коротко-живущего пептида как раз поспеет своими аминами для возрождения долго-живущего. Но главное, что соседний комплекс со своим набором цельночисленных компонентов, окажется конкурирующим за амины с первым.
  По сути, заменителем ДНК-РНК является среда, сама амины не порождающая, но обеспечивающая их сортировку и доставку. Как низка не была бы вероятность появления полипептидного клона, но она будет неизбежно расти за счет "вымирания" комплексов, не вписывающихся своим резонирующим контуром в средовой волновой пакет.
  Не может РНК "доэволюционировать" до чего бы то ни было. Но может занять ту средовую стезю, где наивысшая динамика потока из короткоживущего пептида к долгоживущему. И уже эта РНК будет жировать на отборе пептидов, не пригодных для избранного ей пептидного комплекса. Вымрет комплекс, вымрет и РНК.
  А где место ДНК? В живой клетке ДНК не дотянет до репликации, если не будет провоцировать РНК снимать с нее информацию (черт побери этот ужасный термин). Снимается не информация, а раздражение, которое сконцентрировалось, как волновой пакет, на ее выпяченном фрагменте. Т.е. ДНК в нашем суждении заменяет среду, но если волновой пакет среды - вещь весьма неопределенная, то ее эрзац в образе даже "плохой" ДНК - определенность.
  Конгруэнтность? Дык эта шлындра тут, как тут. Но лучше "согласованность", идущая от пептидного комплекса, как потребителя того избыточного, что позволяет не разрушаться от собственной значимости ДНК, в окружении льстецов РНК.

  Химию, разумеется не соображаю, но худо-бедно физику подвести смогу.

Alexeyy


Alexeyy

#33
Цитата: Питер от июля 21, 2022, 18:01:21
Цитата: Alexeyy от июля 21, 2022, 14:44:44
Цитата: Питер от июля 21, 2022, 14:00:51Алексей,  то  ли  было,  то  ли  нет. Детали в  студию.
Нашёл: https://paleoforum.ru/index.php?topic=11708.0 Там третьим с начала темы постом Вы задавали мне, вроде, (примерно) тот же вопрос (о матричном синтезе пептидов на комплексе пептидов ... его авторы называют амилоидом). И там, в моём ответе, приведены цитаты из статей (гугловский перевод), где говорится об этом матричном синтезе. Там можно и продолжить ...
Вы  об  этом  ?
Maury C. P. J. 2018. Amyloid and the origin of life: self-replicating catalytic amyloids as pre-biotic informational and protometabolic entities. Cell Mol Life Sci., 75(9): 1499–1507, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5897472/ .
Но  там  ничего  нет  кроме  гипотезы.  Никак   не  показано,  что это  некая   реальность.  С  рибозимами есть  хоть что-то  экспериментальное,  а  тут   - ничего
Нет. Почитайте внимательнее: там - не гипотезы (по поводу разрастания и матричного синтеза у пептидных комплексов). Там, оказывается - обзор экспериментальных работ и приводятся ссылки на непосредственные экспериментальные работы. В продолжение той темы привёл соответствующие цитаты об этом (и непосредственные ссылки на экспериментальные работы; ссылка - в предыдущем посте).

василий андреевич

  Репликация - раздвоение, размножение, клонирование с минимальным отклонением, а не бифуркация или дивергенция. Белки и пр.пептиды не "раздваиваются", но воссоздаются "сторонней матрицей", которая, собственно говоря, репликатором и является.
  У нас нет пока матрицы.

ПП. Не понял. Куда-то в нетуда получилось

Panteley_nt

Илья Пригожин:

Статистическая вероятность того, что органические структуры и наиболее точно согласованные реакции, которые характеризуют живые организмы, будут генерироваться случайно, равна нулю.